FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5383, 307 aa
1>>>pF1KE5383 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5573+/-0.00124; mu= 13.8099+/- 0.073
mean_var=66.6596+/-14.874, 0's: 0 Z-trim(99.8): 73 B-trim: 349 in 1/46
Lambda= 0.157088
statistics sampled from 5816 (5883) to 5816 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.503), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 1.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 1981 458.4 3e-129
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CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 524 128.2 7.5e-30
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CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 333 85.0 8.5e-17
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 293 75.9 4.2e-14
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
initn: 1981 init1: 1981 opt: 1981 Z-score: 2433.8 bits: 458.4 E(32554): 3e-129
Smith-Waterman score: 1981; 99.7% identity (99.7% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 IITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFLW
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
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pF1KE5 GVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFILYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 GVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFILYF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKCCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 IGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKCCEK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RKNLRVT
:::::::
CCDS86 RKNLRVT
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
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Smith-Waterman score: 794; 41.1% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (5-295:5-303)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW
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10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIV-FLLISSLLNFAYIAKILNDY------KMKNDTVWDLNMYKSEYF
:.: : . :. .... ...: .... .. :. : :.. .:. . :...
CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
...:::.... : . :.. ..::.:: :: :.:: ..:: :: .:::::.:.:..:::
CCDS86 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
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CCDS86 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 QQLKCCEKRKNLRVT
..
CCDS86 WKVMSILKGRKFQQHKQI
310
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
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Smith-Waterman score: 752; 41.2% identity (74.6% similar) in 311 aa overlap (1-302:1-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW
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CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
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CCDS86 WLKLKINKV---MLAILLGSFLISLI-ISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPG
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CCDS86 TFKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVII
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FIILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRV
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CCDS86 FLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKM
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 LQQLKCCEKRKNLRVT
:. .:: .:.
CCDS86 LRFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 705; 38.4% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (1-297:1-307)
10 20 30 40 50
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:. ...:::.....: ..:.::::.:.::: :: :.:.::. .:::.:.:.:: ::
CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
.....:.. ...:..:.... : ::...: .::..: :..:::::::. :. .::
CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILN-DY------KMKNDTVWDLNMYKSEYF
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CCDS86 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
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pF1KE5 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
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CCDS86 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
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pF1KE5 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
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CCDS86 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
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300
pF1KE5 --QQLKCCEKRKNLRVT
... :
CCDS86 TCRKIACMI
>>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa)
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:...:: ::.. : ..: :::.::.:::::: .:. :.:.. :::.:::::: :.:
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CCDS86 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
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pF1KE5 WLKSRTNMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKI-------LNDYKMKNDTVWDLNMYKSEYF
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CCDS86 YLKWRVKKVV---LVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTR--F
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. :.:. :..: ::::: ..::.:.:.: ..:: .: :..:.:: ...: .:
CCDS86 SSLIVLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVI
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.:..:. .. ... : . . ..:: :...... :: :: .:::::.::.::::
CCDS86 TFFLLYAIFSLSFFISVWTSERLEEN--LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASL
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pF1KE5 RVLQQLKCCEKRKNLRVT
:: :.
CCDS86 SVLLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
300 310
>>CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 (314 aa)
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Smith-Waterman score: 645; 39.2% identity (68.5% similar) in 311 aa overlap (1-303:1-310)
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: .. ::......: ....::: ::::::: . :: :. . :::: :::: : .
CCDS31 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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CCDS31 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
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CCDS31 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSLVLEIFIDISLNIIDKSNLTLY-LDESKTLYDKLS
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: . ::.: .. :.: : . .::..:: ::.:... . : :::.:::: .:::...::
CCDS31 ILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMVMSF
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CCDS31 LFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAVRLL
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300
pF1KE5 QQLKCCEKRKNLRVT
.:. : :
CCDS31 WHLRNYTKTPNPLPL
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>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 634 init1: 316 opt: 641 Z-score: 792.4 bits: 154.8 E(32554): 8.2e-38
Smith-Waterman score: 641; 39.4% identity (70.0% similar) in 307 aa overlap (1-297:1-301)
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pF1KE5 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCIDCAKNK-LSTIGFILTGLAISRIFLIW
:. ..::.:... .. ..:.: : :: ::: . :.: .: ::.: ::. ::.:.
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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pF1KE5 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
::.::.:. :::: . :: ... :. :.. :. :.:.:: :...: ::::.::. ::
CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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CCDS58 WLKWRVSRVMVWM---LLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSE
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pF1KE5 YFIKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLI
:.. ..: .: . . .:: . .::.:: ::.::: .: :. :: .:::: .:.....
CCDS58 YYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE5 SFIILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLR
::..::.:::... : . ..:. :.: . : .:: ::::::::::::::: ..
CCDS58 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQ-TFV
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300
pF1KE5 VLQQLKCCEKRKNLRVT
:. :.:
CCDS58 VM--LRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
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10 20 30 40 50
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300
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300
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CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVE--VRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF
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: :: :.. :. :.. .:... : . .:. ..... .: ... .. :.
CCDS53 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDAT
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CCDS53 VTTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLC
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300
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CCDS53 YWVKGEKPSSP
300
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
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CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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CCDS53 VLLLNWYSTVLNPA-FNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFL
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CCDS53 HLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTV
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CCDS53 WVKGEKTSSP
300
307 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]