Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5381
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5381, 305 aa
1>>>pF1KE5381 305 - 305 aa - 305 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3518+/-0.00047; mu= 15.3590+/- 0.029
mean_var=105.1341+/-29.866, 0's: 0 Z-trim(109.2): 354 B-trim: 1956 in 2/50
Lambda= 0.125084
statistics sampled from 16770 (17315) to 16770 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16
Scan time: 4.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1013 194.2 2.9e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 791 154.1 3.3e-37
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 789 153.7 4.3e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 787 153.4 5.5e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 784 152.8 8.1e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 784 152.8 8.1e-37
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 784 152.8 8.1e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 783 152.6 9e-37
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 780 152.1 1.3e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 770 150.3 4.6e-36
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 761 148.7 1.4e-35
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 761 148.7 1.4e-35
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 759 148.3 1.8e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 753 147.2 3.8e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 750 146.7 5.6e-35
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 749 146.5 6.4e-35
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 749 146.5 6.4e-35
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 749 146.5 6.5e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 740 144.9 2e-34
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 725 142.2 1.3e-33
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 561 112.6 1.1e-24
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 516 104.5 2.9e-22
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 242 55.1 2.3e-07
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 228 52.5 1.3e-06
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 226 52.2 1.8e-06
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 208 49.0 1.7e-05
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 206 48.7 2.7e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 204 48.2 2.8e-05
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 206 48.8 2.8e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 200 47.5 4.9e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 200 47.5 4.9e-05
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 197 47.0 7.2e-05
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 196 46.8 8.2e-05
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 196 46.8 8.2e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 192 46.0 0.00012
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 192 46.1 0.00014
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 192 46.1 0.00014
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 192 46.1 0.00014
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 192 46.1 0.00014
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 192 46.1 0.00014
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 186 44.9 0.00024
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 186 44.9 0.00025
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 186 45.0 0.00027
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 185 44.7 0.00027
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 186 45.0 0.00028
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 185 44.7 0.00028
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 185 44.8 0.00028
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 186 45.0 0.00029
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 185 44.8 0.00029
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 186 45.1 0.0003
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1031 init1: 1012 opt: 1013 Z-score: 1005.5 bits: 194.2 E(85289): 2.9e-49
Smith-Waterman score: 1013; 49.1% identity (78.8% similar) in 293 aa overlap (2-294:7-299)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFL
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDR
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLP
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTA
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLR
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 KWDAHSSVKF
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 789 init1: 594 opt: 791 Z-score: 788.9 bits: 154.1 E(85289): 3.3e-37
Smith-Waterman score: 791; 37.9% identity (74.2% similar) in 298 aa overlap (5-298:15-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVA-WGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDS
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFC-HLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 FYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKS-SK
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 ALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLD--KFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKD
...: ::. .: ::: : . .: : .: : ::.:.::.:.:: :::.:::::::
NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 MKTAIRRLRKWDAHSSVKF
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NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 789; 39.2% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:10-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KE5 MYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KE5 GFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFY
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDLPRVIKLACTDTYRLD-IMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHC-PLDKSSKA
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIIC-FIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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pF1KE5 LSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKS--LDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDM
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 KTAIRRLRKWDAHSSVKF
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NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 727 init1: 575 opt: 787 Z-score: 785.0 bits: 153.4 E(85289): 5.5e-37
Smith-Waterman score: 787; 39.3% identity (72.8% similar) in 298 aa overlap (2-296:10-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMG
::.:.:::.::. : :.:::..........:.: ::..: :.. .: :: .. ::.
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 FDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 DLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKS-SKALS
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE5 TLTAHITVVLLFFGPCVFIY--AWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKT
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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290 300
pF1KE5 AIRRLRKWDAHSSVKF
:..::.:
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 780 init1: 602 opt: 784 Z-score: 782.0 bits: 152.8 E(85289): 8.1e-37
Smith-Waterman score: 784; 40.2% identity (74.3% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKS-SKALST
: :..:::.:: .. ....: :: . : :...:: :. :: . .. .::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KE5 IRRLRKWDAHSSVKF
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 780 init1: 602 opt: 784 Z-score: 782.0 bits: 152.8 E(85289): 8.1e-37
Smith-Waterman score: 784; 40.2% identity (74.3% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKS-SKALST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRRLRKWDAHSSVKF
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 780 init1: 602 opt: 784 Z-score: 782.0 bits: 152.8 E(85289): 8.1e-37
Smith-Waterman score: 784; 40.2% identity (74.3% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKS-SKALST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRRLRKWDAHSSVKF
..:
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 793 init1: 600 opt: 783 Z-score: 781.2 bits: 152.6 E(85289): 9e-37
Smith-Waterman score: 783; 36.0% identity (74.6% similar) in 303 aa overlap (1-300:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLL
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFL
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pF1KE5 ANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRY
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NP_001 LTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 IAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPR
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NP_001 VAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPP
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pF1KE5 VIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHC-PLDKSSKALSTLTA
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NP_001 LLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSS
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pF1KE5 HITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRR
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NP_001 HLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRK
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300
pF1KE5 LRKWDAHSSVKF
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NP_001 VFAFLKH
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 786 init1: 559 opt: 780 Z-score: 778.2 bits: 152.1 E(85289): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 780; 40.5% identity (72.3% similar) in 296 aa overlap (3-294:10-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLD--IMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALS
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSY-IVRAVLQIRSASGRQKAFG
190 200 210 220 230
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pF1KE5 TLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDK--FLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKT
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NP_001 TCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKG
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290 300
pF1KE5 AIRRLRKWDAHSSVKF
:. ::
NP_001 ALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 792 init1: 582 opt: 770 Z-score: 768.4 bits: 150.3 E(85289): 4.6e-36
Smith-Waterman score: 770; 40.6% identity (70.6% similar) in 293 aa overlap (5-294:10-302)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFL
:..::.:. :. ::.. .. : . :: ::.. . : .:::::::.
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
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pF1KE5 LANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDR
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NP_009 LSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDR
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 YIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLP
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]