Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5378
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5378, 305 aa
1>>>pF1KE5378 305 - 305 aa - 305 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2745+/-0.000473; mu= 15.7562+/- 0.029
mean_var=121.3716+/-36.756, 0's: 0 Z-trim(108.9): 368 B-trim: 957 in 1/49
Lambda= 0.116417
statistics sampled from 16473 (17005) to 16473 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.537), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 5.860
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1013 182.1 1.2e-45
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 792 145.0 1.8e-34
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 789 144.5 2.6e-34
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 789 144.5 2.6e-34
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 784 143.6 4.7e-34
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 784 143.6 4.7e-34
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 784 143.6 4.7e-34
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 783 143.5 5.2e-34
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 782 143.3 5.9e-34
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 779 142.8 8.4e-34
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 765 140.4 4.2e-33
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 762 139.9 5.9e-33
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 753 138.4 1.7e-32
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 748 137.6 3.1e-32
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 743 136.8 5.5e-32
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 743 136.8 5.5e-32
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 743 136.8 5.6e-32
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 739 136.1 8.8e-32
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 731 134.7 2.2e-31
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 722 133.3 6.6e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 551 104.5 2.9e-22
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 512 98.0 2.7e-20
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 232 51.0 4.2e-06
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 229 50.5 5.6e-06
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 223 49.5 1.1e-05
NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 214 48.0 3.4e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 208 47.0 6.6e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 197 45.1 0.00024
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 197 45.2 0.00025
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 197 45.2 0.00025
NP_002502 (OMIM: 162341) neuromedin-B receptor iso ( 390) 196 45.0 0.00029
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 196 45.0 0.0003
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 45.0 0.0003
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 45.0 0.0003
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 45.0 0.0003
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 196 45.0 0.0003
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 195 44.8 0.0003
NP_001186948 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 370) 191 44.1 0.0005
NP_872588 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 191 44.1 0.0005
NP_000904 (OMIM: 602548) nociceptin receptor isofo ( 370) 191 44.1 0.0005
XP_016883343 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 370) 191 44.1 0.0005
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 190 43.9 0.0005
XP_016883342 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 191 44.2 0.00051
XP_016883341 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 191 44.2 0.00051
XP_011527130 (OMIM: 602548) PREDICTED: nociceptin ( 388) 191 44.2 0.00051
NP_001305782 (OMIM: 602548) nociceptin receptor is ( 399) 191 44.2 0.00052
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 190 43.9 0.00052
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 190 44.0 0.00056
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 190 44.0 0.00056
NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 192 44.5 0.00058
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 1031 init1: 1012 opt: 1013 Z-score: 940.3 bits: 182.1 E(85289): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 1013; 49.1% identity (78.8% similar) in 293 aa overlap (2-294:7-299)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFL
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
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60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDR
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLP
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 RVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTA
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTCVS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 HITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLR
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NP_001 HITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRKLC
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 KWDAHSSVKF
NP_001 SRKDISGDK
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 787 init1: 592 opt: 792 Z-score: 739.7 bits: 145.0 E(85289): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 792; 37.9% identity (73.8% similar) in 298 aa overlap (5-298:15-311)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
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pF1KE5 PMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIA
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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pF1KE5 MGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVA-WGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDS
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFC-HLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDH
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 FYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTI-QHRPLDKSSK
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NP_001 FFCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 ALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLD--KFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKD
...: ::. .: ::: : . .: : .: : ::.:.::.:.:: :::.:::::::
NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 MKTAIRRLRKWDAHSSVKF
.. :..:: :.
NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 789; 39.2% identity (72.9% similar) in 306 aa overlap (1-302:10-314)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSP
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pF1KE5 MYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAM
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pF1KE5 GFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFY
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KE5 CDLPRVIKLACTDTYRLD-IMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKA
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIIC-FIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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pF1KE5 LSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKS--LDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDM
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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290 300
pF1KE5 KTAIRRLRKWDAHSSVKF
: : ... . . ::
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 784 init1: 557 opt: 789 Z-score: 736.9 bits: 144.5 E(85289): 2.6e-34
Smith-Waterman score: 789; 40.9% identity (72.3% similar) in 296 aa overlap (3-294:10-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
:.::.::..:::... . :... .. . :.::. :: .:.::. .:: : ..: .:..
NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
:: .:::::::: .:: : :...:.:: : .:... ...:: :: .::: : .
NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLD--IMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALS
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSY-IVRAVLQIRSASGRQKAFG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE5 TLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDK--FLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKT
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NP_001 TCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKG
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 AIRRLRKWDAHSSVKF
:. ::
NP_001 ALGRLLLGKRELGKE
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 778 init1: 599 opt: 784 Z-score: 732.3 bits: 143.6 E(85289): 4.7e-34
Smith-Waterman score: 784; 40.2% identity (74.0% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
:.:::.::::.. .. ::.::.:.: :.:: :::. . ::.::.:::
XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
:::.:.: :.:..:: :. :. . ..: ::. : : :.. .::.: . .: . :.
XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKALST
: :..:::.:: .. ....: :: . : :...:: :. :: . . . .::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
..:.::: : .: .: : : :. .:...:::...::.:::.::.::::..: :
XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KE5 IRRLRKWDAHSSVKF
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 778 init1: 599 opt: 784 Z-score: 732.3 bits: 143.6 E(85289): 4.7e-34
Smith-Waterman score: 784; 40.2% identity (74.0% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
:.:::.::::.. .. ::.::.:.: :.:: :::. . ::.::.:::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
:.:.::::.:.: .. ..:.... :....:.: :..: .:.:. .:: :.:.: .:..
NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKALST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 IRRLRKWDAHSSVKF
..:
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 778 init1: 599 opt: 784 Z-score: 732.3 bits: 143.6 E(85289): 4.7e-34
Smith-Waterman score: 784; 40.2% identity (74.0% similar) in 296 aa overlap (2-294:9-304)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKALST
: :..:::.:: .. ....: :: . : :...:: :. :: . . . .::. :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE5 LTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSL--DKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300
pF1KE5 IRRLRKWDAHSSVKF
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
initn: 795 init1: 591 opt: 783 Z-score: 731.6 bits: 143.5 E(85289): 5.2e-34
Smith-Waterman score: 783; 36.0% identity (74.6% similar) in 303 aa overlap (1-300:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLL
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMYVFL
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pF1KE5 ANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRY
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NP_001 LTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAYDRY
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pF1KE5 IAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPR
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NP_001 VAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCEIPP
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pF1KE5 VIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQH-RPLDKSSKALSTLTA
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NP_001 LLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFSTCSS
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NP_001 HLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAGIRK
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300
pF1KE5 LRKWDAHSSVKF
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NP_001 VFAFLKH
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 724 init1: 572 opt: 782 Z-score: 730.6 bits: 143.3 E(85289): 5.9e-34
Smith-Waterman score: 782; 39.3% identity (72.5% similar) in 298 aa overlap (2-296:10-307)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPM
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NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
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pF1KE5 YFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMG
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 FDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KE5 DLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKS-SKALS
:.:... :.::::. ...:. . . . : ....::: : ..:.. :. :::..
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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pF1KE5 TLTAHITVVLLFFGPCVFIY--AWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKT
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NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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290 300
pF1KE5 AIRRLRKWDAHSSVKF
:..::.:
NP_001 ALKRLQKRKCC
310
>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
initn: 803 init1: 593 opt: 779 Z-score: 727.9 bits: 142.8 E(85289): 8.4e-34
Smith-Waterman score: 779; 41.0% identity (71.0% similar) in 293 aa overlap (5-294:10-302)
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pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFL
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFF
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pF1KE5 YIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLP
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pF1KE5 RVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSS-KALSTLT
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NP_009 RLLGKEMGLTQS
310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]