FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5378, 305 aa
1>>>pF1KE5378 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8159+/-0.00125; mu= 12.6139+/- 0.073
mean_var=169.1775+/-56.222, 0's: 0 Z-trim(102.9): 394 B-trim: 819 in 2/43
Lambda= 0.098606
statistics sampled from 6647 (7173) to 6647 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 1.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 2009 298.8 3.4e-81
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CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1979 294.5 6.6e-80
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1281 195.2 5.2e-50
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1266 193.2 2.4e-49
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1242 189.7 2.5e-48
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CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1226 187.4 1.2e-47
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1223 187.0 1.7e-47
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1220 186.6 2.1e-47
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1208 184.9 7e-47
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1208 184.9 7e-47
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1208 184.9 7e-47
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1207 184.7 7.7e-47
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1205 184.4 9.4e-47
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1170 179.4 3e-45
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1147 176.2 2.9e-44
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1104 170.1 2e-42
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1083 167.1 1.6e-41
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CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1074 165.8 3.8e-41
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CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1062 164.1 1.2e-40
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1056 163.2 2.3e-40
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1044 161.5 7.3e-40
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CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1037 160.5 1.5e-39
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CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1029 159.4 3.3e-39
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1015 157.5 1.4e-38
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1013 157.1 1.6e-38
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1009 156.5 2.3e-38
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1007 156.2 2.8e-38
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1005 156.0 3.4e-38
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1004 155.8 3.8e-38
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1004 155.9 3.9e-38
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1003 155.7 4.2e-38
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1000 155.3 5.6e-38
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1000 155.3 6e-38
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 999 155.1 6.2e-38
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 997 154.8 7.5e-38
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 988 153.6 1.8e-37
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 982 152.7 3.3e-37
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 968 150.7 1.3e-36
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 913 142.9 3e-34
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 891 139.8 2.6e-33
CCDS31704.1 OR10G8 gene_id:219869|Hs108|chr11 ( 311) 884 138.8 5.2e-33
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 870 136.8 2.1e-32
>>CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 (305 aa)
initn: 2009 init1: 2009 opt: 2009 Z-score: 1571.1 bits: 298.8 E(32554): 3.4e-81
Smith-Waterman score: 2009; 99.7% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS32 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS32 SSVKF
>>CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 (305 aa)
initn: 1993 init1: 1993 opt: 1993 Z-score: 1558.8 bits: 296.5 E(32554): 1.7e-80
Smith-Waterman score: 1993; 99.3% identity (99.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
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70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS32 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHCPLDKSSKALSTLTAHITVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS32 SSVKF
>>CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 (305 aa)
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Smith-Waterman score: 1979; 98.7% identity (99.3% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MVTEFIFLGLSDSQELQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLS
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pF1KE5 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAIC
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 KPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKL
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVV
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pF1KE5 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS30 LLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRQLRKWDAH
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SSVKF
:::::
CCDS30 SSVKF
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 1281; 60.5% identity (85.7% similar) in 301 aa overlap (1-301:8-308)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
::.::..::::.: ::: :.: .: . : :.::.::.. . ::::.::::
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pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
:::.:::.::. :. ..:::..::: .::.:::.::..:::.:: : ::::..:.::..
CCDS32 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 DRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVSQLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCD
::.:::::::::.::: :: .....:..: :::::.:::.: ::::::::::::.::
CCDS32 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISYTIILMTIQHRPLDKSSKALSTL
:: ::.::: :::...::...:::.... :. :::::::::. .. : . ::::::::
CCDS32 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVITPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRR
:::::::.::::::...: ::: .::::.:::.: :::::::::.:::.:.:.:. .
CCDS32 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LRKWDAHSSVKF
::. ..:
CCDS32 LRNRHVNSWKN
310
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 1290 init1: 1266 opt: 1266 Z-score: 999.3 bits: 193.2 E(32554): 2.4e-49
Smith-Waterman score: 1266; 59.5% identity (88.1% similar) in 294 aa overlap (2-295:33-326)
10 20 30
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGI
::::..::::.:. :: :::. : ..: .:
CCDS32 TSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYLAI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 VFGNLLIVITVVSDSHLHSPMYFLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCL
..::.::..::.:::.::.::::::::::.::. ..: ..::::.::. .::.::: .::
CCDS32 LLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDACL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 VQIFLLHFFGGSEMVILIAMGFDRYIAICKPLHYTTIMCGNACVGIMAVAWGIGFLHSVS
.:::..:.: :::::.:..:..:::.:::::::: :.: .:: .. ..: .::.:..:
CCDS32 AQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHTTS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 QLAFAVHLPFCGPNEVDSFYCDLPRVIKLACTDTYRLDIMVIANSGVLTVCSFVLLIISY
::::.:.:::::::.::::.:::: : :::: ::: ......:.:: :.. ::.::..::
CCDS32 QLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVVSY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 TIILMTIQHRPLDKSSKALSTLTAHITVVLLFFGPCVFIYAWPFPIKSLDKFLAVFYSVI
:.::.:...: . .:: :::::::::: ::::::.:::.::: :.:: :::::...
CCDS32 TVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYTIF
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE5 TPLLNPIIYTLRNKDMKTAIRRLRKWDAHSSVKF
: .:::.:::::::..:.:. .:.
CCDS32 TLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 (323 aa)
initn: 1259 init1: 1234 opt: 1242 Z-score: 981.1 bits: 189.7 E(32554): 2.5e-48
Smith-Waterman score: 1242; 57.1% identity (87.8% similar) in 294 aa overlap (1-294:8-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVTEFIFLGLSDSQGLQTFLFMLFFVFYGGIVFGNLLIVITVVSDSHLHSPMY
.:.::..::: .:: :: : : .: :.: ::.:::::..::.::. ::::::
CCDS32 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLLANLSLIDLSLSSVTAPKMITDFFSQRKVISFKGCLVQIFLLHFFGGSEMVILIAMGF
:::.:::..:. .: ..::::.::.: ...:::.::..:::..:.: :.:::.:..:..
CCDS32 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY
70 80 90 100 110 120
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300
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.:.
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310
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