Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5377
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5377, 304 aa
1>>>pF1KE5377 304 - 304 aa - 304 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0062+/-0.00132; mu= 12.2029+/- 0.077
mean_var=200.6949+/-69.960, 0's: 0 Z-trim(101.9): 408 B-trim: 414 in 1/44
Lambda= 0.090533
statistics sampled from 6224 (6727) to 6224 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 1.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1966 270.3 1.3e-72
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1372 192.8 3.1e-49
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1350 189.9 2.2e-48
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1284 181.2 8.5e-46
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1265 178.8 5e-45
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1260 178.1 7.5e-45
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1254 177.4 1.3e-44
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1238 175.2 5.5e-44
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1229 174.0 1.2e-43
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1219 172.7 3e-43
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1216 172.4 4e-43
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1136 161.9 5.6e-40
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1132 161.4 8e-40
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1127 160.7 1.3e-39
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1118 159.6 2.9e-39
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1118 159.6 2.9e-39
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1118 159.6 2.9e-39
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1115 159.2 3.7e-39
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1114 159.0 4.1e-39
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1085 155.3 5.7e-38
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1081 154.7 8.1e-38
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1080 154.6 8.9e-38
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1071 153.4 2e-37
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1051 150.8 1.2e-36
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1050 150.7 1.3e-36
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1040 149.4 3.3e-36
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1038 149.1 4e-36
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1035 148.7 5.3e-36
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1032 148.3 6.9e-36
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1026 147.5 1.2e-35
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1023 147.2 1.5e-35
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 997 143.8 1.6e-34
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 992 143.1 2.6e-34
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 988 142.6 3.9e-34
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 987 142.6 4.4e-34
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 975 140.9 1.2e-33
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 973 140.6 1.4e-33
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 971 140.4 1.7e-33
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 954 138.1 8e-33
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 951 137.8 1.1e-32
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 947 137.2 1.5e-32
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 943 136.7 2.2e-32
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 932 135.3 5.9e-32
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 921 133.8 1.6e-31
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 916 133.2 2.5e-31
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 907 132.0 5.6e-31
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 893 130.2 2e-30
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 878 128.3 8e-30
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 870 127.2 1.6e-29
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 864 126.4 2.8e-29
>>CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 (304 aa)
initn: 1966 init1: 1966 opt: 1966 Z-score: 1417.2 bits: 270.3 E(32554): 1.3e-72
Smith-Waterman score: 1966; 99.7% identity (100.0% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSSKAFSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSSKAFSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNKEVKAAIKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS32 SAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNQEVKAAIKK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RLCI
::::
CCDS32 RLCI
>>CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 (348 aa)
initn: 1391 init1: 1365 opt: 1372 Z-score: 997.3 bits: 192.8 E(32554): 3.1e-49
Smith-Waterman score: 1372; 68.3% identity (89.7% similar) in 300 aa overlap (1-300:25-324)
10 20 30
pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFV
:...::: :.::.:::::.:..:: ..:: ::....
CCDS32 MLTSLTDLCFSPIQVAEIKSLPKSMNETNHSRVTEFVLLGLSSSRELQPFLFLTFSLLYL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 GIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMYFLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWG
.:.:::.::..::: :: :::::::::.::: ::. .:::::::::.::: ::::::. .
CCDS32 AILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVERKTISFDA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 CYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAIDRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHS
: .:.::.::. ::::.:::.:: ::::::::::::::.:: :: . :.: :. :::.:.
CCDS32 CLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISWFVGFIHT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 SSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCDLPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLV
.::.:: ..::::::: .:::::::::: :::: :::...::..::::.::: ::::.:
CCDS32 TSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLSSFLLLVV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 SYGVIIFSVRYRAASRSSKAFSTLSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKILSVFYT
:: ::. .:: :... .:: :::.::::::::::.::.:::::::: :::::.:.::::
CCDS32 SYTVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDKVLAVFYT
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE5 IFTPLLNPIIYTLRNKEVKAAIKKRLCI
::: .:::.::::::::::::..:
CCDS32 IFTLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK
310 320 330 340
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 1179 init1: 1179 opt: 1350 Z-score: 982.3 bits: 189.9 E(32554): 2.2e-48
Smith-Waterman score: 1350; 67.8% identity (87.4% similar) in 301 aa overlap (1-300:1-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHT-PM
:. :.:.::::.: :: :..:: .::. : :.:.:.:::::::::: : ::. ::
CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 YFLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMA
::::.::. .:: :::::::::: ::: ..: ::. ::..:.::.:. ::.::.:::.::
CCDS32 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 IDRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFC
::::::::::::::.:: .. :.:.:..:::::: ::.:: ..::.:::: .:::::
CCDS32 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 DLPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSSKAFST
:::::::::: :::.: ...:.::::::: ::::::.:: ::....: :::. .:::.::
CCDS32 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNKEVKAAIK
:::: ::::::.::.:.:: ::::.::::.:::::::::::::::::::::.:.:::.:
CCDS32 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 KRLCI
:
CCDS32 KLQNRRVTFQ
310
>>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa)
initn: 1290 init1: 1265 opt: 1284 Z-score: 935.7 bits: 181.2 E(32554): 8.5e-46
Smith-Waterman score: 1284; 62.7% identity (86.7% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMY
: ..:.:.::::.:::::.: .::..:: ::.:.: ::::.::.: ..::: :..:::
CCDS32 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAIFSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERKTISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAI
::::::: ::. ..::::::.:::. ::::::. ::..:.: .: . :::::::::::
CCDS32 FLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERKTISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYAVGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCD
::..:::::::: :::. :. . .. :.::: .:: :..:: . ::::::: .::::::
CCDS32 DRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWAVGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVCFLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSSKAFSTL
:::::.::: ::: ........:::.:: ::: :..:: .:...:: :..: ::::.:::
CCDS32 LPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSCFLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKILSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNKEVKAAIKK
.:::::: :::.::...:.::::: :::.::::::. :::::::::.:::..::::. :
CCDS32 TAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKFLSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWK
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RLCI
CCDS32 LRNRHVNSWKN
310
>>CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 (343 aa)
initn: 1262 init1: 1262 opt: 1265 Z-score: 921.9 bits: 178.8 E(32554): 5e-45
Smith-Waterman score: 1265; 60.7% identity (88.7% similar) in 300 aa overlap (1-300:32-331)
10 20 30
pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLG
:. :.: :::::::::..::....:.:
CCDS32 ALYFSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFAL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 FSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMYFLLSNLSCIDMILASFATPKMIVDFLRERK
:::..: :::::::.::: :.:::::::.::: .:: ::::::::.:...:...:
CCDS32 FSVIYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 TISWWGCYSQMFFMHLLGGSEMMLLVAMAIDRYVAICKPLHYMTIMSPRVLTGLLLSSYA
.::. ::..:.:..::::: ::.:::.::.::::::::::::::::. .: . :...:.
CCDS32 VISFAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 VGFVHSSSQMAFMLTLPFCGPNVIDSFFCDLPLVIKLACKDTYILQLLVIADSGLLSLVC
.:..::. :. : ..::::::::.::.::::::: :::: : :..:....:.::..:: :
CCDS32 LGLLHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 FLLLLVSYGVIIFSVRYRAASRSSKAFSTLSAHITVVTLFFAPCVFIYVWPFSRYSVDKI
:..::.::..:..... .. . .::: :::.:::::: :::.::.:::.:::. .::::.
CCDS32 FIILLISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDKF
250 260 270 280 290 300
280 290 300
pF1KE5 LSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNKEVKAAIKKRLCI
:.:::::.::.::::::::::::.: ..::
CCDS32 LAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT
310 320 330 340
>>CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 (312 aa)
initn: 1271 init1: 1237 opt: 1260 Z-score: 918.7 bits: 178.1 E(32554): 7.5e-45
Smith-Waterman score: 1260; 62.0% identity (84.7% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MERANHSVVSEFILLGLSKSQNLQILFFLGFSVVFVGIVLGNLLILVTVTFDSLLHTPMY
:. : :.:.::::::. .:::.::. ::... . :.::.::.:::: : ::.:.:
CCDS32 MDLKNGSLVTEFILLGFFGRWELQIFFFVTFSLIYGATVMGNILIMVTVTCRSTLHSPLY
10 20 30 40 50 60
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CCDS32 IVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH
310 320
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CCDS32 FLLTNLSIIDMSLASFATPKMITDYLTGHKTISFDGCLTQIFFLHLFTGTEIILLMAMSF
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CCDS32 LKNRFLNFNKAMPS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]