Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5376
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5376, 303 aa
1>>>pF1KE5376 303 - 303 aa - 303 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6164+/-0.00111; mu= 13.3759+/- 0.066
mean_var=139.4516+/-45.338, 0's: 0 Z-trim(103.3): 390 B-trim: 838 in 2/49
Lambda= 0.108608
statistics sampled from 6821 (7339) to 6821 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 1.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 1985 323.4 1.4e-88
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 1887 308.0 5.8e-84
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 1464 241.8 5.2e-64
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1225 204.3 9.8e-53
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 1172 196.0 3.1e-50
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 1019 172.0 5e-43
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 960 162.8 3e-40
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 956 162.2 4.8e-40
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 951 161.4 8.3e-40
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 935 158.9 4.7e-39
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 933 158.6 5.8e-39
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 931 158.2 7.2e-39
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 924 157.1 1.5e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 923 157.0 1.7e-38
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 923 157.0 1.7e-38
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 919 156.4 2.9e-38
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 918 156.2 2.9e-38
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 917 156.0 3.3e-38
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 916 155.9 3.6e-38
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 914 155.6 4.6e-38
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 914 155.6 4.6e-38
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 914 155.6 4.6e-38
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 911 155.1 6.3e-38
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 909 154.8 7.8e-38
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 909 154.8 8.1e-38
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 907 154.5 9.7e-38
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 907 154.5 9.8e-38
CCDS31547.1 OR10Q1 gene_id:219960|Hs108|chr11 ( 319) 902 153.7 1.7e-37
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 902 153.7 1.7e-37
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 900 153.4 2.1e-37
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 897 152.9 2.9e-37
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 894 152.4 3.9e-37
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 894 152.4 4e-37
CCDS42837.1 OR6B3 gene_id:150681|Hs108|chr2 ( 331) 894 152.5 4.1e-37
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 893 152.3 4.5e-37
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 892 152.1 5e-37
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 890 151.9 6.5e-37
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 889 151.7 6.8e-37
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 888 151.5 7.6e-37
CCDS46559.1 OR6B2 gene_id:389090|Hs108|chr2 ( 312) 886 151.2 9.5e-37
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 886 151.2 9.5e-37
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 886 151.2 9.7e-37
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 885 151.0 1.1e-36
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 884 150.9 1.2e-36
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 884 150.9 1.2e-36
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 884 150.9 1.2e-36
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 883 150.7 1.3e-36
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 883 150.7 1.4e-36
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 881 150.4 1.6e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 881 150.4 1.6e-36
>>CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 (303 aa)
initn: 1985 init1: 1985 opt: 1985 Z-score: 1704.0 bits: 323.4 E(32554): 1.4e-88
Smith-Waterman score: 1985; 99.7% identity (100.0% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSFLEIGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 NLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMAYDRYVAICSPLHYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMAYDRYVAICSPLHYP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VIMNQRTRAKLAATSWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFCDSPPVLRLVCADTA
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFCDSPPVLRLVCADTA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFSTCSSHLLVVSLFYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFSTCSSHLLVVSLFYI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKNALSRTVSKALALRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKNALSRTVSKALALRN
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 CIP
:::
CCDS31 CIP
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1887 init1: 1887 opt: 1887 Z-score: 1620.8 bits: 308.0 E(32554): 5.8e-84
Smith-Waterman score: 1887; 95.4% identity (98.0% similar) in 303 aa overlap (1-303:15-317)
10 20 30 40
pF1KE5 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
:::::::::::::::::::::::::: :: ::::::::::::::::
CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAATSWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::
CCDS77 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
::::::::::::::: ::::: ::::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::
CCDS77 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE5 ALSRTVSKALALRNCIP
::::: :.::::::::
CCDS77 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1505 init1: 1463 opt: 1464 Z-score: 1262.7 bits: 241.8 E(32554): 5.2e-64
Smith-Waterman score: 1464; 74.3% identity (90.5% similar) in 296 aa overlap (1-296:15-310)
10 20 30 40
pF1KE5 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
.:::.: ::.:.:::: :::::::::::: ::::::.:: :.:::
CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.::: ::::::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAATSWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
::::::::.::::::::.. . :.:::.::: :: ::::::::.::::::: :.::::::
CCDS77 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
:::::. ::::::..::. :...:.: ...: :::: ::..: ..:...:::.::..:::
CCDS77 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
:::.::::::::: . ::::::.:. : :.::::::: ::.:::::::::: ::.:::
CCDS77 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE5 ALSRTVSKALALRNCIP
::.: . ..:
CCDS77 ALKRLIHRTLGSQKL
310
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 1270 init1: 1207 opt: 1225 Z-score: 1060.3 bits: 204.3 E(32554): 9.8e-53
Smith-Waterman score: 1225; 61.2% identity (84.7% similar) in 294 aa overlap (1-294:15-307)
10 20 30 40
pF1KE5 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
..:.. : :.: ::. ::.:: :::.:: ::. :: .: :..::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNP-EMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPM
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
::::.:::.::. :.::.::::: :.. :::.::.:::::::::: .:::::. ::
CCDS31 YFFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAATSWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
:::.::::.:::: ::::. .: ::. : ::. .::.:....:::: : :.::::
CCDS31 YDRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
:.::::.:: .::...:. :...:.: .:.: ::: :::.: .::.. :: :..::::
CCDS31 DGPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
::::::.:::::: . ::::.:::::.:::.:::.::::::.:::::::::.:::::::.
CCDS31 TCSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKG
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 ALSRTVSKALALRNCIP
:..::...
CCDS31 AVKRTITQKVLQKLDVF
300 310
>>CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1188 init1: 1143 opt: 1172 Z-score: 1015.4 bits: 196.0 E(32554): 3.1e-50
Smith-Waterman score: 1172; 58.1% identity (83.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:15-311)
10 20 30 40
pF1KE5 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
..::..: :.: :: .::.::.:::::: .: .. . :: ::
CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFP-ELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPM
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
:.:: ::: .:..:. ::.:.:: .: .. : :::.:: .::::...:: .:::::..::
CCDS31 YLFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAATSWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
:::..::: ::.::::::. . ::. ::. :. ::::::::.::::::: :..::.::
CCDS31 YDRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
..::::.:::::: ::::::..::::.::.: :::: :: .. ::::.::. :..::::
CCDS31 ETPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
::.::: :.::: . ..::..:::. ::: :::.::.::..::.:::.::::::.:.:
CCDS31 TCASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 ALSRTVSKALALRNCIP
.: . . . :
CCDS31 TLIKLWRRKVILHTF
300 310
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1032 init1: 1000 opt: 1019 Z-score: 885.9 bits: 172.0 E(32554): 5e-43
Smith-Waterman score: 1019; 52.7% identity (79.5% similar) in 298 aa overlap (1-298:14-310)
10 20 30 40
pF1KE5 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPMY
..:: : ...:.::: .::::::.:. :: ::.... .: :.::::
CCDS34 MSANTSMVTEFLLLGFSHL-ADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMY
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 FFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMAY
::::.:: ::::.. : :: .: ::. :: ::: ::.::.:::..:: :::.:::
CCDS34 FFLRTLSALEIGYTSVTVPLLLHHLLTGRRHISRSGCALQMFFFLFFGATECCLLAAMAY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
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CCDS34 DRYAAICEPLRYPLLLSHRVCLQLAGSAWACGVLVGLGHTPFIFSLPFCGPNTIPQFFCE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 SPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFST
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CCDS34 IQPVLQLVCGDTSLNELQIILATALLILCPFGLILGSYGRILVTIFRIPSVAGRRKAFST
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 CSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKNA
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CCDS34 CSSHLIMVSLFYGTALFIYIRPKASYDPATDPLVSLFYAVVTPILNPIIYSLRNTEVKAA
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 LSRTVSKALALRNCIP
:.::..:.. .
CCDS34 LKRTIQKTVPMEI
300 310
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pF1KE5 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPMYFFLRNLSF
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CCDS31 MEFVLLGFSDIPN-LHWMLFSIFLLMYLMILMCNGIIILLIKIHPALQTPMYFFLSNFSL
10 20 30 40 50
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CCDS31 LEICYVTIIIPRMLMDIWTQKGNISLFACATQMCFFLMLGGTECLLLTVMAYDRYVAICK
60 70 80 90 100 110
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CCDS31 PLQYPLVMNHKVCIQLIIASWTITIPVVIGETCQIFLLPFCGTNTINHFFCDIPPILKLA
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CCDS31 CGNIFVNEITVHVVAVVFITVPFLLIVVSYGKIISNILKLSSARGKAKAFSTCSSHLIVV
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pF1KE5 SLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKNALSRTVSKA
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CCDS31 ILFFGAGTITYLQPKPHQFQRMGKLISLFYTILIPTLNPIIYTLRNKDIMVALRKLLAKL
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300
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:
CCDS31 LT
300
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10 20 30 40
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CCDS16 MYFFLANLPFLDMSFTTSIVPQLLANLWGPQKTISYGGCVVQFYISHWLGATECVLLATM
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CCDS16 SYDRYAAICRPLHYTVIMHPQLCLGLALASWLGGLTTSMVGSTLTMLLPLCGNNCIDHFF
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CCDS16 CEMPLIMQLACVDTSLNEMEMYLASFVFVVLPLGLILVSYGHIARAVLKIRSAEGRRKAF
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CCDS16 NTCSSHVAVVSLFYGSIIFMYLQPAKSTSHEQGKFIALFYTVVTPALNPLIYTLRNTEVK
240 250 260 270 280 290
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CCDS16 SAL-----RHMVLENCCGSAGKLAQI
300 310 320
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CCDS11 MLLCFRFGNQSMKRENFTLITDFVFQGFSSFH-EQQITLFGVFLALYILTLAGNIIIVTI
10 20 30 40 50
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CCDS11 IRMDLHLHTPMYFFLSMLSTSETVYTLVILPRMLSSLVGMSQPISLAGCATQMFFFVTFG
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CCDS11 ITNCFLLTAMGYDRYVAICNPLRYMVIMNKRLRIQLVLGACSIGLIVAITQVTSVFRLPF
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CCDS11 CAR-KVPHFFCDIRPVMKLSCIDTTVNEILTLIISVLVLVVPMGLVFISYVLIISTILKI
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CCDS11 ASVEGRKKAFATCASHLTVVIVHYSCASIAYLKPKSENTREHDQLISVTYTVITPLLNPV
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CCDS11 VYTLRNKEVKDALCRAVGGKFS
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CCDS46 MERKNQTAITEFIILGFSNL-NELQFLLFTIFFLTYFCTLGGNILIILTTVTDPHLHTPM
10 20 30 40 50
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]