Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5373
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5373, 299 aa
1>>>pF1KE5373 299 - 299 aa - 299 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0499+/-0.000547; mu= 17.0882+/- 0.033
mean_var=67.6592+/-14.886, 0's: 0 Z-trim(106.4): 85 B-trim: 555 in 1/48
Lambda= 0.155923
statistics sampled from 14414 (14479) to 14414 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.492), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 4.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1912 439.6 3.5e-123
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1366 316.8 3.4e-86
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1351 313.4 3.5e-85
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1324 307.4 2.4e-83
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1310 304.2 2.1e-82
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1306 303.3 3.9e-82
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1305 303.1 4.4e-82
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1305 303.1 4.4e-82
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1305 303.1 4.4e-82
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1258 292.5 6.7e-79
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 858 202.5 8.3e-52
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 764 181.4 2e-45
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 678 162.1 1.3e-39
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 650 155.8 1e-37
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 623 149.7 6.9e-36
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 565 136.6 5.8e-32
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 528 128.3 1.9e-29
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 524 127.4 3.6e-29
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 409 101.5 2.1e-21
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 402 99.9 6.2e-21
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 383 95.7 1.2e-19
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 353 89.0 1.4e-17
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 320 81.5 2.2e-15
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 319 81.3 2.8e-15
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 300 77.0 4.9e-14
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 293 75.4 1.6e-13
NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 149 43.1 0.00095
NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095
NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095
NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095
NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095
NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095
NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095
NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 149 43.1 0.00095
NP_001158194 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 134 39.7 0.0097
NP_001158195 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 134 39.7 0.0097
NP_001158193 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 134 39.7 0.0097
NP_000943 (OMIM: 173393) platelet-activating facto ( 342) 134 39.7 0.0097
>>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1912 init1: 1912 opt: 1912 Z-score: 2332.5 bits: 439.6 E(85289): 3.5e-123
Smith-Waterman score: 1912; 100.0% identity (100.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1358 init1: 1358 opt: 1366 Z-score: 1668.5 bits: 316.8 E(85289): 3.4e-86
Smith-Waterman score: 1366; 69.7% identity (88.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
:... :::: .: :. ..::::.: :.::: :::: :::.::::: ::::::::::: ::
NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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NP_795 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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NP_795 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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NP_795 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
NP_795 VKGEKPSSS
>>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1351 init1: 1351 opt: 1351 Z-score: 1650.3 bits: 313.4 E(85289): 3.5e-85
Smith-Waterman score: 1351; 69.8% identity (86.9% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
:: :: :. ::::: ::.::: :::::::.: : ::. .:::::.::..::.:::.::::
NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
NP_795 AKGQNQSTP
>>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa)
initn: 1324 init1: 1324 opt: 1324 Z-score: 1617.3 bits: 307.4 E(85289): 2.4e-83
Smith-Waterman score: 1324; 69.0% identity (88.4% similar) in 294 aa overlap (1-294:1-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
.:.:.::::::::::::.::.:.: ::.::: :::::::::::::::::.:.. :..:.:
NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
:::..:.::.:: :::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::::.: ::
NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1310 init1: 1310 opt: 1310 Z-score: 1600.5 bits: 304.2 E(85289): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 1310; 66.3% identity (87.5% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
:. :: :: : ::: .::.:: ::::::::: :.: . .::: :.::::::.:::.::::
NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
::.:.:::.::.:::::.:: :.: ::.:.: : :::.:::.::::::..:...:..:::
NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
.:::.::::.:. :.:::::::::::::.::.:::::::::::::::::: :::.: ::
NP_795 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
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pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
NP_795 VKGEKTSSP
>>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1325 init1: 1295 opt: 1306 Z-score: 1595.6 bits: 303.3 E(85289): 3.9e-82
Smith-Waterman score: 1306; 68.0% identity (87.2% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
: :. :: : .:: ::.:: ::::::::: :. :. .::: :.::::::.:::.::::
NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
:.:. ::.:::: :.:..::: .: :.::::.::: :::.::::: ::::::::::: ::
NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
::.:.:::.::.:::::.:: :.: ::.: : : :::::::.:::::::.:..::. :::
NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
::.::.::::.:.::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::.: :.
NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
::: :. :.:.. . ..: :...:... . :::.: :::: :..:::::::::: :.
NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
NP_795 VKGEKPSSP
>>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1305 init1: 1305 opt: 1305 Z-score: 1594.6 bits: 303.1 E(85289): 4.4e-82
Smith-Waterman score: 1305; 66.0% identity (87.5% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
:.:. ::.::.: :.:..:.: .: : ::::.::: : :.::::: ::::::::::: :.
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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250 260 270 280 290
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>>XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1305 init1: 1305 opt: 1305 Z-score: 1594.6 bits: 303.1 E(85289): 4.4e-82
Smith-Waterman score: 1305; 66.0% identity (87.5% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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XP_006 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
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pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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XP_006 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
>>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa)
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NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
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NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
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NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]