Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5373
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5373, 299 aa
1>>>pF1KE5373 299 - 299 aa - 299 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1519+/-0.00123; mu= 16.3718+/- 0.074
mean_var=66.7986+/-14.474, 0's: 0 Z-trim(100.6): 67 B-trim: 392 in 1/47
Lambda= 0.156924
statistics sampled from 6126 (6173) to 6126 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 1.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1912 442.2 2.2e-124
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 1366 318.6 3.7e-87
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 1351 315.2 3.9e-86
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1324 309.1 2.8e-84
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1310 305.9 2.5e-83
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1306 305.0 4.6e-83
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1258 294.1 8.4e-80
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 858 203.6 1.5e-52
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 764 182.3 4.1e-46
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 678 162.8 3e-40
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 650 156.5 2.4e-38
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 623 150.4 1.6e-36
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 565 137.2 1.4e-32
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 528 128.9 4.9e-30
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 524 128.0 9.2e-30
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 409 101.9 6.1e-22
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 402 100.3 1.8e-21
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 383 96.0 3.7e-20
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 367 92.4 4.9e-19
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 353 89.3 4.2e-18
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 320 81.8 7.1e-16
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 319 81.6 9e-16
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 300 77.2 1.6e-14
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 293 75.7 5.1e-14
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1912 init1: 1912 opt: 1912 Z-score: 2346.4 bits: 442.2 E(32554): 2.2e-124
Smith-Waterman score: 1912; 100.0% identity (100.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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CCDS86 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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CCDS86 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1358 init1: 1358 opt: 1366 Z-score: 1678.1 bits: 318.6 E(32554): 3.7e-87
Smith-Waterman score: 1366; 69.7% identity (88.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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CCDS53 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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CCDS53 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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CCDS53 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKPSSS
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1351 init1: 1351 opt: 1351 Z-score: 1659.8 bits: 315.2 E(32554): 3.9e-86
Smith-Waterman score: 1351; 69.8% identity (86.9% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
CCDS86 AKGQNQSTP
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
initn: 1324 init1: 1324 opt: 1324 Z-score: 1626.6 bits: 309.1 E(32554): 2.8e-84
Smith-Waterman score: 1324; 69.0% identity (88.4% similar) in 294 aa overlap (1-294:1-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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CCDS53 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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CCDS53 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
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CCDS53 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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CCDS53 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1310 init1: 1310 opt: 1310 Z-score: 1609.6 bits: 305.9 E(32554): 2.5e-83
Smith-Waterman score: 1310; 66.3% identity (87.5% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
.:::.::::.:. :.:::::::::::::.::.:::::::::::::::::: :::.: ::
CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
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CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKTSSP
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1325 init1: 1295 opt: 1306 Z-score: 1604.7 bits: 305.0 E(32554): 4.6e-83
Smith-Waterman score: 1306; 68.0% identity (87.2% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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CCDS53 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
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CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
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CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
::.::.::::.:.::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::.: :.
CCDS53 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
::: :. :.:.. . ..: :...:... . :::.: :::: :..:::::::::: :.
CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
CCDS53 VKGEKPSSP
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 1266 init1: 1246 opt: 1258 Z-score: 1546.2 bits: 294.1 E(32554): 8.4e-80
Smith-Waterman score: 1258; 65.3% identity (86.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
:. :: :. :::.. ::::: ::::::::: ::::. .:::::.::::::.::::::::
CCDS86 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
..:. :: ::.: :.:..:.::.. :::.:::::::::::.:::: ::::::::::. ::
CCDS86 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
::.:..::.:::::: :.::.:.: : .::: .:..:::::.: :.::::..::: ::::
CCDS86 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
:: ..:::::::: ::.::::::::::::.::..:::: :::::::::::. :::.: ::
CCDS86 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
.:: .:.:.:. : .. :... ..:. .: .: ::::: ..:::.::: .: :.
CCDS86 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 839 init1: 253 opt: 858 Z-score: 1056.7 bits: 203.6 E(32554): 1.5e-52
Smith-Waterman score: 858; 45.2% identity (75.9% similar) in 290 aa overlap (8-293:8-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
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CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]