Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5372
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5372, 299 aa
1>>>pF1KE5372 299 - 299 aa - 299 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2670+/-0.00116; mu= 15.4061+/- 0.069
mean_var=65.1834+/-13.870, 0's: 0 Z-trim(102.6): 70 B-trim: 1330 in 3/44
Lambda= 0.158857
statistics sampled from 6946 (7021) to 6946 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 1.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 1944 454.6 4.1e-128
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 511 126.2 3.1e-29
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 493 122.1 5.5e-28
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 486 120.5 1.7e-27
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 477 118.4 6.9e-27
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 475 117.9 9.2e-27
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 474 117.7 1.1e-26
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 463 115.2 6.8e-26
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 456 113.6 1.9e-25
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 453 112.9 3.1e-25
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 443 110.6 1.5e-24
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 424 106.2 2.9e-23
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 419 105.1 6.8e-23
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 419 105.1 6.9e-23
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 419 105.1 7e-23
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 412 103.5 2.1e-22
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 410 103.0 2.8e-22
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 409 102.8 3.3e-22
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 409 102.8 3.4e-22
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 403 101.4 8.4e-22
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 387 97.8 1.1e-20
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 367 93.2 2.6e-19
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 367 93.2 2.6e-19
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 272 71.4 1e-12
>>CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 (299 aa)
initn: 1944 init1: 1944 opt: 1944 Z-score: 2413.5 bits: 454.6 E(32554): 4.1e-128
Smith-Waterman score: 1944; 99.7% identity (99.7% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQL
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CCDS38 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILLFINELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLFIWLKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 FIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILLFINELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLFIWLKM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFMVPYFLRKFFSQNATIQKEDTLAIQIFSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 RISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFMVPYFLRKFFSQNATIQKEDTLAIQIFSFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 AEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTWQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLSILSFLILYFSH
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 AEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTRQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLSILSFLILYFSH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 CMIKVFLSSLKFHIRRFIFLFFILVIGIYPSGHSLILILGNPKLKQNAKKFLLHSKCCQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 CMIKVFLSSLKFHIRRFIFLFFILVIGIYPSGHSLILILGNPKLKQNAKKFLLHSKCCQ
250 260 270 280 290
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 543 init1: 221 opt: 511 Z-score: 638.3 bits: 126.2 E(32554): 3.1e-29
Smith-Waterman score: 511; 35.9% identity (62.8% similar) in 309 aa overlap (8-297:8-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQL
....:. :: :::..: .: .::: . .: ..:. :.... ::. ::.: :
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIIL-L
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 FIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILL--------FINELELWLATWLGVFYCAKVASVRH
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CCDS58 CIILTDS---FLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE5 PLFIWLKMRISKLVPWMILGSLLY-----VSMICVF--HSKYAGFMVPYFLRKFFSQNAT
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CCDS58 PTFLWLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRK---
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 IQKEDTLAIQIFSFVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTWQMRNTVAGSRVPGRGAPIS
.. . :.... . . ::.. : . :::::::::: :: .. ..:: : :
CCDS58 -KRSEYYLIHVLGTLW-YLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 ALLSILSFL---ILYFSHCMIKVFLSSL-KFHIRRFIFLFFILVIGIYPSGHSLILILGN
:. ::::. .::: .: : . : : .. ..: . . .::.:::.::::::
CCDS58 AIRIILSFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTM---FYPAGHSFILILGN
240 250 260 270 280
290
pF1KE5 PKLKQNAKKFLLHSKCCQ
::::. :.. .:
CCDS58 SKLKQT---FVVMLRCESGHLKPGSKGPIFS
290 300 310
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 374 init1: 167 opt: 493 Z-score: 615.9 bits: 122.1 E(32554): 5.5e-28
Smith-Waterman score: 493; 31.5% identity (65.4% similar) in 292 aa overlap (10-292:10-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQL
..::: .: .::. :..: .:: .: .:.::.: .::.:. ::.::: :
CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILLFI----NELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLFI
:. :.... . . . :. :. :.: .:.:: :...: :... ::::.
CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKMRISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAG----FMVPYFLRKFFSQNATIQKEDTL
:.: ::.... :..:: .. .: . .. . : : . .. . ..: .
CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 AIQIFSFVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTWQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLSILS
. ..: .: . .:. . :.. .:::.:: :: .:. ...: : :. : . :: ...:
CCDS86 STKLFLNLATL-LPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVIS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FLILYFSHCMIKVFLSSLKFHIRRFIFLFFILVIG-IYPSGHSLILILGNPKLKQNAKKF
::.:.... . .. .: : . . ..: :. ::::.::.:::::: ::.. . :
CCDS86 FLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKV
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LLHSKCCQ
.
CCDS86 IWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
>>CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 (323 aa)
initn: 412 init1: 240 opt: 486 Z-score: 607.1 bits: 120.5 E(32554): 1.7e-27
Smith-Waterman score: 494; 33.7% identity (64.7% similar) in 300 aa overlap (4-291:14-310)
10 20 30 40
pF1KE5 MLESHLIIYFLLAV--IQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLL
:.. . : :.: :. . ::. .:.:... : . . . . : ..
CCDS43 MATVNTDATDKDISKFKVTFTLVVSGIECITGILGSGFITAIYGAEWARGKTLPTGDRIM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 SCLAVSRIFLQLFIFYVNVIVIFF-IEFIMCSANC---AILLFINELELWLATWLGVFYC
:. ::..::.... :.. ..: : . . :. .: .:.:. .::.:.:: ::::
CCDS43 LMLSFSRLLLQIWMMLENIFSLLFRIVYNQNSVYILFKVITVFLNHSNLWFAAWLKVFYC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 AKVASVRHPLFIWLKMRISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFMVPYFLRKFF--SQ
..:. ::::. .: .: :.::.. :.: ::. : . : : : .. :.
CCDS43 LRIANFNHPLFFLMKRKIIVLMPWLLRLSVL-VSLSFSFPLSRDVFNV-YVNSSIPIPSS
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE5 NATIQK---EDTLAIQIFSFVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTWQMRNTVAGSRVPG
:.: .: : ... .: . . :::..:..:. :::.:: ::: .: ....::: :.
CCDS43 NSTEKKYFSETNMVNLVFFYNMGIFVPLIMFILAATLLILSLKRHTLHMGSNATGSRDPS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 RGAPISALLSILSFLILYFSHCMIKVFLSSLK-FHIRRFIFLFFILVIGIYPSGHSLILI
: :.:. . :::::. . : .:::. . : .. .... ::.:::. ::
CCDS43 MKAHIGAIKATSYFLILYIFNA-IALFLSTSNIFDTYSSWNILCKIIMAAYPAGHSVQLI
240 250 260 270 280 290
280 290
pF1KE5 LGNPKLKQNAKKFLLHSKCCQ
:::: :.. :.:
CCDS43 LGNPGLRRAWKRFQHQVPLYLKGQTL
300 310 320
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 483 init1: 228 opt: 477 Z-score: 596.2 bits: 118.4 E(32554): 6.9e-27
Smith-Waterman score: 477; 32.8% identity (63.2% similar) in 302 aa overlap (8-297:8-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQL
::..: . .. .::. ::.::.:: :: .:.: .. .:..: ::.::: :
CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 FI----FYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILLFINELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLFI
: :.. .. . . .. : .. : :. ::... :..:: :.:.. ::.:.
CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE5 WLKMRISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSK---YAGFMVPY---FLRKF-FSQNATIQKE
:::..:.:.. ..:::.: .: : .. : : : . . :: :. :.
CCDS86 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGTFKQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 DTLAIQIFSFVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTWQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLS
:: . .. ::... :.. .::.::: ::: :.: ..: : :. : . :. .
CCDS86 LTLNLGVM-------VPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKA
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 ILSFLILYFSHCMI-KVFLSSLKFHIRRFIFLFFILVIGIYPSGHSLILILGNPKLKQNA
.. ::.: . . . :. :: . ...... .: :.::.::.:::.:: ::..
CCDS86 VIIFLLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAF
240 250 260 270 280 290
290
pF1KE5 KKFLLHSKCCQ
:.: ::
CCDS86 LKMLRFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 456 init1: 286 opt: 475 Z-score: 593.9 bits: 117.9 E(32554): 9.2e-27
Smith-Waterman score: 475; 30.9% identity (65.1% similar) in 301 aa overlap (2-293:1-294)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLESHLIIYFLLAVI-QFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQ
.:: : : :..: .:..: ..::.::..: :: ...:... .: :: ::.::: :
CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LFIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILLFI----NELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLF
:. ... .. ... ... :..: :...::::: ...:: :.:: : :
CCDS86 WEILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 IWLKMRISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFMVPYFLRKFFSQNATIQKEDTLAIQ
..:: :..:.. ..::.:... . . . . . . :. . : ... .:....
CCDS86 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNT-TWNFSMSDFETFSVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IFSFVAEFSV-PLLIFLFAVLLLIFSLGRHTWQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLSILSFL
. .. ::. :. . ... ::::::: .: .:. . : : : . .:: ..:::
CCDS86 VKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ILY--FSHCMIKVFLSSLKFHIRRFIFLFFILVIGIY-PSGHSLILILGNPKLKQNAKKF
..: : :.. ..: : . .. .. .::.. ::.::..::::: ::.: :
CCDS86 LFYASFFLCVLISWISEL---YQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQA---F
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LLHSKCCQ
::
CCDS86 LLVAAKVWAKR
300
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 349 init1: 141 opt: 474 Z-score: 592.6 bits: 117.7 E(32554): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 483; 32.3% identity (63.3% similar) in 300 aa overlap (8-296:8-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQL
:...: . .:.:::. :: :..:: :: ::..:.. .: .:. :...:: : .
CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICL-I
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 FIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILLFI-----NELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLF
.. :: ::: . .. . . :..: : :..:..: :.::: :.:: ::::
CCDS86 SVMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 IWLKMRISKLVPWMILGSL---LYVSMIC--VFHSKYAGFMVPYFLRKFFSQNATIQKED
.::: .:. .: :..:: . : ::.: :. : . :.. . . .
CCDS86 LWLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TLAIQIFSFVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTWQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLSI
. .:.. : ::... :.. .::. :: ::: :.. ..::: :. . . :. ..
CCDS86 FEPLTLFNLFA--IVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE5 LSFLILYFSHCMIKVFLSSLKFHIRRFIFLFFILVIGI-YPSGHSLILILGNPKLKQNAK
::....: . . ..... . . . . : . .: :: :::::::. : ::.:.
CCDS86 TSFIFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFV
240 250 260 270 280 290
290
pF1KE5 KFLLHSKCCQ
..: :
CCDS86 RMLTCRKIACMI
300
>>CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 (338 aa)
initn: 423 init1: 202 opt: 463 Z-score: 578.4 bits: 115.2 E(32554): 6.8e-26
Smith-Waterman score: 463; 30.9% identity (65.4% similar) in 301 aa overlap (4-293:30-327)
10 20 30
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]