Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5359
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5359, 307 aa
1>>>pF1KE5359 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6401+/-0.000989; mu= 13.3043+/- 0.059
mean_var=65.9190+/-13.400, 0's: 0 Z-trim(103.6): 77 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.157968
statistics sampled from 7418 (7495) to 7418 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3753.1 UCP1 gene_id:7350|Hs108|chr4 ( 307) 1997 464.2 5.6e-131
CCDS8228.1 UCP2 gene_id:7351|Hs108|chr11 ( 309) 1191 280.5 1.1e-75
CCDS8229.1 UCP3 gene_id:7352|Hs108|chr11 ( 312) 1182 278.5 4.7e-75
CCDS44677.1 UCP3 gene_id:7352|Hs108|chr11 ( 275) 1035 244.9 5.1e-65
CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 290) 597 145.1 5.9e-35
CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 322) 597 145.1 6.5e-35
CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 325) 597 145.1 6.6e-35
CCDS31967.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 291) 594 144.4 9.6e-35
CCDS11059.1 SLC25A11 gene_id:8402|Hs108|chr17 ( 314) 586 142.6 3.6e-34
CCDS11786.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 ( 287) 562 137.2 1.5e-32
CCDS43470.1 SLC25A27 gene_id:9481|Hs108|chr6 ( 323) 507 124.6 9.8e-29
CCDS66539.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 240) 488 120.3 1.5e-27
CCDS54069.1 SLC25A11 gene_id:8402|Hs108|chr17 ( 263) 475 117.3 1.3e-26
CCDS59301.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 ( 296) 420 104.8 8.4e-23
CCDS162.1 SLC25A34 gene_id:284723|Hs108|chr1 ( 304) 385 96.8 2.2e-20
CCDS13758.1 SLC25A1 gene_id:6576|Hs108|chr22 ( 311) 372 93.9 1.7e-19
CCDS33327.1 SLC25A12 gene_id:8604|Hs108|chr2 ( 678) 355 90.1 5.1e-18
CCDS2779.1 SLC25A20 gene_id:788|Hs108|chr3 ( 301) 345 87.7 1.2e-17
CCDS11138.1 SLC25A35 gene_id:399512|Hs108|chr17 ( 295) 343 87.2 1.6e-17
CCDS82067.1 SLC25A35 gene_id:399512|Hs108|chr17 ( 300) 343 87.2 1.6e-17
CCDS5645.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 675) 332 84.9 1.9e-16
CCDS55130.1 SLC25A13 gene_id:10165|Hs108|chr7 ( 676) 332 84.9 1.9e-16
CCDS56431.1 SLC25A27 gene_id:9481|Hs108|chr6 ( 245) 318 81.5 7.1e-16
CCDS76020.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 353) 302 77.9 1.2e-14
CCDS74176.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 ( 406) 293 75.9 5.8e-14
CCDS14005.1 SLC25A17 gene_id:10478|Hs108|chr22 ( 307) 270 70.6 1.7e-12
CCDS786.1 SLC25A24 gene_id:29957|Hs108|chr1 ( 458) 269 70.5 2.8e-12
CCDS41361.1 SLC25A24 gene_id:29957|Hs108|chr1 ( 477) 269 70.5 2.9e-12
CCDS9959.1 SLC25A47 gene_id:283600|Hs108|chr14 ( 308) 257 67.7 1.3e-11
CCDS6300.1 SLC25A32 gene_id:81034|Hs108|chr8 ( 315) 257 67.7 1.4e-11
CCDS32882.1 SLC25A23 gene_id:79085|Hs108|chr19 ( 468) 259 68.2 1.4e-11
CCDS82138.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 336) 248 65.6 5.9e-11
CCDS11482.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 351) 248 65.6 6.2e-11
CCDS45700.1 SLC25A39 gene_id:51629|Hs108|chr17 ( 359) 248 65.6 6.3e-11
CCDS2685.1 SLC25A38 gene_id:54977|Hs108|chr3 ( 304) 246 65.1 7.5e-11
CCDS3733.1 SLC25A31 gene_id:83447|Hs108|chr4 ( 315) 245 64.9 9e-11
CCDS74817.1 SLC25A1 gene_id:6576|Hs108|chr22 ( 208) 242 64.2 1e-10
>>CCDS3753.1 UCP1 gene_id:7350|Hs108|chr4 (307 aa)
initn: 1997 init1: 1997 opt: 1997 Z-score: 2464.9 bits: 464.2 E(32554): 5.6e-131
Smith-Waterman score: 1997; 100.0% identity (100.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGECPTSSVIRYKGVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGECPTSSVIRYKGVLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPSLGSKILAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 TITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPSLGSKILAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKPRYTGTYNAYRIIATTEGLTGLWKGTTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKPRYTGTYNAYRIIATTEGLTGLWKGTTPN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSSPVDVVKTRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSSPVDVVKTRF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 INSPPGQYKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMFVCFEQLKRELSKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 INSPPGQYKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMFVCFEQLKRELSKSR
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QTMDCAT
:::::::
CCDS37 QTMDCAT
>>CCDS8228.1 UCP2 gene_id:7351|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1221 init1: 656 opt: 1191 Z-score: 1472.2 bits: 280.5 E(32554): 1.1e-75
Smith-Waterman score: 1191; 59.7% identity (85.0% similar) in 300 aa overlap (1-296:1-298)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGEC--PT--SSVIRYK
: :. :.:: :: :....:: :::.::.:::::::::::::.::: :. .. .:.
CCDS82 MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESQGPVRATASAQYR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GVLGTITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPSLGSK
::.::: ..:.::: .::.:: ::::::.: ::.::::::.:..: : :.: : :.::.
CCDS82 GVMGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHA-SIGSR
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 ILAGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKPRYTGTYNAYRIIATTEGLTGLWKG
.::: :::..:: ..:::.:::::.:::.. : . :: .: :::. :: ::. :::::
CCDS82 LLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGR-RYQSTVNAYKTIAREEGFRGLWKG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TTPNLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSSPVDVV
:.::. :..:.::.:::::::.:.:..: :...::.:::..::. ::::.:...::::::
CCDS82 TSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDLPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 KTRFINSPPGQYKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMFVCFEQLKREL
:::..:: :::.:. .::. .. .::: ::.::..:::::::::::.::: .::::: :
CCDS82 KTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRAL
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 SKSRQTMDCAT
CCDS82 MAACTSREAPF
300
>>CCDS8229.1 UCP3 gene_id:7352|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1178 init1: 662 opt: 1182 Z-score: 1461.0 bits: 278.5 E(32554): 4.7e-75
Smith-Waterman score: 1182; 58.7% identity (81.8% similar) in 303 aa overlap (1-298:1-303)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGE---CPTSSVIRYKG
: :: ::: ::..:....:: :::.::..::::::::::::.::: :. ...:.:
CCDS82 MVGLKPSDVPPTMAVKFLGAGTAACFADLVTFPLDTAKVRLQIQGENQAVQTARLVQYRG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VLGTITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPSLGSKI
::::: ..:.::: . :.:: ::::::.: ::.::::::.:.. : :: ..:
CCDS82 VLGTILTMVRTEGPCSPYNGLVAGLQRQMSFASIRIGLYDSVKQVYTPKGADNSSLTTRI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKP--RYTGTYNAYRIIATTEGLTGLWK
::: :::..:: .:::.:::::.::. :: . .:.::..::: :: ::. ::::
CCDS82 LAGCTTGAMAVTCAQPTDVVKVRFQASIHLGPSRSDRKYSGTMDAYRTIAREEGVRGLWK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GTTPNLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSSPVDV
:: ::.::..:.::.:.::::..:: .. ..:.:. :::.:::. ::::::...:::::
CCDS82 GTLPNIMRNAIVNCAEVVTYDILKEKLLDYHLLTDNFPCHFVSAFGAGFCATVVASPVDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VKTRFINSPPGQYKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMFVCFEQLKRE
::::..::::::: : .: .:. ..::::::.::..:::::::::::.::: .:::::
CCDS82 VKTRYMNSPPGQYFSPLDCMIKMVAQEGPTAFYKGFTPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE5 LSKSRQTMDCAT
: :
CCDS82 LMKVQMLRESPF
310
>>CCDS44677.1 UCP3 gene_id:7352|Hs108|chr11 (275 aa)
initn: 1044 init1: 528 opt: 1035 Z-score: 1280.8 bits: 244.9 E(32554): 5.1e-65
Smith-Waterman score: 1035; 57.1% identity (81.1% similar) in 275 aa overlap (1-270:1-275)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGE---CPTSSVIRYKG
: :: ::: ::..:....:: :::.::..::::::::::::.::: :. ...:.:
CCDS44 MVGLKPSDVPPTMAVKFLGAGTAACFADLVTFPLDTAKVRLQIQGENQAVQTARLVQYRG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 VLGTITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPSLGSKI
::::: ..:.::: . :.:: ::::::.: ::.::::::.:.. : :: ..:
CCDS44 VLGTILTMVRTEGPCSPYNGLVAGLQRQMSFASIRIGLYDSVKQVYTPKGADNSSLTTRI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LAGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKP--RYTGTYNAYRIIATTEGLTGLWK
::: :::..:: .:::.:::::.::. :: . .:.::..::: :: ::. ::::
CCDS44 LAGCTTGAMAVTCAQPTDVVKVRFQASIHLGPSRSDRKYSGTMDAYRTIAREEGVRGLWK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GTTPNLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSSPVDV
:: ::.::..:.::.:.::::..:: .. ..:.:. :::.:::. ::::::...:::::
CCDS44 GTLPNIMRNAIVNCAEVVTYDILKEKLLDYHLLTDNFPCHFVSAFGAGFCATVVASPVDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VKTRFINSPPGQYKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMFVCFEQLKRE
::::..::::::: : .: .:. ..::::::.::
CCDS44 VKTRYMNSPPGQYFSPLDCMIKMVAQEGPTAFYKG
250 260 270
300
pF1KE5 LSKSRQTMDCAT
>>CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (290 aa)
initn: 549 init1: 203 opt: 597 Z-score: 741.0 bits: 145.1 E(32554): 5.9e-35
Smith-Waterman score: 597; 34.9% identity (70.8% similar) in 281 aa overlap (21-294:13-287)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGECPTSSV--IRYKGV
:.:. .:. :::.: .:.::::::. . :.:.:.
CCDS76 MSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQSIDARFKEIKYRGM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LGTITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPSLGSKIL
. .. . : :: . ::::. .: :: : ....::.:........ : .: ...
CCDS76 FHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFVERLEDE-TLLINMI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKPRYTGTYNAYRIIATTEGLTGLWKGTT
:...: .. :..::.:.:.:.:::. : .. . :.. : :: :::.:..
CCDS76 CGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSL--FQGSMIGSFID---IYQQEGTRGLWRGVV
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PNLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSSPVDVVKT
:. .:..:. .:: .::. :. .. .....: . :.::.. :. .. :.:::::.:
CCDS76 PTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGALASNPVDVVRT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 RFINSPP--GQ---YKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMFVCFEQLK
:..:. :. ::.. . .:.. .:: :..::. :..:::: ::.:.:. .::::
CCDS76 RMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNIIFFITYEQLK
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE5 RELSKSRQTMDCAT
:
CCDS76 RLQI
290
>>CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (322 aa)
initn: 549 init1: 203 opt: 597 Z-score: 740.3 bits: 145.1 E(32554): 6.5e-35
Smith-Waterman score: 597; 34.9% identity (70.8% similar) in 281 aa overlap (21-294:45-319)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGECPTS
:.:. .:. :::.: .:.::::::. .
CCDS14 KFATAAVIHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQSIDA
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100
pF1KE5 SV--IRYKGVLGTITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKE
:.:.:.. .. . : :: . ::::. .: :: : ....::.:........ :
CCDS14 RFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFVERLE
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 TAPSLGSKILAGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKPRYTGTYNAYRIIATTE
.: ... :...: .. :..::.:.:.:.:::. : .. . :.. : :
CCDS14 DE-TLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSL--FQGSMIGSFID---IYQQE
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 GLTGLWKGTTPNLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATA
: :::.:..:. .:..:. .:: .::. :. .. .....: . :.::.. :. ..
CCDS14 GTRGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGAL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 MSSPVDVVKTRFINSPP--GQ---YKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNV
:.:::::.::..:. :. ::.. . .:.. .:: :..::. :..:::: ::.
CCDS14 ASNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNI
250 260 270 280 290 300
290 300
pF1KE5 IMFVCFEQLKRELSKSRQTMDCAT
:.:. .:::::
CCDS14 IFFITYEQLKRLQI
310 320
>>CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX (325 aa)
initn: 549 init1: 203 opt: 597 Z-score: 740.2 bits: 145.1 E(32554): 6.6e-35
Smith-Waterman score: 597; 34.9% identity (70.8% similar) in 281 aa overlap (21-294:48-322)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGECPTS
:.:. .:. :::.: .:.::::::. .
CCDS14 TAAVIVSGHQKSTTVSHEMSGLNWKPFVYGGLASIVAEFGTFPVDLTKTRLQVQGQSIDA
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100
pF1KE5 SV--IRYKGVLGTITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKE
:.:.:.. .. . : :: . ::::. .: :: : ....::.:........ :
CCDS14 RFKEIKYRGMFHALFRICKEEGVLALYSGIAPALLRQASYGTIKIGIYQSLKRLFVERLE
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 TAPSLGSKILAGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKPRYTGTYNAYRIIATTE
.: ... :...: .. :..::.:.:.:.:::. : .. . :.. : :
CCDS14 DE-TLLINMICGVVSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQGSL--FQGSMIGSFID---IYQQE
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 GLTGLWKGTTPNLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATA
: :::.:..:. .:..:. .:: .::. :. .. .....: . :.::.. :. ..
CCDS14 GTRGLWRGVVPTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGMMGDTILTHFVSSFTCGLAGAL
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 MSSPVDVVKTRFINSPP--GQ---YKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNV
:.:::::.::..:. :. ::.. . .:.. .:: :..::. :..:::: ::.
CCDS14 ASNPVDVVRTRMMNQRAIVGHVDLYKGTVDGILKMWKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNI
260 270 280 290 300 310
290 300
pF1KE5 IMFVCFEQLKRELSKSRQTMDCAT
:.:. .:::::
CCDS14 IFFITYEQLKRLQI
320
>>CCDS31967.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 (291 aa)
initn: 581 init1: 192 opt: 594 Z-score: 737.3 bits: 144.4 E(32554): 9.6e-35
Smith-Waterman score: 594; 34.6% identity (68.9% similar) in 283 aa overlap (21-294:13-288)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGECPTSSV--IRYKGV
:.:. :. :::.: .:.:::.::. .. :::.:.
CCDS31 MSALNWKPFVYGGLASITAECGTFPIDLTKTRLQIQGQTNDAKFKEIRYRGM
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LGTITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPSLGSKIL
: ... . . :: ::::. .. :: : ....:: :....... : .: ...
CCDS31 LHALVRIGREEGLKALYSGIAPAMLRQASYGTIKIGTYQSLKRLFIERPEDE-TLPINVI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSH-LHGIKPRYTGTYNAYRIIATTEGLTGLWKGT
:. .: .. :..::.:.:.:.::::. ..: : . . : :: :::::.
CCDS31 CGILSGVISSTIANPTDVLKIRMQAQSNTIQG------GMIGNFMNIYQQEGTRGLWKGV
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TPNLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSSPVDVVK
. . .:..:. .:: .::. :. .. .....: : :..:.. :. .. :.:::::.
CCDS31 SLTAQRAAIVVGVELPVYDITKKHLILSGLMGDTVYTHFLSSFTCGLAGALASNPVDVVR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TRFINSP---PGQ---YKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMFVCFEQ
::..:. :. : .. .: .... ::: :..::. :..:::: ::.:.:: .::
CCDS31 TRMMNQRVLRDGRCSGYTGTLDCLLQTWKNEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNIIFFVTYEQ
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE5 LKRELSKSRQTMDCAT
::.
CCDS31 LKKLDL
290
>>CCDS11059.1 SLC25A11 gene_id:8402|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 581 init1: 220 opt: 586 Z-score: 726.9 bits: 142.6 E(32554): 3.6e-34
Smith-Waterman score: 586; 32.3% identity (69.0% similar) in 303 aa overlap (2-298:10-309)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGECPTSSV
::. .. .:... .:.:. : :.. ::: .: :.:..:: .
CCDS11 MAATASAGAGGIDGKPRTSPKSVKFLFGGLAGMGATVFVQPLDLVKNRMQLSGEGAKTR-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IRYKGVLGTITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPS
.:: . ..:...:.:: .:.:: ::: :: . .. :.:.: .. : ::.. : :.
CCDS11 -EYKTSFHALTSILKAEGLRGIYTGLSAGLLRQATYTTTRLGIYTVLFERLTGADGTPPG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LGSKILAGLTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHLHGIKPR-YTGTYNAYRIIATTEGLT
. : . :.:.:....:.: :.::. .:. :...: . . : : ...:: :. ::.
CCDS11 FLLKAVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIRMTADGRLPADQRRGYKNVFNALIRITREEGVL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 GLWKGTTPNLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSS
::.: :.. :.:..: ..:..:. :. .. .. ..:.. ::. ...:.:. .:: :
CCDS11 TLWRGCIPTMARAVVVNAAQLASYSQSKQFLLDSGYFSDNILCHFCASMISGLVTTAASM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE5 PVDVVKTRF-----INSPPGQYKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMF
:::..:::. :.. : .::. . .:: :: ...::..: . ::: .:. :
CCDS11 PVDIAKTRIQNMRMIDGKP-EYKNGLDVLFKVVRYEGFFSLWKGFTPYYARLGPHTVLTF
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 VCFEQLKRELSKSRQTMDCAT
. .::... ..
CCDS11 IFLEQMNKAYKRLFLSG
300 310
>>CCDS11786.1 SLC25A10 gene_id:1468|Hs108|chr17 (287 aa)
initn: 508 init1: 192 opt: 562 Z-score: 697.9 bits: 137.2 E(32554): 1.5e-32
Smith-Waterman score: 562; 35.4% identity (68.9% similar) in 280 aa overlap (18-296:11-281)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGGLTASDVHPTLGVQLFSAGIAACLADVITFPLDTAKVRLQVQGECPTSSVIRYKGVLG
. .:.:.: : : ::: ::.::.: : .. . . :
CCDS11 MAAEARVSRWYFGGLASCGAACCTHPLDLLKVHLQTQQE------VKLR-MTG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 TITAVVKTEGRMKLYSGLPAGLQRQISSASLRIGLYDTVQEFLTAGKETAPSLGSKILAG
::.:.: . ::::: :.: ::.. . :...:.::.. .. :.. . :.: :
CCDS11 MALRVVRTDGILALYSGLSASLCRQMTYSLTRFAIYETVRDRVAKGSQGPLPFHEKVLLG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE5 LTTGGVAVFIGQPTEVVKVRLQAQSHL-HGIKPRYTGTYNAYRIIATTEGLTGLWKGTTP
..: .. :.: :...:.::.: . .: .: . :. . .. .: ::: :..:.:
CCDS11 SVSGLAGGFVGTPADLVNVRMQNDVKLPQGQRRNYAHALDGLYRVAREEGLRRLFSGATM
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NLMRSVIINCTELVTYDLMKEAFVKNNILADDVPCHLVSALIAGFCATAMSSPVDVVKTR
:..... .: :: :. .... :.:.. :.:...::: ::: . .:.::.:::
CCDS11 ASSRGALVTVGQLSCYDQAKQLVLSTGYLSDNIFTHFVASFIAGGCATFLCQPLDVLKTR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FINSPPGQYKSVPNCAMKVFTNEGPTAFFKGLVPSFLRLGSWNVIMFVCFEQLKRELSKS
..:: :.:..: .::... .. :: ::.:::::. .:: .:. :: .:::....
CCDS11 LMNSK-GEYQGVFHCAVET-AKLGPLAFYKGLVPAGIRLIPHTVLTFVFLEQLRKNFGIK
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE5 RQTMDCAT
CCDS11 VPS
307 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 00:05:45 2016 done: Tue Nov 8 00:05:46 2016
Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]