Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5358
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5358, 307 aa
1>>>pF1KE5358 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8372+/- 0.001; mu= 19.0053+/- 0.060
mean_var=78.4663+/-17.253, 0's: 0 Z-trim(103.9): 44 B-trim: 35 in 1/49
Lambda= 0.144788
statistics sampled from 7594 (7628) to 7594 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 1.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 2081 444.4 5.2e-125
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 801 177.0 1.6e-44
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 595 134.0 1.4e-31
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 536 121.7 7.5e-28
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 533 121.0 1.1e-27
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 526 119.6 3.1e-27
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 522 118.7 5.7e-27
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 520 118.3 7.5e-27
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 512 116.7 2.4e-26
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 492 112.5 4.3e-25
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 473 108.5 6.7e-24
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 463 106.4 2.8e-23
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 457 105.1 6.7e-23
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 455 104.7 8.9e-23
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 453 104.4 1.3e-22
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 449 103.5 2.1e-22
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 443 102.3 5.3e-22
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 432 99.9 2.5e-21
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 419 97.2 1.7e-20
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 397 92.7 4.3e-19
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 385 90.1 2.3e-18
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 383 89.7 3e-18
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 366 86.2 3.7e-17
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 353 83.4 2.3e-16
>>CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 (307 aa)
initn: 2081 init1: 2081 opt: 2081 Z-score: 2357.8 bits: 444.4 E(32554): 5.2e-125
Smith-Waterman score: 2081; 100.0% identity (100.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETYY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLISFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLISFL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQLLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQLLLL
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 ARGFWVA
:::::::
CCDS43 ARGFWVA
>>CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 (318 aa)
initn: 813 init1: 473 opt: 801 Z-score: 912.6 bits: 177.0 E(32554): 1.6e-44
Smith-Waterman score: 801; 42.0% identity (71.0% similar) in 293 aa overlap (9-294:20-307)
10 20 30 40
pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILI
.: .. :: :..::.::::. .:: ::. ::: : .:.
CCDS58 MNGDHMVLGSSVTDKKAIILVTILLLLRLVAIAGNGFITAALGVEWVLRRMLLPCDKLLV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 SLGASRFCLQLVGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCV
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CCDS58 SLGASRFCLQSVVMGKTIYVFLHPMAFPYNPVLQFLAFQWDFLNAATLWSSTWLSVFYCV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 KIANITHSTFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMT
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CCDS58 KIATFTHPVFFWLKHKLSGWLPWMLFSSVGLSSFTTILFFIGNHRMYQNYL-R----NHL
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 YKWN-------TRIETYYFPSLKLVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQ
:: . : .:. ::.. :..: .::.. ..:::.:: :: .. . ...
CCDS58 QPWNVTGDSIRSYCEKFYLFPLKMITWTMPTAVFFICMILLITSLGRHRKKALLTTSGFR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 DPSTQAHTRALKSLISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFI
.::.::: .:: .:.:: .:. ::::...:: .. . .: :. ..::: .:::.:
CCDS58 EPSVQAHIKALLALLSFAMLFISYFLSLVFSAAGIFPPLDFKFWVWESVIYLCAAVHPII
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KE5 LIFSNLKLRSVFSQLLLLARGFWVA
:.::: .::.:.
CCDS58 LLFSNCRLRAVLKSRRSSRCGTP
300 310
>>CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 (291 aa)
initn: 577 init1: 258 opt: 595 Z-score: 680.6 bits: 134.0 E(32554): 1.4e-31
Smith-Waterman score: 595; 35.0% identity (65.3% similar) in 294 aa overlap (5-294:6-287)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQ
::.::.... : :: :. ...:: :::::::. ::.:.:::::::: ::::::
CCDS57 MIPIQLTVFFMIIYVLESLTIIVQSSLIVAVLGREWLQVRRLMPVDMILISLGISRFCLQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 LVGTVHNF--YYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHS
.. ..:: :.. . : . . . :.:.: :::. : :.:..:.:....::
CCDS57 WASMLNNFCSYFNLNYVLCN-------LTITWEFFNILTFWLNSLLTVFYCIKVSSFTHH
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 TFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIE
::::.::. ::.::::..:. . . :: : . .... : : . ..:
CCDS57 IFLWLRWRILRLFPWILLGSLMITCVTIIPSAIGNYIQIQLLTMEHLPRNSTV--TDKLE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TYYFPSLK--LVIWSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKS
... ... : ::: .::.: ..:. :: :...::.. . .:: .:. ::.:
CCDS57 NFHQYQFQAHTVALVIPFILFLASTIFLMASL---TKQIQHHSTGHCNPSMKARFTALRS
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFS
: ..:... ::...: . . . : :. :: : .: :..:. :. ..
CCDS57 LAVLFIVFTSYFLTILITIIGTLFDKRCWLWVWEAFVYAFILMHSTSLMLSSPTLKRILK
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE5 QLLLLARGFWVA
CCDS57 GKC
290
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 537 init1: 290 opt: 536 Z-score: 613.5 bits: 121.7 E(32554): 7.5e-28
Smith-Waterman score: 536; 36.0% identity (63.3% similar) in 278 aa overlap (19-291:19-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL
.:: .:.:: :: .:.. .. .:.:: ::. ::.::
CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL
: . : :. : ... . : . : ..:: . ::. . ::.:. : ::
CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIR-KFSGNMTYKWNTRIETY
:.:::. . :.::: :..: .:.: : . .: .. : . :.: :. :..
CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATE-NLNADFRFCVKAKRKTNLT--WSCRVNKT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YFPSLKLVI---WSIPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSL
: :: . .:: : :.:..::: ::::: .::: .. . .::::.::.::::..
CCDS86 QHASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCI-SVHPFILIFSNLKLRSVFS
::::.:. .::..: ..... .... . .. : : : ::::..: :::
CCDS86 ISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASL
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 QLLLLARGFWVA
CCDS86 KVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 522 init1: 301 opt: 533 Z-score: 610.2 bits: 121.0 E(32554): 1.1e-27
Smith-Waterman score: 533; 33.3% identity (66.7% similar) in 306 aa overlap (1-304:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL
: .:. :....:.. .:: .::::::: .::. . .:.:::::. ::.::
CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL
: .. .:.. :.... .. .. : : :....:: : ::... .:::::.: :.
CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETYY
::: .. . .:::: :::.::.. : .. ... . :.:.:...
CCDS86 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVP---KNDDMWYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGT
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pF1KE5 FPSLKLVIWS-IPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLISF
: .: : . .:: . :.:..::. :: :::.... .. ...::::.:: ::.:..: :
CCDS86 FKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LILYALSF-LSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQLL
:.: . . . :.. .. .: . . .:.. . : : ::::..: ::: .: ..:
CCDS86 LLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKML
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 LLARGFWVA
... :
CCDS86 RFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 471 init1: 235 opt: 526 Z-score: 602.4 bits: 119.6 E(32554): 3.1e-27
Smith-Waterman score: 526; 34.1% identity (66.6% similar) in 311 aa overlap (5-306:1-301)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSL----LGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRF
. .:. ..:: : . .: :::::.:: . ::.. .. :.:: .:..::
CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 CLQLVGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITH
: : . :.: .. . ... : . : .: . :. . ::... .::::...
CCDS53 GLLWV-LLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSN
60 70 80 90 100 110
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pF1KE5 STFLWLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVNYPVYQEFL-IRKFSGNMTYKWNTR
:: :: : . . .::: .: :. :: .: ..:.. ..: :::: :. .
CCDS53 FIFLHLKRRVKSVILVMLLGPLL--FLACHLFV-IN---MNEIVRTKEFEGNMT--WKIK
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 IET-YYFPSLKLVIWS--IPFSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRA
... .:: .. ... . .::.. :.:.:::: :: .: ..:: .:.. :::::..: .:
CCDS53 LKSAMYFSNMTVTMVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LKSLISFLILYALSFLSLIIDAAKFISMQNDFYWPWQIAVYLCI-SVHPFILIFSNLKLR
:...::::.: :. :::..:.. .: :..: . . :. . :.::::::..: ::.
CCDS53 LQTVISFLLLCAIYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLK
230 240 250 260 270 280
300
pF1KE5 SVFSQLLLLARGFWVA
..: ... : .::
CCDS53 QTFLSVFWQMR-YWVKGEKTSSP
290 300
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 497 init1: 434 opt: 522 Z-score: 597.7 bits: 118.7 E(32554): 5.7e-27
Smith-Waterman score: 522; 32.4% identity (62.4% similar) in 306 aa overlap (1-303:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQAALTAFFVLLFSLLSLLGIAANGFIVLVLGREWLRYGRLLPLDMILISLGASRFCLQL
:.. . :..: . ::: .: :: :: : :.. :. :.:. .:. :. :
CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VGTVHNFYYSAQKVEYSGGLGRQFFHLHWHFLNSATFWFCSWLSVLFCVKIANITHSTFL
. . .: . ...:. :.. . : : : ..:. . :.::.:.:::...: :::
CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 WLKWRFPGWVPWLLLGSVLISFIITLLFFWVN-YPVYQEFLIRKFSGNMTYKWNTRIETY
::::: . :.:::..:.: : . .: . .:. : . . :.: .. . :
CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASL--INEFKLYSVFRGIEATRNVTEHFRKKRSEY
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YFPSLKLVIWSIP-FSVFLVSIMLLINSLRRHTQRMQHNGHSLQDPSTQAHTRALKSLIS
:. . ..: .: . : :.: ::: :: :::..: .:: : .::.:.:: ::.. ..:
CCDS58 YLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIILS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FLILYALSFLSLIIDA-AKFISMQNDFYWPWQIAVYLCISVHPFILIFSNLKLRSVFSQL
:..:. : ::...: . ..:. . .. ... . : ::::..: ::...: .
CCDS58 FFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVVM
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 LLLARGFWVA
: :
CCDS58 LRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 439 init1: 222 opt: 520 Z-score: 595.6 bits: 118.3 E(32554): 7.5e-27
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300
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300
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
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CCDS53 RIKRRVKSVVLVILLGPLL--FLVCHLFV-INMD--ETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYH
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CCDS53 LLLCAIYFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVL
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CCDS53 RHVR-YWVKDRSLRLHRFTRGALCVF
300 310
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
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CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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CCDS86 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
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CCDS86 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
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CCDS86 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
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300
pF1KE5 LLARGFWVA
CCDS86 TCRKIACMI
307 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 00:05:05 2016 done: Tue Nov 8 00:05:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]