Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5336
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5336, 268 aa
1>>>pF1KE5336 268 - 268 aa - 268 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0210+/-0.000721; mu= 15.9444+/- 0.044
mean_var=59.0543+/-11.856, 0's: 0 Z-trim(108.6): 179 B-trim: 525 in 1/50
Lambda= 0.166897
statistics sampled from 10126 (10306) to 10126 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.317), width: 16
Scan time: 2.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 ( 268) 1874 459.3 1.3e-129
CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 ( 269) 1174 290.7 7.2e-79
CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 ( 269) 1088 270.0 1.2e-72
CCDS219.1 CELA3B gene_id:23436|Hs108|chr1 ( 270) 1024 254.6 5.4e-68
CCDS220.1 CELA3A gene_id:10136|Hs108|chr1 ( 270) 975 242.8 1.9e-64
CCDS8812.1 CELA1 gene_id:1990|Hs108|chr12 ( 258) 852 213.2 1.5e-55
CCDS32489.1 CTRB2 gene_id:440387|Hs108|chr16 ( 263) 694 175.1 4.4e-44
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs108|chr16 ( 263) 681 172.0 3.8e-43
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 649 164.3 8.1e-41
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 578 147.4 2.4e-35
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 574 146.4 4.5e-35
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 566 144.4 1.3e-34
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 560 143.0 3.3e-34
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 560 143.0 3.5e-34
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 560 143.0 3.6e-34
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 554 141.5 9.8e-34
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs108|chr6 ( 810) 556 142.2 1.1e-33
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 553 141.5 2.1e-33
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 (1042) 553 141.5 2.3e-33
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs108|chr16 ( 317) 545 139.3 3.2e-33
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 546 139.6 3.5e-33
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 532 136.2 3.6e-32
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 534 136.9 5.4e-32
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 526 134.8 9.7e-32
CCDS10431.1 TPSAB1 gene_id:7177|Hs108|chr16 ( 275) 517 132.5 3.1e-31
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 516 132.3 3.8e-31
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 397) 516 132.4 5e-31
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2 ( 603) 518 132.9 5e-31
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 432) 516 132.4 5.3e-31
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 516 132.4 5.3e-31
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 516 132.4 5.4e-31
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 514 131.8 5.8e-31
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4 ( 438) 511 131.2 1.2e-30
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 510 131.1 3.1e-30
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12 ( 348) 504 129.4 3.3e-30
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 506 130.1 5e-30
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 418) 495 127.3 1.7e-29
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 421) 495 127.3 1.7e-29
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 495 127.3 1.7e-29
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 496 127.6 1.8e-29
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 461) 495 127.3 1.9e-29
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 496 127.6 1.9e-29
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 496 127.6 1.9e-29
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 495 127.5 3e-29
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 495 127.5 3e-29
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 492 126.8 5.3e-29
CCDS82945.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 576) 482 124.3 2e-28
CCDS34049.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 583) 482 124.3 2e-28
CCDS82946.1 CFI gene_id:3426|Hs108|chr4 ( 591) 482 124.3 2e-28
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 481 124.0 2e-28
>>CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 (268 aa)
initn: 1874 init1: 1874 opt: 1874 Z-score: 2440.3 bits: 459.3 E(32554): 1.3e-129
Smith-Waterman score: 1874; 100.0% identity (100.0% similar) in 268 aa overlap (1-268:1-268)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLSARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWRHTCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLSARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWRHTCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GTLIASNFVLTAAHCISNTRTYRVAVGKNNLEVEDEEGSLFVGVDTIHVHKRWNALLLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GTLIASNFVLTAAHCISNTRTYRVAVGKNNLEVEDEEGSLFVGVDTIHVHKRWNALLLRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 DIALIKLAEHVELSDTIQVACLPEKDSLLPKDYPCYVTGWGRLWTNGPIADKLQQGLQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 DIALIKLAEHVELSDTIQVACLPEKDSLLPKDYPCYVTGWGRLWTNGPIADKLQQGLQPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 VDHATCSRIDWWGFRVKKTMVCAGGDGVISACNGDSGGPLNCQLENGSWEVFGIVSFGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VDHATCSRIDWWGFRVKKTMVCAGGDGVISACNGDSGGPLNCQLENGSWEVFGIVSFGSR
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KE5 RGCNTRKKPVVYTRVSAYIDWINEKMQL
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RGCNTRKKPVVYTRVSAYIDWINEKMQL
250 260
>>CCDS157.1 CELA2A gene_id:63036|Hs108|chr1 (269 aa)
initn: 1151 init1: 720 opt: 1174 Z-score: 1529.4 bits: 290.7 E(32554): 7.2e-79
Smith-Waterman score: 1174; 63.4% identity (80.0% similar) in 265 aa overlap (1-263:1-263)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLSARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWRHTCG
:. .:..:.: : ::: :..:: .. ::::::.:::.:::::.:::: .: : ::::
CCDS15 MIRTLLLSTLVAGALSCGDPTYPPYVT-RVVGGEEARPNSWPWQVSLQYSSNGKWYHTCG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 GTLIASNFVLTAAHCISNTRTYRVAVGKNNLEVEDEEGSLFVGVDTIHVHKRWNALLLR-
:.:::...:::::::::..:::::..:..:: : : ::: :.:. : ::: ::. .
CCDS15 GSLIANSWVLTAAHCISSSRTYRVGLGRHNLYVA-ESGSLAVSVSKIVVHKDWNSNQISK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 -NDIALIKLAEHVELSDTIQVACLPEKDSLLPKDYPCYVTGWGRLWTNGPIADKLQQGLQ
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CCDS15 GNDIALLKLANPVSLTDKIQLACLPPAGTILPNNYPCYVTGWGRLQTNGAVPDVLQQGRL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PVVDHATCSRIDWWGFRVKKTMVCAGGDGVISACNGDSGGPLNCQLENGSWEVFGIVSFG
:::.:::: ::: :: .:.:::::::::.:::::::::::: .: :.: ::::::
CCDS15 LVVDYATCSSSAWWGSSVKTSMICAGGDGVISSCNGDSGGPLNCQASDGRWQVHGIVSFG
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KE5 SRRGCNTRKKPVVYTRVSAYIDWINEKMQL
:: ::: .:: :.:::: ::::::
CCDS15 SRLGCNYYHKPSVFTRVSNYIDWINSVIANN
240 250 260
>>CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 (269 aa)
initn: 1067 init1: 665 opt: 1088 Z-score: 1417.5 bits: 270.0 E(32554): 1.2e-72
Smith-Waterman score: 1088; 59.2% identity (76.6% similar) in 265 aa overlap (1-263:1-263)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLSARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWRHTCG
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CCDS30 MIRTLLLSTLVAGALSCGVSTYAPDMS-RMLGGEEARPNSWPWQVSLQYSSNGQWYHTCG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 GTLIASNFVLTAAHCISNTRTYRVAVGKNNLEVEDEEGSLFVGVDTIHVHKRWNALLLR-
:.:::...:::::::::.. ::: .:..:: : : ::: :.:. : ::: ::. .
CCDS30 GSLIANSWVLTAAHCISSSGIYRVMLGQHNLYVA-ESGSLAVSVSKIVVHKDWNSDQVSK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 -NDIALIKLAEHVELSDTIQVACLPEKDSLLPKDYPCYVTGWGRLWTNGPIADKLQQGLQ
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CCDS30 GNDIALLKLANPVSLTDKIQLACLPPAGTILPNNYPCYVTGWGRLQTNGALPDDLKQGQL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 PVVDHATCSRIDWWGFRVKKTMVCAGGDGVISACNGDSGGPLNCQLENGSWEVFGIVSFG
:::.:::: ::: :: .:.:::::::: .:::::::::::: .: ::: :: :.
CCDS30 LVVDYATCSSSGWWGSTVKTNMICAGGDGVICTCNGDSGGPLNCQASDGRWEVHGIGSLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KE5 SRRGCNTRKKPVVYTRVSAYIDWINEKMQL
: ::: :: ..:::: : ::::
CCDS30 SVLGCNYYYKPSIFTRVSNYNDWINSVIANN
240 250 260
>>CCDS219.1 CELA3B gene_id:23436|Hs108|chr1 (270 aa)
initn: 1040 init1: 414 opt: 1024 Z-score: 1334.2 bits: 254.6 E(32554): 5.4e-68
Smith-Waterman score: 1024; 55.4% identity (77.3% similar) in 269 aa overlap (1-266:2-267)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLSARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWRHTC
:: . :.: ::. : :: : :.:::.:::: :.:::::.:::: :. .. :::
CCDS21 MMLRLLSSLLLVAVASGYGPPSSRP--SSRVVNGEDAVPYSWPWQVSLQYEKSGSFYHTC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GGTLIASNFVLTAAHCISNTRTYRVAVGKNNLEV-EDEEGSLFVGVDTIHVHKRWN--AL
::.::: ..:.::.::::..:::.:..:. . : : : . .. . :: :: .
CCDS21 GGSLIAPDWVVTAGHCISSSRTYQVVLGEYDRAVKEGPEQVIPINSGDLFVHPLWNRSCV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LLRNDIALIKLAEHVELSDTIQVACLPEKDSLLPKDYPCYVTGWGRLWTNGPIADKLQQG
::::::::.. ..:.:..:.: :: ..::.. :::.::::::.::::. ::::..
CCDS21 ACGNDIALIKLSRSAQLGDAVQLASLPPAGDILPNETPCYITGWGRLYTNGPLPDKLQEA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LQPVVDHATCSRIDWWGFRVKKTMVCAGGDGVISACNGDSGGPLNCQLENGSWEVFGIVS
: ::::. ::: .::: ::::::::::: . :.::::::::::: :.:.:.: :..:
CCDS21 LLPVVDYEHCSRWNWWGSSVKKTMVCAGGD-IRSGCNGDSGGPLNCPTEDGGWQVHGVTS
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KE5 FGSRRGCNTRKKPVVYTRVSAYIDWINEKMQL
: : :::::.::.:.:::::.::::.: .
CCDS21 FVSAFGCNTRRKPTVFTRVSAFIDWIEETIASH
240 250 260 270
>>CCDS220.1 CELA3A gene_id:10136|Hs108|chr1 (270 aa)
initn: 1004 init1: 400 opt: 975 Z-score: 1270.4 bits: 242.8 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 975; 54.3% identity (74.3% similar) in 269 aa overlap (1-266:2-267)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLSARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWRHTC
:: . :.: ::. : :: . :.::: :::: :.:::::.:::: :. .. :::
CCDS22 MMLRLLSSLLLVAVASGYGPPS--SHSSSRVVHGEDAVPYSWPWQVSLQYEKSGSFYHTC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GGTLIASNFVLTAAHCISNTRTYRVAVGKNNLEV-EDEEGSLFVGVDTIHVHKRWN--AL
::.::: ..:.::.:::: ::.:..:. :: : : : . .. . . :: :: .
CCDS22 GGSLIAPDWVVTAGHCISRDLTYQVVLGEYNLAVKEGPEQVIPINSEELFVHPLWNRSCV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LLRNDIALIKLAEHVELSDTIQVACLPEKDSLLPKDYPCYVTGWGRLWTNGPIADKLQQG
::::::::.. ..:.:..:.: :: ..::. :::.::::::.::::. :::::.
CCDS22 ACGNDIALIKLSRSAQLGDAVQLASLPPAGDILPNKTPCYITGWGRLYTNGPLPDKLQQA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LQPVVDHATCSRIDWWGFRVKKTMVCAGGDGVISACNGDSGGPLNCQLENGSWEVFGIVS
::::. ::: .::: :::::::::: . :.::::::::::: :.:.:.: :..:
CCDS22 RLPVVDYKHCSRWNWWGSTVKKTMVCAGGY-IRSGCNGDSGGPLNCPTEDGGWQVHGVTS
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KE5 FGSRRGCNTRKKPVVYTRVSAYIDWINEKMQL
: : ::: ::.:.:::::.::::.: .
CCDS22 FVSAFGCNFIWKPTVFTRVSAFIDWIEETIASH
240 250 260 270
>>CCDS8812.1 CELA1 gene_id:1990|Hs108|chr12 (258 aa)
initn: 418 init1: 418 opt: 852 Z-score: 1110.6 bits: 213.2 E(32554): 1.5e-55
Smith-Waterman score: 852; 52.3% identity (77.0% similar) in 243 aa overlap (24-263:13-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLSARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWRHTCG
:. .:::::: .: .::: :::::: .. . ::::
CCDS88 MLVLYGHSTQDLPETNARVVGGTEAGRNSWPSQISLQYRSGGSRYHTCG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE5 GTLIASNFVLTAAHCISNTRTYRVAVGKNNLEVEDEEGS-LFVGVDTIHVHKRWNA--LL
:::: .:.:.:::::.. .:.::..: .:: .: :. .:.:. : :: ::. .
CCDS88 GTLIRQNWVMTAAHCVDYQKTFRVVAGDHNLSQND--GTEQYVSVQKIVVHPYWNSDNVA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LRNDIALIKLAEHVELSDTIQVACLPEKDSLLPKDYPCYVTGWGRLWTNGPIADKLQQGL
::::..::. : :.. .:.. ::.. ..: .. :::.::::. ::: .:. :::.
CCDS88 AGYDIALLRLAQSVTLNSYVQLGVLPQEGAILANNSPCYITGWGKTKTNGQLAQTLQQAY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 QPVVDHATCSRIDWWGFRVKKTMVCAGGDGVISACNGDSGGPLNCQLENGSWEVFGIVSF
: ::.: :: ..:: ::.:::::::::: :.:.:::::::.: : ::.. : :..::
CCDS88 LPSVDYAICSSSSYWGSTVKNTMVCAGGDGVRSGCQGDSGGPLHC-LVNGKYSVHGVTSF
170 180 190 200 210 220
240 250 260
pF1KE5 GSRRGCNTRKKPVVYTRVSAYIDWINEKMQL
: ::::. .::.:.:.:::::.:::
CCDS88 VSSRGCNVSRKPTVFTQVSAYISWINNVIASN
230 240 250
>>CCDS32489.1 CTRB2 gene_id:440387|Hs108|chr16 (263 aa)
initn: 586 init1: 165 opt: 694 Z-score: 904.9 bits: 175.1 E(32554): 4.4e-44
Smith-Waterman score: 694; 43.2% identity (70.3% similar) in 259 aa overlap (9-264:11-258)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MLGITVLAALLACASSCGVPSFPPNLS--ARVVGGEDARPHSWPWQISLQYLKNDTWR
:::. . .::::.. : :: .:.:.:::: : :::::.::: . :
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CCDS32 SWGSDT-CST-SSPGVYARVTKLIPWVQKILAAN
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CCDS10 TTMNNDVTLLKLASPAQYTTRISPVCLASSNEALTEGLTCVTTGWGRLSGVGNVTPAHLQ
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CCDS10 QVALPLVTVNQCRQ--YWGSSITDSMICAGGAGA-SSCQGDSGGPLVCQKGN-TWVLIGI
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CCDS10 VSWGTK-NCNVRA-PAVYTRVSKFSTWINQVIAYN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]