Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5325
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5325, 303 aa
1>>>pF1KE5325 303 - 303 aa - 303 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6324+/-0.00143; mu= 14.1412+/- 0.085
mean_var=77.1974+/-16.710, 0's: 0 Z-trim(99.1): 49 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.145973
statistics sampled from 5591 (5622) to 5591 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.491), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16
Scan time: 2.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 1956 422.0 2.7e-118
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 901 199.9 2.2e-51
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 882 195.8 3.4e-50
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 867 192.7 3e-49
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 858 190.8 1.1e-48
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 850 189.1 3.7e-48
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 835 185.9 3.2e-47
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 816 181.9 5e-46
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 808 180.3 1.7e-45
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 761 170.4 1.6e-42
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 712 160.0 2e-39
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 631 143.0 2.8e-34
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 629 142.6 3.7e-34
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 593 135.0 7.2e-32
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 592 134.8 8.3e-32
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 477 110.5 1.6e-24
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 476 110.4 2e-24
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 469 108.9 5e-24
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 463 107.6 1.2e-23
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 437 102.2 5.8e-22
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 417 97.9 1.1e-20
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 400 94.3 1.2e-19
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 368 87.6 1.3e-17
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 364 86.7 2.2e-17
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 1956 init1: 1956 opt: 1956 Z-score: 2237.2 bits: 422.0 E(32554): 2.7e-118
Smith-Waterman score: 1956; 100.0% identity (100.0% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
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CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YASFFLCVLISWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 YASFFLCVLISWISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKVW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKR
:::
CCDS86 AKR
>>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa)
initn: 933 init1: 774 opt: 901 Z-score: 1036.2 bits: 199.9 E(32554): 2.2e-51
Smith-Waterman score: 901; 49.5% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (1-302:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
: ... ::::.:.:.:::::::.:.::.:.::::::. :..::::..: ::::::.:.:
CCDS86 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
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CCDS86 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK
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CCDS86 YLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLIV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF
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CCDS86 LTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAHRG-VKSVITFFLL
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE5 YASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAKV
:: : : .:: : :: ....: .: ...:. :: :: .::::: ::::: : : .
CCDS86 YAIFSLSFFISVWTSERLEENLI-ILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVL--L
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 WAKR
: .
CCDS86 WLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
300 310
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 853 init1: 258 opt: 882 Z-score: 1014.7 bits: 195.8 E(32554): 3.4e-50
Smith-Waterman score: 882; 44.0% identity (76.7% similar) in 309 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
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CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIF---SWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSP
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CCDS86 VILLHWYSTV----LNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 AFLYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSV
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CCDS86 IFHHLKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLS-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 SVKFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVIS
..:..:.. : :::...:::::::.:: :::.::::. :: .:: ::.: .::. : :
CCDS86 --NLTVAMLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FLLFYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV
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CCDS86 FLILLAIYFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSV
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 AAKV--WAKR
.: :::
CCDS86 LWQVTCWAKGQNQSTP
300
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 814 init1: 266 opt: 867 Z-score: 997.6 bits: 192.7 E(32554): 3e-49
Smith-Waterman score: 867; 46.9% identity (73.9% similar) in 307 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
....:. : . : : .:: .. : : :::. :::: .:::::::::.::. :
CCDS53 VLVLNWY-ATELNPAFNS-IEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV
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CCDS53 LHLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNT-
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFL
:.:... :.:::...::::::: :: :::.::::. :: .:: ::: .::. : :::
CCDS53 --TVTILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LFYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAA
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CCDS53 LLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 KV--WAKR
.: :.:
CCDS53 HVRYWVKGEKPSSS
300
>>CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 (299 aa)
initn: 839 init1: 253 opt: 858 Z-score: 987.6 bits: 190.8 E(32554): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 858; 45.2% identity (75.9% similar) in 290 aa overlap (8-295:8-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
: ..... :..::..::::.:.: ::::. :..::....: :..:::::.:
CCDS86 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
.: :. .. :.. : .::. . : :.:::..:::. .::: :::::.::.
CCDS86 VMLFLWYATVFNSALY--GLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLIS
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pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV
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CCDS86 LHLKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRN--AIHLSS
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180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLL
. :. .: :::...: ::::: :: :::.::.:. :: .:: :::: .::. : :::.
CCDS86 LTVTTLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLM
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240 250 260 270 280 290
pF1KE5 FYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK
..: .:::.. : : . :. .. .::.:.... :: :::.::.:. ::.:.:: :
CCDS86 LFAIYFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQ
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 VWAKR
CCDS86 MTR
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
initn: 797 init1: 255 opt: 850 Z-score: 978.1 bits: 189.1 E(32554): 3.7e-48
Smith-Waterman score: 850; 47.2% identity (75.4% similar) in 309 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
.:. :. : . : : . .:: .. : :.:::. :::: .:.::::.::.::. :
CCDS53 VLLLHWY-ATQLNPAFYS-VEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV
: .: ::..:.:.:::: :.:: .:. ::: : .:: :.::.... . :
CCDS53 LRIKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHS---
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFL
..:.::.. ..:.:...::::::: :: :::.::::. :: .:: :::: .::. : :::
CCDS53 NMTLTMLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LFYASFFLCVLISW--ISELYQNTVIYMLCETIGVFS-PSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV
:. : .:: ..:: ...: .. : .:.:..: .:: ::.: :.::::: ::.: :: :
CCDS53 LLCAIYFLSMIISVCNFGRLEKQPV-FMFCQAI-IFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSV
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 AAKV--WAKR
.: :.:
CCDS53 LRHVRYWVKDRSLRLHRFTRGALCVF
300 310
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 797 init1: 263 opt: 835 Z-score: 961.2 bits: 185.9 E(32554): 3.2e-47
Smith-Waterman score: 835; 45.3% identity (73.3% similar) in 307 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
: . :: ::. .... :.:::..::::.:.: :.: .....: .:..: ::.::.::.:
CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
.:..:. .. : ... .: .. : : :::. :::: .:::::::::.::. :
CCDS53 VLLLNWYSTV--LNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV
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CCDS53 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFS---
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 KFTMTMFS-LTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFL
..:.:: . :.:::....::.::: :: :::.::::. :: .:: :::: .::. :::::
CCDS53 NMTVTMVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 LFYASFFLCVLIS-WISELYQNTVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLV--
:. : .:: ..:: : .: ..:.:..: :: : :.:: :: ::.:.:: :
CCDS53 LLCAIYFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFW
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE5 AAKVWAKR
. :.:
CCDS53 QMRYWVKGEKTSSP
300
>>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS86 LCAIFFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQ
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300
pF1KE5 VWAKR
.
CCDS86 IRC
>>CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 (309 aa)
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pF1KE5 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF
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CCDS53 VLLLNWYSTVFNPAFY--SVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF
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CCDS53 LHLKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRS--AVYLSD
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CCDS53 ATVTTLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLL
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300
pF1KE5 V--WAKR
: :.:
CCDS53 VRYWVKGEKPSSP
300
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
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CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVN--KTQ
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CCDS86 HASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVI
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: ::
CCDS86 VIWKVMSILKGRKFQQHKQI
300 310
303 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 23:47:54 2016 done: Mon Nov 7 23:47:54 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]