Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5324
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5324, 299 aa
1>>>pF1KE5324 299 - 299 aa - 299 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3557+/-0.000984; mu= 15.0294+/- 0.059
mean_var=73.8423+/-16.773, 0's: 0 Z-trim(104.9): 55 B-trim: 456 in 1/50
Lambda= 0.149253
statistics sampled from 8063 (8116) to 8063 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 2.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 2031 446.8 9.2e-126
CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 484 113.7 1.8e-25
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 469 110.5 1.6e-24
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 462 109.0 4.7e-24
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 442 104.7 9.4e-23
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 427 101.4 8.8e-22
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 416 99.1 4.4e-21
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 415 98.9 5.4e-21
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 412 98.2 8.1e-21
CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 403 96.3 3.2e-20
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 402 96.0 3.6e-20
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 399 95.4 5.9e-20
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 398 95.2 6.4e-20
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 395 94.5 1e-19
CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 356 86.1 3.6e-17
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 353 85.5 5.5e-17
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 329 80.3 1.9e-15
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 314 77.1 1.9e-14
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 307 75.6 5.7e-14
CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 264 66.3 3.2e-11
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 263 66.1 3.9e-11
>>CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 (299 aa)
initn: 2031 init1: 2031 opt: 2031 Z-score: 2371.3 bits: 446.8 E(32554): 9.2e-126
Smith-Waterman score: 2031; 100.0% identity (100.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
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CCDS58 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIILDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLWLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LIILDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLWLKQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RAYNLSLWCLLGYFIINLLLTVQIGLTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYAFQLNSGSYLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RAYNLSLWCLLGYFIINLLLTVQIGLTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYAFQLNSGSYLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 LVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLVYIMASPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLVYIMASPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE5 SITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVCARRCWGP
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CCDS58 SITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVCARRCWGP
250 260 270 280 290
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
initn: 455 init1: 222 opt: 484 Z-score: 570.9 bits: 113.7 E(32554): 1.8e-25
Smith-Waterman score: 484; 30.8% identity (64.9% similar) in 302 aa overlap (1-295:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
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CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIILD--LSLF-P-LFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYL
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CCDS86 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKQRAYNLSLWCLLGYFIINLLLT-VQIGLTFYHPPQGNSSIR--YPFESWQYLYAFQL
:::.:. :. : .. ...:. ::. . :. . :... ..: .. . :
CCDS86 WLKSRT-NMVLPFMIVFLLISSLLNFAYIAKILNDYKTKNDTVWDLNMYKSEYFIKQILL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NSGSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLV
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CCDS86 NLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISFIILFIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YIMASPFSITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVCA
:... . :. : . ... : : :: ::.:::.: ..::. ..: . :
CCDS86 YFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVLQQLKCC
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 RRCWGP
..
CCDS86 EKRKNLRVT
300
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 453 init1: 176 opt: 469 Z-score: 553.5 bits: 110.5 E(32554): 1.6e-24
Smith-Waterman score: 469; 31.7% identity (62.4% similar) in 306 aa overlap (1-295:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
: :: ... :: ..::.:: ..:: .:. . .:. : . :: . ... :: :. : :
CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LII----LDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYL
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CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKQRAYNLSLWCLLGYFIINLLLTVQIGL---TFYHPPQGNSSIRYP---FESWQYLYA
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CCDS86 YLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSVK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FQLNSGSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLL
: .. : :..: ..: .:: :: : .::... :.:: :.:.: .::: . :::.
CCDS86 FTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLLF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE5 HLVYIMASPFSITSKTYPPDLTSVFIW-ETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWK
. ... .: :. : : ... ::. . :: ::..::.: ...:. . :
CCDS86 YASFFLCVLISWISELYQN--TVIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLLVAAK
250 260 270 280 290
290
pF1KE5 TVCARRCWGP
: :.:
CCDS86 -VWAKR
300
>>CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 424 init1: 224 opt: 462 Z-score: 545.2 bits: 109.0 E(32554): 4.7e-24
Smith-Waterman score: 462; 29.4% identity (63.5% similar) in 299 aa overlap (1-292:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
:.: .. ...:: :..: ..:: ... .: :... . :: . :: .:: : : :
CCDS86 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIIL---DLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLW
.:.: . : : .. . . ..: :..... :.:.:: ::.:: ::..:.: .
CCDS86 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 LKQRAYNLSLWCLLG--YFIINLLLTVQIGLTFYHPP-QGNSSIRYPFESWQYLYAFQLN
::..: .. : .:: .:.. :. . .. . .:: . . ... ..: . .
CCDS86 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 S-GSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLV
.. .:... :.: .:: :: : :::..:. : .: .: :: ::... ::.: .
CCDS86 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 YIMASPFSITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVCA
:.. .:. . . : ... ... :::.::.::: : .::: ..::...:
CCDS86 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 RRCWGP
CCDS86 AKGQNQSTP
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 379 init1: 213 opt: 442 Z-score: 522.0 bits: 104.7 E(32554): 9.4e-23
Smith-Waterman score: 442; 31.8% identity (62.3% similar) in 302 aa overlap (8-297:8-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
.. .. :: :.:: ..:: ... . ::... . : . :. .:: : : :
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIILD---LSLFPLFQSSRWLRYLSI-FWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYL
...:. : : :.: . .: . :..... : :.:: ::.:: ::..:. .:
CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSIE-VRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 WLKQRAYNLSLWCLLG--YFIINLLLTVQIG-LTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYAFQL
::.:. .. : ::: :.. :...... . . . .:: . . ..: .:: .
CCDS53 HLKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NS-GSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHL
. .. .:... :.: .:: :: : :::..:. : .: :.:: ::... ::::
CCDS53 TILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE5 VY---IMASPFSITSKTYPPDLTSVFIW-ETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILW
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CCDS53 IYFLSIIMSVWSFESLENKP----VFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLW
240 250 260 270 280 290
290
pF1KE5 KTVCARRCWGP
.. : :
CCDS53 HV----RYWVKGEKPSSS
300
>>CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 386 init1: 203 opt: 427 Z-score: 504.5 bits: 101.4 E(32554): 8.8e-22
Smith-Waterman score: 427; 31.5% identity (63.3% similar) in 289 aa overlap (12-289:12-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
..:: :.:: ..:: ... . ::... . : . :. .:: : : :
CCDS53 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIILD---LSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLW
...:. : : :.: . .:..... : :.:: ::.:: ::..:. .:
CCDS53 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 LKQRAYNLSLWCLLG--YFIINLLLTVQIG-LTFYHPPQGNSSIRYPFESWQYLYAFQLN
::.:. .. : ::: :. :...... .. . .:: . . ..: .:. . ..
CCDS53 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 S-GSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHLV
.. .:... :.: .:: :: : :::..:. : .: .:.:: ::... :::: .
CCDS53 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE5 Y---IMASPFSITSKTYPPDLTSVFIW-ETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWK
: :: : .:. : : ::.. ... .:::.: .::: : ..::: ...:.
CCDS53 YFLSIMISVWSFGSLENKP----VFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQ
250 260 270 280 290
290
pF1KE5 TVCARRCWGP
CCDS53 MRYWVKGEKTSSP
300
>>CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 (299 aa)
initn: 436 init1: 236 opt: 416 Z-score: 491.9 bits: 99.1 E(32554): 4.4e-21
Smith-Waterman score: 416; 29.0% identity (60.0% similar) in 300 aa overlap (1-292:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
:: . : . .:.::..::.:.. :: .:: . . :.. . . .:.. :: :..::
CCDS38 MLESHLIIYFLLAVIQFLLGIFTNGIIVVVNGIDLIKHRKMAPLDLLLSCLAVSRIFLQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 LIILDLSLFPLFQSSRWLRYLSIFWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYLWLKQ
.:. . .: . ..... ::.::.:.:::: :... .: ..:::.
CCDS38 FIFYVNVIVIFFIEFIMCSANCAILLFINELELWLATWLGVFYCAKVASVRHPLFIWLKM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE5 RAYNLSLWCLLGYFI-INLLLTVQIGLTFYHPP-------QGNSSIRYPFESWQYLYAFQ
: .: : .:: .. .... . . . . : . :..:. :. . :.
CCDS38 RISKLVPWMILGSLLYVSMICVFHSKYAGFMVPYFLRKFFSQNATIQK--EDTLAIQIFS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LNSGSYLPLVVFLVSSGMLIVSLYTHHKKMKVHSAGRRDVRAKAHITALKSLGCFLLLHL
. . .::..:: . .:: :: : ..:. :: : : :.:: :. ::.:..
CCDS38 FVAEFSVPLLIFLFAVLLLIFSLGRHTRQMRNTVAGSRVPGRGAPISALLSILSFLILYF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VYIMASPFSITSKTYPPDLTSVFIWETLMAAYPSLHSLILIMGIPRVKQTCQKILWKTVC
. : . : . : . . .:. ... ::: ::::::.: :..::. .:.: .. :
CCDS38 SHCMIKVFLSSLKFHIRRFIFLFFI-LVIGIYPSGHSLILILGNPKLKQNAKKFLLHSKC
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ARRCWGP
CCDS38 CQ
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
initn: 372 init1: 216 opt: 415 Z-score: 490.4 bits: 98.9 E(32554): 5.4e-21
Smith-Waterman score: 415; 30.1% identity (63.3% similar) in 289 aa overlap (8-287:8-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MLSAGLGLLMLVAVVEFLIGLIGNGSLVVWSFREWIRKFNWSSYNLIILGLAGCRFLLQW
.. .. :: :.:: ..:: ... . ::... . : . :. .:: : : :
CCDS53 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE5 LIILD---LSLFPLFQSSRWLRYLSI-FWVLVSQASLWFATFLSVFYCKKITTFDRPAYL
...: .: : : : . .: . :..... : :.:: ::.:: .:..:. .:
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