Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5066
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5066, 968 aa
1>>>pF1KE5066 968 - 968 aa - 968 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0323+/-0.00113; mu= 17.2558+/- 0.068
mean_var=70.7006+/-14.097, 0's: 0 Z-trim(101.6): 28 B-trim: 6 in 1/48
Lambda= 0.152533
statistics sampled from 6580 (6587) to 6580 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.202), width: 16
Scan time: 3.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32474.1 AARS gene_id:16|Hs108|chr16 ( 968) 6361 1409.8 0
CCDS34464.1 AARS2 gene_id:57505|Hs108|chr6 ( 985) 2777 621.2 3.2e-177
>>CCDS32474.1 AARS gene_id:16|Hs108|chr16 (968 aa)
initn: 6361 init1: 6361 opt: 6361 Z-score: 7557.7 bits: 1409.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6361; 100.0% identity (100.0% similar) in 968 aa overlap (1-968:1-968)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MDSTLTASEIRQRFIDFFKRNEHTYVHSSATIPLDDPTLLFANAGMNQFKPIFLNTIDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDSTLTASEIRQRFIDFFKRNEHTYVHSSATIPLDDPTLLFANAGMNQFKPIFLNTIDPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 HPMAKLSRAANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHHTFFEMLGSWSFGDYFKELACKMALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HPMAKLSRAANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHHTFFEMLGSWSFGDYFKELACKMALE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LLTQEFGIPIERLYVTYFGGDEAAGLEADLECKQIWQNLGLDDTKILPGNMKDNFWEMGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLTQEFGIPIERLYVTYFGGDEAAGLEADLECKQIWQNLGLDDTKILPGNMKDNFWEMGD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 TGPCGPCSEIHYDRIGGRDAAHLVNQDDPNVLEIWNLVFIQYNREADGILKPLPKKSIDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TGPCGPCSEIHYDRIGGRDAAHLVNQDDPNVLEIWNLVFIQYNREADGILKPLPKKSIDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GMGLERLVSVLQNKMSNYDTDLFVPYFEAIQKGTGARPYTGKVGAEDADGIDMAYRVLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GMGLERLVSVLQNKMSNYDTDLFVPYFEAIQKGTGARPYTGKVGAEDADGIDMAYRVLAD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 HARTITVALADGGRPDNTGRGYVLRRILRRAVRYAHEKLNASRGFFATLVDVVVQSLGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HARTITVALADGGRPDNTGRGYVLRRILRRAVRYAHEKLNASRGFFATLVDVVVQSLGDA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 FPELKKDPDMVKDIINEEEVQFLKTLSRGRRILDRKIQSLGDSKTIPGDTAWLLYDTYGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FPELKKDPDMVKDIINEEEVQFLKTLSRGRRILDRKIQSLGDSKTIPGDTAWLLYDTYGF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 PVDLTGLIAEEKGLVVDMDGFEEERKLAQLKSQGKGAGGEDLIMLDIYAIEELRARGLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVDLTGLIAEEKGLVVDMDGFEEERKLAQLKSQGKGAGGEDLIMLDIYAIEELRARGLEV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 TDDSPKYNYHLDSSGSYVFENTVATVMALRREKMFVEEVSTGQECGVVLDKTCFYAEQGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDDSPKYNYHLDSSGSYVFENTVATVMALRREKMFVEEVSTGQECGVVLDKTCFYAEQGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 QIYDEGYLVKVDDSSEDKTEFTVKNAQVRGGYVLHIGTIYGDLKVGDQVWLFIDEPRRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QIYDEGYLVKVDDSSEDKTEFTVKNAQVRGGYVLHIGTIYGDLKVGDQVWLFIDEPRRRP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 IMSNHTATHILNFALRSVLGEADQKGSLVAPDRLRFDFTAKGAMSTQQIKKAEEIANEMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IMSNHTATHILNFALRSVLGEADQKGSLVAPDRLRFDFTAKGAMSTQQIKKAEEIANEMI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 EAAKAVYTQDCPLAAAKAIQGLRAVFDETYPDPVRVVSIGVPVSELLDDPSGPAGSLTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAAKAVYTQDCPLAAAKAIQGLRAVFDETYPDPVRVVSIGVPVSELLDDPSGPAGSLTSV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 EFCGGTHLRNSSHAGAFVIVTEEAIAKGIRRIVAVTGAEAQKALRKAESLKKCLSVMEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EFCGGTHLRNSSHAGAFVIVTEEAIAKGIRRIVAVTGAEAQKALRKAESLKKCLSVMEAK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 VKAQTAPNKDVQREIADLGEALATAVIPQWQKDELRETLKSLKKVMDDLDRASKADVQKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKAQTAPNKDVQREIADLGEALATAVIPQWQKDELRETLKSLKKVMDDLDRASKADVQKR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 VLEKTKQFIDSNPNQPLVILEMESGASAKALNEALKLFKMHSPQTSAMLFTVDNEAGKIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLEKTKQFIDSNPNQPLVILEMESGASAKALNEALKLFKMHSPQTSAMLFTVDNEAGKIT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 CLCQVPQNAANRGLKASEWVQQVSGLMDGKGGGKDVSAQATGKNVGCLQEALQLATSFAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CLCQVPQNAANRGLKASEWVQQVSGLMDGKGGGKDVSAQATGKNVGCLQEALQLATSFAQ
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 LRLGDVKN
::::::::
CCDS32 LRLGDVKN
>>CCDS34464.1 AARS2 gene_id:57505|Hs108|chr6 (985 aa)
initn: 1952 init1: 783 opt: 2777 Z-score: 3295.2 bits: 621.2 E(32554): 3.2e-177
Smith-Waterman score: 2777; 45.8% identity (72.3% similar) in 970 aa overlap (7-963:39-985)
10 20 30
pF1KE5 MDSTLTASEIRQRFIDFFK-RNEHTYVHSSATIPLD
:: .: :..::. :. : : :... :
CCDS34 ARRLRRAIRRSPAWRGLSHRPLSSEPPAAKASAVRAAFLNFFRDRHGHRLVPSASVRPRG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 DPTLLFANAGMNQFKPIFLNTIDPSHPMAKLSRAANTQKCIRAGGKHNDLDDVGKDVYHH
::.:::.::::::::::::.:.:: :: . :.::.:::.::::.::::.:::.:. ::
CCDS34 DPSLLFVNAGMNQFKPIFLGTVDPRSEMAGFRRVANSQKCVRAGGHHNDLEDVGRDLSHH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 TFFEMLGSWSFG-DYFKELACKMALELLTQEFGIPIERLYVTYFGGDEAAGLEADLECKQ
:::::::.:.:: .:::: ::.:: ::::: .::: :::...:: :: :::. ::: ..
CCDS34 TFFEMLGNWAFGGEYFKEEACNMAWELLTQVYGIPEERLWISYFDGDPKAGLDPDLETRD
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 IWQNLGLDDTKILPGNMKDNFWEMGDTGPCGPCSEIHYDRIGGRDAAHLVNQDDPNVLEI
:: .::. ...: . ..::::::::::::::.::::: :: : :...:.
CCDS34 IWLSLGVPASRVLSFGPQENFWEMGDTGPCGPCTEIHYDLAGGVGA--------PQLVEL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 WNLVFIQYNREADGILKPLPKKSIDTGMGLERLVSVLQNKMSNYDTDLFVPYFEAIQKGT
:::::.:.:::::: :.:::.. .::::::::::.:::.: :.:::::: : ..:::.:
CCDS34 WNLVFMQHNREADGSLQPLPQRHVDTGMGLERLVAVLQGKHSTYDTDLFSPLLNAIQQGC
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 GARPYTGKVGAEDADGIDMAYRVLADHARTITVALADGGRPDNTGRGYVLRRILRRAVRY
: :: :.::. : : ::::.::: ::..: ..:: : .: :::::::::::.
CCDS34 RAPPYLGRVGVADEGRTDTAYRVVADHIRTLSVCISDGIFPGMSGPPLVLRRILRRAVRF
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 AHEKLNASRGFFATLVDVVVQSLGDAFPELKKDPDMVKDIINEEEVQFLKTLSRGRRILD
. : :.: ::...:: :::..::::.:::... .. ....:.:. :: .: :::::.:
CCDS34 SMEILKAPPGFLGSLVPVVVETLGDAYPELQRNSAQIANLVSEDEAAFLASLERGRRIID
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 RKIQSLGDSKTIPGDTAWLLY--DTYGFPVDLTGLIAEEKGLVVDMDGFEEERKLAQLKS
: ...:: : .:...:: : :.:.:.. :. ::::. .: :.: .::: ..
CCDS34 RTLRTLGPSDMFPAEVAWSLSLCGDLGLPLDMVELMLEEKGVQLDSAGLE---RLAQEEA
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE5 QGKGAGGEDL----IMLDIYAIEELRARGLEVTDDSPKYNYHLDSSGSYVFENTVATVMA
: .. .: . . ::..:. ::. .:. ::::::::: : :::: : . : :.
CCDS34 QHRARQAEPVQKQGLWLDVHALGELQRQGVPPTDDSPKYNYSLRPSGSYEFGTCEAQVLQ
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE5 LRREK-MFVEEVSTGQECGVVLDKTCFYAEQGGQIYDEGYLVKVDDSSEDKTEFTVKNAQ
: : : :. ::.::..::.: :::::::: :.::::. .... . : : ::
CCDS34 LYTEDGTAVASVGKGQRCGLLLDRTNFYAEQGGQASDRGYLVR---AGQEDVLFPVARAQ
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE5 VRGGYVLHIGTIYGDLKVGDQVWLFIDEPRRRPIMSNHTATHILNFALRSVLGEA-DQKG
: ::..:: .. :..:::: : .:: : :..:::::.::.:::..:: . .:.:
CCDS34 VCGGFILHEAVAPECLRLGDQVQLHVDEAWRLGCMAKHTATHLLNWALRQTLGPGTEQQG
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KE5 SLVAPDRLRFDFTAKGAMSTQQIKKAEEIANEMIEAAKAVYTQDCPLAAAKAIQGLRAVF
: . :..::.: :.. .. .:.. .:. ..: . .::: .. ::: . . :::..
CCDS34 SHLNPEQLRLDVTTQTPLTPEQLRAVENTVQEAVGQDEAVYMEEVPLALTAQVPGLRSL-
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KE5 DETYPDPVRVVSIGVPVSELLDDPSGPAGSLTSVEFCGGTHLRNSSHAGAFVIVTEEAIA
::.:::::::::.::::.. :: :.. :. ::::.: :::: .. .: .::. .. ..
CCDS34 DEVYPDPVRVVSVGVPVAHALD-PASQAALQTSVELCCGTHLLRTGAVGDLVIIGDRQLS
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KE5 KGIRRIVAVTGAEAQKALRKAESLKKCLSVMEAKVKAQTAPNKDVQREIADLG---EALA
:: :..:::: .::.: . ..:: . ... ... . .. : :.: ::.
CCDS34 KGTTRLLAVTGEQAQQARELGQSLAQEVKAATERLSLGSRDVAEALRLSKDIGRLIEAVE
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850 860
pF1KE5 TAVIPQWQKDELRETLKSLKKVMDDLDRASKADVQKRVLEKTKQFIDSNPNQPLVILEME
:::.::::. :: :.: :.. . : . .. .::..... . . ::.. .
CCDS34 TAVMPQWQRRELLATVKMLQRRANTAIRKLQMG---QAAKKTQELLERHSKGPLIV-DTV
840 850 860 870 880
870 880 890 900 910 920
pF1KE5 SGASAKALNEALKLFKMHSPQTSAMLFTVDNEAGKITCLCQVPQNAANRGLKASEWVQQV
:. : ..: .... . ..:.::..:.. . ::. : ::: :.: . : :. :
CCDS34 SAESLSVLVKVVRQLCEQAPSTSVLLLS-PQPMGKVLCACQVAQGAMPT-FTAEAWALAV
890 900 910 920 930 940
930 940 950 960
pF1KE5 SGLMDGKGGGKDVSAQATGKNVGCLQEALQLATSFAQLRLGDVKN
. : ::. :. : ::.::... :. ::..: ..: .:
CCDS34 CSHMGGKAWGSRVVAQGTGSTTD-LEAALSIAQTYALSQL
950 960 970 980
968 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 04:42:32 2016 done: Tue Nov 8 04:42:33 2016
Total Scan time: 3.480 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]