Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5004
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5004, 914 aa
1>>>pF1KE5004 914 - 914 aa - 914 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3070+/-0.00086; mu= 16.3568+/- 0.052
mean_var=77.4589+/-15.049, 0's: 0 Z-trim(106.7): 12 B-trim: 40 in 1/52
Lambda= 0.145726
statistics sampled from 9108 (9113) to 9108 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 4.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS709.1 CLCA1 gene_id:1179|Hs108|chr1 ( 914) 6031 1277.8 0
CCDS41355.1 CLCA4 gene_id:22802|Hs108|chr1 ( 919) 3726 793.2 0
CCDS708.1 CLCA2 gene_id:9635|Hs108|chr1 ( 943) 2539 543.7 6.2e-154
>>CCDS709.1 CLCA1 gene_id:1179|Hs108|chr1 (914 aa)
initn: 6031 init1: 6031 opt: 6031 Z-score: 6845.1 bits: 1277.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6031; 99.9% identity (100.0% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPFKSSVFILILHLLEGALSNSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQA
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CCDS70 MGPFKSSVFILILHLLEGALSNSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTE
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SLYLLEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RIQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 RIQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMFA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 QHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 QIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 QIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNELI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 QINSGSDRDTLAKRLPAAASGGTSICSGLRSAFTVIRKKYPTDGSEIVLLTDGEDNTISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 QINSGSDRDTLAKRLPAAASGGTSICSGLRSAFTVIRKKYPTDGSEIVLLTDGEDNTISG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 CFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSGNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 CFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSGNG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 AVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 AVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQKQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 GFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQASSQTLTLTVTSRASNATLPPITVTSKTNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQASSQTLTLTVTSRASNATLPPITVTSKTNKD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 TSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDGVYSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDGVYSR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 YFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEINKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 YFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEINKDD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 VQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 DHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFENGTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFENGTDL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 FIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLFIPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 FIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLFIPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILK
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE5 IMWKWIGELQLSIA
::::::::::::::
CCDS70 IMWKWIGELQLSIA
910
>>CCDS41355.1 CLCA4 gene_id:22802|Hs108|chr1 (919 aa)
initn: 2799 init1: 1048 opt: 3726 Z-score: 4226.0 bits: 793.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3726; 61.8% identity (83.2% similar) in 912 aa overlap (1-907:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MGPFKSSVFILILHLLEGALSNSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQA
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CCDS41 MGLFRGFVFLLVLCLLHQS-NTSFIKLNNNGFEDIVIVIDPSVPEDEKIIEQIEDMVTTA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 SLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTE
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CCDS41 STYLFEATEKRFFFKNVSILIPENWKENPQYKRPKHENHKHADVIVAPPTLPGRDEPYTK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG
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CCDS41 QFTECGEKGEYIHFTPDLLLGKKQNEYGPPGKLFVHEWAHLRWGVFDEYNEDQPFYRAKS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE5 R-IQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMF
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CCDS41 KKIEATRCSAGISGRNRVYKCQGGSCLSRACRIDSTTKLYGKDCQFFPDKVQTEKASIMF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AQHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSL
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CCDS41 MQSIDSVVEFCNEKTHNQEAPSLQNIKCNFRSTWEVISNSEDFKNTIPMVTPPPPPVFSL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LQIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNEL
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CCDS41 LKISQRIVCLVLDKSGSMGGKDRLNRMNQAAKHFLLQTVENGSWVGMVHFDSTATIVNKL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 IQINSGSDRDTLAKRLPAAASGGTSICSGLRSAFTVIRKKYPT-DGSEIVLLTDGEDNTI
:::.:...:.:: ::. ::::::::.. :: :: . . ::::..:::::::::
CCDS41 IQIKSSDERNTLMAGLPTYPLGGTSICSGIKYAFQVIGELHSQLDGSEVLLLTDGEDNTA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 SGCFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSG
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CCDS41 SSCIDEVKQSGAIVHFIALGRAADEAVIEMSKITGGSHFYVSDEAQNNGLIDAFGALTSG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 NGAVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQK
: .::.:.:::::::::... ::: :::.::::::::.:::::. ::.: ::::::
CCDS41 NTDLSQKSLQLESKGLTLNSNAWMNDTVIIDSTVGKDTFFLITWNSLPPSISLWDPSGTI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 QGGFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQASS--QTLTLTVTSRASNATLPPITVTSK
. .:.:: ..:::::.::: :::::: :.:::.. .:::.::::::.:...:::::..:
CCDS41 MENFTVDATSKMAYLSIPGTAKVGTWAYNLQAKANPETLTITVTSRAANSSVPPITVNAK
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 TNKDTSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDG
:::...::::..:::.: :: :.: :.:::.::: ::.: .:::::::::::. :.::
CCDS41 MNKDVNSFPSPMIVYAEILQGYVPVLGANVTAFIESQNGHTEVLELLDNGAGADSFKNDG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 VYSRYFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEI
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CCDS41 VYSRYFTAYTENGRYSLKVRAHGGANTARLKLRPPLNRAAYIPGWVVNGEIEANPPRPEI
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE5 NKDDVQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAP
. .:.: ::::.:::.::.:.::. :.:: .::.::::: : .: ..: ::::::
CCDS41 D-EDTQTTLEDFSRTASGGAFVVSQVPSLPLPDQYPPSQITDLDATVHEDKII-LTWTAP
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE5 GDDYDHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFEN
::..: : ...::::::.:::::::.:...:::::: : ::::::.: : ::::::. ::
CCDS41 GDNFDVGKVQRYIIRISASILDLRDSFDDALQVNTTDLSPKEANSKESFAFKPENISEEN
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE5 GTDLFIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLFIPPQTPPET-PSPDETSAPCPNIHINSTIPG
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CCDS41 ATHIFIAIKSIDKSNLTSKVSNIAQVTLFIPQANPDDIDPTPTPTPTPTPDKSHNS---G
840 850 860 870 880 890
900 910
pF1KE5 IHILKIMWKWIGELQLSIA
..: .. . ::
CCDS41 VNISTLVLSVIGSVVIVNFILSTTI
900 910
>>CCDS708.1 CLCA2 gene_id:9635|Hs108|chr1 (943 aa)
initn: 2091 init1: 588 opt: 2539 Z-score: 2877.1 bits: 543.7 E(32554): 6.2e-154
Smith-Waterman score: 2630; 45.6% identity (75.9% similar) in 906 aa overlap (2-878:8-899)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MGPFKSSVFILILHLLEGALS--NSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQ
::. . :. .: : . : .. .::..:::.:...::.:.:::...::..
CCDS70 MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 IKDMVTQASLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPP
::.:.:.::.:::.:: .: .:.:. :::: :::.. . . : :.:..:.:.:..
CCDS70 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNS-KIKQESYEKANVIVTDWYGA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 GNDEPYTEQMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKL-AEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNN
.:.::: :. .::..:. ::.::.:. . .: : :: .::.::::::::::::::::::
CCDS70 HGDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE5 DEKFYLSNGR--IQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQS
:. ::. ::. :...:::. ::: : :. : : . : ..: :...:: :. .:
CCDS70 DKPFYI-NGQNQIKVTRCSSDITGIFV---CEKGPCPQENCIISK---LFKEGCTFIYNS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 RQTEKASIMFAQHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPM-
:. ::::: : ..:.::::. ..::.:::: ::: :.:::.:.:: :: ::... ::
CCDS70 TQNATASIMFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 -TTQPPNPTFSLLQIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMV
: :: :::::.: :...:::::: :..:: ..:: .:.::....:.: ::. ..::..
CCDS70 GTELPPPPTFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 TFDSAAHVQNELIQINSGSDRDTLAKRLPAAASGGT--SICSGLRSAFTVIRK-KYPTDG
.::: .... .: ::::..:: :.. ::...:. : ::::::...: :..: . . :
CCDS70 SFDSKGEIRAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 SEIVLLTDGEDNTISGCFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQ
: ..:.:.:.:. ...:. : .::. ::..::: ::: .:::::..::::. .. : .
CCDS70 SVMILVTSGDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISN
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 NNGLIDAFGALSSGNGAVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTM
.:..::::. .:::.: . :. ::::: : ... . ...:: ::.:::.::.::.::
CCDS70 SNSMIDAFSRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KE5 Q-PPQILLWDPSGQKQ--GGFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQA---SSQTLTLT
. ::.:.:.::.:.: ..:... . . : : ::: :: : : :.:. : :.: .:
CCDS70 SGPPEIILFDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVT
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 VTSRASNATLPPITVTSKTNKDTSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTV
:::::::...:: :: . ...:. .:: :...:::..:: ::: :.::: .: .: :
CCDS70 VTSRASNSAVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPV
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 TLELLDNGAGADATKDDGVYSRYFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAAR-RRVIPQQSGALY
::.:::.:::::. :.::.::::: .. .:::::.::.. . . . . :: : :.:
CCDS70 TLRLLDDGAGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPG-SHAMY
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 IPGWIENDEIQWNPPRPEINKDDVQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQIT
.::. : .:: : :: ..... .... :::.:::::: . :: .: ::.::: .:
CCDS70 VPGYTANGNIQMNAPRKSVGRNE-EERKWGFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKII
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KE5 DLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDYDHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPK
::.: .. ..:.:::::.:.:.: : .: ::.: :. ...: ::... :::. :.
CCDS70 DLEA-VKVEEELTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQ
780 790 800 810 820
820 830 840 850 860
pF1KE5 EANSEEVFLFKPENITFENGTD------------LFIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLF
.:. .:.: :.:. : :: . ...::.:.:. .:.: .::::.. ::
CCDS70 QAGIREIFTFSPQIST--NGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLF
830 840 850 860 870 880
870 880 890 900 910
pF1KE5 IPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILKIMWKWIGELQLSIA
:::.. : .:. :
CCDS70 IPPNSDP-VPARDYLILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL
890 900 910 920 930 940
914 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 04:04:17 2016 done: Tue Nov 8 04:04:18 2016
Total Scan time: 4.430 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]