Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5001
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5001, 1049 aa
1>>>pF1KE5001 1049 - 1049 aa - 1049 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4855+/-0.00139; mu= 15.5613+/- 0.083
mean_var=118.2383+/-24.427, 0's: 0 Z-trim(102.6): 178 B-trim: 50 in 1/48
Lambda= 0.117949
statistics sampled from 6810 (7015) to 6810 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 4.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049) 6976 1199.9 0
CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041) 2470 433.1 1.5e-120
CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059) 2470 433.1 1.5e-120
CCDS2848.1 TLR9 gene_id:54106|Hs108|chr3 (1032) 1241 224.0 1.3e-57
CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 ( 858) 628 119.6 2.9e-26
CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 525 102.0 5.2e-21
CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 ( 796) 449 89.1 4.1e-17
CCDS3445.1 TLR10 gene_id:81793|Hs108|chr4 ( 811) 438 87.2 1.5e-16
CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 406 81.8 6.5e-15
>>CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049 aa)
initn: 6976 init1: 6976 opt: 6976 Z-score: 6421.6 bits: 1199.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6976; 100.0% identity (100.0% similar) in 1049 aa overlap (1-1049:1-1049)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MVFPMWTLKRQILILFNIILISKLLGARWFPKTLPCDVTLDVPKNHVIVDCTDKHLTEIP
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CCDS14 MVFPMWTLKRQILILFNIILISKLLGARWFPKTLPCDVTLDVPKNHVIVDCTDKHLTEIP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 GGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKRLQIKP
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CCDS14 GGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKRLQIKP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 RSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNIFSIRKENLTELANIEILYLG
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CCDS14 RSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNIFSIRKENLTELANIEILYLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 QNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMIAKI
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CCDS14 QNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMIAKI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSN
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CCDS14 QEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASM
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CCDS14 SLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 NLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQF
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CCDS14 NLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 KRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNK
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CCDS14 KRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 EASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQP
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CCDS14 EASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 LAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQK
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CCDS14 LAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 LMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQLFKNLLKLEELDISKN
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CCDS14 LMMNDNDISSSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQLFKNLLKLEELDISKN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 SLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETLDLSHNQLTTVPERLSN
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CCDS14 SLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETLDLSHNQLTTVPERLSN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 CSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNLKMLLL
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CCDS14 CSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNLKMLLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE5 HHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCELDLTNL
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CCDS14 HHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCELDLTNL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE5 ILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTK
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CCDS14 ILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE5 DPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDK
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CCDS14 DPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE5 YAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQ
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CCDS14 YAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KE5 AHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
1030 1040
>>CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041 aa)
initn: 2619 init1: 1331 opt: 2470 Z-score: 2277.7 bits: 433.1 E(32554): 1.5e-120
Smith-Waterman score: 2766; 42.5% identity (72.1% similar) in 1051 aa overlap (5-1049:4-1038)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MVFPMWTLKRQILILFNIILIS-KLLGARWFPKTLPCDVTLDVPKNHVIVDCTDKHLTEI
:. . .. .: .: : .: . . : .. ::: . .. ::..:....: :.
CCDS14 MENMFLQSSMLTCIFLLISGSCELCAEENFSRSYPCDEKKQ--NDSVIAECSNRRLQEV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 PGGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKR--LQ
: . .:.: :. : : :. ::. :..:..:.. : : ...: :. :.
CCDS14 PQTVGKYVTELDLSDNFITHITNESFQGLQNLTKINLNHN--PNVQHQNGNPGIQSNGLN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 IKPRSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNIFSIRKENLTELANIEIL
: .: .: :. : :. ::: .::.::: :: ::: :::..: ::....: :.. :
CCDS14 ITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNIYNITKEGISRLINLKNL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 YLGQNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMI
::. :::. . : . .:: .: .::.:..:::. :... :: :::.: .:.: :..:
CCDS14 YLAWNCYFNKVCEKT-NIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVPPKLPSSLRKLFLSNTQI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AKIQEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRL
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CCDS14 KYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASINIDRFAFQNLTQLRYLNL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 HSNSLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYR
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CCDS14 SSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLPRLEILDLSFNYIKGSYP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ASMNLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMF
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CCDS14 QHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLSTINLGINFIKQIDFKLF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 KQFKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHY-FRYDKYARSCR
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CCDS14 QNFSNLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSS-----SFQRHIRKRRSTDFEFDPHSNFYH
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE5 FKNKEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGS
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CCDS14 FTRPL-----IKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDIACLNLSANSNAQVLSGT
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE5 EFQPLAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLK
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CCDS14 EFSAIPHVKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHYFRIAGVTHHLEFIQNFT
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE5 VLQKLMMNDNDISSSTSR-TMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRYLQLFKNLLKLEEL
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CCDS14 NLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDDDNRYISIFKGLKNLTRL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE5 DISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCLKNLETLDLSHNQLTTVP
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CCDS14 DLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQFPRLELLDLRGNKLLFLT
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE5 ERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKTSFPENVLNNL
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CCDS14 DSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNLLKTINKSALETKTTTKL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KE5 KMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVN-HTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSVISLDLYTCE
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CCDS14 SMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLV-DVICASPGDQRGKSIVSLELTTCV
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KE5 LDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKGYQRLISPDCCYDAF
:.: .::: ... .. ..:. : ::..::::.::. : ::.:::. : . . :::.
CCDS14 SDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVCLAKVKGYRSLSTSQTFYDAY
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KE5 IVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTV
: ::::: .::.::. :: .::. :.:. :::::::: :: ...:: :::. :::::
CCDS14 ISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTV
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE5 FVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQKSKFLQLRKRLCGSSVLE
::.: ::::. ::: ::::. ::::::..::::.:.:: .:.:..:.::.:.: ::.:.
CCDS14 FVLTKKYAKSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQHSQYLRLRQRICKSSILQ
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040
pF1KE5 WPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
:: ::.:. ::: :.:.. :.: :.... ...
CCDS14 WPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
1010 1020 1030 1040
>>CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059 aa)
initn: 2619 init1: 1331 opt: 2470 Z-score: 2277.6 bits: 433.1 E(32554): 1.5e-120
Smith-Waterman score: 2766; 42.5% identity (72.1% similar) in 1051 aa overlap (5-1049:22-1056)
10 20 30 40
pF1KE5 MVFPMWTLKRQILILFNIILIS-KLLGARWFPKTLPCDVTLDV
:. . .. .: .: : .: . . : .. ::: .
CCDS14 MKESSLQNSSCSLGKETKKENMFLQSSMLTCIFLLISGSCELCAEENFSRSYPCDEKKQ-
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 PKNHVIVDCTDKHLTEIPGGIPTNTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVP
.. ::..:....: :.: . .:.: :. : : :. ::. :..:..:.. : :
CCDS14 -NDSVIAECSNRRLQEVPQTVGKYVTELDLSDNFITHITNESFQGLQNLTKINLNHN--P
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE5 IPLGSKNNMCIKR--LQIKPRSFSGLTYLKSLYLDGNQLLEIPQGLPPSLQLLSLEANNI
...: :. :.: .: .: :. : :. ::: .::.::: :: ::: :::
CCDS14 NVQHQNGNPGIQSNGLNITDGAFLNLKNLRELLLEDNQLPQIPSGLPESLTELSLIQNNI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 FSIRKENLTELANIEILYLGQNCYYRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVP
..: ::....: :.. :::. :::. . : . .:: .: .::.:..:::. :... ::
CCDS14 YNITKEGISRLINLKNLYLAWNCYFNKVCEKT-NIEDGVFETLTNLELLSLSFNSLSHVP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 TVLPSTLTELYLYNNMIAKIQEDDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQ
:::.: .:.: :..: :.:.::..: .: .::::::::::.::::::.:: ... ..
CCDS14 PKLPSSLRKLFLSNTQIKYISEEDFKGLINLTLLDLSGNCPRCFNAPFPCVPCDGGASIN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 IPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLP
: ::. ::.:. : : :.::... ::::. .:. ::: :.:. ::... :: .::
CCDS14 IDRFAFQNLTQLRYLNLSSTSLRKINAAWFKNMPHLKVLDLEFNYLVGEIASGAFLTMLP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 SLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLE
: ::::::. : .:.:. ::.: ::. :..:::::.::. ...:: .: ::
CCDS14 RLEILDLSFNYIKGSYPQHINISRNFSKLLSLRALHLRGYVFQELREDDFQPLMQLPNLS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 VLDLGTNFIKIANLSMFKQFKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVL
...:: :::: ....:..:. :..: :: :.::: ... .. ... :.. ..
CCDS14 TINLGINFIKQIDFKLFQNFSNLEIIYLSENRISPLVKDTRQSYANSS-----SFQRHIR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE5 EQLHY-FRYDKYARSCRFKNKEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFL
.. :..: .. .: .. .: ::..:::: :::::. ..:..: .
CCDS14 KRRSTDFEFDPHSNFYHFTRPL-----IKPQCAAYGKALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDI
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 KCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLAELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHY
:::::.: .:.:.:.::. . ...:::..:::::. ...:. :: :::::.: ::::
CCDS14 ACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHY
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 FQSEGITHMLNFTKNLKVLQKLMMNDNDISSSTSR-TMESESLRTLEFRGNHLDVLWREG
:. :.:: :.: .:. :. : .. :.: . :.. ..::.:: : : ::.::.:: .
CCDS14 FRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDD
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 DNRYLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCL
::::...::.: .: .::.: : :. .:. .: ..: .: .: . : :: :.: :: .
CCDS14 DNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKFFNWTLLQQF
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 KNLETLDLSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNK
:: ::: :.: . . ::. . ::..:.:..:.: : . ::... .:..::::::
CCDS14 PRLELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLDLSSNL
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KE5 IQMIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVN-HTEVTIPYLATDVTCVGP
.. :.:... .. ..:.:: :: : : :::: : :.. : .: :: :. :: :..:
CCDS14 LKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKIPRLV-DVICASP
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pF1KE5 GAHKGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAK
: ..:.:..::.: :: :.: .::: ... .. ..:. : ::..::::.::. : ::
CCDS14 GDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFITTMVMLAALAHHLFYWDVWFIYNVCLAK
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880 890 900 910 920 930
pF1KE5 IKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQ
.:::. : . . :::.: ::::: .::.::. :: .::. :.:. :::::::: ::
CCDS14 VKGYRSLSTSQTFYDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLEESRDKNVLLCLEERDWDPGL
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940 950 960 970 980 990
pF1KE5 PVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQK
...:: :::. :::::::.: ::::. ::: ::::. ::::::..::::.:.:: .:.
CCDS14 AIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKSWNFKTAFYLALQRLMDENMDVIIFILLEPVLQH
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pF1KE5 SKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
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CCDS14 SQYLRLRQRICKSSILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLTENDSRYNNMYVDSIKQY
1010 1020 1030 1040 1050
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10 20 30 40 50
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pF1KE5 G---GIPT-NTTNLTLTINHIPDISPASFHRLDHLVEIDFRCNCVPIPLGSKNNMCIKRL
. : :.:.:.:. :.: . ..: .: : ..... :: :. :. . : ..
CCDS28 HFSMAAPRGNVTSLSLSSNRIHHLHDSDFAHLPSLRHLNLKWNCPPVGLSPMHFPC--HM
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:.: .: .. :. : :. :... .: .:: :: ::: .::. . . .:. : ...
CCDS28 TIEPSTFLAVPTLEELNLSYNNIMTVP-ALPKSLISLSLSHTNILMLDSASLAGLHALRF
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:.. ::::.::: . . :.:.: .: :::: ::.:.:: :::.: : : :
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:.:. .:. ::. :..::..::: :: .:: :: : . : :. ..:. :..:. :
CCDS28 IVKLAPEDLANLTALRVLDVGGNCRRCDHAPNPCMECPRHFP-QLHPDTFSHLSRLEGLV
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:...::. . ::.....:. ::::.::: : : .: .. : .: .:.::::.. .:
CCDS28 LKDSSLSWLNASWFRGLGNLRVLDLSENFLYKCITKTKAFQGLTQLRKLNLSFNYQKRVS
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pF1KE5 RASMNLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSM
: ..:. .:.:: .:: : ..: :. : .: :: : :..: : :::. :.:..
CCDS28 FAHLSLAPSFGSLVALKELDMHGIFFRSLDETTLRPLARLPMLQTLRLQMNFINQAQLGI
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pF1KE5 FKQFKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCR
:. : :. .::: :.:: ... . . ... .: .: : : :
CCDS28 FRAFPGLRYVDLSDNRISGASELTATMGEADGGEKVW-LQPGDLAPAP---VDT-PSSED
420 430 440 450 460
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pF1KE5 FKNKEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGS
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CCDS28 FR----------PNCSTLNFTLDLSRNNLVTVQPEMFAQLSHLQCLRLSHNCISQAVNGS
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CCDS28 LSQNRLHTLLPQTLRNLPKSLQVLRLRDNYLAFFKWWSLHFLPKLEVLDLAGNQLKALTN
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. :. : .. :.: .. :.. : .:: :.::.: .. .... : . . :.
CCDS28 GSLPAGTRLRRLDVSCNSISFVAPGFFSKAKELRELNLSANALKTVDHSWFGP-LASALQ
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CCDS28 ILDVSANPLHCACGAA-FMDFLLEVQAAVPGLPSRVKCGSPGQLQGLSIFAQDLRLCLDE
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pF1KE5 LTNLILFSLSI-SVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKI--KGYQRLISPDCC-YD
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CCDS28 ALSWDCFALSLLAVALGLGVPML-HHLCGWDLWYCFHLCLAWLPWRGRQSGRDEDALPYD
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::.:.: . ::..:: :: ..::. : . . :::::::::::. ..::: :. :.
CCDS28 AFVVFDKTQSAVADWVYNELRGQLEECRGRWALRLCLEERDWLPGKTLFENLWASVYGSR
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CCDS28 KTLFVLAHTDRVSGL--LRASFLLAQQRLLEDRKDVVVLVILSPDGRRSRYVRLRQRLCR
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pF1KE5 SSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
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CCDS28 QSVLLWPHQPSGQRSFWAQLGMALTRDNHHFYNRNFCQGPTAE
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CCDS31 FPFLEQLQLLELGSQ----Y------------TPLTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKIYF
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CCDS31 LHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKN---QIR--SLYLHP
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.:..:.::: . . . . . .: ::.. ..: ..:..: . . .... : .. .
CCDS31 SFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQG-KTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPF
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. . : . .: .: . .. : ::: .. ... : :.. .. .
CCDS31 RNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFS---LILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQN
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pF1KE5 SFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLA
.: .. .: .. ::::.. .: ..: :. :. :: :::. : :.. . : :
CCDS31 TFAGLARSSVRH---LDLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINK-IADEAFYGLD
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.:. :..: : : :.:. : : :. .:...: : .: . .: : :. :: :
CCDS31 NLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGLPKVAYIDLQKN-HI----AIIQDQTF-KFLEKLQTLD
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. :: .. : . . ...: :: . : : . ..:: :... ::.. .
CCDS31 LRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLP-KINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLRVPH
400 410 420 430 440
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pF1KE5 LDISKNSLSFLPSGVFDGMP---PNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQC------LKNLETLD
:.: . . . : : : :.:..: :..: :. ..:. : :..:..:
CCDS31 LQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQ-LAWETELCWDVFEGLSHLQVLY
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pF1KE5 LSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKT
:.:: :...: . . .:..: :..:.. :.. : .:. ::.: : :.. .
CCDS31 LNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPA--NLEILDISRN--QLLAPN
510 520 530 540 550 560
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pF1KE5 SFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSV
:. :. .:..: . ::.:.: :. :. :.:::.::: .:. :: : . .: :.
CCDS31 --PD-VFVSLSVLDITHNKFICECELSTFINWLNHTNVTIAGPPADIYCVYPDSFSGVSL
570 580 590 600 610 620
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pF1KE5 ISLDLYTC-ELDLTNLILFSL----SISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKG
.::. : : .. . . ::: .....::::...:.... :: :
CCDS31 FSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFR--------GFCFICYKT
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pF1KE5 YQRLI--------SPDCC-YDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPR--EKHFNLCLE
:::. :: :::.. ...:: :: :. .:. ...::::.:
CCDS31 AQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKD---FTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFE
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pF1KE5 ERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILI
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CCDS31 ERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMV
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pF1KE5 FLEK--PFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKE
. . .: : ..: . .. :.:: . : .: . :.. .
CCDS31 VVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIP
800 810 820 830 840 850
pF1KE5 TV
CCDS31 LQTVATIS
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pF1KE5 DDFNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDA-LTE-LKVLRLHSN
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CCDS37 WMVWVLGVIISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSG---SLNSIPSGLTEAVKSLDLSNN
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 SLQHVPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASM
. .. .. .:: : :..: . . : . .: : :: .::::.: : ...
CCDS37 RITYISNSDLQRCVNLQALVLTSNGI-NTIEEDSFSS-LGSLEHLDLSYN-----YLSNL
70 80 90 100 110
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pF1KE5 NLSQAFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNL-SPLHNLQNLEVLDLGTNFIKIANLSMFKQ
. :. :. :.:: .: . : .: : .: : : .:: :.: .. : : :: . :
CCDS37 S-SSWFKPLSSLTFLNLLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDT-FTKIQRKD-FAG
120 130 140 150 160 170
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pF1KE5 FKRLKVIDLSVNKISPSGDSSEVGFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKN
. :. ...... .. : . . . .:. . .. ..: :. : . : ..
CCDS37 LTFLEELEIDASDLQ-SYEPKSLKSIQNVSHLILHMKQHIL-LLEIFVDVTSSVEC-LEL
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pF1KE5 KEASFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFF-VKSSDFQHLSFLKCLN-LSGNLISQ----TL
..... . . : . :.: .: :. : :: .: . .. .: :: .:: : . ::
CCDS37 RDTDLDTFHFSELSTGETNSLIKKFTFRNVKITDESLFQVMKLLNQISGLLELEFDDCTL
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 NG-SEFQPLAELRYLDFSN-NRLDL--LHSTAFEELHKLEVL-DISSNSHYFQSEGITHM
:: ..:. . : .: .. . : . :: : .. : .: ... . . :. .
CCDS37 NGVGNFRASDNDRVIDPGKVETLTIRRLHIPRFYLFYDLSTLYSLTERVKRITVENSKVF
290 300 310 320 330 340
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pF1KE5 LN---FTKNLKVLQKLMMNDNDISSSTSRTMESE----SLRTLEFRGNHLDVLWREGDNR
: ....:: :. : ...: . .. : ::.:: .: ::: : . :..
CCDS37 LVPCLLSQHLKSLEYLDLSENLMVEEYLKNSACEDAWPSLQTLILRQNHLASLEKTGET-
350 360 370 380 390 400
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pF1KE5 YLQLFKNLLKLEELDISKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQCL-KN
: .::: ..::::::. .: : ..: :.:... ..: . :. :.
CCDS37 -LLTLKNLT---NIDISKNSFHSMPETC--QWPEKMKYLNLSSTRIHSVT----GCIPKT
410 420 430 440 450
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pF1KE5 LETLDLSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQ
:: ::.:.:.:. : . ::.: .. :.. .: : .: : .: : :
CCDS37 LEILDVSNNNLNLFSLNLPQ----LKELYISRNKLMTLPDASLLP--MLLVLKISRNAIT
460 470 480 490 500 510
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pF1KE5 MIQKTSFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAH
..: .. . ...:: : : :.:.:. . :. . .. .. : .:.
CCDS37 TFSKEQL--DSFHTLKTLEAGGNNFICSCEFLSFTQEQQALAKVLIDWPANYLCDSPSHV
520 530 540 550 560 570
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pF1KE5 KGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLY-FWDVWYI---YHFCKA
.::.: .. : . : : :. .. .:::....:. . : .::. . . .:
CCDS37 RGQQVQDVRLSVSECHRTALV---SGMCCALFLLILLTGVLCHRFHGLWYMKMMWAWLQA
580 590 600 610 620
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pF1KE5 KIKGYQRLISPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPG
: : .. : . :::::. :. .: . :: .: .::. . :.:::..::..::
CCDS37 KRKP-RKAPSRNICYDAFVSYSERD---AYWVENLMVQELEN-FNPPFKLCLHKRDFIPG
630 640 650 660 670 680
940 950 960 970 980 990
pF1KE5 QPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEKPFQ
. ...:. .::. :.:::::......:.: : . .:: ::.::. :. :::.:: :..
CCDS37 KWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHFRLFDENNDAAILILLE-PIE
690 700 710 720 730 740
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pF1KE5 KS----KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
:. .: .::: . .. :::: . . :: :. :. .
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:: . :. ::::.: : : :. : . :. .:::::: ..: . . . :..
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: . : : .. ::.. : :. .:. : : ..
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. . .. ::. ... .:. .: . .. ::. . : ... .: . :.
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: . . :.. :. .:: : :.. . .: ::.. :.. .. . ..::::.:
CCDS34 ALTIEHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIM-MLTISDTPFIHMLCPHAPSTFKFLNFTQNV
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: :. :... : ... . . .... .::. ::: : ..
CCDS34 FTDSIFEKCSTLVKLETLILQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEI----LDVSWNSLESGRH
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. .: .: . . . : ..: ..:: .:: .: :.: .: .:: :.. :. :.
CCDS34 K--ENCTWVESIVVLNLSSNMLTDSVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSVP-KQVVKLEALQE
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pF1KE5 LDLSHNQLTTVPERLSNCSR--SLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQM
:... :.:: .: .:. ::. ::. .:.. . :.:. ..: . ..: .:
CCDS34 LNVAFNSLTDLP----GCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQ-
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:::. :: .... . : : : ..
CCDS34 -------------------------CTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESY
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pF1KE5 KGQSVISLDLYTCELDLTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDV-WYIYHFCK-AKI
.:. . :.. ::. :. :. ..:......... ..: . :. ::. :. ..
CCDS34 RGSPLK--DFHMSELS-CNITLLIVTIGATMLVLAVTVTSLCIYLDLPWYLRMVCQWTQT
570 580 590 600 610 620
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pF1KE5 KGYQRLI-----SPDCCYDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDW
. : : . . . ::: :. .: : :: .::: :: .. ...::.::..
CCDS34 RRRARNIPLEELQRNLQFHAFISYSEHDSA---WVKSELVPYLE---KEDIQICLHERNF
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pF1KE5 LPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILIFLEK
.::. ..::. . :. : :..::.. .....: . .:..:. :. : . .:::.::
CCDS34 VPGKSIVENIINCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEP
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pF1KE5 PFQKS---KFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
:.: :. .:. . . :.:: . . . :: .. :.
CCDS34 IPQNSIPNKYHKLKALMTQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS
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.:. . : ....:.:: : : .:.. .
CCDS34 MTNCSNMSLRKVPADLTPATTTLDLSYNLLFQLQSSDFHSVSKLRVLILCHNRIQQLDLK
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:. ..:. ::::.: : : . ..: .: :::::: :. .: . . .
CCDS34 TFEFNKELRYLDLSNNRL-KSVT----WYLLAGLRYLDLSFNDFD------TMPICEEAG
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... :.:: . : : :: ..:.. : :.: :. . .: ... : ...
CCDS34 NMSHLEILGLSGA--KIQKS-------DFQKIAHLHLNTVFLGFRTLPHYEE-GSLPILN
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. .. . : . : . .. .:: . : .. : .. :. ..: ..: .
CCDS34 TTKLHIVLPMDTNFWVLLRDGIKTS-KILEMTNIDGKSQFVSYEMQRNLSLENAKTSVLL
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.:. .:: ...: :: .. .:.. .. ....:. : .... :. .
CCDS34 LNK--------VDLLWDDLFLILQFVWHTSVEHFQ-IRNVTFGGKAYLDHNSFDYSNTVM
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.:... : . . .. . : :... ... ::.. . ::: : . .
CCDS34 RTIKLEHVHFRV--FYIQQDKIYLLLTKMDIENLTISNAQ------MPHML-FPNYPTKF
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: : . .: ... .::.. :.:: . ::.:..: .. : : ::.::.
CCDS34 QYLNFANNILTDELFKRTIQLPHLKTLILNGNKLETL------SLVSCFANNTPLEHLDL
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:.: :. . . : .. :..:. : :.. . ..:: :... :::..::. :::.
CCDS34 SQNLLQH-KNDENCSWPETVVNMNLSYNKLSD---SVFRCLPKSIQILDLNNNQIQTVPK
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. . .:..: . : . .: . .: :.. : : . . .: .. ...:
CCDS34 ETIHLM-ALRELNIAFNFLTDLPG--CSHFSRLSVLNIEMNFI-LSPSLDFVQSC-QEVK
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: .: : :::. :. ...:: . . . :: : .: . :.. ::.
CCDS34 TLNAGRNPFRCTCELKNFIQLETYSEVMMVGWSDSYTCEYPLNLRGTRLK--DVHLHELS
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pF1KE5 LTNLILFSLSISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHF--CKA---KI-KGYQRLISPDCC
.. .:. . . : : . .. :.: ::. . : .. : :. .. .
CCDS34 CNTALLIVTIVVIMLVLGLAVAFCCLHFDLPWYLRMLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVR
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pF1KE5 YDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPREKHFNLCLEERDWLPGQPVLENLSQSIQLS
. ::: :. .: . :: ::. .:: .. . .:: : . ::. . ::. . :. :
CCDS34 FHAFISYSEHD---SLWVKNELIPNLEK-EDGSILICLYESYFDPGKSISENIVSFIEKS
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:..::.. .....: . ::..:. :. :. : ::::.:: :: ... .:. :
CCDS34 YKSIFVLSPNFVQNEWCHYEFYFAHHNLFHENSDHIILILLEPIPFYCIPTRYHKLKALL
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pF1KE5 CGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKETV
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CCDS34 EKKAYLEWPKDRRKCGLFWANLRAAINVNVLATREMYELQTFTELNEESRGSTISLMRTD
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CCDS33 IHVPKDLSQKTTILNISQNYISELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELE
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CCDS33 YLDLSHNKLVK-IS----CHPTVNLKHLDLSFNAFDALPICKEFGNMSQLKFLGLSTTHL
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CCDS33 EKSSVLPIAHLNISKVLLVLGETYGEKEDPEGLQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVK
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CCDS33 TVANLELSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTL-NNIETTWNSF-IRILQLVW
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CCDS33 HTTVWYFSISNVKLQGQLDFRDFDYSGTSLKALSIHQVV----SDVFGFPQSYIYEIFSN
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. : ...::. . . : :...:. .:::::: :: .:.::. : .::.: .
CCDS33 MNIKNFTVSGTRMVHMLCPSKISPFL---HLDFSNN---LLTDTVFENCGHLTELETLIL
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. : : . .... ..: ..: ::.: ...:..: . : .: :
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CCDS33 IKAGDNPFQ--------------------------CTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPD
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CCDS33 MQICLHERNFVPGKSIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGS
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CCDS33 AKK
1049 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 04:02:05 2016 done: Tue Nov 8 04:02:06 2016
Total Scan time: 4.050 Total Display time: 0.330
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]