Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4590
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4590, 1094 aa
1>>>pF1KE4590 1094 - 1094 aa - 1094 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5697+/-0.000648; mu= -7.4312+/- 0.041
mean_var=405.6089+/-83.638, 0's: 0 Z-trim(115.1): 56 B-trim: 253 in 1/56
Lambda= 0.063683
statistics sampled from 25269 (25321) to 25269 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 16.260
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003655 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex subun (1094) 6942 653.8 1.6e-186
XP_005248675 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 (1053) 6653 627.2 1.5e-178
NP_001258698 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex su (1045) 6629 625.0 6.8e-178
XP_016865490 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 (1004) 6340 598.5 6.5e-170
XP_005248676 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 ( 871) 5416 513.5 2.1e-144
NP_001265441 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit b (1101) 2944 286.5 5.8e-76
NP_001265440 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit b (1050) 2189 217.1 4.3e-55
NP_004635 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit beta (1082) 2189 217.1 4.4e-55
XP_016878130 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 comple ( 629) 1736 175.3 9.9e-43
XP_016878129 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 comple (1058) 1632 165.9 1.1e-39
NP_001159491 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit b ( 919) 535 65.1 2.2e-09
NP_663782 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta ( 939) 535 65.1 2.2e-09
NP_001118 (OMIM: 600157) AP-1 complex subunit beta ( 949) 535 65.1 2.2e-09
XP_005257998 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 733) 528 64.4 2.9e-09
XP_016879776 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 733) 528 64.4 2.9e-09
XP_011522757 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 880) 528 64.4 3.3e-09
XP_016879775 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 880) 528 64.4 3.3e-09
XP_016879774 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 894) 528 64.5 3.3e-09
XP_011522756 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 528 64.5 3.4e-09
XP_011522755 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 528 64.5 3.4e-09
XP_011522754 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 926) 528 64.5 3.4e-09
XP_016879773 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 937) 528 64.5 3.4e-09
NP_001273 (OMIM: 601025) AP-2 complex subunit beta ( 937) 528 64.5 3.4e-09
XP_005257995 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 951) 528 64.5 3.5e-09
NP_001025177 (OMIM: 601025) AP-2 complex subunit b ( 951) 528 64.5 3.5e-09
XP_005257994 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 951) 528 64.5 3.5e-09
XP_011522753 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 969) 528 64.5 3.5e-09
XP_011522750 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 528 64.5 3.5e-09
XP_011522752 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 528 64.5 3.5e-09
XP_011522751 (OMIM: 601025) PREDICTED: AP-2 comple ( 983) 528 64.5 3.5e-09
XP_016855582 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 405) 327 45.7 0.00067
XP_016855578 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 635) 327 45.9 0.00093
NP_006585 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex subun ( 739) 327 45.9 0.001
NP_001240781 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 739) 327 45.9 0.001
XP_016855579 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 571) 323 45.4 0.0011
NP_001295241 (OMIM: 607245,614066) AP-4 complex su ( 571) 323 45.4 0.0011
XP_016855577 (OMIM: 607245,614066) PREDICTED: AP-4 ( 700) 309 44.2 0.0031
>>NP_003655 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex subunit b (1094 aa)
initn: 6942 init1: 6942 opt: 6942 Z-score: 3469.9 bits: 653.8 E(85289): 1.6e-186
Smith-Waterman score: 6942; 99.9% identity (99.9% similar) in 1094 aa overlap (1-1094:1-1094)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 AAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEII
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 KHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 AKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGALSKYAKKIFLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
NP_003 AKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNVKSGALSKYAKKIFLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 QKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 TPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 SSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 DSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 SLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 SIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 VIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090
pF1KE4 SVLLRELKPVLSQG
::::::::::::::
NP_003 SVLLRELKPVLSQG
1090
>>XP_005248675 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 com (1053 aa)
initn: 6868 init1: 6653 opt: 6653 Z-score: 3326.6 bits: 627.2 E(85289): 1.5e-178
Smith-Waterman score: 6653; 99.8% identity (99.9% similar) in 1045 aa overlap (1-1045:1-1045)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATM
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pF1KE4 SIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQF
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pF1KE4 AAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEII
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pF1KE4 KHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLG
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pF1KE4 AKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGALSKYAKKIFLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
XP_005 AKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNVKSGALSKYAKKIFLA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 QKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 TPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 SSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 DSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 SLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 SIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 SFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 VIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIG
::::::::::::::::::::::::.
XP_005 VIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRYEELNFEAL
1030 1040 1050
>>NP_001258698 (OMIM: 603401,608233) AP-3 complex subuni (1045 aa)
initn: 6629 init1: 6629 opt: 6629 Z-score: 3314.7 bits: 625.0 E(85289): 6.8e-178
Smith-Waterman score: 6629; 99.9% identity (99.9% similar) in 1045 aa overlap (50-1094:1-1045)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 LGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKRIVGMIAKGKNASEL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLESNKDSAKLDAMKRIVGMIAKGKNASEL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 FPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQLIRASALRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQLIRASALRVL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 SSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKLLKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKLLKDK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYIL
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::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEWTPAGKAKQENSAKKFYSES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVIS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMVSIQITLNNTTDRKIENIHI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQ
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pF1KE4 DNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG
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>>XP_016865490 (OMIM: 603401,608233) PREDICTED: AP-3 com (1004 aa)
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20 30 40 50 60 70
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::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLESNKDSAKLDAMKRIVGMIAKGKNASEL
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XP_016 FPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQLIRASALRVL
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XP_016 SSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKLLKDK
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pF1KE4 STLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 STLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSP
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XP_016 WKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYIL
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::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEWTPAGKAKQENSAKKFYSES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDSSSEQDSESGRESGLENKRT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVIS
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pF1KE4 VSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMVSIQITLNNTTDRKIENIHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMVSIQITLNNTTDRKIENIHI
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pF1KE4 GEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPV
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pF1KE4 GELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQ
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pF1KE4 DNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG
:::::.
XP_016 DNIHRYEELNFEAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
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pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
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pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
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pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE4 IRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATM
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pF1KE4 SIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEII
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pF1KE4 KHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLG
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pF1KE4 AKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGALSKYAKKIFLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
XP_005 AKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNVKSGALSKYAKKIFLA
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pF1KE4 QKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRNVEVIELAKEW
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pF1KE4 TPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSSSDSESESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDS
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pF1KE4 SSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSS
730 740 750 760 770 780
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pF1KE4 DSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSP
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pF1KE4 SLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDKMV
:::::::::::::::::::
XP_005 SLMADLEGLHLSTSSSVISERKALHLKLGKK
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>>NP_001265441 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit beta- (1101 aa)
initn: 4448 init1: 2052 opt: 2944 Z-score: 1484.7 bits: 286.5 E(85289): 5.8e-76
Smith-Waterman score: 4225; 62.2% identity (82.2% similar) in 1115 aa overlap (8-1093:7-1101)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL
:.:..::. . :. . :: :.:::: :...:::.::..:::: ::
NP_001 MSAAPAYSEDKGGSAGP--GEPEYGHDPASG--GIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKL
10 20 30 40 50
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pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
.::::::.:::.:::::.:::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAMKRIVAMIARGKNASDLFPAVVKNVACKNIEVKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::.::::: :::::
NP_001 QRGLKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
: .::..::::::::: ::.::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::
NP_001 DSDQKDQLIEVIEKLLADKTTLVAGSVVMAFEEVCPERIDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNG-KNFYESDDDQ-----KEKTDK----KKKP
::::: ::::::::::.:: .. . ::.:. : :: :..:. .:.: ..::
NP_001 QVVIISMLTRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKP
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 YTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQ
:.::::::::.::::::::::.:::::::::::.:..::.:.:.:.:.:::::::. :::
NP_001 YVMDPDHRLLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 YIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQ
:.::::.:::::.:.:::::::::::.::::::.:: ::::.:::::::.:: :.:::::
NP_001 YVVLQNVATMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 TYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQ
::..:.::.:.:::::.:::::::: .: :::::::: :::::::.::::::::::::::
NP_001 TYIRSMDKDFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQ
420 430 440 450 460 470
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pF1KE4 MQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDD
::::::::::::.::: :.: ::.::::::::::: ::.::.::::::::::::::.:.:
NP_001 MQPAQHGEIIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEED
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 LVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGAL
.::::..::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::.:: ::::::.:..:::
NP_001 IVKLQVINLAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQNYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGAL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 SKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRN
:..:::.::: ::::.::: ::::::::::.::: :: ::::: :: .::: ::::::::
NP_001 SRHAKKLFLAPKPAPVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRN
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690
pF1KE4 VEVIELA---------------KEWTP-AGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSS-SDSE
:: .:. ::: ... :.... : :::.:: : ..:. :: :
NP_001 VEEEDLSLIETHVGLLGEYTEVPEWTKCSNREKRKEKEKPFYSDSEGESGPTESADSDPE
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 SESGSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDSSSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSE
::: :.: ..::: .:.:...:: ...: :.:: : :... :. :: ..
NP_001 SESESDSKSSSESGSGESSSESDNED--QDEDEEKGR--GSESEQ-----SEEDGKRKTK
720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 DGEKENEKSKTSDSSNDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRT-PL
:. . : ::.::.: ..:::.:::: ::: :. . .. ..: .... :
NP_001 ---KKVPERKGEASSSDEGS--DSSSSSSESEMTSESEEEQLEPASWSRKTPPSSKSAPA
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860 870
pF1KE4 TKDVSLLDLDDFNPVSTPVALPTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHV
::..:::::.::.: :. . : .: :: :::::: :. :. : :. .:. . .
NP_001 TKEISLLDLEDFTPPSVQPVSPPAIVSTSLAADLEGLTLTDSTLVPSLLSPV-SGVGRQE
830 840 850 860 870 880
880 890 900 910 920 930
pF1KE4 LLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGD-KMVSIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMH
::::..:.:::. : : ::: . :: .:::..: ..:..: :...:.: ::: :....
NP_001 LLHRVAGEGLAVDYTFSRQP-FSGDPHMVSVHIHFSNSSDTPIKGLHVGTPKLPAGISIQ
890 900 910 920 930
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 VFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEK
: :.:: : : :. :::.::::::.:.:::::. : :.::::::::. :: :::.
NP_001 EFPEIESLAPGESATAVMGINFCDSTQAANFQLCTQTRQFYVSIQPPVGELMAPVFMSEN
940 950 960 970 980 990
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE4 DFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVH
.:::::: : :::: . .. . .. :::. .::.: :: : .. .:::..:.
NP_001 EFKKEQGKLMGMNEITEKLMLPDTCRSDHIVVQKVTATANLGRVPCGTSDEYRFAGRTLT
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1060 1070 1080 1090
pF1KE4 SGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG
.:::.:.:.. . ...::: .:.:: :::..:.... .:.:
NP_001 GGSLVLLTLDARPAGAAQLTVNSEKMVIGTMLVKDVIQALTQ
1060 1070 1080 1090 1100
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL
:.:..::. . :. . :: :.:::: :...:::.::..:::: ::
NP_001 MSAAPAYSEDKGGSAGP--GEPEYGHDPASG--GIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKL
10 20 30 40 50
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pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
.::::::.:::.:::::.:::::::::: ::::
NP_001 EAMKRIVAMIARGKNASDLFPAVVKNVACKNIE---------------------------
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pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::.::::: :::::
NP_001 -----DPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSL
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pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
: .::..::::::::: ::.::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::
NP_001 DSDQKDQLIEVIEKLLADKTTLVAGSVVMAFEEVCPERIDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWG
150 160 170 180 190 200
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pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNG-KNFYESDDDQ-----KEKTDK----KKKP
::::: ::::::::::.:: .. . ::.:. : :: :..:. .:.: ..::
NP_001 QVVIISMLTRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKP
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pF1KE4 YTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQ
:.::::::::.::::::::::.:::::::::::.:..::.:.:.:.:.:::::::. :::
NP_001 YVMDPDHRLLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQ
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pF1KE4 YIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQ
:.::::.:::::.:.:::::::::::.::::::.:: ::::.:::::::.:: :.:::::
NP_001 YVVLQNVATMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQ
330 340 350 360 370 380
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pF1KE4 TYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQ
::..:.::.:.:::::.:::::::: .: :::::::: :::::::.::::::::::::::
NP_001 TYIRSMDKDFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQ
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pF1KE4 MQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDD
::::::::::::.::: :.: ::.::::::::::: ::.::.::::::::::::::.:.:
NP_001 MQPAQHGEIIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEED
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 LVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGAL
.::::..::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::.:: ::::::.:..:::
NP_001 IVKLQVINLAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQNYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGAL
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 SKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRN
:..:::.::: ::::.::: ::::::::::.::: :: ::::: :: .::: ::::::::
NP_001 SRHAKKLFLAPKPAPVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRN
570 580 590 600 610 620
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pF1KE4 VEVIELAKEWTP-AGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSS-SDSESESGSESGEQGESGE
::: ::: ... :.... : :::.:: : ..:. :: :::: :.: ..:::
NP_001 VEV----PEWTKCSNREKRKEKEKPFYSDSEGESGPTESADSDPESESESDSKSSSESGS
630 640 650 660 670
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pF1KE4 EGDSNEDSSEDSSSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSS
.:.:...:: ...: :.:: : :... :. :: .. :. . : ::
NP_001 GESSSESDNED--QDEDEEKGR--GSESEQ-----SEEDGKRKTK---KKVPERKGEASS
680 690 700 710 720
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pF1KE4 NDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRT-PLTKDVSLLDLDDFNPV
.::.: ..:::.:::: ::: :. . .. ..: .... : ::..:::::.::.:
NP_001 SDEGS--DSSSSSSESEMTSESEEEQLEPASWSRKTPPSSKSAPATKEISLLDLEDFTPP
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KE4 STPVALPTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYF
:. . : .: :: :::::: :. :. : :. .:. . . ::::..:.:::. :
NP_001 SVQPVSPPAIVSTSLAADLEGLTLTDSTLVPSLLSPV-SGVGRQELLHRVAGEGLAVDYT
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 FPRQPCIFGD-KMVSIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSIT
: ::: . :: .:::..: ..:..: :...:.: ::: :.... : :.:: : : :
NP_001 FSRQP-FSGDPHMVSVHIHFSNSSDTPIKGLHVGTPKLPAGISIQEFPEIESLAPGESAT
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 VSMGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNET
. :::.::::::.:.:::::. : :.::::::::. :: :::..:::::: : ::::
NP_001 AVMGINFCDSTQAANFQLCTQTRQFYVSIQPPVGELMAPVFMSENEFKKEQGKLMGMNEI
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pF1KE4 SAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGS
. .. . .. :::. .::.: :: : .. .:::..:. .:::.:.:.. . ..
NP_001 TEKLMLPDTCRSDHIVVQKVTATANLGRVPCGTSDEYRFAGRTLTGGSLVLLTLDARPAG
970 980 990 1000 1010 1020
1070 1080 1090
pF1KE4 TAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG
.::: .:.:: :::..:.... .:.:
NP_001 AAQLTVNSEKMVIGTMLVKDVIQALTQ
1030 1040 1050
>>NP_004635 (OMIM: 602166) AP-3 complex subunit beta-2 i (1082 aa)
initn: 4338 init1: 2097 opt: 2189 Z-score: 1109.9 bits: 217.1 E(85289): 4.4e-55
Smith-Waterman score: 4251; 63.1% identity (83.1% similar) in 1100 aa overlap (8-1093:7-1082)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL
:.:..::. . :. . :: :.:::: :...:::.::..:::: ::
NP_004 MSAAPAYSEDKGGSAGP--GEPEYGHDPASG--GIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
.::::::.:::.:::::.:::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EAMKRIVAMIARGKNASDLFPAVVKNVACKNIEVKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::.::::: :::::
NP_004 QRGLKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
: .::..::::::::: ::.::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::
NP_004 DSDQKDQLIEVIEKLLADKTTLVAGSVVMAFEEVCPERIDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNG-KNFYESDDDQ-----KEKTDK----KKKP
::::: ::::::::::.:: .. . ::.:. : :: :..:. .:.: ..::
NP_004 QVVIISMLTRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 YTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQ
:.::::::::.::::::::::.:::::::::::.:..::.:.:.:.:.:::::::. :::
NP_004 YVMDPDHRLLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 YIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQ
:.::::.:::::.:.:::::::::::.::::::.:: ::::.:::::::.:: :.:::::
NP_004 YVVLQNVATMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 TYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQ
::..:.::.:.:::::.:::::::: .: :::::::: :::::::.::::::::::::::
NP_004 TYIRSMDKDFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 MQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDD
::::::::::::.::: :.: ::.::::::::::: ::.::.::::::::::::::.:.:
NP_004 MQPAQHGEIIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEED
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 LVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGAL
.::::..::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::.:: ::::::.:..:::
NP_004 IVKLQVINLAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQNYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGAL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 SKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRN
:..:::.::: ::::.::: ::::::::::.::: :: ::::: :: .::: ::::::::
NP_004 SRHAKKLFLAPKPAPVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRN
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KE4 VEVIELAKEWTP-AGKAKQENSAKKFYSESEEEEDSSDSS-SDSESESGSESGEQGESGE
::: ::: ... :.... : :::.:: : ..:. :: :::: :.: ..:::
NP_004 VEV----PEWTKCSNREKRKEKEKPFYSDSEGESGPTESADSDPESESESDSKSSSESGS
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 EGDSNEDSSEDSSSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSS
.:.:...:: ...: :.:: : :... :. :: .. :. . : ::
NP_004 GESSSESDNED--QDEDEEKGR--GSESEQ-----SEEDGKRKTK---KKVPERKGEASS
720 730 740 750
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pF1KE4 NDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRT-PLTKDVSLLDLDDFNPV
.::.: ..:::.:::: ::: :. . .. ..: .... : ::..:::::.::.:
NP_004 SDEGS--DSSSSSSESEMTSESEEEQLEPASWSRKTPPSSKSAPATKEISLLDLEDFTPP
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KE4 STPVALPTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYF
:. . : .: :: :::::: :. :. : :. .:. . . ::::..:.:::. :
NP_004 SVQPVSPPAIVSTSLAADLEGLTLTDSTLVPSLLSPV-SGVGRQELLHRVAGEGLAVDYT
820 830 840 850 860 870
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 FPRQPCIFGD-KMVSIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSIT
: ::: . :: .:::..: ..:..: :...:.: ::: :.... : :.:: : : :
NP_004 FSRQP-FSGDPHMVSVHIHFSNSSDTPIKGLHVGTPKLPAGISIQEFPEIESLAPGESAT
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 VSMGIDFCDSTQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNET
. :::.::::::.:.:::::. : :.::::::::. :: :::..:::::: : ::::
NP_004 AVMGINFCDSTQAANFQLCTQTRQFYVSIQPPVGELMAPVFMSENEFKKEQGKLMGMNEI
940 950 960 970 980 990
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE4 SAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGS
. .. . .. :::. .::.: :: : .. .:::..:. .:::.:.:.. . ..
NP_004 TEKLMLPDTCRSDHIVVQKVTATANLGRVPCGTSDEYRFAGRTLTGGSLVLLTLDARPAG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1070 1080 1090
pF1KE4 TAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQG
.::: .:.:: :::..:.... .:.:
NP_004 AAQLTVNSEKMVIGTMLVKDVIQALTQ
1060 1070 1080
>>XP_016878130 (OMIM: 602166) PREDICTED: AP-3 complex su (629 aa)
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Smith-Waterman score: 3000; 76.7% identity (92.0% similar) in 615 aa overlap (8-612:7-617)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKL
:.:..::. . :. . :: :.:::: :...:::.::..:::: ::
XP_016 MSAAPAYSEDKGGSAGP--GEPEYGHDPASG--GIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKL
10 20 30 40 50
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pF1KE4 DAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
.::::::.:::.:::::.:::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAMKRIVAMIARGKNASDLFPAVVKNVACKNIEVKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTF
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 QRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSL
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:.::::::.::::: :::::
XP_016 QRGLKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWG
: .::..::::::::: ::.::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::
XP_016 DSDQKDQLIEVIEKLLADKTTLVAGSVVMAFEEVCPERIDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWG
180 190 200 210 220 230
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pF1KE4 QVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNG-KNFYESDDDQ-----KEKTDK----KKKP
::::: ::::::::::.:: .. . ::.:. : :: :..:. .:.: ..::
XP_016 QVVIISMLTRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]