Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4584
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4584, 853 aa
1>>>pF1KE4584 853 - 853 aa - 853 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4697+/-0.00104; mu= 19.6986+/- 0.063
mean_var=66.1184+/-12.813, 0's: 0 Z-trim(103.4): 72 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.157730
statistics sampled from 7296 (7371) to 7296 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54703.1 PDE6B gene_id:5158|Hs108|chr4 ( 853) 5706 1308.0 0
CCDS33932.1 PDE6B gene_id:5158|Hs108|chr4 ( 854) 5694 1305.3 0
CCDS4299.1 PDE6A gene_id:5145|Hs108|chr5 ( 860) 4189 962.8 0
CCDS46993.1 PDE6B gene_id:5158|Hs108|chr4 ( 575) 3833 881.7 0
CCDS7429.1 PDE6C gene_id:5146|Hs108|chr10 ( 858) 3781 870.0 0
CCDS42786.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 489) 565 138.0 3.8e-32
CCDS46459.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 575) 565 138.1 4.4e-32
CCDS42785.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 683) 565 138.1 5.1e-32
CCDS33334.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 933) 565 138.2 6.7e-32
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 501 123.5 9.6e-28
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 501 123.5 9.7e-28
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 501 123.5 1.2e-27
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 501 123.5 1.2e-27
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 501 123.5 1.2e-27
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 501 123.5 1.3e-27
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 501 123.5 1.3e-27
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 501 123.6 1.4e-27
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 499 123.1 1.6e-27
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 499 123.1 2e-27
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 499 123.1 2.1e-27
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 499 123.1 2.1e-27
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 499 123.1 2.1e-27
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 478 118.3 4.2e-26
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 478 118.3 4.6e-26
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 478 118.3 4.8e-26
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 453 112.5 1.8e-24
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 453 112.6 2e-24
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 453 112.6 2.5e-24
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 453 112.6 2.6e-24
CCDS5289.1 PDE10A gene_id:10846|Hs108|chr6 ( 779) 418 104.7 6.7e-22
CCDS47513.1 PDE10A gene_id:10846|Hs108|chr6 ( 789) 418 104.7 6.8e-22
CCDS73345.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 920) 410 102.9 2.7e-21
CCDS53678.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 932) 410 102.9 2.8e-21
CCDS44670.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 934) 410 102.9 2.8e-21
CCDS8216.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 941) 410 102.9 2.8e-21
CCDS34055.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 833) 402 101.0 8.9e-21
CCDS3713.1 PDE5A gene_id:8654|Hs108|chr4 ( 875) 402 101.0 9.3e-21
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 353 89.8 1.1e-17
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 353 89.8 1.2e-17
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 353 89.8 1.2e-17
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 353 89.8 1.2e-17
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 353 89.8 1.3e-17
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 353 89.8 1.3e-17
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 353 89.8 1.3e-17
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 353 89.8 1.4e-17
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 353 89.8 1.4e-17
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 353 89.8 1.4e-17
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 353 89.8 1.4e-17
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 353 89.8 1.4e-17
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 353 89.8 1.5e-17
>>CCDS54703.1 PDE6B gene_id:5158|Hs108|chr4 (853 aa)
initn: 5706 init1: 5706 opt: 5706 Z-score: 7009.3 bits: 1308.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5706; 99.8% identity (100.0% similar) in 853 aa overlap (1-853:1-853)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLSEEQARSFLDQNPDFARQYFGKKLSPENVAAACEDGCPPDCDSLRDLCQVEESTALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSLSEEQARSFLDQNPDFARQYFGKKLSPENVAAACEDGCPPDCDSLRDLCQVEESTALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ELVQDMQESINMERVVFKVLRRLCTLLQADRCSLFMYRQRNGVAELATRLFSVQPDSVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ELVQDMQESINMERVVFKVLRRLCTLLQADRCSLFMYRQRNGVAELATRLFSVQPDSVLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DCLVPPDSEIVFPLDIGVVGHVAQTKKMVNVEDVAECPHFSSFADELTDYKTKNMLATPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DCLVPPDSEIVFPLDIGVVGHVAQTKKMVNVEDVAECPHFSSFADELTDYKTKNMLATPI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MNGKDVVAVIMAVNKLNGPFFTSEDEDVFLKYLNFATLYLKIYHLSYLHNCETRRGQVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MNGKDVVAVIMAVNKLNGPFFTSEDEDVFLKYLNFATLYLKIYHLSYLHNCETRRGQVLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 WSANKVFEELTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGESQPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WSANKVFEELTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGESQPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SGPRTPDGREIVFYKVIDYILHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMNA
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SGPRTPDGREIVFYKVIDYVLHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SADEMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEVLMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SADEMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEVLMES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LTQFLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPADC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LTQFLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPADC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 DEDELGEILKEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DEDELGEILKEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 VRFLFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VRFLFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDID
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 HRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHDHVIHLM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS54 HRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHEHVIHLM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 DIAIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTACDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DIAIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTACDLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 AITKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AITKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFVCT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 FVYKEFSRFHEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKKGTEICN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FVYKEFSRFHEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKKGTEICN
790 800 810 820 830 840
850
pF1KE4 GGPAPKSSTCCIL
:::::::::::::
CCDS54 GGPAPKSSTCCIL
850
>>CCDS33932.1 PDE6B gene_id:5158|Hs108|chr4 (854 aa)
initn: 5564 init1: 5564 opt: 5694 Z-score: 6994.5 bits: 1305.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5694; 99.6% identity (99.9% similar) in 854 aa overlap (1-853:1-854)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLSEEQARSFLDQNPDFARQYFGKKLSPENVAAACEDGCPPDCDSLRDLCQVEESTALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSLSEEQARSFLDQNPDFARQYFGKKLSPENVAAACEDGCPPDCDSLRDLCQVEESTALL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ELVQDMQESINMERVVFKVLRRLCTLLQADRCSLFMYRQRNGVAELATRLFSVQPDSVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELVQDMQESINMERVVFKVLRRLCTLLQADRCSLFMYRQRNGVAELATRLFSVQPDSVLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DCLVPPDSEIVFPLDIGVVGHVAQTKKMVNVEDVAECPHFSSFADELTDYKTKNMLATPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DCLVPPDSEIVFPLDIGVVGHVAQTKKMVNVEDVAECPHFSSFADELTDYKTKNMLATPI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 MNGKDVVAVIMAVNKLNGPFFTSEDEDVFLKYLNFATLYLKIYHLSYLHNCETRRGQVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNGKDVVAVIMAVNKLNGPFFTSEDEDVFLKYLNFATLYLKIYHLSYLHNCETRRGQVLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 WSANKVFEELTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGESQPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WSANKVFEELTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGESQPY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SGPRTPDGREIVFYKVIDYILHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMNA
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SGPRTPDGREIVFYKVIDYVLHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SADEMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEVLMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SADEMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEVLMES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LTQFLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPADC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTQFLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPADC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 DEDELGEILKEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DEDELGEILKEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 VRFLFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRFLFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDID
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 HRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHDHVIHLM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS33 HRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHEHVIHLM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 DIAIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTACDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DIAIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTACDLS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 AITKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AITKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFVCT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KE4 FVYKEFSRFHEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKK-GTEIC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS33 FVYKEFSRFHEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKKVGTEIC
790 800 810 820 830 840
840 850
pF1KE4 NGGPAPKSSTCCIL
::::::::::::::
CCDS33 NGGPAPKSSTCCIL
850
>>CCDS4299.1 PDE6A gene_id:5145|Hs108|chr5 (860 aa)
initn: 4164 init1: 4119 opt: 4189 Z-score: 5143.6 bits: 962.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4189; 71.8% identity (89.4% similar) in 859 aa overlap (3-852:4-859)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLSEEQARSFLDQNPDFARQYFGKKLSPENVA---AACEDGCPPDCDSLRDLCQVEES
.. :....:::.: ::.::.. . . .. .: : . : .. .. ..:::
CCDS42 MGEVTAEEVEKFLDSNIGFAKQYYNLHYRAKLISDLLGAKEAAV--DFSNYHSPSSMEES
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 TALLELVQDMQESINMERVVFKVLRRLCTLLQADRCSLFMYRQRNGVAELATRLFSVQPD
...:..:.::... :. .:.:...:: :::::: :::::: :::.::::::::.:. :
CCDS42 EIIFDLLRDFQENLQTEKCIFNVMKKLCFLLQADRMSLFMYRTRNGIAELATRLFNVHKD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SVLEDCLVPPDSEIVFPLDIGVVGHVAQTKKMVNVEDVAECPHFSSFADELTDYKTKNML
.::::::: ::.:::::::.:.:::::..::..:: .. : :: .:.: ::.:::::.:
CCDS42 AVLEDCLVMPDQEIVFPLDMGIVGHVAHSKKIANVPNTEEDEHFCDFVDILTEYKTKNIL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ATPIMNGKDVVAVIMAVNKLNGPFFTSEDEDVFLKYLNFATLYLKIYHLSYLHNCETRRG
:.::::::::::.::::::..: ::..::...:::::::.: .:.::::::::::::::
CCDS42 ASPIMNGKDVVAIIMAVNKVDGSHFTKRDEEILLKYLNFANLIMKVYHLSYLHNCETRRG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QVLLWSANKVFEELTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGE
:.::::..::::::::::::::::.:::::.:::.:::::::::::.::::::: :::::
CCDS42 QILLWSGSKVFEELTDIERQFHKALYTVRAFLNCDRYSVGLLDMTKQKEFFDVWPVLMGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SQPYSGPRTPDGREIVFYKVIDYILHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICN
::::::::::::: :::::::::::::.:::::.: :::::.::::.:::..:.:::
CCDS42 VPPYSGPRTPDGREINFYKVIDYILHGKEDIKVIPNPPPDHWALVSGLPAYVAQNGLICN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 IMNASADEMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEV
:::: :...: ::. ::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.
CCDS42 IMNAPAEDFFAFQKEPLDESGWMIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEMDET
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LMESLTQFLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKE
:::::::::::::.: :::..:::::::::: ::.: :::::: .::: :: :: :::
CCDS42 LMESLTQFLGWSVLNPDTYESMNKLENRKDIFQDIVKYHVKCDNEEIQKILKTREVYGKE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 PADCDEDELGEILKEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIP
: .:.:.::.:::. ::: ..: .:::::: :::.:::::::::::: :: ::.::
CCDS42 PWECEEEELAEILQAELPDADKYEINKFHFSDLPLTELELVKCGIQMYYELKVVDKFHIP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 QEVLVRFLFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLC
::.::::..:.:::::.::::::::::::.::::.::.::::: :.:::::.:::::..:
CCDS42 QEALVRFMYSLSKGYRKITYHNWRHGFNVGQTMFSLLVTGKLKRYFTDLEALAMVTAAFC
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 HDIDHRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHDHV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: .:.:::.::::::::.:.
CCDS42 HDIDHRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKTLLRDESLNIFQNLNRRQHEHA
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 IHLMDIAIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTA
::.:::::::::::::::::.:::::::.::.:.... :..:. :: :::::::::::::
CCDS42 IHMMDIAIIATDLALYFKKRTMFQKIVDQSKTYESEQEWTQYMMLEQTRKEIVMAMMMTA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 CDLSAITKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFID
::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::: :::::::::::
CCDS42 CDLSAITKPWEVQSQVALLVAAEFWEQGDLERTVLQQNPIPMMDRNKADELPKLQVGFID
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 FVCTFVYKEFSRFHEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVA--AKK
::::::::::::::::: ::.: . :::::::::::::.::.:. :::..... : :
CCDS42 FVCTFVYKEFSRFHEEITPMLDGITNNRKEWKALADEYDAKMKVQEEKKQKQQSAKSAAA
780 790 800 810 820 830
840 850
pF1KE4 GTEICNGGPAP----KSSTCCIL
:.. .:.:.: :..:::
CCDS42 GNQP-GGNPSPGGATTSKSCCIQ
840 850 860
>>CCDS46993.1 PDE6B gene_id:5158|Hs108|chr4 (575 aa)
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Smith-Waterman score: 3833; 99.5% identity (99.8% similar) in 575 aa overlap (280-853:1-575)
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGESQPYSGPRTPDGR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTKEKEFFDVWSVLMGESQPYSGPRTPDGR
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310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EIVFYKVIDYILHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMNASADEMFKFQ
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIVFYKVIDYVLHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMNASADEMFKFQ
40 50 60 70 80 90
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEVLMESLTQFLGWSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEVLMESLTQFLGWSV
100 110 120 130 140 150
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 MNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPADCDEDELGEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPADCDEDELGEIL
160 170 180 190 200 210
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 KEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEVLVRFLFSISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEVLVRFLFSISK
220 230 240 250 260 270
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 GYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDIDHRGTNNLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDIDHRGTNNLYQ
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 MKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHDHVIHLMDIAIIATDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS46 MKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHEHVIHLMDIAIIATDL
340 350 360 370 380 390
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 ALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTACDLSAITKPWEVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTACDLSAITKPWEVQ
400 410 420 430 440 450
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 SKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFVCTFVYKEFSRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFVCTFVYKEFSRF
460 470 480 490 500 510
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 HEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKK-GTEICNGGPAPKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS46 HEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKKVGTEICNGGPAPKSS
520 530 540 550 560 570
850
pF1KE4 TCCIL
:::::
CCDS46 TCCIL
>>CCDS7429.1 PDE6C gene_id:5146|Hs108|chr10 (858 aa)
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Smith-Waterman score: 3781; 64.3% identity (86.5% similar) in 855 aa overlap (3-853:4-858)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLSEEQARSFLDQNPDFARQYFGKKLSPENVAAACEDGCPPDCDSLR--DLCQVEEST
... ....:..::.::..:: .:: : .. ... : .:. .: :::::.
CCDS74 MGEINQVAVEKYLEENPQFAKEYFDRKLRVEVLGEIFKNSQVPVQSSMSFSELTQVEESA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ALLELVQDMQESINM-ERVVFKVLRRLCTLLQADRCSLFMYRQRNGVAELATRLFSVQPD
:::. .:: . :. : ..:.:: ::::::::.:. :.:::. :.:.::..: :
CCDS74 LCLELLWTVQEEGGTPEQGVHRALQRLAHLLQADRCSMFLCRSRNGIPEVASRLLDVTPT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SVLEDCLVPPDSEIVFPLDIGVVGHVAQTKKMVNVEDVAECPHFSSFADELTDYKTKNML
: .:: :: ::.:.:::::::.:: .:.::: :: :: . :::.: :. : : :::.:
CCDS74 SKFEDNLVGPDKEVVFPLDIGIVGWAAHTKKTHNVPDVKKNSHFSDFMDKQTGYVTKNLL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ATPIMNGKDVVAVIMAVNKLNGPFFTSEDEDVFLKYLNFATLYLKIYHLSYLHNCETRRG
::::. ::.:.::::::::.:. :...::.:: :::::... :...: ::..: :.::.
CCDS74 ATPIVVGKEVLAVIMAVNKVNASEFSKQDEEVFSKYLNFVSIILRLHHTSYMYNIESRRS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QVLLWSANKVFEELTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGE
:.:.::::::::::::.:::::::.::::.::::::::.:::::::::::.: : . .::
CCDS74 QILMWSANKVFEELTDVERQFHKALYTVRSYLNCERYSIGLLDMTKEKEFYDEWPIKLGE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SQPYSGPRTPDGREIVFYKVIDYILHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICN
.::.::.::::::. :::.::::::::::::::::: ::::.: ::::.::::.:::::
CCDS74 VEPYKGPKTPDGREVNFYKIIDYILHGKEEIKVIPTPPADHWTLISGLPTYVAENGFICN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 IMNASADEMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEV
.::: :::.: ::.: .:..::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::.::
CCDS74 MMNAPADEYFTFQKGPVDETGWVIKNVLSLPIVNKKEDIVGVATFYNRKDGKPFDEHDEY
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LMESLTQFLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKE
. :.::::::::..:::::::::::::::::::.:.. ..: .::. :: . .:. .
CCDS74 ITETLTQFLGWSLLNTDTYDKMNKLENRKDIAQEMLMNQTKATPEEIKSILKFQEKLNVD
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 PAD-CDEDELGEILKEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQI
: :.: .: ::::.:: : . ..:::.:::. :: :.::::....:..::.::..
CCDS74 VIDDCEEKQLVAILKEDLPDPRSAELYEFRFSDFPLTEHGLIKCGIRLFFEINVVEKFKV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 PQEVLVRFLFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGL
: :::.:..... :::: .:::::::::::.::::::::::.::.::::::::::..:..
CCDS74 PVEVLTRWMYTVRKGYRAVTYHNWRHGFNVGQTMFTLLMTGRLKKYYTDLEAFAMLAAAF
550 560 570 580 590 600
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pF1KE4 CHDIDHRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHDH
::::::::::::::::: .:::.:::::::::::::..: ::..:.:::.::::.:: .
CCDS74 CHDIDHRGTNNLYQMKSTSPLARLHGSSILERHHLEYSKTLLQDESLNIFQNLNKRQFET
610 620 630 640 650 660
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pF1KE4 VIHLMDIAIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMT
::::...::::::::::::::.::::::: ...: .. ..:.... :.:::.::::::
CCDS74 VIHLFEVAIIATDLALYFKKRTMFQKIVDACEQMQTEEEAIKYVTVDPTKKEIIMAMMMT
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 ACDLSAITKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFI
:::::::::::::::.:::.:: :::::::::::::.::::::::::: ::::::::::
CCDS74 ACDLSAITKPWEVQSQVALMVANEFWEQGDLERTVLQQQPIPMMDRNKRDELPKLQVGFI
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 DFVCTFVYKEFSRFHEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKKG
:::::::::::::::.:: ::.. ::::: :::.:::::.::.:..::. .... .:.:.
CCDS74 DFVCTFVYKEFSRFHKEITPMLSGLQNNRVEWKSLADEYDAKMKVIEEEAKKQEGGAEKA
790 800 810 820 830 840
840 850
pF1KE4 TEICNGGPAPKSSTCCIL
.: .:: ::.:: .:
CCDS74 AEDSGGGDDKKSKTCLML
850
>>CCDS42786.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 (489 aa)
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310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RTPDGREIVFYKVIDYILHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMNASAD
: . : . ... :: .:. :: .: :
CCDS42 MSPKCSADAENSFKESMEKSSYSDWLINNSIAELVASTGLPVNISDAYQD
10 20 30 40 50
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEVLMESLTQ
.:. : . ::. :..:: .:: :....:.::: :: ::::::. :. :.:...
CCDS42 P--RFDAEADQISGFHIRSVLCVPIWNSNHQIIGVAQVLNRLDGKPFDDADQRLFEAFVI
60 70 80 90 100
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pF1KE4 FLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPADCDED
: : .. :: ::...: ....: :.. ::. :.. :. :.
CCDS42 FCGLGINNTIMYDQVKKSWAKQSVALDVLSYHATCSKAEV-----------------DKF
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pF1KE4 ELGEILKEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEVLVRF
. ..: : . . : ..::.:. .. ...:..:::.:.::.: :.: :.
CCDS42 KAANI-----PLVSELAIDDIHFDDFSLDVDAMITAALRMFMELGMVQKFKIDYETLCRW
160 170 180 190 200
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pF1KE4 LFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDIDHRG
:... :.:: . ::::::.::: : ::..: :. ... :..: .:.... ::::.::::
CCDS42 LLTVRKNYRMVLYHNWRHAFNVCQLMFAMLTTAGFQDILTEVEILAVIVGCLCHDLDHRG
210 220 230 240 250 260
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 TNNLYQMKSQNPLAKLHGSSI-LERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHDHVIHLMDI
::: .: :: . ::.:.:.: ::.::.. . ..:. : ::. ::. .... ...:.
CCDS42 TNNAFQAKSGSALAQLYGTSATLEHHHFNHAVMILQSEGHNIFANLSSKEYSDLMQLLKQ
270 280 290 300 310 320
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pF1KE4 AIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTACDLSAI
.:.::::.:::..:. : ..: ::. : : .... : .: .:.::::::.:.
CCDS42 SILATDLTLYFERRTEFFELV--SKGEYD---W----NIKNHR-DIFRSMLMTACDLGAV
330 340 350 360 370
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pF1KE4 TKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFVCTFV
:::::.. .:: ::..::.:::: :: : : ..:::. :::.::. .:: .: .
CCDS42 TKPWEISRQVAELVTSEFFEQGDRERLELKLTPSAIFDRNRKDELPRLQLEWIDSICMPL
380 390 400 410 420 430
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 YKEFSRFHEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKKGTEICNGG
:. . . . .. ::.: . .::..:. :
CCDS42 YQALVKVNVKLKPMLDSVATNRSKWEELHQKRLLASTASSSPASVMVAKEDRN
440 450 460 470 480
>>CCDS46459.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 (575 aa)
initn: 1227 init1: 418 opt: 565 Z-score: 689.5 bits: 138.1 E(32554): 4.4e-32
Smith-Waterman score: 1175; 34.9% identity (64.5% similar) in 602 aa overlap (212-810:4-550)
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NGKDVVAVIMAVNKLNGPFFTSEDEDVFLKYLNFATLYLKIYHLSYLHNCETRRGQVLLW
:: : . .. .: : .:...::
CCDS46 MQMYLPFCGIAISNAQLFAASRKEYERSRALLE
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SANKVFEELTDIERQFHKAFYTVRAYLNCERYSVGLLDMTKEKEFFDVWSVLMGESQPYS
.: .::: ::.:. .: .. ... :.::: :: ::. :. : .. .. .
CCDS46 VVNDLFEEQTDLEKIVKKIMHRAQTLLKCERCSVLLLE--------DIESPVVKFTKSFE
40 50 60 70 80
310 320 330 340 350
pF1KE4 --GPRTPDGREIVFYKVIDYILHGKEEIKVIPTPSADHWALASGLPSYVAESGFICNIMN
.:. : : :: .. : . : . ... :: .:. :: .
CCDS46 LMSPKCSADAENSF----------KESME---KSSYSDWLINNSIAELVASTGLPVNISD
90 100 110 120 130
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ASADEMFKFQEGALDDSGWLIKNVLSMPIVNKKEEIVGVATFYNRKDGKPFDEQDEVLME
: : .:. : . ::. :..:: .:: :....:.::: :: ::::::. :. :.:
CCDS46 AYQDP--RFDAEADQISGFHIRSVLCVPIWNSNHQIIGVAQVLNRLDGKPFDDADQRLFE
140 150 160 170 180 190
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 SLTQFLGWSVMNTDTYDKMNKLENRKDIAQDMVLYHVKCDRDEIQLILPTRARLGKEPAD
... : : .. :: ::...: ....: :.. ::. :.. :.. : :
CCDS46 AFVIFCGLGINNTIMYDQVKKSWAKQSVALDVLSYHATCSKAEVD----------KFKA-
200 210 220 230
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 CDEDELGEILKEELPGPTTFDIYEFHFSDLECTELDLVKCGIQMYYELGVVRKFQIPQEV
..: . . : ..::.:. .. ...:..:::.:.::.: :.
CCDS46 -----------ANIPLVSELAIDDIHFDDFSLDVDAMITAALRMFMELGMVQKFKIDYET
240 250 260 270 280
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 LVRFLFSISKGYRRITYHNWRHGFNVAQTMFTLLMTGKLKSYYTDLEAFAMVTAGLCHDI
: :.:... :.:: . ::::::.::: : ::..: :. ... :..: .:.... ::::.
CCDS46 LCRWLLTVRKNYRMVLYHNWRHAFNVCQLMFAMLTTAGFQDILTEVEILAVIVGCLCHDL
290 300 310 320 330 340
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 DHRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSI-LERHHLEFGKFLLSEETLNIYQNLNRRQHDHVIH
::::::: .: :: . ::.:.:.: ::.::.. . ..:. : ::. ::. .... ...
CCDS46 DHRGTNNAFQAKSGSALAQLYGTSATLEHHHFNHAVMILQSEGHNIFANLSSKEYSDLMQ
350 360 370 380 390 400
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 LMDIAIIATDLALYFKKRAMFQKIVDESKNYQDKKSWVEYLSLETTRKEIVMAMMMTACD
:. .:.::::.:::..:. : ..: ::. : : .... : .: .:.:::::
CCDS46 LLKQSILATDLTLYFERRTEFFELV--SKGEYD---W----NIKNHR-DIFRSMLMTACD
410 420 430 440 450
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 LSAITKPWEVQSKVALLVAAEFWEQGDLERTVLDQQPIPMMDRNKAAELPKLQVGFIDFV
:.:.:::::.. .:: ::..::.:::: :: : : ..:::. :::.::. .:: .
CCDS46 LGAVTKPWEISRQVAELVTSEFFEQGDRERLELKLTPSAIFDRNRKDELPRLQLEWIDSI
460 470 480 490 500 510
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 CTFVYKEFSRFHEEILPMFDRLQNNRKEWKALADEYEAKVKALEEKEEEERVAAKKGTEI
: .:. . . . .. ::.: . .::..:. :
CCDS46 CMPLYQALVKVNVKLKPMLDSVATNRSKWEELHQKRLLASTASSSPASVMVAKEDRN
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CCDS42 ALVKVNVKLKPMLDSVATNRSKWEELHQKRLLASTASSSPASVMVAKEDRN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]