Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4582, 817 aa
1>>>pF1KE4582 817 - 817 aa - 817 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1845+/-0.000349; mu= 17.7705+/- 0.022
mean_var=104.6831+/-20.540, 0's: 0 Z-trim(117.2): 40 B-trim: 49 in 1/54
Lambda= 0.125353
statistics sampled from 28966 (29006) to 28966 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.34), width: 16
Scan time: 10.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000350 (OMIM: 190195,242300) protein-glutamine ( 817) 5599 1023.6 0
NP_000120 (OMIM: 134570,188050,608446,613225) coag ( 732) 1961 365.6 4.4e-100
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XP_011527330 (OMIM: 190196) PREDICTED: protein-glu ( 687) 1514 284.8 9e-76
NP_004604 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 687) 1514 284.8 9e-76
NP_001310247 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 627) 1395 263.2 2.5e-69
NP_003236 (OMIM: 600238) protein-glutamine gamma-g ( 693) 1355 256.0 4.1e-67
NP_443187 (OMIM: 606776) protein-glutamine gamma-g ( 710) 1340 253.3 2.8e-66
XP_016877392 (OMIM: 606776) PREDICTED: protein-glu ( 711) 1340 253.3 2.8e-66
NP_945189 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 548) 1330 251.4 7.9e-66
NP_001241663 (OMIM: 613900,613908) protein-glutami ( 625) 1329 251.3 9.9e-66
NP_945345 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine ( 706) 1329 251.3 1.1e-65
NP_001310246 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 606) 1283 243.0 3.1e-63
NP_963925 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 720) 1259 238.7 7.1e-62
NP_004236 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 638) 1110 211.7 8.4e-54
XP_011519652 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 951 183.0 4.2e-45
NP_000110 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte membra ( 721) 951 183.0 4.2e-45
XP_011519653 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 951 183.0 4.2e-45
XP_011519651 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 951 183.0 4.2e-45
NP_001107606 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte mem ( 691) 948 182.4 5.9e-45
XP_011519654 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 709) 769 150.0 3.3e-35
XP_011519656 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 536) 732 143.3 2.8e-33
XP_005254282 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 656) 618 122.7 5.2e-27
XP_011519655 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 686) 618 122.7 5.4e-27
XP_011520532 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 394 82.0 5.3e-15
XP_016878218 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 394 82.0 5.3e-15
>>NP_000350 (OMIM: 190195,242300) protein-glutamine gamm (817 aa)
initn: 5599 init1: 5599 opt: 5599 Z-score: 5472.8 bits: 1023.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5599; 100.0% identity (100.0% similar) in 817 aa overlap (1-817:1-817)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MMDGPRSDVGRWGGNPLQPPTTPSPEPEPEPDGRSRRGGGRSFWARCCGCCSCRNAADDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MMDGPRSDVGRWGGNPLQPPTTPSPEPEPEPDGRSRRGGGRSFWARCCGCCSCRNAADDD
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pF1KE4 WGPEPSDSRGRGSSSGTRRPGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WGPEPSDSRGRGSSSGTRRPGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 RSDQNRREHHTDEYEYDELIVRRGQPFHMLLLLSRTYESSDRITLELLIGNNPEVGKGTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RSDQNRREHHTDEYEYDELIVRRGQPFHMLLLLSRTYESSDRITLELLIGNNPEVGKGTH
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190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VIIPVGKGGSGGWKAQVVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VIIPVGKGGSGGWKAQVVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPR
190 200 210 220 230 240
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pF1KE4 NEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDA
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310 320 330 340 350 360
pF1KE4 CLYILDRRGMPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CLYILDRRGMPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVE
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDEN
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430 440 450 460 470 480
pF1KE4 MKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESI
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NP_000 KNGLVYMKYDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDI
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pF1KE4 TYLYKHPEGSDAERKAVETAAAHGSKPNVYANRGSAEDVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TYLYKHPEGSDAERKAVETAAAHGSKPNVYANRGSAEDVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVML
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610 620 630 640 650 660
pF1KE4 INHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVELAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLV
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NP_000 INHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVELAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLV
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NP_000 DQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVT
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pF1KE4 LTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHG
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pF1KE4 VIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
790 800 810
>>NP_000120 (OMIM: 134570,188050,608446,613225) coagulat (732 aa)
initn: 1774 init1: 1374 opt: 1961 Z-score: 1917.8 bits: 365.6 E(85289): 4.4e-100
Smith-Waterman score: 1961; 43.2% identity (70.3% similar) in 723 aa overlap (76-790:10-730)
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pF1KE4 RCCGCCSCRNAADDDWGPEPSDSRGRGSSSGTRR--P--GSRGSDSRRPVSRGSGVNAAG
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pF1KE4 DGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDELIVRRGQPFHMLLLLSRTYESS-
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pF1KE4 DRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIP-VGKGGSGGWKAQVVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGK
: . .: .:: :. .:::.. .: :.. :: : :..: ... : ...::. :.::
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pF1KE4 FQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGT
:.. : . . : .. .:... :::::::: .: ::.:.: :.:::::. : :.::
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pF1KE4 EAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLI
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NP_000 VNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLV
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pF1KE4 GNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVT
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NP_000 GSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVT
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pF1KE4 NFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVD
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NP_000 NYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVD
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pF1KE4 ATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVE
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pF1KE4 DVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVMLINHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVE
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NP_000 NVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVT
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pF1KE4 LAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTL
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NP_000 LEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKV
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:. :::.. : . : ::: :: :: .:.: :. :: .: : :: ..
NP_000 RGTQVVGSDMTVTVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCR
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pF1KE4 PVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
: : :.::::..: .: .:.: ..:.. :
NP_000 PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM
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>>NP_003232 (OMIM: 600585) protein-glutamine gamma-gluta (684 aa)
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Smith-Waterman score: 1632; 37.9% identity (69.3% similar) in 678 aa overlap (110-779:8-675)
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pF1KE4 PGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDEL
: : .:.:.. .: ::: :.. .
NP_003 MMDASKELQVLHIDFLNQ---DNAVSHHTWEFQTSSP
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pF1KE4 IVRRGQPFHMLLLLSRTYESSDRITLELLIGNNPEVGKGTHVII-PVGKGGSGGWKAQVV
. :::: ::. :.:.. .: .. ::. : :: ..: : :.. : . .:.: .
NP_003 VFRRGQVFHLRLVLNQPLQSYHQLKLEFSTGPNPSIAKHTLVVLDPRTPSDHYNWQATLQ
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pF1KE4 KASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYV
. ::..... : .:::::.::.:..:.: :. : . .: .:.:::::: ::.:..
NP_003 NESGKEVTVAVTSSPNAILGKYQLNVKT----GNHILK-SEENILYLLFNPWCKEDMVFM
100 110 120 130 140
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pF1KE4 DHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDP
:: :.::.::..: : :. .: . ::.:::...::: :. .: . .. : ::
NP_003 PDEDERKEYILNDTGCHYVGAARSIKCKPWNFGQFEKNVLDCCISLLTESSLKPTDRRDP
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pF1KE4 VNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCW
: : :.. ::.. .:::::::.::: :: : :.::. :: .: : .: .::::
NP_003 VLVCRAMCAMMSFEKGQGVLIGNWTGDYEGGTAPYKWTGSAPILQQYYNTKQAVCFGQCW
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 VFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVW
::::. ::::: ::. .:.::.:.:::::. .::.: : .:: . . ..::::::::::
NP_003 VFAGILTTVLRALGIPARSVTGFDSAHDTERNLTVDTYVNENGEKITSMTHDSVWNFHVW
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 NDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEV
.: ::::::::.:.::::.::::::: :.:.::::: . .:..: ... ::: :.:.::
NP_003 TDAWMKRPDLPKGYDGWQAVDATPQERSQGVFCCGPSPLTAIRKGDIFIVYDTRFVFSEV
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 NSDKVYWQ-RQDDGS--FKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEGSDAERK
:.:.. : .. .:. .... .: .:: : :::.... :.:::: ::.::::. ::.
NP_003 NGDRLIWLVKMVNGQEELHVISMETTSIGKNISTKAVGQDRRRDITYEYKYPEGSSEERQ
390 400 410 420 430 440
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pF1KE4 AVETAAAHGSKPNVYANRGSAED-VAMQVEAQDAVMGQDLMVSVMLINHSSSRRTVKLHL
... : :. . : :. . :.:...:...:... .:.: .... ..:..
NP_003 VMDHAFLLLSSEREH-RRPVKENFLHMSVQSDDVLLGNSVNFTVILKRKTAALQNVNILG
450 460 470 480 490 500
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pF1KE4 YLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVELAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLV---DQGAMLLNVSG
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NP_003 SFELQLYTGKKMAKLCDLNKTSQIQ-GQVSEVTLTLDSKTYINSLAILDDEPVIRGFIIA
510 520 530 540 550 560
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pF1KE4 HVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVTLTNVVFRLEGS
.. :: ...:.. .. :..:. : ... .:: . .::: : . ::.: : ::.
NP_003 EIVESKEIMASEVFTSFQYPEFSIELPNTGRIGQLLVCNCIFKNTLAIPLTDVKFSLESL
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pF1KE4 GLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPG
:.. . . : . .::. . . .:.. ::...:..:.: :.....
NP_003 GISSLQTSDHGTVQPGETIQSQIKCTPIKTGPKKFIVKLSSKQVKEINAQKIVLITK
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pF1KE4 DGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
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XP_011 IVKLSSKQVKEINAQKIVLITK
710 720
>>NP_001310245 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-gl (687 aa)
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NP_001 RNVIIGPA
680
>>XP_011527330 (OMIM: 190196) PREDICTED: protein-glutami (687 aa)
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XP_011 MAEELVLERCDL---ELETNGRDHHTADLCREKL
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pF1KE4 IVRRGQPFHMLLLL-SRTYESS-DRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIPVGKG-GSGGWKAQ
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pF1KE4 IQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
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XP_011 RNVIIGPA
680
>>NP_004604 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-gluta (687 aa)
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NP_004 MAEELVLERCDL---ELETNGRDHHTADLCREKL
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pF1KE4 VVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIV
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NP_004 VVDQQDCTLSLQLTTPANAPIGLYRLSLEASTG---YQGSSFVLGHFILLFNAWCPADAV
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pF1KE4 YVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILD-------RRG
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pF1KE4 -YSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLN
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NP_004 CQRVKYGQCWVFAAVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIE-YFRNEFGEIQGDK
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NP_004 SEMIWNFHCWVESWMTRPDLQPGYEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTK
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pF1KE4 YDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPE
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NP_004 YDAPFVFAEVNADVVDWIQQDDGSVHKSINRSLIVGLKISTKSVGRDEREDITHTYKYPE
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NP_004 GSSEEREAF-TRANHLNKLAEKEETG----MAMRIRVGQSMNMGSDFDVFAHITNNTAEE
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NP_004 LIKVRALLVEPVINSYLLAERDLYLENPEIKIRILGEPKQKRKLVAEVSLQNPLPVALEG
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pF1KE4 VVFRLEGSGL-QRPKILNVGD-IGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGV
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NP_004 CTFTVEGAGLTEEQKTVEIPDPVEAGEEVKVRMDLLPLHMGLHKLVVNFESDKLKAVKGF
620 630 640 650 660 670
790 800 810
pF1KE4 IQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
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NP_004 RNVIIGPA
680
>>NP_001310247 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-gl (627 aa)
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690
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