Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4582, 817 aa
1>>>pF1KE4582 817 - 817 aa - 817 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2959+/-0.000849; mu= 17.2635+/- 0.052
mean_var=104.8097+/-20.816, 0's: 0 Z-trim(110.1): 24 B-trim: 43 in 1/50
Lambda= 0.125278
statistics sampled from 11371 (11389) to 11371 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16
Scan time: 3.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9622.1 TGM1 gene_id:7051|Hs108|chr14 ( 817) 5599 1022.9 0
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CCDS2723.1 TGM4 gene_id:7047|Hs108|chr3 ( 684) 1632 305.9 1.5e-82
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CCDS33435.1 TGM3 gene_id:7053|Hs108|chr20 ( 693) 1355 255.8 1.8e-67
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CCDS13025.1 TGM6 gene_id:343641|Hs108|chr20 ( 706) 1329 251.1 4.8e-66
CCDS32212.1 TGM5 gene_id:9333|Hs108|chr15 ( 720) 1259 238.5 3.2e-62
CCDS32211.1 TGM5 gene_id:9333|Hs108|chr15 ( 638) 1110 211.5 3.7e-54
CCDS10093.1 EPB42 gene_id:2038|Hs108|chr15 ( 721) 951 182.8 1.8e-45
CCDS45249.1 EPB42 gene_id:2038|Hs108|chr15 ( 691) 948 182.2 2.5e-45
>>CCDS9622.1 TGM1 gene_id:7051|Hs108|chr14 (817 aa)
initn: 5599 init1: 5599 opt: 5599 Z-score: 5469.1 bits: 1022.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5599; 100.0% identity (100.0% similar) in 817 aa overlap (1-817:1-817)
10 20 30 40 50 60
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CCDS96 WGPEPSDSRGRGSSSGTRRPGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSS
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CCDS96 VIIPVGKGGSGGWKAQVVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPR
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CCDS96 NEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDA
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CCDS96 CLYILDRRGMPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVE
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370 380 390 400 410 420
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CCDS96 ILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 MKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESI
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CCDS96 MKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 KNGLVYMKYDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDI
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CCDS96 KNGLVYMKYDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 TYLYKHPEGSDAERKAVETAAAHGSKPNVYANRGSAEDVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVML
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CCDS96 TYLYKHPEGSDAERKAVETAAAHGSKPNVYANRGSAEDVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVML
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 INHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVELAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLV
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CCDS96 INHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVELAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLV
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pF1KE4 LTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHG
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CCDS96 LTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHG
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790 800 810
pF1KE4 VIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
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CCDS96 VIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
790 800 810
>>CCDS4496.1 F13A1 gene_id:2162|Hs108|chr6 (732 aa)
initn: 1774 init1: 1374 opt: 1961 Z-score: 1916.2 bits: 365.3 E(32554): 2e-100
Smith-Waterman score: 1961; 43.2% identity (70.3% similar) in 723 aa overlap (76-790:10-730)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 RCCGCCSCRNAADDDWGPEPSDSRGRGSSSGTRR--P--GSRGSDSRRPVSRGSGVNAAG
: :: : .: .... :. . .:: :
CCDS44 MSETSRTAFGGRRAVPPNNSNAAEDDLPTVELQGVVPRG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 DGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDELIVRRGQPFHMLLLLSRTYESS-
. ..: .: :..: :.. : : :. .::::.:: ..::::::: :.. . .:: :.
CCDS44 VN-LQE-FLNVTSVHLFKERWDTNKVDHHTDKYENNKLIVRRGQSFYVQIDFSRPYDPRR
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210
pF1KE4 DRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIP-VGKGGSGGWKAQVVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGK
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CCDS44 DLFRVEYVIGRYPQENKGTYIPVPIVSELQSGKWGAKIVMREDRSVRLSIQSSPKCIVGK
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 FQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGT
:.. : . . : .. .:... :::::::: .: ::.:.: :.:::::. : :.::
CCDS44 FRMYVAVWTPYGVLRTSRNPETDTYILFNPWCEDDAVYLDNEKEREEYVLNDIGVIFYGE
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280 290 300 310 320 330
pF1KE4 EAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILDRRGMPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLI
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CCDS44 VNDIKTRSWSYGQFEDGILDTCLYVMDRAQMDLSGRGNPIKVSRVGSAMVNAKDDEGVLV
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 GNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVT
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CCDS44 GSWDNIYAYGVPPSAWTGSVDILLEYRSSENPVRYGQCWVFAGVFNTFLRCLGIPARIVT
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 NFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVWNDCWMKRPDLPSGFDGWQVVD
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CCDS44 NYFSAHDNDANLQMDIFLEEDGNVNSKLTKDSVWNYHCWNEAWMTRPDLPVGFGGWQAVD
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pF1KE4 ATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEVNSDKVYWQRQDDGSFKIVYVE
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CCDS44 STPQENSDGMYRCGPASVQAIKHGHVCFQFDAPFVFAEVNSDLIYITAKKDGTHVVENVD
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 EKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEGSDAERKAVETAAAHGSK-P-NVYANRGSAE
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CCDS44 ATHIGKLIVTKQIGGDGMMDITDTYKFQEGQEEERLALETALMYGAKKPLNTEGVMKSRS
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 DVAMQVEAQDAVMGQDLMVSVMLINHSSSRRTVKLHLYLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVE
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CCDS44 NVDMDFEVENAVLGKDFKLSITFRNNSHNRYTITAYLSANITFYTGVPKAEFKKETFDVT
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 LAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLVDQGAMLLNVSGHVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTL
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CCDS44 LEPLSFKKEAVLIQAGEYMGQLLEQASLHFFVTARINETRDVLAKQKSTVLTIPEIIIKV
580 590 600 610 620 630
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pF1KE4 LGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVTLTNVVFRLEGSGLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFV
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CCDS44 RGTQVVGSDMTVTVEFTNPLKETLRNVWVHLDGPGVTRPMKKMFREIRPNSTVQWEEVCR
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pF1KE4 PVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPGDGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
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CCDS44 PWVSGHRKLIASMSSDSLRHVYGELDVQIQRRPSM
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>>CCDS2723.1 TGM4 gene_id:7047|Hs108|chr3 (684 aa)
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pF1KE4 PGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDEL
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140 150 160 170 180 190
pF1KE4 IVRRGQPFHMLLLLSRTYESSDRITLELLIGNNPEVGKGTHVII-PVGKGGSGGWKAQVV
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pF1KE4 KASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIVYV
. ::..... : .:::::.::.:..:.: :. : . .: .:.:::::: ::.:..
CCDS27 NESGKEVTVAVTSSPNAILGKYQLNVKT----GNHILK-SEENILYLLFNPWCKEDMVFM
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CCDS27 PDEDERKEYILNDTGCHYVGAARSIKCKPWNFGQFEKNVLDCCISLLTESSLKPTDRRDP
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pF1KE4 VNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTGYSVPYGQCW
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CCDS27 VLVCRAMCAMMSFEKGQGVLIGNWTGDYEGGTAPYKWTGSAPILQQYYNTKQAVCFGQCW
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pF1KE4 VFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLNHDSVWNFHVW
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CCDS27 VFAGILTTVLRALGIPARSVTGFDSAHDTERNLTVDTYVNENGEKITSMTHDSVWNFHVW
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pF1KE4 NDCWMKRPDLPSGFDGWQVVDATPQETSSGIFCCGPCSVESIKNGLVYMKYDTPFIFAEV
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CCDS27 TDAWMKRPDLPKGYDGWQAVDATPQERSQGVFCCGPSPLTAIRKGDIFIVYDTRFVFSEV
330 340 350 360 370 380
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pF1KE4 NSDKVYWQ-RQDDGS--FKIVYVEEKAIGTLIVTKAISSNMREDITYLYKHPEGSDAERK
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CCDS27 NGDRLIWLVKMVNGQEELHVISMETTSIGKNISTKAVGQDRRRDITYEYKYPEGSSEERQ
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pF1KE4 AVETAAAHGSKPNVYANRGSAED-VAMQVEAQDAVMGQDLMVSVMLINHSSSRRTVKLHL
... : :. . : :. . :.:...:...:... .:.: .... ..:..
CCDS27 VMDHAFLLLSSEREH-RRPVKENFLHMSVQSDDVLLGNSVNFTVILKRKTAALQNVNILG
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pF1KE4 YLSVTFYTGVSGTIFKETKKEVELAPGASDRVTMPVAYKEYRPHLV---DQGAMLLNVSG
. . .::: . . . . .: .. : ..::. . : : :. :. .. . .
CCDS27 SFELQLYTGKKMAKLCDLNKTSQIQ-GQVSEVTLTLDSKTYINSLAILDDEPVIRGFIIA
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pF1KE4 HVKESGQVLAKQHTFRLRTPDLSLTLLGAAVVGQECEVQIVFKNPLPVTLTNVVFRLEGS
.. :: ...:.. .. :..:. : ... .:: . .::: : . ::.: : ::.
CCDS27 EIVESKEIMASEVFTSFQYPEFSIELPNTGRIGQLLVCNCIFKNTLAIPLTDVKFSLESL
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pF1KE4 GLQRPKILNVGDIGGNETVTLRQSFVPVRPGPRQLIASLDSPQLSQVHGVIQVDVAPAPG
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CCDS27 GISSLQTSDHGTVQPGETIQSQIKCTPIKTGPKKFIVKLSSKQVKEINAQKIVLITK
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pF1KE4 DGGFFSDAGGDSHLGETIPMASRGGA
>>CCDS13302.1 TGM2 gene_id:7052|Hs108|chr20 (687 aa)
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pF1KE4 PGSRGSDSRRPVSRGSGVNAAGDGTIREGMLVVNGVDLLSSRSDQNRREHHTDEYEYDEL
::.. :: . . : :.::: . ..:
CCDS13 MAEELVLERCDL---ELETNGRDHHTADLCREKL
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 IVRRGQPFHMLLLL-SRTYESS-DRITLELLIGNNPEVGKGTHVIIPVGKG-GSGGWKAQ
.::::::: . : . .:.::.: : .:. .. : : ::.. .:. . : : :
CCDS13 VVRRGQPFWLTLHFEGRNYEASVDSLTFSVVTGPAPSQEAGTKARFPLRDAVEEGDWTAT
40 50 60 70 80 90
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pF1KE4 VVKASGQNLNLRVHTSPNAIIGKFQFTVRTQSDAGEFQLPFDPRNEIYILFNPWCPEDIV
:: . .:.:.. : :: :: ......... .: ... .::: ::: : :
CCDS13 VVDQQDCTLSLQLTTPANAPIGLYRLSLEASTG---YQGSSFVLGHFILLFNAWCPADAV
100 110 120 130 140
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pF1KE4 YVDHEDWRQEYVLNESGRIYYGTEAQIGERTWNYGQFDHGVLDACLYILD-------RRG
:.: :. ::::::...: :: :. : . ::.:::. :.:: :: .:: :
CCDS13 YLDSEEERQEYVLTQQGFIYQGSAKFIKNIPWNFGQFEDGILDICLILLDVNPKFLKNAG
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310 320 330 340 350 360
pF1KE4 MPYGGRGDPVNVSRVISAMVNSLDDNGVLIGNWSGDYSRGTNPSAWVGSVEILLSYLRTG
. :..:: :.::.:.::: ::.:::.: :...:. :..: .:.:::.:: . :
CCDS13 RDCSRRSSPVYVGRVVSGMVNCNDDQGVLLGRWDNNYGDGVSPMSWIGSVDILRRWKNHG
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 -YSVPYGQCWVFAGVTTTVLRCLGLATRTVTNFNSAHDTDTSLTMDIYFDENMKPLEHLN
: ::::::::.:. :::::::. ::.:::.::::: ...: .. :: ... .. .
CCDS13 CQRVKYGQCWVFAAVACTVLRCLGIPTRVVTNYNSAHDQNSNLLIE-YFRNEFGEIQGDK
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CCDS13 SEMIWNFHCWVESWMTRPDLQPGYEGWQALDPTPQEKSEGTYCCGPVPVRAIKEGDLSTK
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CCDS13 ASEEERQEYVLSDSGIIFRGVEKHIRAQGWNYGQFEEDILNICLSILDRSPGHQNNPATD
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CCDS32 YVDFAL
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