FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4579, 785 aa
1>>>pF1KE4579 785 - 785 aa - 785 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5936+/-0.000868; mu= 19.2673+/- 0.052
mean_var=72.5275+/-14.704, 0's: 0 Z-trim(107.5): 20 B-trim: 368 in 1/50
Lambda= 0.150599
statistics sampled from 9595 (9611) to 9595 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 4.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8382.1 PCSK7 gene_id:9159|Hs108|chr11 ( 785) 5444 1192.4 0
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CCDS73789.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 956) 1558 348.1 4e-95
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CCDS55320.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 (1860) 1545 345.4 5e-94
CCDS73791.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 623) 1494 334.1 4.3e-91
CCDS73793.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 652) 1494 334.1 4.5e-91
CCDS73792.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 664) 1494 334.1 4.5e-91
CCDS10364.1 FURIN gene_id:5045|Hs108|chr15 ( 794) 1459 326.5 1e-88
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CCDS4081.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 ( 753) 1435 321.3 3.6e-87
CCDS54881.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 ( 706) 1413 316.5 9.5e-86
CCDS56179.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 603) 1307 293.4 7.1e-79
CCDS56180.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 619) 1307 293.5 7.3e-79
CCDS13125.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 638) 1307 293.5 7.4e-79
>>CCDS8382.1 PCSK7 gene_id:9159|Hs108|chr11 (785 aa)
initn: 5444 init1: 5444 opt: 5444 Z-score: 6385.6 bits: 1192.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5444; 100.0% identity (100.0% similar) in 785 aa overlap (1-785:1-785)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MPKGRQKVPHLDAPLGLPTCLWLELAGLFLLVPWVMGLAGTGGPDGQGTGGPSWAVHLES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LEGDGEEETLEQQADALAQAAGLVNAGRIGELQGHYLFVQPAGHRPALEVEAIRQQVEAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LAGHEAVRWHSEQRLLRRAKRSVHFNDPKYPQQWHLNNRRSPGRDINVTGVWERNVTGRG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VTVVVVDDGVEHTIQDIAPNYSPEGSYDLNSNDPDPMPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVP
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pF1KE4 NNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HQLGKAALQHGVIAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HQLGKAALQHGVIAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTEGHTGTSAAAPLAAGMIALML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTEGHTGTSAAAPLAAGMIALML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 QVRPCLTWRDVQHIIVFTATRYEDRRAEWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKIWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QVRPCLTWRDVQHIIVFTATRYEDRRAEWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKIWT
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490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SVPYLASYVSPVLKENKAIPQSPRSLEVLWNVSRMDLEMSGLKTLEHVAVTVSITHPRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SVPYLASYVSPVLKENKAIPQSPRSLEVLWNVSRMDLEMSGLKTLEHVAVTVSITHPRRG
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550 560 570 580 590 600
pF1KE4 SLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERARGTYRLVIRDVGDESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERARGTYRLVIRDVGDESF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 QVGILRQWQLTLYGSVWSAVDIRDRQRLLESAMSGKYLHDDFALPCPPGLKIPEEDGYTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QVGILRQWQLTLYGSVWSAVDIRDRQRLLESAMSGKYLHDDFALPCPPGLKIPEEDGYTI
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pF1KE4 TPNTLKTLVLVGCFTVFWTVYYMLEVYLSQRNVASNQVCRSGPCHWPHRSRKAKEEGTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TPNTLKTLVLVGCFTVFWTVYYMLEVYLSQRNVASNQVCRSGPCHWPHRSRKAKEEGTEL
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pF1KE4 ESVPLCSSKDPDEVETESRGPPTTSDLLAPDLLEQGDWSLSQNKSALDCPHQHLDVPHGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ESVPLCSSKDPDEVETESRGPPTTSDLLAPDLLEQGDWSLSQNKSALDCPHQHLDVPHGK
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 EEQIC
:::::
CCDS83 EEQIC
>>CCDS73790.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 (969 aa)
initn: 1391 init1: 883 opt: 1565 Z-score: 1829.4 bits: 349.6 E(32554): 1.4e-95
Smith-Waterman score: 1589; 41.8% identity (67.8% similar) in 668 aa overlap (34-673:51-695)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 GRQKVPHLDAPLGLPTCLWLELAGLFLLVPWVMGLA---GTGGPDGQGTGGPSWAVHLES
:.. :: . ..: . . :::..
CCDS73 TDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPRPVYTNHWAVQV--
30 40 50 60 70
70 80 90 100 110
pF1KE4 LEGDGEEETLEQQADALAQAAGLVNAGRIGELQGHYLFVQPAGHRPALEVEAIRQQ-VEA
: : .: :: .: : : .: :.::.:. .: : : ... .. .. ..
CCDS73 LGGPAE-------ADRVAAAHGYLNLGQIGNLEDYYHFY----HSKTFKRSTLSSRGPHT
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE4 VLAGHEAVRWHSEQRLLRRAKRSV-------HFNDPKYPQQWHLN--NRRSPGR-DINVT
: :.: ..:.. ::.::.: .:::: . ..:.:. .. : : ..::
CCDS73 FLRMDPQVKWLQQQEVKRRVKRQVRSDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRCRSEMNVQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 GVWERNVTGRGVTVVVVDDGVEHTIQDIAPNYSPEGSYDLNSNDPDPMPHPDVENGNHHG
..:.:. ::..:.:...:::.:.. :.::::. .:::.:.:: :: :. :. : :.::
CCDS73 AAWKRGYTGKNVVVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENKHG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 TRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWG
::::::.:: :::.: ::.::...:.:::.::: .:: .:: ... . . :::: :::
CCDS73 TRCAGEVAASANNSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWG
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290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVIAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTV
::::::::::: .:.: :...:. ::::.::::: ::::::...: :. :::.:::::.
CCDS73 PDDDGKTVDGPGRLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIYTI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 TIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTEGHTGTSAAA
..... :.: :.: ::::: ::.:.:.: . :.::::: :. ::.::::::..:
CCDS73 SVSSATENGYKPWYLEECASTLATTYSSGAFYERKIVTTDLR-QR---CTDGHTGTSVSA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 PLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATRYEDRRAEWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNA
:..::.::: :.. ::::::::..: :. . . ..: .: :: . :: .::::..:
CCDS73 PMVAGIIALALEANSQLTWRDVQHLLVKTSRPAHLKASDWKVNGAGHKVSHFYGFGLVDA
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 WRLVNAAKIWTSVPYLASYVSPVLKENKAIP--QSPRSLEVLWNVSRMDLEMSGLKT--L
:: :: ::.:: :. :. ..:: : :. . . : : .. :
CCDS73 EALVVEAKKWTAVPSQHMCVAASDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACA----EHSDQRVVYL
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530 540 550 560 570 580
pF1KE4 EHVAVTVSITHPRRGSLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERAR
:::.: .::.:::::.:.. : ::: : . : : .: . .::..: : ::.::::.:.
CCDS73 EHVVVRTSISHPRRGDLQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KE4 GTYRLVIRDVGDE---SFQVGILRQWQLTLYGSVWSAVDI----RDRQRLLESAMSGKYL
: . : :.:. .. . : :..:.: :::.. ..:.:.:: .:. :
CCDS73 GQWTLEIQDLPSQVRNPEKQGKLKEWSLILYGTAEHPYHTFSAHQSRSRMLE--LSAPEL
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 HDDFALPCPPGLKIPE-EDGYTI--TPNTLKTLVLVGCFTVFWTVYYMLEVYLSQRNVAS
. : : ...:: :. :: ::.. . : :
CCDS73 EPPKAALSPSQVEVPEDEEDYTAQSTPGSANILQTSVCHPECGDKGCDGPNADQCLNCVH
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 NQVCRSGPCHWPHRSRKAKEEGTELESVPLCSSKDPDEVETESRGPPTTSDLLAPDLLEQ
CCDS73 FSLGSVKTSRKCVSVCPLGYFGDTAARRCRRCHKGCETCSSRAATQCLSCRRGFYHHQEM
720 730 740 750 760 770
>>CCDS73789.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 (956 aa)
initn: 1391 init1: 883 opt: 1558 Z-score: 1821.2 bits: 348.1 E(32554): 4e-95
Smith-Waterman score: 1582; 42.2% identity (68.4% similar) in 652 aa overlap (34-659:51-679)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 GRQKVPHLDAPLGLPTCLWLELAGLFLLVPWVMGLA---GTGGPDGQGTGGPSWAVHLES
:.. :: . ..: . . :::..
CCDS73 TDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPRPVYTNHWAVQV--
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pF1KE4 LEGDGEEETLEQQADALAQAAGLVNAGRIGELQGHYLFVQPAGHRPALEVEAIRQQ-VEA
: : .: :: .: : : .: :.::.:. .: : : ... .. .. ..
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pF1KE4 VLAGHEAVRWHSEQRLLRRAKRSV-------HFNDPKYPQQWHLN--NRRSPGR-DINVT
: :.: ..:.. ::.::.: .:::: . ..:.:. .. : : ..::
CCDS73 FLRMDPQVKWLQQQEVKRRVKRQVRSDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRCRSEMNVQ
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170 180 190 200 210 220
pF1KE4 GVWERNVTGRGVTVVVVDDGVEHTIQDIAPNYSPEGSYDLNSNDPDPMPHPDVENGNHHG
..:.:. ::..:.:...:::.:.. :.::::. .:::.:.:: :: :. :. : :.::
CCDS73 AAWKRGYTGKNVVVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENKHG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 TRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSMEAVAFNKHYQINDIYSCSWG
::::::.:: :::.: ::.::...:.:::.::: .:: .:: ... . . :::: :::
CCDS73 TRCAGEVAASANNSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVIAGRQGFGSIFVVASGNGGQHNDNCNYDGYANSIYTV
::::::::::: .:.: :...:. ::::.::::: ::::::...: :. :::.:::::.
CCDS73 PDDDGKTVDGPGRLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIYTI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 TIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVTTDWDLQKGTGCTEGHTGTSAAA
..... :.: :.: ::::: ::.:.:.: . :.::::: :. ::.::::::..:
CCDS73 SVSSATENGYKPWYLEECASTLATTYSSGAFYERKIVTTDLR-QR---CTDGHTGTSVSA
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 PLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATRYEDRRAEWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNA
:..::.::: :.. ::::::::..: :. . . ..: .: :: . :: .::::..:
CCDS73 PMVAGIIALALEANSQLTWRDVQHLLVKTSRPAHLKASDWKVNGAGHKVSHFYGFGLVDA
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 WRLVNAAKIWTSVPYLASYVSPVLKENKAIP--QSPRSLEVLWNVSRMDLEMSGLKT--L
:: :: ::.:: :. :. ..:: : :. .. : : .. :
CCDS73 EALVVEAKKWTAVPSQHMCVAASDKRPRSIPLVQVLRTTA----LTSACAEHSDQRVVYL
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 EHVAVTVSITHPRRGSLELKLFCPSGMMSLIGAPRSMDSDPNGFNDWTFSTVRCWGERAR
:::.: .::.:::::.:.. : ::: : . : : .: . .::..: : ::.::::.:.
CCDS73 EHVVVRTSISHPRRGDLQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KE4 GTYRLVIRDVGDE---SFQVGILRQWQLTLYGSVWSAVDI----RDRQRLLESAMSGKYL
: . : :.:. .. . : :..:.: :::.. ..:.:.:: .:. :
CCDS73 GQWTLEIQDLPSQVRNPEKQGKLKEWSLILYGTAEHPYHTFSAHQSRSRMLE--LSAPEL
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640 650 660 670 680 690
pF1KE4 HDDFALPCPPGLKIPE-EDGYTITPNTLKTLVLVGCFTVFWTVYYMLEVYLSQRNVASNQ
. : : ...:: :. ::
CCDS73 EPPKAALSPSQVEVPEDEEDYTGVCHPECGDKGCDGPNADQCLNCVHFSLGSVKTSRKCV
660 670 680 690 700 710
>>CCDS6652.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 (913 aa)
initn: 1487 init1: 854 opt: 1545 Z-score: 1806.3 bits: 345.3 E(32554): 2.7e-94
Smith-Waterman score: 1571; 42.8% identity (70.3% similar) in 603 aa overlap (73-648:49-638)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 GPDGQGTGGPSWAVHLESLEGDGEEETLEQQADALAQAAGLVNAGRIGELQGHYLFVQPA
.:. .:. :..: :.:: :. .: :
CCDS66 LALLGGCLLPVCRTRVYTNHWAVKIAGGFPEANRIASKYGFINIGQIGALKDYYHFY---
20 30 40 50 60 70
110 120 130 140 150
pF1KE4 GHRPALEVEAIRQQ-VEAVLAGHEAVRWHSEQRLLRRAKR--------SVHFNDPKYPQQ
: ... .: .. ... .. . :.: ..: . .:.:: :..:::::.:..
CCDS66 -HSRTIKRSVISSRGTHSFISMEPKVEWIQQQVVKKRTKRDYDFSRAQSTYFNDPKWPSM
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 W--HLNNRRSPGR-DINVTGVWERNVTGRGVTVVVVDDGVEHTIQDIAPNYSPEGSYDLN
: : .. : . :.:. :.:.:. ::....:...:::.:.: :. ::. .: :.:
CCDS66 WYMHCSDNTHPCQSDMNIEGAWKRGYTGKNIVVTILDDGIERTHPDLMQNYDALASCDVN
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 SNDPDPMPHPDVENGNHHGTRCAGEIAAVPNNSFCAVGVAYGSRIAGIRVLDGPLTDSME
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CCDS66 GNDLDPMPRYDASNENKHGTRCAGEVAAAANNSHCTVGIAFNAKIGGVRMLDGDVTDMVE
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320
pF1KE4 A--VAFN-KHYQINDIYSCSWGPDDDGKTVDGPHQLGKAALQHGVIAGRQGFGSIFVVAS
: :.:: .: .: :: :::::::::::::: : . :...:: ::.:.::.:: ::
CCDS66 AKSVSFNPQHVHI---YSASWGPDDDGKTVDGPAPLTRQAFENGVRMGRRGLGSVFVWAS
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 GNGGQHNDNCNYDGYANSIYTVTIGAVDEEGRMPFYAEECASMLAVTFSGGDKMLRSIVT
::::. .:.:. :::.:::::..:... : :. :.: :::.: ::.:.:.:... ..:.:
CCDS66 GNGGRSKDHCSCDGYTNSIYTISISSTAESGKKPWYLEECSSTLATTYSSGESYDKKIIT
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 TDWDLQKGTGCTEGHTGTSAAAPLAAGMIALMLQVRPCLTWRDVQHIIVFTATRYEDRRA
:: :. ::..::::::.::.:::.::: :.. : ::::::::.:: :. .
CCDS66 TDLR-QR---CTDNHTGTSASAPMAAGIIALALEANPFLTWRDVQHVIVRTSRAGHLNAN
380 390 400 410 420
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pF1KE4 EWVTNEAGFSHSHQHGFGLLNAWRLVNAAKIWTSVPYLASYVSPVLKENKAI-PQSP-RS
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. . : : .. ::::.: ..:::::::.: . : ::: : . : : .: .
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.. .:. : . . : .:.: :: :
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.:. .:. :..: :.:: :. .: :
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: ... .: .. ... .. . :.: ..: . .:.:: :..:::::.:..
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.::..: : :..:::::: : . : . :. .. .:.. : :..:.:.:::. . .
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.. .:. : . . : .:.: :: :
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CCDS73 EHVVVRTSISHPRRGDLQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAE
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CCDS73 GQWTLEIQDLPSQVRNPEKQGDLETPVANQLTTEERFVSTLSILFHWSVYLSWSQYHIVL
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