Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4578
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4578, 774 aa
1>>>pF1KE4578 774 - 774 aa - 774 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9004+/-0.000967; mu= 17.2977+/- 0.058
mean_var=78.5109+/-15.879, 0's: 0 Z-trim(105.7): 36 B-trim: 63 in 1/49
Lambda= 0.144747
statistics sampled from 8527 (8558) to 8527 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 3.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34864.1 LOXL2 gene_id:4017|Hs108|chr8 ( 774) 5505 1159.7 0
CCDS1953.1 LOXL3 gene_id:84695|Hs108|chr2 ( 753) 3125 662.7 6e-190
CCDS7473.1 LOXL4 gene_id:84171|Hs108|chr10 ( 756) 2299 490.2 5.1e-138
CCDS74527.1 LOXL3 gene_id:84695|Hs108|chr2 ( 608) 2177 464.7 2e-130
CCDS4129.1 LOX gene_id:4015|Hs108|chr5 ( 417) 759 168.5 2e-41
CCDS10253.1 LOXL1 gene_id:4016|Hs108|chr15 ( 574) 737 164.0 6.2e-40
CCDS44490.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2413) 546 124.4 2.2e-27
CCDS1171.1 CD5L gene_id:922|Hs108|chr1 ( 347) 430 99.8 8.1e-21
CCDS53742.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1121) 419 97.7 1.1e-19
CCDS8578.1 CD163 gene_id:9332|Hs108|chr12 (1156) 419 97.7 1.1e-19
CCDS8577.1 CD163L1 gene_id:283316|Hs108|chr12 (1453) 406 95.1 8.9e-19
CCDS73434.1 CD163L1 gene_id:283316|Hs108|chr12 (1463) 406 95.1 8.9e-19
CCDS44492.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2403) 381 89.9 5.1e-17
CCDS58137.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 592) 372 87.8 5.6e-17
CCDS58138.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 601) 372 87.8 5.7e-17
CCDS7999.1 CD6 gene_id:923|Hs108|chr11 ( 668) 372 87.8 6.3e-17
CCDS59424.1 SSC5D gene_id:284297|Hs108|chr19 ( 951) 367 86.8 1.7e-16
CCDS11759.1 LGALS3BP gene_id:3959|Hs108|chr17 ( 585) 364 86.1 1.8e-16
CCDS46196.1 SSC5D gene_id:284297|Hs108|chr19 (1573) 367 86.9 2.7e-16
CCDS5995.1 MSR1 gene_id:4481|Hs108|chr8 ( 451) 359 85.0 2.9e-16
CCDS5585.1 SSC4D gene_id:136853|Hs108|chr7 ( 575) 360 85.3 3.1e-16
CCDS2124.1 MARCO gene_id:8685|Hs108|chr2 ( 520) 356 84.4 5.1e-16
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 351 83.5 1.6e-15
CCDS44491.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (1785) 355 84.5 1.7e-15
CCDS6064.1 SCARA5 gene_id:286133|Hs108|chr8 ( 495) 340 81.1 5e-15
CCDS45162.1 HHIPL1 gene_id:84439|Hs108|chr14 ( 782) 338 80.7 9.8e-15
>>CCDS34864.1 LOXL2 gene_id:4017|Hs108|chr8 (774 aa)
initn: 5505 init1: 5505 opt: 5505 Z-score: 6209.5 bits: 1159.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5505; 99.9% identity (100.0% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRL
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CCDS34 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 IWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGLPAVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGLPAVVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQGCNHEEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQGCNHEEDA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 VACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRFS
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFMLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 SQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLED
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 TECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE4 AESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
730 740 750 760 770
>>CCDS1953.1 LOXL3 gene_id:84695|Hs108|chr2 (753 aa)
initn: 2887 init1: 1665 opt: 3125 Z-score: 3523.6 bits: 662.7 E(32554): 6e-190
Smith-Waterman score: 3125; 55.1% identity (79.6% similar) in 760 aa overlap (19-771:1-752)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHY-----PEYFQQPAPEYHQPQAPANVAK
. :.:. :.. : . .:.: :. :.
CCDS19 MRPVSVWQWSPWGLLLCLLCSSCLGSPSPSTG-PEKKAGSQG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IQLRLAGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYG
...:::: :: :::::. :.:::.:::::...:::..:::::..:: .:: :..::
CCDS19 LRFRLAGFPRKPYEGRVEIQRAGEWGTICDDDFTLQAAHILCRELGFTEATGWTHSAKYG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQ
: : :::::: :.:.: ... :.: ::: .:: : ::.::.:.:.:.:::. :...: .
CCDS19 PGTGRIWLDNLSCSGTEQSVTECASRGWGNSDCTHDEDAGVICKDQRLPGFS-DSNVI-E
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFG
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CCDS19 VEH-HLQVEEVRIRPAVGWGRRPLPVTEGLVEVRLPDGWSQVCDKGWSAHNSHVVCGMLG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGL
::.:. :. :...:.:... . .. :.:::::.: :.: . : . : .:
CCDS19 FPSEKRVNAAFYRLLAQRQQHSFGLHGVACVGTEAHLSLCSLEFYRANDTAR---CPGGG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 PAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPE-QPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDK
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CCDS19 PAVVSCVPGPVYAASSGQKKQQQSKPQGEARVRLKGGAHPGEGRVEVLKASTWGTVCDRK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 WDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NAESQG
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CCDS19 WDLHAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNITAED
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 CNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEA
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CCDS19 CSHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWGTLEA
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 MVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQG
::.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..: .
CCDS19 MVACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHITCKRT
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGY
:... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... :.
CCDS19 GTRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGH
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHK
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CCDS19 RRLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHK
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 ASFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVV
::::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:..:::
CCDS19 ASFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVV
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 INPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSP
:::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .::.
CCDS19 INPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSNQII
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 Q
>>CCDS7473.1 LOXL4 gene_id:84171|Hs108|chr10 (756 aa)
initn: 2334 init1: 1594 opt: 2299 Z-score: 2591.4 bits: 490.2 E(32554): 5.1e-138
Smith-Waterman score: 3014; 55.3% identity (78.8% similar) in 740 aa overlap (47-769:21-754)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 ALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLAGQKRKHSEGRVEVYY
:. : ... .:::.: . : :::.:: .
CCDS74 MAWSPPATLFLFLLLLGQPPPSRPQSLGTTKLRLVGPESKPEEGRLEVLH
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 DGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLA
.:::::::::.:.:. : :.::.::. : .:. :..::.:::::::::..:.:.:..:
CCDS74 QGQWGTVCDDNFAIQEATVACRQLGFEAALTWAHSAKYGQGEGPIWLDNVRCVGTESSLD
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 ACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLNIQVEDIRIRAILSTYR
: ::::::.::.:.:::::.: .: :. ..... : . . ..:..:.. ::.. .
CCDS74 QCGSNGWGVSDCSHSEDVGVICHPRRHRGY-LSETVSNALGPQGRRLEEVRLKPILASAK
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMF------
...:: :: :::: :.:.::. :: .::::::::.:::.: ... :.
CCDS74 QHSPVTEGAVEVKYEGHWRQVCDQGWTMNNSRVVCGMLGFPSEVPVDSHYYRKVWDLKMR
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300
pF1KE4 --ASR-----RKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNV---TCENGLPAVVS
:: :. .: .. : ::: :...: ::.. : .. .: .:. ::::
CCDS74 DPKSRLKSLTNKNSFWIHQVTCLGTEPHMANC----QVQVAPARGKLRPACPGGMHAVVS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 CVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSA
:: : : : . ::. :.: ::::.:: .:::::::: : .:::::: .:.:.::
CCDS74 CVAGPHFRPPKTKPQRKGSWAEEPRVRLRSGAQVGEGRVEVLMNRQWGTVCDHRWNLISA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE4 SVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAESQ-GCNHEED
:::::.::::::.::. :.:::::.:::::.:..: : :... :: :: ::.::.:
CCDS74 SVVCRQLGFGSAREALFGARLGQGLGPIHLSEVRCRGYERTLSDCPALEGSQNGCQHEND
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 AGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQ
:.::::.: ::.:...:: ::: : :: .:: :: :: :: ::..:::..::::.:::
CCDS74 AAVRCNVPNMGFQNQVRLAGGRIPEEGLLEVQVEVNGVPRWGSVCSENWGLTEAMVACRQ
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 LGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGA
:::::: .:..:::.: : ...::::::.::::::.: .:.. : : : .:: .. :
CCDS74 LGLGFAIHAYKETWFWSGTPRAQEVVMSGVRCSGTELALQQCQRHGP-VHCSHGGGRFLA
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYRRLLRF
::.: ..:::::.::..::.:.::::::. : :: :::::: :: . : ::::::::
CCDS74 GVSCMDSAPDLVMNAQLVQETAYLEDRPLSQLYCAHEENCLSKSADHMDWPYGYRRLLRF
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 SSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKASFCLE
:.::.: :..:::::.:: .:.::.:::::::.:::::::::.:::.:::::::::::::
CCDS74 STQIYNLGRTDFRPKTGRDSWVWHQCHRHYHSIEVFTHYDLLTLNGSKVAEGHKASFCLE
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 DTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFE
::.: .:. : :::::.::.:.:::: ::::::::::::::: ::.:.:::..::..:
CCDS74 DTNCPTGLQRRYACANFGEQGVTVGCWDTYRHDIDCQWVDITDVGPGNYIFQVIVNPHYE
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 VAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
:::::.:::...:: .:::::.:..::: :.:. ..: ..:. . : ::
CCDS74 VAESDFSNNMLQCRCKYDGHRVWLHNCHTGNSYPANAELSLEQEQRLRNNLI
710 720 730 740 750
>>CCDS74527.1 LOXL3 gene_id:84695|Hs108|chr2 (608 aa)
initn: 2673 init1: 1665 opt: 2177 Z-score: 2455.1 bits: 464.7 E(32554): 2e-130
Smith-Waterman score: 2420; 47.4% identity (66.0% similar) in 759 aa overlap (19-771:1-607)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MERPLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHY-----PEYFQQPAPEYHQPQAPANVAK
. :.:. :.. : . .:.: :. :.
CCDS74 MRPVSVWQWSPWGLLLCLLCSSCLGSPSPSTG-PEKKAGSQG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IQLRLAGQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYG
...:::: :: :::::. :.:::.:::::...:::..:::::..:: .:: :..::
CCDS74 LRFRLAGFPRKPYEGRVEIQRAGEWGTICDDDFTLQAAHILCRELGFTEATGWTHSAKYG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQ
: : :::::: :.:.: ... :.: ::: .:: : ::.::.:.:.:.:::. :...:
CCDS74 PGTGRIWLDNLSCSGTEQSVTECASRGWGNSDCTHDEDAGVICKDQRLPGFS-DSNVI--
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFG
CCDS74 ------------------------------------------------------------
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMDCTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGL
::.
CCDS74 ---------------------------------EAR------------------------
160
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 PAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPLVRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKW
:::.:::. ::::::::: . :::::: ::
CCDS74 ------------------------------VRLKGGAHPGEGRVEVLKASTWGTVCDRKW
170 180 190
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 DLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKF-NAESQGC
:: .:::::::::::::.::..:.:.:::.: :::.:..:.:.: :. : : .. :
CCDS74 DLHAASVVCRELGFGSAREALSGARMGQGMGAIHLSEVRCSGQELSLWKCPHKNITAEDC
200 210 220 230 240 250
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 NHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAM
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CCDS74 SHSQDAGVRCNLPYTGAETRIRLSGGRSQHEGRVEVQIGGPGPLRWGLICGDDWGTLEAM
260 270 280 290 300 310
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 VVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGG
:.:::::::.:....:::::: . : ..::::::.:.:::::: .: : : ..: . :
CCDS74 VACRQLGLGYANHGLQETWYWDSG-NITEVVMSGVRCTGTELSLDQCAHHGTHITCKRTG
320 330 340 350 360 370
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGYR
... ::: ::::: ::.:.. .::.:.:.::::. .: :: :::::..:: ... :.:
CCDS74 TRFTAGVICSETASDLLLHSALVQETAYIEDRPLHMLYCAAEENCLASSARSANWPYGHR
380 390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTKVAEGHKA
::::::::::: :..::::: :::.:.::.:: :::::..:::::.:. :::::::::::
CCDS74 RLLRFSSQIHNLGRADFRPKAGRHSWVWHECHGHYHSMDIFTHYDILTPNGTKVAEGHKA
440 450 460 470 480 490
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 SFCLEDTECEGDIQKNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVI
:::::::::. :..: :::::::.::::.::::.:::::::::.::::: ::.:..::::
CCDS74 SFCLEDTECQEDVSKRYECANFGEQGITVGCWDLYRHDIDCQWIDITDVKPGNYILQVVI
500 510 520 530 540 550
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pF1KE4 NPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
::::::::::..:: ::: .:::::::..::::: .::::....::.. : .::.
CCDS74 NPNFEVAESDFTNNAMKCNCKYDGHRIWVHNCHIGDAFSEEANRRFERYPGQTSNQII
560 570 580 590 600
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Smith-Waterman score: 759; 47.1% identity (72.4% similar) in 221 aa overlap (531-748:195-414)
510 520 530 540 550
pF1KE4 SNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAGVACSETA-PDLVLNAEMVQQ
: : . : :.. . . :::: . ..:
CCDS41 GMVGDDPYNPYKYSDDNPYYNYYDTYERPRPGGRYRPGYGTGYFQYGLPDLVADPYYIQA
170 180 190 200 210 220
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 TTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTT-GYRRLLRFSSQIHNNGQSDFRPKNGRH
.::.. :. :.:: :::::...: ..: .: :::: ....:.: ::: :. :.
CCDS41 STYVQKMSMYNLRCAAEENCLASTAYRADVRDYDHRVLLRFPQRVKNQGTSDFLPSRPRY
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 AWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNLNGTK-VAEGHKASFCLEDTECEGDIQKNYECANFG
.: ::.::.:::::. :.:::::. : . :::::::::::::: :. .. . :.
CCDS41 SWEWHSCHQHYHSMDEFSHYDLLDANTQRRVAEGHKASFCLEDTSCDYGYHRRFACTAH-
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pF1KE4 DQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEVAESDYSNNIMKCRSRYD
::.. ::.: : ::::::.::::: ::.:...: .::.. : ::::.::...: ::
CCDS41 TQGLSPGCYDTYGADIDCQWIDITDVKPGNYILKVSVNPSYLVPESDYTNNVVRCDIRYT
350 360 370 380 390 400
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pF1KE4 GHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
::. . .: :
CCDS41 GHHAYASGCTISPY
410
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500 510 520 530 540 550
pF1KE4 WHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAGVACSETA---PDLV
:: . :: .. :. .... ::::
CCDS10 ANPPPEAYGPPRALEPPYLPVRSSDTPPPGGERNGAQQGRLSVGSVYRPNQNGRGLPDLV
320 330 340 350 360 370
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pF1KE4 LNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGY--RRLLRFSSQIHNNGQS
. ..:: .::.. .. :.:: ::.:: ::.: . .: : : :::: ....:.: .
CCDS10 PDPNYVQASTYVQRAHLYSLRCAAEEKCL-ASTAYAPEATDYDVRVLLRFPQRVKNQGTA
380 390 400 410 420 430
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pF1KE4 DFRPKNGRHAWIWHDCHRHYHSMEVFTHYDLLNL-NGTKVAEGHKASFCLEDTECEGDIQ
:: :. ::.: ::.::.:::::. :.:::::. .: ::::::::::::::. :.
CCDS10 DFLPNRPRHTWEWHSCHQHYHSMDEFSHYDLLDAATGKKVAEGHKASFCLEDSTCDFGNL
440 450 460 470 480 490
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pF1KE4 KNYECANFGDQGITMGCWDMYRHDIDCQWVDITDVPPGDYLFQVVINPNFEVAESDYSNN
: : :.. ::.. ::.: : ::::::.::::: ::.:...: .::.. : :::..::
CCDS10 KRYACTSH-TQGLSPGCYDTYNADIDCQWIDITDVQPGNYILKVHVNPKYIVLESDFTNN
500 510 520 530 540 550
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pF1KE4 IMKCRSRYDGHRIWMYNCHIGGSFSEETEKKFEHFSGLLNNQLSPQ
...: .: :. . ::.:
CCDS10 VVRCNIHYTGRYVSATNCKIVQS
560 570
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Smith-Waterman score: 957; 35.8% identity (59.1% similar) in 523 aa overlap (54-546:989-1482)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLA-GQKRKHSEGRVEVYYDGQWGT
... :::. : : .::::: :.:.:::
CCDS44 VICSAAHSWSTPSPDTLPTITLPASTVGSESSLALRLVNGGDR--CQGRVEVLYQGSWGT
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pF1KE4 VCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNG
::::... . :.::::.:: : : ... .:.: ::: ::...:.:.:. : .: ::
CCDS44 VCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPHNG
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pF1KE4 WGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLINQIENLNIQVEDIRIRAILSTYRKRTPVM
: .: :.::.::.:: .. .. .. . . .. .: . . :
CCDS44 WLSHNCGHSEDAGVICSASQSRPTPSPDTWPTSHASTAGSESSLALRLVNGGDR-----C
1080 1090 1100 1110 1120 1130
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 EGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFS
.: ::: .: .:: .: .... ::: ..: . . .: : :.
CCDS44 QGRVEVLYRGSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGN------ARFGQGSGPIV
1140 1150 1160 1170 1180
270 280 290 300 310
pF1KE4 MD---CTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVTCENGLPAVVSCVPGQ---VFSPDG-PSRF
.: :.: :... :: . .: . : . : : : .: . ::: :.
CCDS44 LDDVRCSGHESYLWSCPHNGWLSHN------CGHHEDAGVICSASQSQPTPSPDTWPTSH
1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KE4 RKAYKPEQPL-VRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSASVVCRELGFGSAKE
.. :. : .:: .:. .:::::: : ::::::: :: .:.::::.:: : :
CCDS44 ASTAGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYRGSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWATS
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KE4 AVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNAE-SQGCNHEEDAGVRCN------TP
: ..:.::: ::: :....:.:.:. . .: :. :..:.:.::::: :. ::
CCDS44 APGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPHNGWLSHNCGHHEDAGVICSASQSQPTP
1300 1310 1320 1330 1340 1350
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pF1KE4 A-----------MGLQKKL--RLNGGRNPYEGRVEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAM
. : ...: :: .: . .:::::: . :: :: :: . : .:
CCDS44 SPDTWPTSHASTAGSESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYR--GS--WGTVCDDYWDTNDAN
1360 1370 1380 1390 1400 1410
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pF1KE4 VVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCSGTELSLAHCRHDGE-DVACPQG
::::::: :.:..: .. . .: :. .:.. :.::: : : : :.: . :
CCDS44 VVCRQLGCGWATSAPGNARFGQG---SGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPHNGWLSHNC---
1420 1430 1440 1450 1460
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pF1KE4 GVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRPMFLLQCAMEENCLSASAAQTDPTTGY
: . ::: :: .
CCDS44 GHHEDAGVICSASQSQPTPSPDTWPTSRASTAGSESTLALRLVNGGDRCRGRVEVLYQGS
1470 1480 1490 1500 1510 1520
>--
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Smith-Waterman score: 859; 35.6% identity (58.5% similar) in 491 aa overlap (34-488:336-782)
10 20 30 40 50
pF1KE4 PLCSHLCSCLAMLALLSPLSLAQYDSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVA----KIQLR
:. :.:. : . :..: .. ::
CCDS44 HESYLWSCPHNGWLTHNCGHSEDAGVICSAPQSRPTPSPDT-WPTSHASTAGPESSLALR
310 320 330 340 350 360
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LA-GQKRKHSEGRVEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGE
:. : : .::::: : :.:::::::... :.::::.:: : : ... .:.:
CCDS44 LVNGGDR--CQGRVEVLYRGSWGTVCDDSWDTSDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGS
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 GPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGVTDCKHTEDVGVVCSDKRIPGFKFDNSLIN-QIE
::: ::...:.: :. : .: ::: .:.:.::.::.:: . . ..: . .
CCDS44 GPIVLDDVRCSGYESYLWSCPHNGWLSHNCQHSEDAGVICSAAHSWSTPSPDTLPTITLP
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 NLNIQVED-IRIRAILSTYRKRTPVMEGYVEVKEGKTWKQICDKHWTAKNSRVVCGMFGF
.. :. . .: . . : .: ::: .: .:: : .... ::: ..:
CCDS44 ASTVGSESSLALRLVNGGDR-----CQGRVEVLYRGSWGTVCDDSWDTNDANVVCRQLGC
490 500 510 520 530
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pF1KE4 PGERTYNTKVYKMFA---SRRKQRYWPFSMD---CTGTEAHISSCKLGPQVSLDPMKNVT
. :.: .: : :. .: :.:.:... :: . .: .
CCDS44 G---------WAMLAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGNESYLWSCPHNGWLSHN------
540 550 560 570 580
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pF1KE4 CENGLPAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPL-VRLRGGAYIGEGRVEVLKNGEWGT
: .. : : : .:: :. : .:: .:. .:::::: : :::
CCDS44 CGHSEDAGVIC--------SGP---------ESSLALRLVNGGDRCQGRVEVLYRGSWGT
590 600 610 620
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pF1KE4 VCDDKWDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGNEKSIIDCKFNA
::::.:: .:.::::.:: : : : ..:.::: ::: :....:.:.:. . .: :.
CCDS44 VCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPNNG
630 640 650 660 670 680
410 420 430 440
pF1KE4 E-SQGCNHEEDAGVRCN------TP-------------AMGLQKKL--RLNGGRNPYEGR
:..:.:.::::: :. :: ..: ...: :: .: . .::
CCDS44 WLSHNCGHHEDAGVICSAAQSRSTPRPDTLSTITLPPSTVGSESSLTLRLVNGSDRCQGR
690 700 710 720 730 740
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 VEVLVERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMS
:::: . :: :: :: ..: .: ::::::: :.:..:
CCDS44 VEVLYR--GS--WGTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVR
750 760 770 780 790 800
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pF1KE4 GVKCSGTELSLAHCRHDGEDVACPQGGVQYGAGVACSETAPDLVLNAEMVQQTTYLEDRP
CCDS44 CSGHESYLWSCPHNGWLSHNCGHHEDAGVICSVSQSRPTPSPDTWPTSHASTAGPESSLA
810 820 830 840 850 860
>--
initn: 686 init1: 347 opt: 373 Z-score: 410.0 bits: 88.3 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 377; 37.6% identity (60.1% similar) in 178 aa overlap (260-425:163-334)
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VCGMFGFPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMD---CTGTEAHISSCKLGPQVSLDPM
:...: :.: :... :: . .: .
CCDS44 TNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNAWFGQGSGPIALDDVRCSGHESYLWSCPHNGWLSHN--
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330
pF1KE4 KNVTCENGLPAVVSCVPGQVFSPDGPSRFRKAYKPEQPL--------VRLRGGAYIGEGR
: .: : : : .: : : . .: : .:: .:. .::
CCDS44 ----CGHGEDAGVICSAAQPQSTLRPESWPVRISPPVPTEGSESSLALRLVNGGDRCRGR
200 210 220 230 240
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pF1KE4 VEVLKNGEWGTVCDDKWDLVSASVVCRELGFGSAKEAVTGSRLGQGIGPIHLNEIQCTGN
:::: : ::::::: :: .:.::::.:: : : : ....::: ::: :....:.:.
CCDS44 VEVLYRGSWGTVCDDYWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNAQFGQGSGPIVLDDVRCSGH
250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 EKSIIDCKFNAE-SQGCNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLVERNGS
:. . .: :. ...:.: ::::: :.
CCDS44 ESYLWSCPHNGWLTHNCGHSEDAGVICSAPQSRPTPSPDTWPTSHASTAGPESSLALRLV
310 320 330 340 350 360
>--
initn: 898 init1: 349 opt: 361 Z-score: 396.4 bits: 85.8 E(32554): 9.2e-16
Smith-Waterman score: 398; 39.9% identity (62.3% similar) in 183 aa overlap (252-425:786-962)
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pF1KE4 WTAKNSRVVCGMFGFPGERTYNTKVYKMFASRRKQRYWPFSMD---CTGTEAHISSCKLG
.: : :. .: :.: :... :: .
CCDS44 TVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDVRCSGHESYLWSCPHN
760 770 780 790 800 810
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pF1KE4 PQVSLDPMKNVTCENGLPAVVSCVPGQ---VFSPDG-PSRFRKAYKPEQPL-VRLRGGAY
.: . : . : : : .: . ::: :. .. ::. : .:: .:.
CCDS44 GWLSHN------CGHHEDAGVICSVSQSRPTPSPDTWPTSHASTAGPESSLALRLVNGGD
820 830 840 850 860
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.:::::: : :::::::.:: .:.::::.:: : : : ..:.::: ::: :...
CCDS44 RCQGRVEVLYRGSWGTVCDDSWDTSDANVVCRQLGCGWATSAPGNARFGQGSGPIVLDDV
870 880 890 900 910 920
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pF1KE4 QCTGNEKSIIDCKFNAE-SQGCNHEEDAGVRCNTPAMGLQKKLRLNGGRNPYEGRVEVLV
.:.: :. . .: :. :..:.: ::::: :.
CCDS44 RCSGYESYLWSCPHNGWLSHNCQHSEDAGVICSAAHSWSTPSPDTLPTITLPASTVGSES
930 940 950 960 970 980
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pF1KE4 ERNGSLVWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHGDVNSNKVVMSGVKCS
CCDS44 SLALRLVNGGDRCQGRVEVLYQGSWGTVCDDSWDTNDANVVCRQLGCGWAMSAPGNARFG
990 1000 1010 1020 1030 1040
>--
initn: 742 init1: 354 opt: 355 Z-score: 389.7 bits: 84.5 E(32554): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 355; 45.4% identity (76.9% similar) in 108 aa overlap (58-163:1883-1990)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 DSWPHYPEYFQQPAPEYHQPQAPANVAKIQLRLAGQKRKHS--EGRVEVYYDGQWGTVCD
:::.. . ... ::::.:. : ::::::
CCDS44 NRMTIHFRSDISFQNTGFLAWYNSFPSDATLRLVNLNSSYGLCAGRVEIYHGGTWGTVCD
1860 1870 1880 1890 1900 1910
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 DDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGNEATLAACTSNGWGV
:...:. :.::::.:: .: : ... .:.: ::: ::...:.:.:.:: : . ::
CCDS44 DSWTIQEAEVVCRQLGCGRAVSALGNAYFGSGSGPITLDDVECSGTESTLWQCRNRGWFS
1920 1930 1940 1950 1960 1970
150 160 170 180 190 200
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.:.: ::.::.:: ...
CCDS44 HNCNHREDAGVICSGNHLSTPAPFLNITRPNTDYSCGGFLSQPSGDFSSPFYPGNYPNNA
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: . : : : .: : :. . . : :. : .:: .:. .:::
CCDS44 ----CGHHEDAGVICSAAQSQSTPRPDTWLTTNLPALTVGSESSLALRLVNGGDRCRGRV
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. . .: .. ...:.:.::::: :.
CCDS44 SYLWSCPHKGWLTHNCGHHEDAGVICSATQINSTTTDWWHPTTTTTARPSSNCGGFLFYA
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CCDS11 WDIKDVAVLCRELGCGAASGTPSGILYEPPAEKEQKVLIQSVSCTGTEDTLAQCEQE--E
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: :.: .:. :: :: : .: .. .: :.. .
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: .. . :.. . :. .:.::: :. ::: : . : :.: :.: . :..
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430 440 450 460 470 480
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... :: :: : ::::: ..:. .:: .: ..... : :.::.: : . .
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CCDS85 ---------PASLD--------------KAMSI-PMWVDNVQCPKGPDTLWQC-PSSPWE
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CCDS85 D--ISVQKTPQKATTGRSSRQSSFIAVGILGVVLLAIFVALFFLTKKRRQRQRLAVSSRG
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pF1KE4 VEVYYDGQWGTVCDDDFSIHAAHVVCRELGYVEAKSWTASSSYGKGEGPIWLDNLHCTGN
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CCDS85 ALKTSYQVYSKIQATNTWLFLS--SCNGNETSLWDCK-NWQWGGLTCDHYEEAKITCSA-
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CCDS85 ----HREPRLVGGDIPCSGRVEV---KHGD-TWGSICDSDFSLEAASVLCRELQCGTVVS
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CCDS85 ILGGAHFGEGN---GQIWAEEFQCEGHESHLSLC-----PVAPRPEGTCSHSRDVGVVCS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]