Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4572
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4572, 741 aa
1>>>pF1KE4572 741 - 741 aa - 741 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5193+/- 0.001; mu= 18.8451+/- 0.060
mean_var=67.2181+/-13.306, 0's: 0 Z-trim(104.0): 17 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.156434
statistics sampled from 7690 (7695) to 7690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2171.1 MGAT5 gene_id:4249|Hs108|chr2 ( 741) 5090 1158.2 0
CCDS11751.1 MGAT5B gene_id:146664|Hs108|chr17 ( 790) 1791 413.7 5.5e-115
CCDS45788.1 MGAT5B gene_id:146664|Hs108|chr17 ( 801) 1791 413.7 5.6e-115
CCDS59299.1 MGAT5B gene_id:146664|Hs108|chr17 ( 792) 1784 412.1 1.6e-114
CCDS5384.1 CCDC126 gene_id:90693|Hs108|chr7 ( 140) 434 107.1 1.9e-23
>>CCDS2171.1 MGAT5 gene_id:4249|Hs108|chr2 (741 aa)
initn: 5090 init1: 5090 opt: 5090 Z-score: 6202.1 bits: 1158.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5090; 100.0% identity (100.0% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-741)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQPESSSMLREQILDLSKRYIKA
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CCDS21 MALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQPESSSMLREQILDLSKRYIKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LAEENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESKVDNLVVNGTGTNSTNST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LAEENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNILQRIGKLESKVDNLVVNGTGTNSTNST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TAVPSLVALEKINVADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 TAVPSLVALEKINVADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 STCSFFIYLSEVENWCPHLPWRAKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYSMMKKHEEFRWMRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 STCSFFIYLSEVENWCPHLPWRAKNPYEEADHNSLAEIRTDFNILYSMMKKHEEFRWMRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 RIRRMADAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RIRRMADAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 WSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKEIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 WSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKEIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPEFNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQQFYTMFPHTPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPEFNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQQFYTMFPHTPD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 NSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKRQNQSLVYGKVDSFWKNKKIYLDIIHTYMEVHATVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 NSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKRQNQSLVYGKVDSFWKNKKIYLDIIHTYMEVHATVY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 GSSTKNIPSYVKNHGILSGRDLQFLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEAIANGCAFLNPKFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GSSTKNIPSYVKNHGILSGRDLQFLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEAIANGCAFLNPKFN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 PPKSSKNTDFFIGKPTLRELTSQHPYAEVFIGRPHVWTVDLNNQEEVEDAVKAILNQKIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PPKSSKNTDFFIGKPTLRELTSQHPYAEVFIGRPHVWTVDLNNQEEVEDAVKAILNQKIE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 PYMPYEFTCEGMLQRINAFIEKQDFCHGQVMWPPLSALQVKLAEPGQSCKQVCQESQLIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PYMPYEFTCEGMLQRINAFIEKQDFCHGQVMWPPLSALQVKLAEPGQSCKQVCQESQLIC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 EPSFFQHLNKDKDMLKYKVTCQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQGDLLLFSCAGAHPRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 EPSFFQHLNKDKDMLKYKVTCQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQGDLLLFSCAGAHPRH
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KE4 QRVCPCRDFIKGQVALCKDCL
:::::::::::::::::::::
CCDS21 QRVCPCRDFIKGQVALCKDCL
730 740
>>CCDS11751.1 MGAT5B gene_id:146664|Hs108|chr17 (790 aa)
initn: 1423 init1: 778 opt: 1791 Z-score: 2177.8 bits: 413.7 E(32554): 5.5e-115
Smith-Waterman score: 2149; 43.0% identity (68.0% similar) in 796 aa overlap (1-741:16-790)
10 20 30
pF1KE4 MALFTPWKLSSQKLGFFLVTF-----GFIWGMMLLH---FTIQQR
.. . :..: .::: . : : .. : :::. .
CCDS11 MITVNPDGKIMVRRCLVTLRPFRLFVLGIGFFTLCFLMTSLGGQFSARRLGDSPFTIRTE
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 TQ--PESSSMLREQ--ILDLSKRYIKALAE-ENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDN
.. ::: ..::.. .:.: . . :::. :: . . . . : : :..
CCDS11 VMGGPESRGVLRKMSDLLELMVKRMDALARLENSSELHRAGGDLHFPADRMPPGAGLMER
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE4 IL---QRIGKLESKVDNLVVNGTGTNSTNSTTAVPSLVALEKINVADIINGAQEKCVLPP
: : .. . :::... . ::. :.. .: ...: :
CCDS11 IQAIAQNVSDIAVKVDQILRH--------------SLLLHSKVS-----EGRRDQCEAPS
130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 MDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPHLPWRAKNPYEE
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CCDS11 DPKFPDCSGKVEWMRARWTSDPCYAFFGVDGTECSFLIYLSEVEWFCPPLPWRNQTAAQR
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 ADH---NSLAEIRTDFNILYSMMKKHEE-FRWMRLRIRRMADAWIQAIKSLAEKQNLEKR
: . . : .:.... : ..: . .: . .:. : .:.. : : . ::.: . .:
CCDS11 APKPLPKVQAVFRSNLSHLLDLMGSGKESLIFMKKRTKRLTAQWALAAQRLAQKLGATQR
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 KRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELK
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CCDS11 DQKQILVHIGFLTEESGDVFSPRVLKGGPLGEMVQWADILTALYVLGHGLRVTVSLKELQ
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 EIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFKKTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPE
. : .:..:: . .::: : :: :.:. .: :. .:.: .::.:.:::::
CCDS11 SNLG-VPPGRGSCPLTMPLPFDLIYTDYHGLQQMKRHMGLSFKKYRCRIRVIDTFGTEPA
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 FNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQQFYTMFPHTPDNSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKR
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CCDS11 YNHEEYATLHGYRTNWGYWNLNPKQFMTMFPHTPDNSFMGFVSEE-LNETEKRLIKGGKA
410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 QNQSLVYGKVDSFWKNKKIYLDIIHTYMEVHATVYGSSTK--NIPSYVKNHGILSGRDLQ
.:...:::: :.::.:. .: :.. :::.:.::: : . ..:..:::::.: ..:
CCDS11 SNMAVVYGKEASIWKGKEKFLGILNKYMEIHGTVYYESQRPPEVPAFVKNHGLLPQPEFQ
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 FLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEAIANGCAFLNPKFNPPKSSKNTDFFIGKPTLRELTSQ
:::..:::.:.::::::::::::::::: ::. .:.::.:: : .:: :::: ::. ::
CCDS11 QLLRKAKLFIGFGFPYEGPAPLEAIANGCIFLQSRFSPPHSSLNHEFFRGKPTSREVFSQ
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 HPYAEVFIGRPHVWTVDLNNQEEVEDAVKAILNQKIEPYMPYEFTCEGMLQRINAFIEKQ
::::: :::.::::::: ::.:: : :.:::. ...::.:::.::::::.::.:.:..:
CCDS11 HPYAENFIGKPHVWTVDYNNSEEFEAAIKAIMRTQVDPYLPYEYTCEGMLERIHAYIQHQ
580 590 600 610 620 630
630 640 650
pF1KE4 DFCHGQ--------------VM-------------------WPPLSALQVKLAEPGQSCK
:::.. :. ::: ::.. :: ::..:
CCDS11 DFCRAPDPALPEAHAPQSPFVLAPNATHLEWARNTSLAPGAWPPAHALRAWLAVPGRACT
640 650 660 670 680 690
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 QVCQESQLICEPSFFQHLNKDKDMLKYKVTCQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQGDLLL
..: . :::::::: ::.. .:: .: :.:.: . : :.: ...: .: . ::
CCDS11 DTCLDHGLICEPSFFPFLNSQDAFLKLQVPCDSTESEMNHLYPAFAQPGQECYLQKEPLL
700 710 720 730 740 750
720 730 740
pF1KE4 FSCAGAHPRHQRVCPCRDFIKGQVALCKDCL
:::::.. ...:.:::::: :::::::. ::
CCDS11 FSCAGSNTKYRRLCPCRDFRKGQVALCQGCL
760 770 780 790
>>CCDS45788.1 MGAT5B gene_id:146664|Hs108|chr17 (801 aa)
initn: 1423 init1: 778 opt: 1791 Z-score: 2177.8 bits: 413.7 E(32554): 5.6e-115
Smith-Waterman score: 2141; 44.1% identity (69.2% similar) in 757 aa overlap (32-741:66-801)
10 20 30 40 50
pF1KE4 ALFTPWKLSSQKLGFFLVTFGFIWGMMLLHFTIQQRTQ--PESSSMLREQ--ILDLSKRY
:::. ... ::: ..::.. .:.: .
CCDS45 FVLGIGFFTLCFLMTSLGGQFSARRLGDSPFTIRTEVMGGPESRGVLRKMSDLLELMVKR
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 IKALAE-ENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDNIL---QRIGKLESKVDNLVVNGTG
. :::. :: . . . . : : :.. : : .. . :::... .
CCDS45 MDALARLENSSELHRAGGDLHFPADRMPPGAGLMERIQAIAQNVSDIAVKVDQILRH---
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 TNSTNSTTAVPSLVALEKINVADIINGAQEKCVLPPMDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCY
::. :.. .: ...: : .: : ::..::. : :::::
CCDS45 -----------SLLLHSKVS-----EGRRDQCEAPSDPKFPDCSGKVEWMRARWTSDPCY
160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPHLPWRAKNPYEEADH---NSLAEIRTDFNILYSMMK
: .::::. :::.::::::: .:: :::: .. ..: . . : .:.... : ..:
CCDS45 AFFGVDGTECSFLIYLSEVEWFCPPLPWRNQTAAQRAPKPLPKVQAVFRSNLSHLLDLMG
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280
pF1KE4 KHEE-FRWMRLRIRRMADAWIQAIKSLAEKQNLEKRKRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETA
. .: . .:. : .:.. : : . ::.: . .: .:..:::.:.::.::: .. .
CCDS45 SGKESLIFMKKRTKRLTAQWALAAQRLAQKLGATQRDQKQILVHIGFLTEESGDVFSPRV
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 FSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELKEIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELI
..::::::.:::.:..:.::.::: .:...:: ::. . : .:..:: . .::
CCDS45 LKGGPLGEMVQWADILTALYVLGHGLRVTVSLKELQSNLG-VPPGRGSCPLTMPLPFDLI
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 YIDIVGLAQFKKTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPEFNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQ
: : :: :.:. .: :. .:.: .::.:.::::: .:: .:: .:..: :: :::::.
CCDS45 YTDYHGLQQMKRHMGLSFKKYRCRIRVIDTFGTEPAYNHEEYATLHGYRTNWGYWNLNPK
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 QFYTMFPHTPDNSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKRQNQSLVYGKVDSFWKNKKIYLDII
::.:::::::::::.::: :. :: .. . :. : .:...:::: :.::.:. .: :.
CCDS45 QFMTMFPHTPDNSFMGFVSEE-LNETEKRLIKGGKASNMAVVYGKEASIWKGKEKFLGIL
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 HTYMEVHATVYGSSTK--NIPSYVKNHGILSGRDLQFLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEA
. :::.:.::: : . ..:..:::::.: ..: :::..:::.:.::::::::::::
CCDS45 NKYMEIHGTVYYESQRPPEVPAFVKNHGLLPQPEFQQLLRKAKLFIGFGFPYEGPAPLEA
500 510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 IANGCAFLNPKFNPPKSSKNTDFFIGKPTLRELTSQHPYAEVFIGRPHVWTVDLNNQEEV
::::: ::. .:.::.:: : .:: :::: ::. ::::::: :::.::::::: ::.::
CCDS45 IANGCIFLQSRFSPPHSSLNHEFFRGKPTSREVFSQHPYAENFIGKPHVWTVDYNNSEEF
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630
pF1KE4 EDAVKAILNQKIEPYMPYEFTCEGMLQRINAFIEKQDFCHGQ--------------VM--
: :.:::. ...::.:::.::::::.::.:.:..::::.. :.
CCDS45 EAAIKAIMRTQVDPYLPYEYTCEGMLERIHAYIQHQDFCRAPDPALPEAHAPQSPFVLAP
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670
pF1KE4 -----------------WPPLSALQVKLAEPGQSCKQVCQESQLICEPSFFQHLNKDKDM
::: ::.. :: ::..: ..: . :::::::: ::.. .
CCDS45 NATHLEWARNTSLAPGAWPPAHALRAWLAVPGRACTDTCLDHGLICEPSFFPFLNSQDAF
680 690 700 710 720 730
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 LKYKVTCQSSELAKDILVPSFDPKNKHCVFQGDLLLFSCAGAHPRHQRVCPCRDFIKGQV
:: .: :.:.: . : :.: ...: .: . :::::::.. ...:.:::::: ::::
CCDS45 LKLQVPCDSTESEMNHLYPAFAQPGQECYLQKEPLLFSCAGSNTKYRRLCPCRDFRKGQV
740 750 760 770 780 790
740
pF1KE4 ALCKDCL
:::. ::
CCDS45 ALCQGCL
800
>>CCDS59299.1 MGAT5B gene_id:146664|Hs108|chr17 (792 aa)
initn: 2010 init1: 698 opt: 1784 Z-score: 2169.3 bits: 412.1 E(32554): 1.6e-114
Smith-Waterman score: 2135; 42.9% identity (67.8% similar) in 798 aa overlap (1-741:16-792)
10 20 30
pF1KE4 MALFTPWKLSSQKLGFFLVTF-----GFIWGMMLLH---FTIQQR
.. . :..: .::: . : : .. : :::. .
CCDS59 MITVNPDGKIMVRRCLVTLRPFRLFVLGIGFFTLCFLMTSLGGQFSARRLGDSPFTIRTE
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 TQ--PESSSMLREQ--ILDLSKRYIKALAE-ENRNVVDGPYAGVMTAYDLKKTLAVLLDN
.. ::: ..::.. .:.: . . :::. :: . . . . : : :..
CCDS59 VMGGPESRGVLRKMSDLLELMVKRMDALARLENSSELHRAGGDLHFPADRMPPGAGLMER
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KE4 IL---QRIGKLESKVDNLVVNGTGTNSTNSTTAVPSLVALEKINVADIINGAQEKCVLPP
: : .. . :::... . ::. :.. .: ...: :
CCDS59 IQAIAQNVSDIAVKVDQILRH--------------SLLLHSKVS-----EGRRDQCEAPS
130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 MDGYPHCEGKIKWMKDMWRSDPCYADYGVDGSTCSFFIYLSEVENWCPHLPWRAKNPYEE
.: : ::..::. : :::::: .::::. :::.::::::: .:: :::: .. ..
CCDS59 DPKFPDCSGKVEWMRARWTSDPCYAFFGVDGTECSFLIYLSEVEWFCPPLPWRNQTAAQR
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 ADH---NSLAEIRTDFNILYSMMKKHEE-FRWMRLRIRRMADAWIQAIKSLAEKQNLEKR
: . . : .:.... : ..: . .: . .:. : .:.. : : . ::.: . .:
CCDS59 APKPLPKVQAVFRSNLSHLLDLMGSGKESLIFMKKRTKRLTAQWALAAQRLAQKLGATQR
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 KRKKVLVHLGLLTKESGFKIAETAFSGGPLGELVQWSDLITSLYLLGHDIRISASLAELK
.:..:::.:.::.::: .. ...::::::.:::.:..:.::.::: .:...:: ::.
CCDS59 DQKQILVHIGFLTEESGDVFSPRVLKGGPLGEMVQWADILTALYVLGHGLRVTVSLKELQ
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 EIMKKVVGNRSGCPTVGDRIVELIYIDIVGLAQFKKTLGPSWVHYQCMLRVLDSFGTEPE
. : .:..:: . .::: : :: :.:. .: :. .:.: .::.:.:::::
CCDS59 SNLG-VPPGRGSCPLTMPLPFDLIYTDYHGLQQMKRHMGLSFKKYRCRIRVIDTFGTEPA
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 FNHANYAQSKGHKTPWGKWNLNPQQFYTMFPHTPDNSFLGFVVEQHLNSSDIHHINEIKR
.:: .:: .:..: :: :::::.::.:::::::::::.::: :. :: .. . :. :
CCDS59 YNHEEYATLHGYRTNWGYWNLNPKQFMTMFPHTPDNSFMGFVSEE-LNETEKRLIKGGKA
410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 QNQSLVYGKVDSFWK--NKKIYLDIIHTYMEVHATVYGSSTK--NIPSYVKNHGILSGRD
.:...:::: :.:: .:. .: :.. :::.:.::: : . ..:..:::::.: .
CCDS59 SNMAVVYGKEASIWKLQGKEKFLGILNKYMEIHGTVYYESQRPPEVPAFVKNHGLLPQPE
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 LQFLLRETKLFVGLGFPYEGPAPLEAIANGCAFLNPKFNPPKSSKNTDFFIGKPTLRELT
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.::::.. :. ::: ::.. :: ::..
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