Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4553
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4553, 665 aa
1>>>pF1KE4553 665 - 665 aa - 665 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9118+/-0.000877; mu= 13.2643+/- 0.053
mean_var=126.8887+/-25.200, 0's: 0 Z-trim(110.6): 80 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.113858
statistics sampled from 11631 (11712) to 11631 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16
Scan time: 4.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 4328 722.4 4.8e-208
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 3875 648.0 1.1e-185
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 736 132.5 2.8e-30
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 735 132.3 2.8e-30
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 728 131.1 5.3e-30
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 720 129.8 1.5e-29
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 713 128.7 3.3e-29
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 702 126.8 1e-28
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 702 126.8 1e-28
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 703 127.2 1.4e-28
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 695 125.9 3.5e-28
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 690 124.9 4.1e-28
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 678 123.0 2e-27
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 669 121.5 5.8e-27
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 669 121.8 1.2e-26
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 669 121.8 1.2e-26
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 661 120.2 1.4e-26
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 661 120.2 1.4e-26
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 655 119.1 2.1e-26
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 656 119.3 2.2e-26
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 655 119.1 2.2e-26
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 655 119.2 2.4e-26
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 655 119.2 2.5e-26
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 650 118.4 4.8e-26
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 642 117.0 9.1e-26
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 585 107.8 1e-22
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 560 103.5 1.1e-21
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 560 103.5 1.2e-21
CCDS6551.2 KIF24 gene_id:347240|Hs108|chr9 (1368) 562 104.0 1.4e-21
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 541 100.4 1e-20
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 535 99.5 2.3e-20
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 528 98.4 5.6e-20
CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690) 530 98.8 6.4e-20
CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791) 526 98.2 1.1e-19
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 518 96.7 1.8e-19
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 505 94.8 1.2e-18
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 498 93.5 1.8e-18
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 498 93.6 2.5e-18
CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 671) 462 87.4 7.1e-17
CCDS512.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 725) 462 87.4 7.6e-17
CCDS58949.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 686) 454 86.1 1.8e-16
CCDS3980.2 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 706) 454 86.1 1.8e-16
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 455 86.5 3.4e-16
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 455 86.5 3.4e-16
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 455 86.5 3.4e-16
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 455 86.5 3.4e-16
CCDS47216.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 744) 445 84.6 5.4e-16
CCDS6427.1 KIFC2 gene_id:90990|Hs108|chr8 ( 838) 437 83.4 1.5e-15
CCDS32685.1 KIF2B gene_id:84643|Hs108|chr17 ( 673) 422 80.8 6.8e-15
CCDS1719.1 KIF3C gene_id:3797|Hs108|chr2 ( 793) 413 79.4 2.2e-14
>>CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 (665 aa)
initn: 4328 init1: 4328 opt: 4328 Z-score: 3848.5 bits: 722.4 E(32554): 4.8e-208
Smith-Waterman score: 4328; 100.0% identity (100.0% similar) in 665 aa overlap (1-665:1-665)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAGGSTQQRRREMAAASAAAISGAGRCRLSKIGATRRPPPARVRVAVRLRPFVDGTAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAAGGSTQQRRREMAAASAAAISGAGRCRLSKIGATRRPPPARVRVAVRLRPFVDGTAGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SDPPCVRGMDSCSLEIANWRNHQETLKYQFDAFYGERSTQQDIYAGSVQPILRHLLEGQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SDPPCVRGMDSCSLEIANWRNHQETLKYQFDAFYGERSTQQDIYAGSVQPILRHLLEGQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ASVLAYGPTGAGKTHTMLGSPEQPGVIPRALMDLLQLTREEGAEGRPWALSVTMSYLEIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASVLAYGPTGAGKTHTMLGSPEQPGVIPRALMDLLQLTREEGAEGRPWALSVTMSYLEIY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 QEKVLDLLDPASGDLVIREDCRGNILIPGLSQKPISSFADFERHFLPASRNRTVGATRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QEKVLDLLDPASGDLVIREDCRGNILIPGLSQKPISSFADFERHFLPASRNRTVGATRLN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QRSSRSHAVLLVKVDQRERLAPFRQREGKLYLIDLAGSEDNRRTGNKGLRLKESGAINTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRSSRSHAVLLVKVDQRERLAPFRQREGKLYLIDLAGSEDNRRTGNKGLRLKESGAINTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LFVLGKVVDALNQGLPRVPYRDSKLTRLLQDSLGGSAHSILIANIAPERRFYLDTVSALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LFVLGKVVDALNQGLPRVPYRDSKLTRLLQDSLGGSAHSILIANIAPERRFYLDTVSALN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 FAARSKEVINRPFTNESLQPHALGPVKLSQKELLGPPEAKRARGPEEEEIGSPEPMAAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FAARSKEVINRPFTNESLQPHALGPVKLSQKELLGPPEAKRARGPEEEEIGSPEPMAAPA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SASQKLSPLQKLSSMDPAMLERLLSLDRLLASQGSQGAPLLSTPKRERMVLMKTVEEKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SASQKLSPLQKLSSMDPAMLERLLSLDRLLASQGSQGAPLLSTPKRERMVLMKTVEEKDL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 EIERLKTKQKELEAKMLAQKAEEKENHCPTMLRPLSHRTVTGAKPLKKAVVMPLQLIQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EIERLKTKQKELEAKMLAQKAEEKENHCPTMLRPLSHRTVTGAKPLKKAVVMPLQLIQEQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 AASPNAEIHILKNKGRKRKLESLDALEPEEKAEDCWELQISPELLAHGRQKILDLLNEGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AASPNAEIHILKNKGRKRKLESLDALEPEEKAEDCWELQISPELLAHGRQKILDLLNEGS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 ARDLRSLQRIGPKKAQLIVGWRELHGPFSQVEDLERVEGITGKQMESFLKANILGLAAGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARDLRSLQRIGPKKAQLIVGWRELHGPFSQVEDLERVEGITGKQMESFLKANILGLAAGQ
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 RCGAS
:::::
CCDS10 RCGAS
>>CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 (597 aa)
initn: 3875 init1: 3875 opt: 3875 Z-score: 3447.0 bits: 648.0 E(32554): 1.1e-185
Smith-Waterman score: 3875; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (69-665:1-597)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 PPPARVRVAVRLRPFVDGTAGASDPPCVRGMDSCSLEIANWRNHQETLKYQFDAFYGERS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDSCSLEIANWRNHQETLKYQFDAFYGERS
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 TQQDIYAGSVQPILRHLLEGQNASVLAYGPTGAGKTHTMLGSPEQPGVIPRALMDLLQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TQQDIYAGSVQPILRHLLEGQNASVLAYGPTGAGKTHTMLGSPEQPGVIPRALMDLLQLT
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 REEGAEGRPWALSVTMSYLEIYQEKVLDLLDPASGDLVIREDCRGNILIPGLSQKPISSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 REEGAEGRPWALSVTMSYLEIYQEKVLDLLDPASGDLVIREDCRGNILIPGLSQKPISSF
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 ADFERHFLPASRNRTVGATRLNQRSSRSHAVLLVKVDQRERLAPFRQREGKLYLIDLAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ADFERHFLPASRNRTVGATRLNQRSSRSHAVLLVKVDQRERLAPFRQREGKLYLIDLAGS
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 EDNRRTGNKGLRLKESGAINTSLFVLGKVVDALNQGLPRVPYRDSKLTRLLQDSLGGSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EDNRRTGNKGLRLKESGAINTSLFVLGKVVDALNQGLPRVPYRDSKLTRLLQDSLGGSAH
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 SILIANIAPERRFYLDTVSALNFAARSKEVINRPFTNESLQPHALGPVKLSQKELLGPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SILIANIAPERRFYLDTVSALNFAARSKEVINRPFTNESLQPHALGPVKLSQKELLGPPE
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 AKRARGPEEEEIGSPEPMAAPASASQKLSPLQKLSSMDPAMLERLLSLDRLLASQGSQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AKRARGPEEEEIGSPEPMAAPASASQKLSPLQKLSSMDPAMLERLLSLDRLLASQGSQGA
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 PLLSTPKRERMVLMKTVEEKDLEIERLKTKQKELEAKMLAQKAEEKENHCPTMLRPLSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLLSTPKRERMVLMKTVEEKDLEIERLKTKQKELEAKMLAQKAEEKENHCPTMLRPLSHR
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 TVTGAKPLKKAVVMPLQLIQEQAASPNAEIHILKNKGRKRKLESLDALEPEEKAEDCWEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TVTGAKPLKKAVVMPLQLIQEQAASPNAEIHILKNKGRKRKLESLDALEPEEKAEDCWEL
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 QISPELLAHGRQKILDLLNEGSARDLRSLQRIGPKKAQLIVGWRELHGPFSQVEDLERVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QISPELLAHGRQKILDLLNEGSARDLRSLQRIGPKKAQLIVGWRELHGPFSQVEDLERVE
520 530 540 550 560 570
640 650 660
pF1KE4 GITGKQMESFLKANILGLAAGQRCGAS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GITGKQMESFLKANILGLAAGQRCGAS
580 590
>>CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 (998 aa)
initn: 719 init1: 224 opt: 736 Z-score: 657.2 bits: 132.5 E(32554): 2.8e-30
Smith-Waterman score: 770; 28.9% identity (59.2% similar) in 657 aa overlap (46-660:14-657)
20 30 40 50 60
pF1KE4 AASAAAISGAGRCRLSKIGATRRPPPARVRVAVRLRPF--VDGTAGAS------DPPCVR
::.:.::. .. ::. : :
CCDS32 MKDSGDSKDQQLMVALRVRPISVAELEEGATLIAHKVDEQMVV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GMDSCSLEIANWRNHQETLK-YQFDAFYGERSTQQDIYAGSVQPILRHLLEGQNASVLAY
:: : :. : : ::. . .::. .: .... ... .. : ::.:.::
CCDS32 LMDPMEDPDDILRAHRSREKSYLFDVAFDFTATQEMVYQATTKSLIEGVISGYNATVFAY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GPTGAGKTHTMLGSPEQPGVIPRALMDLLQLTREEGAEGRPWALSVTMSYLEIYQEKVLD
:::: :::.::::. ..::. ..: ::.. .: . . :.:::::::.: . :
CCDS32 GPTGCGKTYTMLGTDQEPGIYVQTLNDLFRAIEETSND---MEYEVSMSYLEIYNEMIRD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LLDPASGDLVIREDCRGNILIPGLSQKPISSFADFERHFLPASRNRTVGATRLNQRSSRS
::.:. : : .::: .: : . :... . .. . .. ..:.:: : :: ::::
CCDS32 LLNPSLGYLELREDSKGVIQVAGITEVSTINAKEIMQLLMKGNRQRTQEPTAANQTSSRS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 HAVLLVKVDQRERLAPFRQ--REGKLYLIDLAGSEDNRRTGNKGLRLKESGAINTSLFVL
:::: : : :: :. . : :.:.:..::::::: .: :.: :.::.. :: ::..:
CCDS32 HAVLQVTVRQRSRVKNILQEVRQGRLFMIDLAGSERASQTQNRGQRMKEGAHINRSLLAL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 GKVVDAL-NQGLPR-VPYRDSKLTRLLQDSLGGSAHSILIANIAPERRFYLDTVSALNFA
:. ..:: ..: . . ::::::::::.:::::......::.:.: . .. ..:..:
CCDS32 GNCINALSDKGSNKYINYRDSKLTRLLKDSLGGNSRTVMIAHISPASSAFEESRNTLTYA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KE4 ARSKEVINRPFTN-----------ESLQPHALGPVKLSQKELLGPPEAKRARGPEEE-EI
.:.:.. .: : :. : .. .... .::: ... .:
CCDS32 GRAKNIKTRVKQNLLNVSYHIAQYTSIIADLRGEIQRLKRKIDEQTGRGQARGRQDRGDI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GSPEPMAAPASASQKLSPLQKLSSMDPAMLERLLSLDRLLASQGSQGAPLLSTPKRERMV
. . :.. . . . .: . . ... ... : : ... . .:. ..
CCDS32 RHIQAEVQLHSGQGEKAGMGQLREQLASAFQEQMDVRRRLLELENRAMEVQIDTSRHLLT
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE4 LMKTVEEKDLEIERLKTKQ-KELEAKMLAQKAEEKENHCPTMLRPLSHRTVTGAKPLKKA
. .::. . . . .: :: :: ..: . . : .:.: :..:. :
CCDS32 IAGWKHEKSRRALKWREEQRKECYAKDDSEKDSDTGDDQPDILEP---PEVAAARESIAA
470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 VVMPLQLIQEQAASPNAEIHILKNKGRKRKLESLDA-LEPEEKAED----CW--ELQI-S
.: . ...: . . . . :. .:: : :.: . ::. : : ::.. .
CCDS32 LVDEQKQLRKQKLALEQRCRELRARGR-RLEETLPRRIGSEEQREVLSLLCRVHELEVEN
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630
pF1KE4 PELLAHGRQKILDLLNEGSARDLR-SLQRIGPKKA---QLIVGWRELHGPFSQV--EDLE
:. .:. :: .:. : . ...:. ... ..: : :.. .. . . ::
CCDS32 TEMQSHA------LLRDGALRHRHEAVRRLEQHRSLCDEIIQGQRQIIDDYNLAVPQRLE
580 590 600 610 620 630
640 650 660
pF1KE4 RVEGITGKQME--SFLKANILGLAAGQRCGAS
.. . ...: :. .:.:. .:..
CCDS32 ELYEVYLRELEEGSLEQATIMDQVASRALQDSSLPKITPAGTSLTPDSDLESVKTLSSDA
640 650 660 670 680 690
>>CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 (898 aa)
initn: 780 init1: 260 opt: 735 Z-score: 657.0 bits: 132.3 E(32554): 2.8e-30
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. :: .: . . .. . .:.. ::. ::: . : :::.... ...::::
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.:.: : .::::: :::::::::::: ..:::. ... : . : : :..
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.::::.:.:.. ::: :: :..::: . .... ::. ..: :: . :.: ...:
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:: : .: :::::::. . . :... : . : : .:. :::::::: .: ::
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:. :. :: ::..::.:..:: .. . .:::.:::::::.:::::. ..:.:: ..
CCDS78 RFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKRKNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVS
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: :: :: ..:..: :.:.. . .: ... : ::. . :: :
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: ..: :... . .:. :.. :. : . . .. :.:. :: .
CCDS78 YEEQKAFTNENDQAKLMISNPQEKEIERFQEI--LNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENE
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.. . :. .:. . :.. ..: .. :::... :: . . . .:. :
CCDS78 LKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEKATGKRDHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNW
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. . .. . .: : . . . .. : . .:.: :.. .. ..:. :.
CCDS78 LHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCHHLHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEA
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:.:: : . . :
CCDS78 VLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSNAAFESDFKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPG
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::::::.:.: ::: . : ..: .. : :: ... :..: . . .::.
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CCDS75 VGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRL
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::. :: :: .::.:..:: .: .::::.:::::::::::::...... :::.:
CCDS75 KEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADY
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: .:.:.: .: :.:.. :. ::. . : . .:: :... : .
CCDS75 NYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALLRQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISG
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::. .. . .: .. :: : ...:. ::..: .:. : .:
CCDS75 SEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSSSDSTCSVIEK--PLDKFLPNQA--GKKKVS-
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: ..:. : :..: : :.: :. . . ::: . ::..... :
CCDS75 P--DKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLS
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: .....:. : . .:..:. : :.. ..... .:.:: : :..
CCDS75 ALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEES----NMELEERRKRAEQLRRELE-----EKEQE
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: : : . :.:. : :
CCDS75 RLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRE
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. : .:: :.:.:.. :::.: .: :.:::: .... ::: ..: :. .: . .
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.:::: : : ::::::.. . : :..:. . : . .:. :::::::: :
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:: ::.:.. :: ::..: .:..:: .. : ::::::::::::.:::::. ....::
CCDS58 KGERLREGANINRSLLALINVLNALADAKGRKTHVPYRDSKLTRLLKDSLGGNCRTVMIA
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:.: : :: ..:..: :.::. .. . ::. : . . :. : . : :
CCDS58 AISPSSLTYEDTYNTLKYADRAKEIRLSLKSNVTSLDCHISQYATICQQ-LQAEVAALRK
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. : :.: :. :.: .. : . :: : .: :. .. : :
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. :: . .. .... .. . .:. ..: :. . . : . :.:
CCDS58 MEAQVERAMEGNSSDQEQSPEDEDEGPAEEVPTQMPEQNPTHALPESPRLTLQPKPVVGH
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CCDS58 FSARELDGDRS-KQLALKVLCVAQRQYSLLQAA--NLLTPDMITEFETLQQLVQEEKIEP
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: . ::.: .: .:
CCDS58 GAE-ALRTSGLARGAPLAQELCSESIPVPSPLCPEPPGYTGPVTRTMARRLSGPLHTLGI
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.: .:.: : ::.::: ::::::::::: .::.. . ..: :. :. .
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. : .:: :.:.:.. :::.: .: :.:::: .... ::: ..: :. .: . .
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.:::: : : ::::::.. . : :..:. . : . .:. :::::::: :
CCDS45 NRNRTQHPTDANATSSRSHAIFQIFVKQQDRVPGLTQAVQVAKMSLIDLAGSERASSTHA
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:: ::.:.. :: ::..: .:..:: .. : ::::::::::::.:::::. ....::
CCDS45 KGERLREGANINRSLLALINVLNALADAKGRKTHVPYRDSKLTRLLKDSLGGNCRTVMIA
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. : :.: :. :.: . : .: ::. : :..:: .
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: :. . .: . : . :. :..:. : : . . :.. ..:
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: :.. .::. . . . ..: : .: . :. ::.::. :.::
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:...: :
CCDS45 --LRTSGLARGAPLAQELCSESIPVPSPLCPEPPGYTGPVTRTMARRLSGPLHTLGIPPG
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>>CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (699 aa)
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CCDS34 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMC
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CCDS34 YKQAV-SVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKTFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEG
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:....::: ::.::: :: : :: :.:: .. .. .... :: . : . : .
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CCDS34 SYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVYIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRS
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CCDS34 VGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMHVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRL
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::. :: :: .::.:..:: .: .::::.:::::::::::::...... :::.:
CCDS34 KEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNSKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADY
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: .:.:.: .: :.:.. :. ::. . : . .:: :... :
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:.:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]