Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4548
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4548, 647 aa
1>>>pF1KE4548 647 - 647 aa - 647 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4696+/-0.000406; mu= -7.6090+/- 0.026
mean_var=356.8312+/-71.532, 0's: 0 Z-trim(122.3): 11 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.067896
statistics sampled from 40277 (40288) to 40277 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.745), E-opt: 0.2 (0.472), width: 16
Scan time: 12.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001922 (OMIM: 245348,608770) dihydrolipoyllysin ( 647) 4303 435.6 2.7e-121
XP_011540949 (OMIM: 245348,608770) PREDICTED: dihy ( 611) 2928 300.9 9.2e-81
XP_011518692 (OMIM: 245349,608769) PREDICTED: pyru ( 441) 781 90.4 1.4e-17
NP_001128496 (OMIM: 245349,608769) pyruvate dehydr ( 486) 781 90.5 1.6e-17
NP_003468 (OMIM: 245349,608769) pyruvate dehydroge ( 501) 781 90.5 1.6e-17
NP_001159630 (OMIM: 245349,608769) pyruvate dehydr ( 274) 485 61.3 5.3e-09
NP_001909 (OMIM: 248600,248610) lipoamide acyltran ( 482) 409 54.0 1.4e-06
XP_005270602 (OMIM: 248600,248610) PREDICTED: lipo ( 301) 401 53.1 1.7e-06
XP_016855958 (OMIM: 248600,248610) PREDICTED: lipo ( 301) 401 53.1 1.7e-06
XP_016855957 (OMIM: 248600,248610) PREDICTED: lipo ( 301) 401 53.1 1.7e-06
NP_001924 (OMIM: 126063) dihydrolipoyllysine-resid ( 453) 395 52.6 3.6e-06
>>NP_001922 (OMIM: 245348,608770) dihydrolipoyllysine-re (647 aa)
initn: 4303 init1: 4303 opt: 4303 Z-score: 2298.5 bits: 435.6 E(85289): 2.7e-121
Smith-Waterman score: 4303; 100.0% identity (100.0% similar) in 647 aa overlap (1-647:1-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MWRVCARRAQNVAPWAGLEARWTALQEVPGTPRVTSRSGPAPARRNSVTTGYGGVRALCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWRVCARRAQNVAPWAGLEARWTALQEVPGTPRVTSRSGPAPARRNSVTTGYGGVRALCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WTPSSGATPRNRLLLQLLGSPGRRYYSLPPHQKVPLPSLSPTMQAGTIARWEKKEGDKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WTPSSGATPRNRLLLQLLGSPGRRYYSLPPHQKVPLPSLSPTMQAGTIARWEKKEGDKIN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 EGDLIAEVETDKATVGFESLEECYMAKILVAEGTRDVPIGAIICITVGKPEDIEAFKNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGDLIAEVETDKATVGFESLEECYMAKILVAEGTRDVPIGAIICITVGKPEDIEAFKNYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LDSSAAPTPQAAPAPTPAATASPPTPSAQAPGSSYPPHMQVLLPALSPTMTMGTVQRWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSSAAPTPQAAPAPTPAATASPPTPSAQAPGSSYPPHMQVLLPALSPTMTMGTVQRWEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KVGEKLSEGDLLAEIETDKATIGFEVQEEGYLAKILVPEGTRDVPLGTPLCIIVEKEADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVGEKLSEGDLLAEIETDKATIGFEVQEEGYLAKILVPEGTRDVPLGTPLCIIVEKEADI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SAFADYRPTEVTDLKPQVPPPTPPPVAAVPPTPQPLAPTPSAPCPATPAGPKGRVFVSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAFADYRPTEVTDLKPQVPPPTPPPVAAVPPTPQPLAPTPSAPCPATPAGPKGRVFVSPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AKKLAVEKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVPSKVAPAPAAVVPPTGPGMAPVPTGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKKLAVEKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVPSKVAPAPAAVVPPTGPGMAPVPTGVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TDIPISNIRRVIAQRLMQSKQTIPHYYLSIDVNMGEVLLVRKELNKILEGRSKISVNDFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDIPISNIRRVIAQRLMQSKQTIPHYYLSIDVNMGEVLLVRKELNKILEGRSKISVNDFI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IKASALACLKVPEANSSWMDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIAND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKASALACLKVPEANSSWMDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIAND
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 VVSLATKAREGKLQPHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVSLATKAREGKLQPHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE4 DNEKGFDVASMMSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNEKGFDVASMMSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
610 620 630 640
>>XP_011540949 (OMIM: 245348,608770) PREDICTED: dihydrol (611 aa)
initn: 3447 init1: 2921 opt: 2928 Z-score: 1571.0 bits: 300.9 E(85289): 9.2e-81
Smith-Waterman score: 3996; 94.4% identity (94.4% similar) in 647 aa overlap (1-647:1-611)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MWRVCARRAQNVAPWAGLEARWTALQEVPGTPRVTSRSGPAPARRNSVTTGYGGVRALCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MWRVCARRAQNVAPWAGLEARWTALQEVPGTPRVTSRSGPAPARRNSVTTGYGGVRALCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 WTPSSGATPRNRLLLQLLGSPGRRYYSLPPHQKVPLPSLSPTMQAGTIARWEKKEGDKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WTPSSGATPRNRLLLQLLGSPGRRYYSLPPHQKVPLPSLSPTMQAGTIARWEKKEGDKIN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 EGDLIAEVETDKATVGFESLEECYMAKILVAEGTRDVPIGAIICITVGKPEDIEAFKNYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGDLIAEVETDKATVGFESLEECYMAKILVAEGTRDVPIGAIICITVGKPEDIEAFKNYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LDSSAAPTPQAAPAPTPAATASPPTPSAQAPGSSYPPHMQVLLPALSPTMTMGTVQRWEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDSSAAPTPQAAPAPTPAATASPPTPSAQAPGSSYPPHMQVLLPALSPTMTMGTVQRWEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KVGEKLSEGDLLAEIETDKATIGFEVQEEGYLAKILVPEGTRDVPLGTPLCIIVEKEADI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVGEKLSEGDLLAEIETDKATIGFEVQEEGYLAKILVPEGTRDVPLGTPLCIIVEKEADI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SAFADYRPTEVTDLKPQVPPPTPPPVAAVPPTPQPLAPTPSAPCPATPAGPKGRVFVSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SAFADYRPTEVTDLKPQVPPPTPPPVAAVPPTPQPLAPTPSAPCPATPAGPKGRVFVSPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AKKLAVEKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVPSKVAPAPAAVVPPTGPGMAPVPTGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKKLAVEKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVPSKVAPAPAAVVPPTGPGMAPVPTGVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TDIPISNIRRVIAQRLMQSKQTIPHYYLSIDVNMGEVLLVRKELNKILEGRSKISVNDFI
:::::::::: ::::::::::::::
XP_011 TDIPISNIRR------------------------------------ILEGRSKISVNDFI
430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IKASALACLKVPEANSSWMDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIAND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IKASALACLKVPEANSSWMDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIAND
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 VVSLATKAREGKLQPHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVSLATKAREGKLQPHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPA
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640
pF1KE4 DNEKGFDVASMMSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNEKGFDVASMMSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
570 580 590 600 610
>>XP_011518692 (OMIM: 245349,608769) PREDICTED: pyruvate (441 aa)
initn: 995 init1: 456 opt: 781 Z-score: 436.4 bits: 90.4 E(85289): 1.4e-17
Smith-Waterman score: 1065; 41.8% identity (67.4% similar) in 457 aa overlap (223-645:1-440)
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 PAPTPAATASPPTPSAQAPGSSYPPHMQVLLPALSPTMTMGTVQRWEKKVGEKLSEGDLL
.:.::::: :.. .: :: :: .: :: :
XP_011 MPSLSPTMEEGNIVKWLKKEGEAVSAGDAL
10 20 30
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 AEIETDKATIGFEVQEEGYLAKILVPEGTRDVPLGTPLCIIVEKEADISAFADYRPTEVT
:::::::.. ......: ::::.: ::.... ::. . .::: :.. :.. .:.
XP_011 CEIETDKAVVTLDASDDGILAKIVVEEGSKNIRLGSLIGLIVE-EGE-----DWKHVEI-
40 50 60 70 80
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 DLKPQVPPPTPPPVAAVPPTPQPLAPTPSAPCPATPAGPKG--RVFVSPLAKKLAVEKGI
:. : ::::. : :.: .: :. :. : : .:: :... ....
XP_011 ---PKDVGP-PPPVSK-PSEPRP-SPEPQISIPVKKEHIPGTLRFRLSPAARNILEKHSL
90 100 110 120 130
380 390 400
pF1KE4 DLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVP---------SKVAPAPAA------------------
: .: .::: : .::.: ..: :. .:::.:
XP_011 DASQGTATGPRGIFTKEDALKLVQLKQTGKITESRPTPAPTATPTAPSPLQATAGPSYPR
140 150 160 170 180 190
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 -VVPPTG-PGMAPVPTGVFTDIPISNIRRVIAQRLMQSKQTIPHYYLSIDVNMGEVLLVR
:.::.. ::. : .:.::.:: ::::::::.:: .::.:.:: : . : ..: :: ::
XP_011 PVIPPVSTPGQ-PNAVGTFTEIPASNIRRVIAKRLTESKSTVPHAYATADCDLGAVLKVR
200 210 220 230 240 250
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 KELNKILEGRSKISVNDFIIKASALACLKVPEANSSWMDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGL
..: : :.:::::::::.:.. ..:..: :: .: .:.::::.: ::
XP_011 QDLVK---DDIKVSVNDFIIKAAAVTLKQMPDVNVSWDGEGPKQLPFIDISVAVATDKGL
260 270 280 290 300 310
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 ITPIVFNAHIKGVETIANDVVSLATKAREGKLQPHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIIN
.:::. .: ::.. ::..: .:. :::.::: :.:.:::.:.::::::::: .:.:.::
XP_011 LTPIIKDAAAKGIQEIADSVKALSKKARDGKLLPEEYQGGSFSISNLGMFGIDEFTAVIN
320 330 340 350 360 370
590 600 610 620 630
pF1KE4 PPQACILAIGASEDKLVPADNEKG---FDVASMMSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKY
::::::::.: . : ...:.: .. ....::.: : :::: .....: :.
XP_011 PPQACILAVGRFRPVLKLTEDEEGNAKLQQRQLITVTMSSDSRVVDDELATRFLKSFKAN
380 390 400 410 420 430
640
pF1KE4 LEKPITMLL
::.:: .
XP_011 LENPIRLA
440
>>NP_001128496 (OMIM: 245349,608769) pyruvate dehydrogen (486 aa)
initn: 1014 init1: 456 opt: 781 Z-score: 435.8 bits: 90.5 E(85289): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 1100; 40.9% identity (66.7% similar) in 484 aa overlap (197-645:19-485)
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 VGKPEDIEAFKNYTLDSSAAPTPQAAPAPTPAATASPPTP-SAQAPGSSYPPHMQVLLPA
:.. .::. :. :: ...:.:.
NP_001 MQSGGAEGSPGAGRTGRGPGSGKAPPAEISSGAPDFPGGDPIKILMPS
10 20 30 40
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LSPTMTMGTVQRWEKKVGEKLSEGDLLAEIETDKATIGFEVQEEGYLAKILVPEGTRDVP
::::: :.. .: :: :: .: :: : :::::::.. ......: ::::.: ::....
NP_001 LSPTMEEGNIVKWLKKEGEAVSAGDALCEIETDKAVVTLDASDDGILAKIVVEEGSKNIR
50 60 70 80 90 100
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LGTPLCIIVEKEADISAFADYRPTEVTDLKPQVPPPTPPPVAAVPPTPQPLAPTPSAPCP
::. . .::: :.. :.. .:. :. : ::::. : :.: .: :. :
NP_001 LGSLIGLIVE-EGE-----DWKHVEI----PKDVGP-PPPVSK-PSEPRP-SPEPQISIP
110 120 130 140 150
350 360 370 380 390
pF1KE4 ATPAGPKG--RVFVSPLAKKLAVEKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVP---------
. : : .:: :... ....: .: .::: : .::.: ..:
NP_001 VKKEHIPGTLRFRLSPAARNILEKHSLDASQGTATGPRGIFTKEDALKLVQLKQTGKITE
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430
pF1KE4 SKVAPAPAA-------------------VVPPTG-PGMAPVPTGVFTDIPISNIRRVIAQ
:. .:::.: :.::.. ::. : .:.::.:: ::::::::.
NP_001 SRPTPAPTATPTAPSPLQATAGPSYPRPVIPPVSTPGQ-PNAVGTFTEIPASNIRRVIAK
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 RLMQSKQTIPHYYLSIDVNMGEVLLVRKELNKILEGRSKISVNDFIIKASALACLKVPEA
:: .::.:.:: : . : ..: :: ::..: : :.:::::::::.:.. ..:..
NP_001 RLTESKSTVPHAYATADCDLGAVLKVRQDLVK---DDIKVSVNDFIIKAAAVTLKQMPDV
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 NSSWMDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIANDVVSLATKAREGKLQ
: :: .: .:.::::.: ::.:::. .: ::.. ::..: .:. :::.:::
NP_001 NVSWDGEGPKQLPFIDISVAVATDKGLLTPIIKDAAAKGIQEIADSVKALSKKARDGKLL
340 350 360 370 380 390
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 PHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPADNEKG---FDVASM
:.:.:::.:.::::::::: .:.:.::::::::::.: . : ...:.: .. ..
NP_001 PEEYQGGSFSISNLGMFGIDEFTAVINPPQACILAVGRFRPVLKLTEDEEGNAKLQQRQL
400 410 420 430 440 450
620 630 640
pF1KE4 MSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
..::.: : :::: .....: :. ::.:: .
NP_001 ITVTMSSDSRVVDDELATRFLKSFKANLENPIRLA
460 470 480
>>NP_003468 (OMIM: 245349,608769) pyruvate dehydrogenase (501 aa)
initn: 1052 init1: 456 opt: 781 Z-score: 435.6 bits: 90.5 E(85289): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 1078; 41.6% identity (67.7% similar) in 461 aa overlap (219-645:57-500)
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 PQAAPAPTPAATASPPTPSAQAPGSSYPPHMQVLLPALSPTMTMGTVQRWEKKVGEKLSE
...:.:.::::: :.. .: :: :: .:
NP_003 GLVKGALGWSVSRGANWRWFHSTQWLRGDPIKILMPSLSPTMEEGNIVKWLKKEGEAVSA
30 40 50 60 70 80
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GDLLAEIETDKATIGFEVQEEGYLAKILVPEGTRDVPLGTPLCIIVEKEADISAFADYRP
:: : :::::::.. ......: ::::.: ::.... ::. . .::: :.. :..
NP_003 GDALCEIETDKAVVTLDASDDGILAKIVVEEGSKNIRLGSLIGLIVE-EGE-----DWKH
90 100 110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TEVTDLKPQVPPPTPPPVAAVPPTPQPLAPTPSAPCPATPAGPKG--RVFVSPLAKKLAV
.:. :. : ::::. : :.: .: :. :. : : .:: :...
NP_003 VEI----PKDVGP-PPPVSK-PSEPRP-SPEPQISIPVKKEHIPGTLRFRLSPAARNILE
150 160 170 180 190
370 380 390 400
pF1KE4 EKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVP---------SKVAPAPAA--------------
....: .: .::: : .::.: ..: :. .:::.:
NP_003 KHSLDASQGTATGPRGIFTKEDALKLVQLKQTGKITESRPTPAPTATPTAPSPLQATAGP
200 210 220 230 240 250
410 420 430 440 450
pF1KE4 -----VVPPTG-PGMAPVPTGVFTDIPISNIRRVIAQRLMQSKQTIPHYYLSIDVNMGEV
:.::.. ::. : .:.::.:: ::::::::.:: .::.:.:: : . : ..: :
NP_003 SYPRPVIPPVSTPGQ-PNAVGTFTEIPASNIRRVIAKRLTESKSTVPHAYATADCDLGAV
260 270 280 290 300 310
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 LLVRKELNKILEGRSKISVNDFIIKASALACLKVPEANSSWMDTVIRQNHVVDVSVAVST
: ::..: : :.:::::::::.:.. ..:..: :: .: .:.::::.:
NP_003 LKVRQDLVK---DDIKVSVNDFIIKAAAVTLKQMPDVNVSWDGEGPKQLPFIDISVAVAT
320 330 340 350 360
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 PAGLITPIVFNAHIKGVETIANDVVSLATKAREGKLQPHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFS
::.:::. .: ::.. ::..: .:. :::.::: :.:.:::.:.::::::::: .:.
NP_003 DKGLLTPIIKDAAAKGIQEIADSVKALSKKARDGKLLPEEYQGGSFSISNLGMFGIDEFT
370 380 390 400 410 420
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 AIINPPQACILAIGASEDKLVPADNEKG---FDVASMMSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAE
:.::::::::::.: . : ...:.: .. ....::.: : :::: .....:
NP_003 AVINPPQACILAVGRFRPVLKLTEDEEGNAKLQQRQLITVTMSSDSRVVDDELATRFLKS
430 440 450 460 470 480
640
pF1KE4 FRKYLEKPITMLL
:. ::.:: .
NP_003 FKANLENPIRLA
490 500
>>NP_001159630 (OMIM: 245349,608769) pyruvate dehydrogen (274 aa)
initn: 689 init1: 380 opt: 485 Z-score: 282.5 bits: 61.3 E(85289): 5.3e-09
Smith-Waterman score: 485; 46.2% identity (75.6% similar) in 160 aa overlap (489-645:114-273)
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 LVRKELNKILEGRSKISVNDFIIKASALACLKVPEANSSWMDTVIRQNHVVDVSVAVSTP
...:..: :: .: .:.::::.:
NP_001 VSAGDALCEIETDKAVVTLDASDDGILAKIVQMPDVNVSWDGEGPKQLPFIDISVAVATD
90 100 110 120 130 140
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 AGLITPIVFNAHIKGVETIANDVVSLATKAREGKLQPHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSA
::.:::. .: ::.. ::..: .:. :::.::: :.:.:::.:.::::::::: .:.:
NP_001 KGLLTPIIKDAAAKGIQEIADSVKALSKKARDGKLLPEEYQGGSFSISNLGMFGIDEFTA
150 160 170 180 190 200
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 IINPPQACILAIGASEDKLVPADNEKG---FDVASMMSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEF
.::::::::::.: . : ...:.: .. ....::.: : :::: .....: :
NP_001 VINPPQACILAVGRFRPVLKLTEDEEGNAKLQQRQLITVTMSSDSRVVDDELATRFLKSF
210 220 230 240 250 260
640
pF1KE4 RKYLEKPITMLL
. ::.:: .
NP_001 KANLENPIRLA
270
>>NP_001909 (OMIM: 248600,248610) lipoamide acyltransfer (482 aa)
initn: 409 init1: 151 opt: 409 Z-score: 238.9 bits: 54.0 E(85289): 1.4e-06
Smith-Waterman score: 550; 29.9% identity (59.4% similar) in 438 aa overlap (234-647:80-479)
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 PTPSAQAPGSSYPPHMQVLLPALSPTMTMGTVQRWEKKVGEKLSEGDLLAEIETDKATIG
::..: : :. .:. : . :...:::..
NP_001 PHHFLKTTAALRGQVVQFKLSDIGEGIREVTVKEWYVKEGDTVSQFDSICEVQSDKASVT
50 60 70 80 90 100
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 FEVQEEGYLAKILVPEGTRDVP-LGTPLCIIVEKEADISAFADYRPTEVTDLKPQVPPPT
. . .: . :. . :. .: :: . .: :: .. : :
NP_001 ITSRYDGVIKKLYY--NLDDIAYVGKPL-VDIETEALKDSEEDVVET-------------
110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 PPPVAAVPPTPQPLAPTPSAPCPATPAGPKGR-VFVSPLAKKLAVEKGIDLTQVKGTGPD
: :. : : . ::: ....: ...::.:..: :..: :.: :
NP_001 -PAVSHDEHTHQEI---------------KGRKTLATPAVRRLAMENNIKLSEVVGSGKD
160 170 180 190
390 400 410 420
pF1KE4 GRITKKDIDSFVPSKVA----PAPAAVV--PPTGPGMAPVPT-----GVFTDI----PIS
::: :.:: ... .... :.: . . :: : :: ::: ::.
NP_001 GRILKEDILNYLEKQTGAILPPSPKVEIMPPPPKPKDMTVPILVSKPPVFTGKDKTEPIK
200 210 220 230 240 250
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 NIRRVIAQRLMQSKQTIPHYYLSIDVNMGEVLLVRKELNKILEGRS-KISVNDFIIKASA
....... . :.. :::. .... :.. .:.::. : .:. :.: :..::..
NP_001 GFQKAMV-KTMSAALKIPHFGYCDEIDLTELVKLREELKPIAFARGIKLSFMPFFLKAAS
260 270 280 290 300 310
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LACLKVPEANSSW----MDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIANDV
:. :. : :.: .. . . .: ....:..: :::.: : :..: .. ::...
NP_001 LGLLQFPILNASVDENCQNITYKASH--NIGIAMDTEQGLIVPNVKNVQICSIFDIATEL
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 VSLATKAREGKLQPHEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPAD
: . :.:. .. :::::.::.: .: . .: ::.. : :.:. : .:
NP_001 NRLQKLGSVGQLSTTDLTGGTFTLSNIGSIGGTFAKPVIMPPEVAIGALGSI--KAIPRF
380 390 400 410 420 430
610 620 630 640
pF1KE4 NEKGFDV--ASMMSVTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
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NP_001 NQKG-EVYKAQIMNVSWSADHRVIDGATMSRFSNLWKSYLENPAFMLLDLK
440 450 460 470 480
>>XP_005270602 (OMIM: 248600,248610) PREDICTED: lipoamid (301 aa)
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Smith-Waterman score: 463; 32.2% identity (64.5% similar) in 304 aa overlap (366-647:1-298)
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 LAPTPSAPCPATPAGPKGRVFVSPLAKKLAVEKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVPS
.:..: :..: :.: :::: :.:: ... .
XP_005 MENNIKLSEVVGSGKDGRILKEDILNYLEK
10 20 30
400 410 420 430 440
pF1KE4 KVA----PAPAAVV--PPTGPGMAPVPT-----GVFTDI----PISNIRRVIAQRLMQSK
... :.: . . :: : :: ::: ::........ . :..
XP_005 QTGAILPPSPKVEIMPPPPKPKDMTVPILVSKPPVFTGKDKTEPIKGFQKAMV-KTMSAA
40 50 60 70 80
450 460 470 480 490
pF1KE4 QTIPHYYLSIDVNMGEVLLVRKELNKILEGRS-KISVNDFIIKASALACLKVPEANSSW-
:::. .... :.. .:.::. : .:. :.: :..::..:. :. : :.:
XP_005 LKIPHFGYCDEIDLTELVKLREELKPIAFARGIKLSFMPFFLKAASLGLLQFPILNASVD
90 100 110 120 130 140
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 ---MDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIANDVVSLATKAREGKLQP
.. . . .: ....:..: :::.: : :..: .. ::... : . ..:.
XP_005 ENCQNITYKASH--NIGIAMDTEQGLIVPNVKNVQICSIFDIATELNRLQKLGSVSQLST
150 160 170 180 190 200
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 HEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPADNEKGFDV--ASMMS
.. :::::.::.: .: . .: ::.. : :.:. : .: :.:: .: :..:.
XP_005 TDLTGGTFTLSNIGSIGGTFAKPVIMPPEVAIGALGSI--KAIPRFNQKG-EVYKAQIMN
210 220 230 240 250 260
620 630 640
pF1KE4 VTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
:. : ::::.:::. ... ...:::.: :::
XP_005 VSWSADHRVIDGATMSRFSNLWKSYLENPAFMLLDLK
270 280 290 300
>>XP_016855958 (OMIM: 248600,248610) PREDICTED: lipoamid (301 aa)
initn: 310 init1: 143 opt: 401 Z-score: 237.5 bits: 53.1 E(85289): 1.7e-06
Smith-Waterman score: 463; 32.2% identity (64.5% similar) in 304 aa overlap (366-647:1-298)
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 LAPTPSAPCPATPAGPKGRVFVSPLAKKLAVEKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVPS
.:..: :..: :.: :::: :.:: ... .
XP_016 MENNIKLSEVVGSGKDGRILKEDILNYLEK
10 20 30
400 410 420 430 440
pF1KE4 KVA----PAPAAVV--PPTGPGMAPVPT-----GVFTDI----PISNIRRVIAQRLMQSK
... :.: . . :: : :: ::: ::........ . :..
XP_016 QTGAILPPSPKVEIMPPPPKPKDMTVPILVSKPPVFTGKDKTEPIKGFQKAMV-KTMSAA
40 50 60 70 80
450 460 470 480 490
pF1KE4 QTIPHYYLSIDVNMGEVLLVRKELNKILEGRS-KISVNDFIIKASALACLKVPEANSSW-
:::. .... :.. .:.::. : .:. :.: :..::..:. :. : :.:
XP_016 LKIPHFGYCDEIDLTELVKLREELKPIAFARGIKLSFMPFFLKAASLGLLQFPILNASVD
90 100 110 120 130 140
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 ---MDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIANDVVSLATKAREGKLQP
.. . . .: ....:..: :::.: : :..: .. ::... : . ..:.
XP_016 ENCQNITYKASH--NIGIAMDTEQGLIVPNVKNVQICSIFDIATELNRLQKLGSVSQLST
150 160 170 180 190 200
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 HEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPADNEKGFDV--ASMMS
.. :::::.::.: .: . .: ::.. : :.:. : .: :.:: .: :..:.
XP_016 TDLTGGTFTLSNIGSIGGTFAKPVIMPPEVAIGALGSI--KAIPRFNQKG-EVYKAQIMN
210 220 230 240 250 260
620 630 640
pF1KE4 VTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
:. : ::::.:::. ... ...:::.: :::
XP_016 VSWSADHRVIDGATMSRFSNLWKSYLENPAFMLLDLK
270 280 290 300
>>XP_016855957 (OMIM: 248600,248610) PREDICTED: lipoamid (301 aa)
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Smith-Waterman score: 463; 32.2% identity (64.5% similar) in 304 aa overlap (366-647:1-298)
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 LAPTPSAPCPATPAGPKGRVFVSPLAKKLAVEKGIDLTQVKGTGPDGRITKKDIDSFVPS
.:..: :..: :.: :::: :.:: ... .
XP_016 MENNIKLSEVVGSGKDGRILKEDILNYLEK
10 20 30
400 410 420 430 440
pF1KE4 KVA----PAPAAVV--PPTGPGMAPVPT-----GVFTDI----PISNIRRVIAQRLMQSK
... :.: . . :: : :: ::: ::........ . :..
XP_016 QTGAILPPSPKVEIMPPPPKPKDMTVPILVSKPPVFTGKDKTEPIKGFQKAMV-KTMSAA
40 50 60 70 80
450 460 470 480 490
pF1KE4 QTIPHYYLSIDVNMGEVLLVRKELNKILEGRS-KISVNDFIIKASALACLKVPEANSSW-
:::. .... :.. .:.::. : .:. :.: :..::..:. :. : :.:
XP_016 LKIPHFGYCDEIDLTELVKLREELKPIAFARGIKLSFMPFFLKAASLGLLQFPILNASVD
90 100 110 120 130 140
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 ---MDTVIRQNHVVDVSVAVSTPAGLITPIVFNAHIKGVETIANDVVSLATKAREGKLQP
.. . . .: ....:..: :::.: : :..: .. ::... : . ..:.
XP_016 ENCQNITYKASH--NIGIAMDTEQGLIVPNVKNVQICSIFDIATELNRLQKLGSVSQLST
150 160 170 180 190 200
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 HEFQGGTFTISNLGMFGIKNFSAIINPPQACILAIGASEDKLVPADNEKGFDV--ASMMS
.. :::::.::.: .: . .: ::.. : :.:. : .: :.:: .: :..:.
XP_016 TDLTGGTFTLSNIGSIGGTFAKPVIMPPEVAIGALGSI--KAIPRFNQKG-EVYKAQIMN
210 220 230 240 250 260
620 630 640
pF1KE4 VTLSCDHRVVDGAVGAQWLAEFRKYLEKPITMLL
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270 280 290 300
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]