Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4529
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4529, 580 aa
1>>>pF1KE4529 580 - 580 aa - 580 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2729+/-0.000288; mu= 15.9148+/- 0.018
mean_var=98.1352+/-20.405, 0's: 0 Z-trim(120.3): 15 B-trim: 1443 in 1/56
Lambda= 0.129468
statistics sampled from 35317 (35332) to 35317 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.733), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16
Scan time: 12.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065394 (OMIM: 252650,605248) mucolipin-1 [Homo ( 580) 3938 745.6 1e-214
XP_011539489 (OMIM: 607399) PREDICTED: mucolipin-2 ( 538) 1673 322.5 2.2e-87
XP_011539490 (OMIM: 607399) PREDICTED: mucolipin-2 ( 538) 1673 322.5 2.2e-87
NP_001317576 (OMIM: 607399) mucolipin-2 isoform 2 ( 538) 1673 322.5 2.2e-87
XP_005270776 (OMIM: 607399) PREDICTED: mucolipin-2 ( 538) 1673 322.5 2.2e-87
NP_694991 (OMIM: 607399) mucolipin-2 isoform 1 [Ho ( 566) 1673 322.5 2.3e-87
NP_001240622 (OMIM: 607400) mucolipin-3 isoform 2 ( 497) 1619 312.4 2.2e-84
XP_011540042 (OMIM: 607400) PREDICTED: mucolipin-3 ( 521) 1619 312.4 2.3e-84
XP_005271060 (OMIM: 607400) PREDICTED: mucolipin-3 ( 553) 1619 312.4 2.4e-84
NP_060768 (OMIM: 607400) mucolipin-3 isoform 1 [Ho ( 553) 1619 312.4 2.4e-84
XP_006710813 (OMIM: 607400) PREDICTED: mucolipin-3 ( 553) 1619 312.4 2.4e-84
XP_011540041 (OMIM: 607400) PREDICTED: mucolipin-3 ( 566) 1619 312.4 2.5e-84
XP_011540044 (OMIM: 607400) PREDICTED: mucolipin-3 ( 398) 1611 310.8 5.3e-84
XP_011540043 (OMIM: 607400) PREDICTED: mucolipin-3 ( 445) 642 129.9 1.8e-29
XP_016856412 (OMIM: 607399) PREDICTED: mucolipin-2 ( 287) 538 110.3 8.7e-24
>>NP_065394 (OMIM: 252650,605248) mucolipin-1 [Homo sapi (580 aa)
initn: 3938 init1: 3938 opt: 3938 Z-score: 3975.8 bits: 745.6 E(85289): 1e-214
Smith-Waterman score: 3938; 100.0% identity (100.0% similar) in 580 aa overlap (1-580:1-580)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTAPAGPRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEEEDLRRRLKYFFMSPCDKFRAKG
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NP_065 MTAPAGPRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEEEDLRRRLKYFFMSPCDKFRAKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RKPCKLMLQVVKILVVTVQLILFGLSNQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGADDTFAAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RKPCKLMLQVVKILVVTVQLILFGLSNQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGADDTFAAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TREQLYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPAND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TREQLYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPAND
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TFDIDPMVVTDCIQVDPPERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRLKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TFDIDPMVVTDCIQVDPPERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRLKTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 NLQSLINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECKHPSVFQHGDNSFRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NLQSLINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECKHPSVFQHGDNSFRLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 FDVVVILTCSLSFLLCARSLLRGFLLQNEFVGFMWRQRGRVISLWERLEFVNGWYILLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 FDVVVILTCSLSFLLCARSLLRGFLLQNEFVGFMWRQRGRVISLWERLEFVNGWYILLVT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SDVLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILIATLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SDVLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILIATLRV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ALPSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFVTFAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ALPSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFVTFAAM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 QAQQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEESELQAY
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NP_065 QAQQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEESELQAY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KE4 IAQCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IAQCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
550 560 570 580
>>XP_011539489 (OMIM: 607399) PREDICTED: mucolipin-2 iso (538 aa)
initn: 1666 init1: 758 opt: 1673 Z-score: 1689.8 bits: 322.5 E(85289): 2.2e-87
Smith-Waterman score: 1771; 49.4% identity (77.7% similar) in 543 aa overlap (37-575:9-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 PRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEEEDLRRRLKYFFMSPCDKFRAKGRKPCKL
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XP_011 MAHRDSEMKEECLREDLKFYFMSPCEKYRARRQIPWKL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 MLQVVKILVVTVQLILFGLSNQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGADDTFA--AYTREQ
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XP_011 GLQILKIVMVTTQLVRFGLSNQLVVAFKEDNTVAFKHLFLKGYSGTDEDDYSCSVYTQED
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPANDTFDI
:..:: :..:: : :..:: .: :. : :: .:...:..: . :.:.:..:
XP_011 AYESIFFAINQYHQLKDITLGTLGY----GENEDNRIGLKVCKQHYKKGTMFPSNETLNI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPMVVTDCIQVDPPERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRLKTINLQS
: : ::.:.: . ::. ..:: .. :.:..:..: : :.:: :.::.
XP_011 DNDVELDCVQLDLQDLSKKPPD-----WKNSSFFR---LEFYRLLQVEISFHLKGIDLQT
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECKHPSVF--QHGDNSFRLLFD
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XP_011 IHSRELPDCYVFQNTIIFDNKAHSGKIKIYFDSDAKIEECKDLNIFGSTQKNAQYVLVFD
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VVVILTCSLSFLLCARSLLRGFLLQNEFVGFMWRQRGRVISLWERLEFVNGWYILLVTSD
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XP_011 AFVIVICLASLILCTRSIVLALRLRKRFLNFFLEKYKRPVCDTDQWEFINGWYVLVIISD
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILIATLRVAL
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XP_011 LMTIIGSILKMEIKAKNLTNYDLCSIFLGTSTLLVWVGVIRYLGYFQAYNVLILTMQASL
330 340 350 360 370 380
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pF1KE4 PSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFVTFAAMQA
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XP_011 PKVLRFCACAGMIYLGYTFCGWIVLGPYHDKFENLNTVAECLFSLVNGDDMFATFA--QI
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 QQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEESELQAYIA
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XP_011 QQ-KSILVWLFSRLYLYSFISLFIYMILSLFIALITDSYDTIKKFQQNGFPETDLQEFLK
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580
pF1KE4 QCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
.:. .. .... :.. : .:: : :..:
XP_011 ECS---SKEEYQKESSAFLSCICCRRRKRSDDHLIPIS
510 520 530
>>XP_011539490 (OMIM: 607399) PREDICTED: mucolipin-2 iso (538 aa)
initn: 1666 init1: 758 opt: 1673 Z-score: 1689.8 bits: 322.5 E(85289): 2.2e-87
Smith-Waterman score: 1771; 49.4% identity (77.7% similar) in 543 aa overlap (37-575:9-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 PRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEEEDLRRRLKYFFMSPCDKFRAKGRKPCKL
.:: ::. ::..:::::.:.::. . : ::
XP_011 MAHRDSEMKEECLREDLKFYFMSPCEKYRARRQIPWKL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 MLQVVKILVVTVQLILFGLSNQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGADDTFA--AYTREQ
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XP_011 GLQILKIVMVTTQLVRFGLSNQLVVAFKEDNTVAFKHLFLKGYSGTDEDDYSCSVYTQED
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130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPANDTFDI
:..:: :..:: : :..:: .: :. : :: .:...:..: . :.:.:..:
XP_011 AYESIFFAINQYHQLKDITLGTLGY----GENEDNRIGLKVCKQHYKKGTMFPSNETLNI
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190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPMVVTDCIQVDPPERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRLKTINLQS
: : ::.:.: . ::. ..:: .. :.:..:..: : :.:: :.::.
XP_011 DNDVELDCVQLDLQDLSKKPPD-----WKNSSFFR---LEFYRLLQVEISFHLKGIDLQT
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250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECKHPSVF--QHGDNSFRLLFD
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XP_011 IHSRELPDCYVFQNTIIFDNKAHSGKIKIYFDSDAKIEECKDLNIFGSTQKNAQYVLVFD
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310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VVVILTCSLSFLLCARSLLRGFLLQNEFVGFMWRQRGRVISLWERLEFVNGWYILLVTSD
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XP_011 AFVIVICLASLILCTRSIVLALRLRKRFLNFFLEKYKRPVCDTDQWEFINGWYVLVIISD
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pF1KE4 VLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILIATLRVAL
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XP_011 LMTIIGSILKMEIKAKNLTNYDLCSIFLGTSTLLVWVGVIRYLGYFQAYNVLILTMQASL
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pF1KE4 PSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFVTFAAMQA
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XP_011 PKVLRFCACAGMIYLGYTFCGWIVLGPYHDKFENLNTVAECLFSLVNGDDMFATFA--QI
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 QQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEESELQAYIA
:: .: ::::::.:::::::::::::.::::::::: .:::::. : :..:: ..
XP_011 QQ-KSILVWLFSRLYLYSFISLFIYMILSLFIALITDSYDTIKKFQQNGFPETDLQEFLK
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580
pF1KE4 QCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
.:. .. .... :.. : .:: : :..:
XP_011 ECS---SKEEYQKESSAFLSCICCRRRKRSDDHLIPIS
510 520 530
>>NP_001317576 (OMIM: 607399) mucolipin-2 isoform 2 [Hom (538 aa)
initn: 1666 init1: 758 opt: 1673 Z-score: 1689.8 bits: 322.5 E(85289): 2.2e-87
Smith-Waterman score: 1771; 49.4% identity (77.7% similar) in 543 aa overlap (37-575:9-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 PRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEEEDLRRRLKYFFMSPCDKFRAKGRKPCKL
.:: ::. ::..:::::.:.::. . : ::
NP_001 MAHRDSEMKEECLREDLKFYFMSPCEKYRARRQIPWKL
10 20 30
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pF1KE4 MLQVVKILVVTVQLILFGLSNQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGADDTFA--AYTREQ
::..::..::.::. :::::::.:.:.:.::.::.:::: ::: .: .. .::.:.
NP_001 GLQILKIVMVTTQLVRFGLSNQLVVAFKEDNTVAFKHLFLKGYSGTDEDDYSCSVYTQED
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pF1KE4 LYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPANDTFDI
:..:: :..:: : :..:: .: :. : :: .:...:..: . :.:.:..:
NP_001 AYESIFFAINQYHQLKDITLGTLGY----GENEDNRIGLKVCKQHYKKGTMFPSNETLNI
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPMVVTDCIQVDPPERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRLKTINLQS
: : ::.:.: . ::. ..:: .. :.:..:..: : :.:: :.::.
NP_001 DNDVELDCVQLDLQDLSKKPPD-----WKNSSFFR---LEFYRLLQVEISFHLKGIDLQT
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pF1KE4 LINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECKHPSVF--QHGDNSFRLLFD
. . :.::::.:. : ::::::::.: : ....:.:.::: ..: . . .. :.::
NP_001 IHSRELPDCYVFQNTIIFDNKAHSGKIKIYFDSDAKIEECKDLNIFGSTQKNAQYVLVFD
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 VVVILTCSLSFLLCARSLLRGFLLQNEFVGFMWRQRGRVISLWERLEFVNGWYILLVTSD
. ::. : :..::.::.. .. :...:..:. .. : . .. ::.::::.:.. ::
NP_001 AFVIVICLASLILCTRSIVLALRLRKRFLNFFLEKYKRPVCDTDQWEFINGWYVLVIISD
270 280 290 300 310 320
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pF1KE4 VLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILIATLRVAL
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NP_001 LMTIIGSILKMEIKAKNLTNYDLCSIFLGTSTLLVWVGVIRYLGYFQAYNVLILTMQASL
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pF1KE4 PSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFVTFAAMQA
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NP_001 PKVLRFCACAGMIYLGYTFCGWIVLGPYHDKFENLNTVAECLFSLVNGDDMFATFA--QI
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pF1KE4 QQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEESELQAYIA
:: .: ::::::.:::::::::::::.::::::::: .:::::. : :..:: ..
NP_001 QQ-KSILVWLFSRLYLYSFISLFIYMILSLFIALITDSYDTIKKFQQNGFPETDLQEFLK
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pF1KE4 QCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
.:. .. .... :.. : .:: : :..:
NP_001 ECS---SKEEYQKESSAFLSCICCRRRKRSDDHLIPIS
510 520 530
>>XP_005270776 (OMIM: 607399) PREDICTED: mucolipin-2 iso (538 aa)
initn: 1666 init1: 758 opt: 1673 Z-score: 1689.8 bits: 322.5 E(85289): 2.2e-87
Smith-Waterman score: 1771; 49.4% identity (77.7% similar) in 543 aa overlap (37-575:9-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 PRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEEEDLRRRLKYFFMSPCDKFRAKGRKPCKL
.:: ::. ::..:::::.:.::. . : ::
XP_005 MAHRDSEMKEECLREDLKFYFMSPCEKYRARRQIPWKL
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pF1KE4 MLQVVKILVVTVQLILFGLSNQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGADDTFA--AYTREQ
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XP_005 GLQILKIVMVTTQLVRFGLSNQLVVAFKEDNTVAFKHLFLKGYSGTDEDDYSCSVYTQED
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pF1KE4 LYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPANDTFDI
:..:: :..:: : :..:: .: :. : :: .:...:..: . :.:.:..:
XP_005 AYESIFFAINQYHQLKDITLGTLGY----GENEDNRIGLKVCKQHYKKGTMFPSNETLNI
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190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DPMVVTDCIQVDPPERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRLKTINLQS
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XP_005 DNDVELDCVQLDLQDLSKKPPD-----WKNSSFFR---LEFYRLLQVEISFHLKGIDLQT
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250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECKHPSVF--QHGDNSFRLLFD
. . :.::::.:. : ::::::::.: : ....:.:.::: ..: . . .. :.::
XP_005 IHSRELPDCYVFQNTIIFDNKAHSGKIKIYFDSDAKIEECKDLNIFGSTQKNAQYVLVFD
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VVVILTCSLSFLLCARSLLRGFLLQNEFVGFMWRQRGRVISLWERLEFVNGWYILLVTSD
. ::. : :..::.::.. .. :...:..:. .. : . .. ::.::::.:.. ::
XP_005 AFVIVICLASLILCTRSIVLALRLRKRFLNFFLEKYKRPVCDTDQWEFINGWYVLVIISD
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILIATLRVAL
..:: :.:.:. :.::::..::.:::.:::::::::::::::: .:. ::.:: :....:
XP_005 LMTIIGSILKMEIKAKNLTNYDLCSIFLGTSTLLVWVGVIRYLGYFQAYNVLILTMQASL
330 340 350 360 370 380
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pF1KE4 PSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFVTFAAMQA
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XP_005 PKVLRFCACAGMIYLGYTFCGWIVLGPYHDKFENLNTVAECLFSLVNGDDMFATFA--QI
390 400 410 420 430 440
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pF1KE4 QQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEESELQAYIA
:: .: ::::::.:::::::::::::.::::::::: .:::::. : :..:: ..
XP_005 QQ-KSILVWLFSRLYLYSFISLFIYMILSLFIALITDSYDTIKKFQQNGFPETDLQEFLK
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pF1KE4 QCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
.:. .. .... :.. : .:: : :..:
XP_005 ECS---SKEEYQKESSAFLSCICCRRRKRSDDHLIPIS
510 520 530
>>NP_694991 (OMIM: 607399) mucolipin-2 isoform 1 [Homo s (566 aa)
initn: 1752 init1: 758 opt: 1673 Z-score: 1689.5 bits: 322.5 E(85289): 2.3e-87
Smith-Waterman score: 1771; 49.4% identity (77.7% similar) in 543 aa overlap (37-575:37-561)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 PRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEEEDLRRRLKYFFMSPCDKFRAKGRKPCKL
.:: ::. ::..:::::.:.::. . : ::
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pF1KE4 MLQVVKILVVTVQLILFGLSNQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGADDTFA--AYTREQ
::..::..::.::. :::::::.:.:.:.::.::.:::: ::: .: .. .::.:.
NP_694 GLQILKIVMVTTQLVRFGLSNQLVVAFKEDNTVAFKHLFLKGYSGTDEDDYSCSVYTQED
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pF1KE4 LYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPANDTFDI
:..:: :..:: : :..:: .: :. : :: .:...:..: . :.:.:..:
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pF1KE4 DPMVVTDCIQVDPPERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRLKTINLQS
: : ::.:.: . ::. ..:: .. :.:..:..: : :.:: :.::.
NP_694 DNDVELDCVQLDLQDLSKKPPD-----WKNSSFFR---LEFYRLLQVEISFHLKGIDLQT
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pF1KE4 LINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECKHPSVF--QHGDNSFRLLFD
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NP_694 IHSRELPDCYVFQNTIIFDNKAHSGKIKIYFDSDAKIEECKDLNIFGSTQKNAQYVLVFD
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. ::. : :..::.::.. .. :...:..:. .. : . .. ::.::::.:.. ::
NP_694 AFVIVICLASLILCTRSIVLALRLRKRFLNFFLEKYKRPVCDTDQWEFINGWYVLVIISD
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pF1KE4 VLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILIATLRVAL
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NP_694 LMTIIGSILKMEIKAKNLTNYDLCSIFLGTSTLLVWVGVIRYLGYFQAYNVLILTMQASL
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pF1KE4 PSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFVTFAAMQA
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NP_694 PKVLRFCACAGMIYLGYTFCGWIVLGPYHDKFENLNTVAECLFSLVNGDDMFATFA--QI
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pF1KE4 QQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEESELQAYIA
:: .: ::::::.:::::::::::::.::::::::: .:::::. : :..:: ..
NP_694 QQ-KSILVWLFSRLYLYSFISLFIYMILSLFIALITDSYDTIKKFQQNGFPETDLQEFLK
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pF1KE4 QCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
.:. .. .... :.. : .:: : :..:
NP_694 ECS---SKEEYQKESSAFLSCICCRRRKRSDDHLIPIS
540 550 560
>>NP_001240622 (OMIM: 607400) mucolipin-3 isoform 2 [Hom (497 aa)
initn: 1818 init1: 887 opt: 1619 Z-score: 1635.8 bits: 312.4 E(85289): 2.2e-84
Smith-Waterman score: 1723; 50.9% identity (71.7% similar) in 544 aa overlap (34-569:27-497)
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.: :: :: .::.::.:::.::.:: :.
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:::: :: .:..:: .::.:
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:: : .::.: .:: : :. :..:.::..:.::.. :.:
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::::::: . :.:. :.: : . : . : :::: ::.:..: ..:.:
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pF1KE4 KTINLQSLINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECK--HPSVFQHGDN
:.::::.. ..:.:::: :.. :::::::::::: :::... :.::: : : . ..
NP_001 KAINLQTVRHQELPDCYDFTLTITFDNKAHSGRIKISLDNDISIRECKDWHVSGSIQKNT
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. ..::. ::::: .:..:: ::..::. ::.:::.:. . . .:. ...:::::::
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pF1KE4 ILLVTSDVLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILI
:... ::.::: :.:.:. :.::.:.:::::::::::::.:::.:::::: :: .::.::
NP_001 IMIIISDILTIIGSILKMEIQAKSLTSYDVCSILLGTSTMLVWLGVIRYLGFFAKYNLLI
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pF1KE4 ATLRVALPSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFV
::..:::.:.:::::.:.::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::.
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pF1KE4 TFAAMQAQQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEES
::: :: .: ::::::..::::::::::::.::::::::: .:.:::. : :.
NP_001 TFAKMQQ---KSYLVWLFSRIYLYSFISLFIYMILSLFIALITDTYETIKQYQQDGFPET
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pF1KE4 ELQAYIAQCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
::...:..:.: :.:::.: . ::.::: .
NP_001 ELRTFISECKDLPNSGKYRLEDDPPVSLFCCCKK
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>>XP_011540042 (OMIM: 607400) PREDICTED: mucolipin-3 iso (521 aa)
initn: 1818 init1: 887 opt: 1619 Z-score: 1635.5 bits: 312.4 E(85289): 2.3e-84
Smith-Waterman score: 1723; 50.9% identity (71.7% similar) in 544 aa overlap (34-569:51-521)
10 20 30 40 50
pF1KE4 PAGPRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEE---ED-LRRRLKYFFMSPCDKFRAK
.: :: :: .::.::.:::.::.:: :.
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:::: :: .:..:: .::.:
XP_011 GRKPWKLAIQILKIAMVTIQ----------------------------------------
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pF1KE4 YTREQLYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPAN
:: : .::.: .:: : :. :..:.::..:.::.. :.:
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pF1KE4 DTFDIDPMVVTDCIQVDP--PERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRL
::::::: . :.:. :.: : . : . : :::: ::.:..: ..:.:
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pF1KE4 KTINLQSLINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECK--HPSVFQHGDN
:.::::.. ..:.:::: :.. :::::::::::: :::... :.::: : : . ..
XP_011 KAINLQTVRHQELPDCYDFTLTITFDNKAHSGRIKISLDNDISIRECKDWHVSGSIQKNT
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pF1KE4 SFRLLFDVVVILTCSLSFLLCARSLLRGFLLQNEFVGFMWRQRGRVISLWERLEFVNGWY
. ..::. ::::: .:..:: ::..::. ::.:::.:. . . .:. ...:::::::
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pF1KE4 ILLVTSDVLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILI
:... ::.::: :.:.:. :.::.:.:::::::::::::.:::.:::::: :: .::.::
XP_011 IMIIISDILTIIGSILKMEIQAKSLTSYDVCSILLGTSTMLVWLGVIRYLGFFAKYNLLI
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pF1KE4 ATLRVALPSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFV
::..:::.:.:::::.:.::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::.
XP_011 LTLQAALPNVIRFCCCAAMIYLGYCFCGWIVLGPYHDKFRSLNMVSECLFSLINGDDMFA
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pF1KE4 TFAAMQAQQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEES
::: :: .: ::::::..::::::::::::.::::::::: .:.:::. : :.
XP_011 TFAKMQQ---KSYLVWLFSRIYLYSFISLFIYMILSLFIALITDTYETIKQYQQDGFPET
440 450 460 470 480
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pF1KE4 ELQAYIAQCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
::...:..:.: :.:::.: . ::.::: .
XP_011 ELRTFISECKDLPNSGKYRLEDDPPVSLFCCCKK
490 500 510 520
>>XP_005271060 (OMIM: 607400) PREDICTED: mucolipin-3 iso (553 aa)
initn: 2111 init1: 887 opt: 1619 Z-score: 1635.1 bits: 312.4 E(85289): 2.4e-84
Smith-Waterman score: 2077; 57.2% identity (80.7% similar) in 544 aa overlap (34-569:27-553)
10 20 30 40 50
pF1KE4 PAGPRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEE---ED-LRRRLKYFFMSPCDKFRAK
.: :: :: .::.::.:::.::.:: :.
XP_005 MADPEVVVSSCSSHEEENRCNFNQQTSPSEELLLEDQMRRKLKFFFMNPCEKFWAR
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:::: :: .:..:: .::.::.:::::::..:.:.:::::::.:::: :: : :::.:.
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pF1KE4 YTREQLYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPAN
::. ..:. .. ::.::: : .::.: .:: : :. :..:.::..:.::.. :.:
XP_005 YTQSDVYDQLIFAVNQYLQLYNVSVGNHAYENKG----TKQSAMAICQHFYKRGNIYPGN
120 130 140 150 160 170
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pF1KE4 DTFDIDPMVVTDCIQVDP--PERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRL
::::::: . :.:. :.: : . : . : :::: ::.:..: ..:.:
XP_005 DTFDIDPEIETECFFVEPDEPFHIGTPAENKL----------NLTLDFHRLLTVELQFKL
180 190 200 210 220
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pF1KE4 KTINLQSLINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECK--HPSVFQHGDN
:.::::.. ..:.:::: :.. :::::::::::: :::... :.::: : : . ..
XP_005 KAINLQTVRHQELPDCYDFTLTITFDNKAHSGRIKISLDNDISIRECKDWHVSGSIQKNT
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. ..::. ::::: .:..:: ::..::. ::.:::.:. . . .:. ...:::::::
XP_005 HYMMIFDAFVILTCLVSLILCIRSVIRGLQLQQEFVNFFLLHYKKEVSVSDQMEFVNGWY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ILLVTSDVLTISGTIMKIGIEAKNLASYDVCSILLGTSTLLVWVGVIRYLTFFHNYNILI
:... ::.::: :.:.:. :.::.:.:::::::::::::.:::.:::::: :: .::.::
XP_005 IMIIISDILTIIGSILKMEIQAKSLTSYDVCSILLGTSTMLVWLGVIRYLGFFAKYNLLI
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pF1KE4 ATLRVALPSVMRFCCCVAVIYLGYCFCGWIVLGPYHVKFRSLSMVSECLFSLINGDDMFV
::..:::.:.:::::.:.::::::::::::::::: :::::.::::::::::::::::.
XP_005 LTLQAALPNVIRFCCCAAMIYLGYCFCGWIVLGPYHDKFRSLNMVSECLFSLINGDDMFA
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pF1KE4 TFAAMQAQQGRSSLVWLFSQLYLYSFISLFIYMVLSLFIALITGAYDTIKHPGGAGAEES
::: :: .: ::::::..::::::::::::.::::::::: .:.:::. : :.
XP_005 TFAKMQQ---KSYLVWLFSRIYLYSFISLFIYMILSLFIALITDTYETIKQYQQDGFPET
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pF1KE4 ELQAYIAQCQDSPTSGKFRRGSGSACSLLCCCGRDPSEEHSLLVN
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XP_005 ELRTFISECKDLPNSGKYRLEDDPPVSLFCCCKK
520 530 540 550
>>NP_060768 (OMIM: 607400) mucolipin-3 isoform 1 [Homo s (553 aa)
initn: 2111 init1: 887 opt: 1619 Z-score: 1635.1 bits: 312.4 E(85289): 2.4e-84
Smith-Waterman score: 2077; 57.2% identity (80.7% similar) in 544 aa overlap (34-569:27-553)
10 20 30 40 50
pF1KE4 PAGPRGSETERLLTPNPGYGTQAGPSPAPPTPPEE---ED-LRRRLKYFFMSPCDKFRAK
.: :: :: .::.::.:::.::.:: :.
NP_060 MADPEVVVSSCSSHEEENRCNFNQQTSPSEELLLEDQMRRKLKFFFMNPCEKFWAR
10 20 30 40 50
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pF1KE4 GRKPCKLMLQVVKILVVTVQLILFGLSNQLAVTFREENTIAFRHLFLLGYSDGADDTFAA
:::: :: .:..:: .::.::.:::::::..:.:.:::::::.:::: :: : :::.:.
NP_060 GRKPWKLAIQILKIAMVTIQLVLFGLSNQMVVAFKEENTIAFKHLFLKGYMDRMDDTYAV
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pF1KE4 YTREQLYQAIFHAVDQYLALPDVSLGRYAYVRGGGDPWTNGSGLALCQRYYHRGHVDPAN
::. ..:. .. ::.::: : .::.: .:: : :. :..:.::..:.::.. :.:
NP_060 YTQSDVYDQLIFAVNQYLQLYNVSVGNHAYENKG----TKQSAMAICQHFYKRGNIYPGN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DTFDIDPMVVTDCIQVDP--PERPPPPPSDDLTLLESSSSYKNLTLKFHKLVNVTIHFRL
::::::: . :.:. :.: : . : . : :::: ::.:..: ..:.:
NP_060 DTFDIDPEIETECFFVEPDEPFHIGTPAENKL----------NLTLDFHRLLTVELQFKL
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 KTINLQSLINNEIPDCYTFSVLITFDNKAHSGRIPISLETQAHIQECK--HPSVFQHGDN
:.::::.. ..:.:::: :.. :::::::::::: :::... :.::: : : . ..
NP_060 KAINLQTVRHQELPDCYDFTLTITFDNKAHSGRIKISLDNDISIRECKDWHVSGSIQKNT
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 SFRLLFDVVVILTCSLSFLLCARSLLRGFLLQNEFVGFMWRQRGRVISLWERLEFVNGWY
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