Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4496
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4496, 521 aa
1>>>pF1KE4496 521 - 521 aa - 521 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4751+/-0.000883; mu= 17.5000+/- 0.053
mean_var=73.3762+/-14.544, 0's: 0 Z-trim(105.8): 60 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.149726
statistics sampled from 8545 (8605) to 8545 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3191.1 KPNA4 gene_id:3840|Hs108|chr3 ( 521) 3435 751.6 4.9e-217
CCDS9421.1 KPNA3 gene_id:3839|Hs108|chr13 ( 521) 3004 658.5 5.2e-189
CCDS32713.1 KPNA2 gene_id:3838|Hs108|chr17 ( 529) 1725 382.2 7.7e-106
CCDS352.1 KPNA6 gene_id:23633|Hs108|chr1 ( 536) 1597 354.6 1.6e-97
CCDS5111.1 KPNA5 gene_id:3841|Hs108|chr6 ( 539) 1480 329.3 6.7e-90
CCDS47651.1 KPNA7 gene_id:402569|Hs108|chr7 ( 516) 1454 323.7 3.2e-88
CCDS3013.1 KPNA1 gene_id:3836|Hs108|chr3 ( 538) 1419 316.1 6.2e-86
CCDS7140.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 ( 458) 283 70.7 4e-12
CCDS73072.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 ( 484) 283 70.7 4.2e-12
CCDS58071.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 ( 484) 283 70.7 4.2e-12
CCDS7139.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 ( 509) 283 70.7 4.4e-12
>>CCDS3191.1 KPNA4 gene_id:3840|Hs108|chr3 (521 aa)
initn: 3435 init1: 3435 opt: 3435 Z-score: 4010.0 bits: 751.6 E(32554): 4.9e-217
Smith-Waterman score: 3435; 100.0% identity (100.0% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MADNEKLDNQRLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNVPHEDICEDS
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CCDS31 MADNEKLDNQRLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNVPHEDICEDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DIDGDYRVQNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DIDGDYRVQNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLLHSPHQNVCEQAVWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLLHSPHQNVCEQAVWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVMVNLCRHKDPPPPMETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVMVNLCRHKDPPPPMETI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIVPHLVPLLSHQEVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIVPHLVPLLSHQEVKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAYLIQQNVIPPFCNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAYLIQQNVIPPFCNLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIGNLIEECGGLEKIEQLQNHENEDIYKLAYEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIGNLIEECGGLEKIEQLQNHENEDIYKLAYEI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE4 IDQFFSSDDIDEDPSLVPEAIQGGTFGFNSSANVPTEGFQF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IDQFFSSDDIDEDPSLVPEAIQGGTFGFNSSANVPTEGFQF
490 500 510 520
>>CCDS9421.1 KPNA3 gene_id:3839|Hs108|chr13 (521 aa)
initn: 3266 init1: 3004 opt: 3004 Z-score: 3506.9 bits: 658.5 E(32554): 5.2e-189
Smith-Waterman score: 3004; 85.8% identity (96.2% similar) in 521 aa overlap (1-521:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MADNEKLDNQRLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNVPHEDICEDS
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CCDS94 MAENPSLENHRIKSFKNKGRDVETMRRHRNEVTVELRKNKRDEHLLKKRNVPQEESLEDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DIDGDYRVQNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
:.:.:...::..::::.:::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 DVDADFKAQNVTLEAILQNATSDNPVVQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGILPILV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLLHSPHQNVCEQAVWA
.:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS94 KCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSAQTQAVVQSNAVPLFLRLLRSPHQNVCEQAVWA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVMVNLCRHKDPPPPMETI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::.
CCDS94 LGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVIVNLCRNKDPPPPMETV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 QEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIVPHLVPLLSHQEVKV
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CCDS94 QEILPALCVLIYHTDINILVDTVWALSYLTDGGNEQIQMVIDSGVVPFLVPLLSHQEVKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
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CCDS94 QTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPKEKINKEAVWFLSNITAGNQQQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAYLIQQNVIPPFCNLL
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CCDS94 VQAVIDAGLIPMIIHQLAKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVEYLVQQNVIPPFCNLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIGNLIEECGGLEKIEQLQNHENEDIYKLAYEI
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CCDS94 SVKDSQVVQVVLDGLKNILIMAGDEASTIAEIIEECGGLEKIEVLQQHENEDIYKLAFEI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE4 IDQFFSSDDIDEDPSLVPEAIQGGTFGFNSSANVPTEGFQF
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CCDS94 IDQYFSGDDIDEDPCLIPEATQGGTYNFDPTANLQTKEFNF
490 500 510 520
>>CCDS32713.1 KPNA2 gene_id:3838|Hs108|chr17 (529 aa)
initn: 1702 init1: 885 opt: 1725 Z-score: 2013.6 bits: 382.2 E(32554): 7.7e-106
Smith-Waterman score: 1726; 51.1% identity (78.8% similar) in 524 aa overlap (1-512:1-523)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MADNEKLDNQ--RLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNV---PHED
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CCDS32 MSTNENANTPAARLHRFKNKGKDSTEMRRRRIEVNVELRKAKKDDQMLKRRNVSSFPDDA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ICEDSDIDGDYRVQNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPIDDLIKSGI
.. .. . : :.. ::.. .:.: ::.:.:::::::: ...::::..:..:.
CCDS32 TSPLQENRNNQGTVNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LPILVHCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLLHSPHQNVCE
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CCDS32 IPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLLASPHAHISE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 QAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFIS-P---SIPITFLRNVTWVMVNLCRHK
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CCDS32 QAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DPPPPMETIQEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIVPHLVP
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CCDS32 NPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADTCWAISYLTDGPNERIGMVVKTGVVPQLVK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEAVWFLS
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CCDS32 LLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NITAGNQQQVQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAYLIQQN
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CCDS32 NITAGRQDQIQQVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTVEQIVYLVHCG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KE4 VIPPFCNLLTVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAED--EAETIGNLIEECGGLEKIEQLQNHE
.: :. ::::.::.... :.::..:::.. :: :.: .. .:::::::.::: :::::
CCDS32 IIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSIMIEECGGLDKIEALQNHE
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 NEDIYKLAYEIIDQFFSSDDIDEDPSLVPEAI-QGGTFGFNSSANVPTEGFQF
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CCDS32 NESVYKASLSLIEKYFSVEE-EEDQNVVPETTSEGYTFQVQDGAPGTFNF
490 500 510 520
>>CCDS352.1 KPNA6 gene_id:23633|Hs108|chr1 (536 aa)
initn: 1581 init1: 1221 opt: 1597 Z-score: 1864.1 bits: 354.6 E(32554): 1.6e-97
Smith-Waterman score: 1597; 48.4% identity (77.4% similar) in 539 aa overlap (1-521:4-536)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MADNEKLDNQRLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNVPHEDIC
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CCDS35 METMASPGK-DNYRMKSYKNNALNPEEMRRRREEEGIQLRKQKREQQLFKRRNV--ELIN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE4 EDSDI-DG---DYRVQNTSLEAI-----VQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPID
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CCDS35 EEAAMFDSLLMDSYVSSTTGESVITREMVEMLFSDDSDLQLATTQKFRKLLSKEPSPPID
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 DLIKSG-ILPILVHCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLLH
..:.. .. .:. :.:..: .:::::::::::::::::.::. :....:::.:..::.
CCDS35 EVINTPRVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWALTNIASGTSQQTKIVIEAGAVPIFIELLN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 SPHQNVCEQAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVMVNL
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CCDS35 SDFEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNCSILNPLLTLLTKSTRLTMTRNAVWALSNL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 CRHKDPPPPMETIQEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIVP
:: :.::: . .. ::.: :. .: ..:.:. ::::::.:. ::.:: :::::.
CCDS35 CRGKNPPPEFAKVSPCLPVLSRLLFSSDSDLLADACWALSYLSDGPNEKIQAVIDSGVCR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 HLVPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEAV
.:: :: :.. :: . ::::::::::: : ::::.:::.:: . ::. :::.: :::
CCDS35 RLVELLMHNDYKVASPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEAC
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 WFLSNITAGNQQQVQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAYL
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CCDS35 WTISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRYL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 IQQNVIPPFCNLLTVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIGN-------LIEECGGLE
.. . : :.:.:::: :...:::.:.:: :::...:.:.. :. :::: ::.
CCDS35 VSLGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEGKRSGSGVNPYCGLIEEAYGLD
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE4 KIEQLQNHENEDIYKLAYEIIDQFFSSDDIDEDPSLVPEAIQGGT-FGFNSSANVPTEGF
::: ::.:::..::. :...:...:. . :.: ::.:.. . : :.. ..: :::
CCDS35 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVE--DDDSSLAPQVDETQQQFIFQQP-EAPMEGF
480 490 500 510 520 530
520
pF1KE4 QF
:.
CCDS35 QL
>>CCDS5111.1 KPNA5 gene_id:3841|Hs108|chr6 (539 aa)
initn: 1557 init1: 1186 opt: 1480 Z-score: 1727.5 bits: 329.3 E(32554): 6.7e-90
Smith-Waterman score: 1598; 48.1% identity (75.9% similar) in 540 aa overlap (1-521:4-539)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MADNEKLDNQRLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNV--PHED
::. : :: :.:..:::. . . :::.:.: ..:::.::.:.:.::::: :..:
CCDS51 MDAMASPGK-DNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRND
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE4 IC------EDSDIDGDYRV--QNTSLEAIVQNASSDNQGIQLSAVQAARKLLSSDRNPPI
.: ::.. . ... .:: :.: ::.:.: :::::.. ::::
CCDS51 ESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNPPI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 DDLI-KSGILPILVHCLERDDNPSLQFEAAWALTNIASGTSEQTQAVVQSNAVPLFLRLL
:..: : :.. .:. :::..: .:::::::::::::::: .:..:....:::.:..::
CCDS51 DQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIKLL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 HSPHQNVCEQAVWALGNIIGDGPQCRDYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLRNVTWVMVN
.: :..: :::::::::: ::. .:::.:.. .. ::: ... : .: ::..:.. :
CCDS51 NSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWALSN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LCRHKDPPPPMETIQEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNEQIQMVIDSGIV
::: :.::: . .. : .: :. .: ..:.:. ::::::.:. :..:: :::::.
CCDS51 LCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 PHLVPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPKEKINKEA
.:: :: :.. :: . ::::::::::: : ::::.:::.:: . ::. :::.: :::
CCDS51 RRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 VWFLSNITAGNQQQVQAVIDANLVPMIIHLLDKGDFGTQKEAAWAISNLTISGRKDQVAY
: .:::::::. :.:::::::. :..:..:.:..: :.:::::::.: : .: .:. :
CCDS51 CWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIRY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE4 LIQQNVIPPFCNLLTVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIG-------NLIEECGGL
:. . : :.:.:::: :...:::.:.:: :::...:.:.. : :::: ::
CCDS51 LVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAYGL
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 EKIEQLQNHENEDIYKLAYEIIDQFFSSDDIDEDPSLVPEAIQGGT-FGFNSSANVPTEG
.::: ::.:::..::. :...:...:. . ..:::.::.. .. : :... ..: .:
CCDS51 DKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVE--EDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQ-EAPMDG
480 490 500 510 520 530
520
pF1KE4 FQF
::.
CCDS51 FQL
>>CCDS47651.1 KPNA7 gene_id:402569|Hs108|chr7 (516 aa)
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10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
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CCDS47 PSEKTAKGVAVSLTLGEIIKGVNSSDPVLCFQATQTARKMLSQEKNPPLKLVIEAGLIPR
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CCDS47 MVEFLKSSLYPCLQFEAAWALTNIASGTSEQTRAVVEGGAIQPLIELLSSSNVAVCEQAV
120 130 140 150 160 170
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CCDS47 WALGNIAGDGPEFRDNVITSNAIPHLLALISPTLPITFLRNITWTLSNLCRNKNPYPCDT
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....::::: :..: : ..: :. ::::::::..:..: .:...:..:.:: :.. .:.
CCDS47 AVKQILPALLHLLQHQDSEVLSDACWALSYLTDGSNKRIGQVVNTGVLPRLVVLMTSSEL
240 250 260 270 280 290
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CCDS47 NVLTPSLRTVGNIVTGTDEQTQMAIDAGMLNVLPQLLQHNKPSIQKEAAWALSNVAAGPC
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...: .. ...: .. :: .:.: .::::.: ..:.. .. ::. :....:. :. :
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CCDS47 LLTAPDVKIVLIILDVISCILQAAEKRSEKENLCLLIEELGGIDRIEALQLHENRQIGQS
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CCDS47 ALNIIEKHFGEEE-DESQTLLSQVIDQDYEFIDYECLAKK
480 490 500 510
>>CCDS3013.1 KPNA1 gene_id:3836|Hs108|chr3 (538 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE4 MADNEKLDNQRLKNFKNKGRDLETMRRQRNEVVVELRKNKRDEHLLKRRNVP--HEDICE
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CCDS30 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEE
10 20 30 40 50
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CCDS30 EVMSDGGFHEAQISNMEMAPGGVITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPID
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CCDS30 EVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLS
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170 180 190 200 210 220
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CCDS30 SEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNL
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230 240 250 260 270 280
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CCDS30 CRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCR
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CCDS30 RLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEAC
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350 360 370 380 390 400
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CCDS30 WTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 IQQNVIPPFCNLLTVKDAQVVQVVLDGLSNILKMAEDEAETIGN-------LIEECGGLE
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CCDS30 VELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLD
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CCDS30 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTE--DEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQC-EAPMEGF
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520
pF1KE4 QF
:.
CCDS30 QL
>>CCDS7140.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 (458 aa)
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40 50 60 70 80 90
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CCDS71 LLDVVPTIQQTAALALGRLANYNDDLAEAVVKCDILPQLVYSLAEQNRFYKKAAAFVLRA
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CCDS71 V--GKHSPQLAQAIVDCGALDTLVICLE-DFDPGVKEAAAWALRYIARHNAELSQAVVDA
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CCDS71 GAVPLLVLCIQEPEIALKRIAASALSDIAKHSPELAQTVVDAGAVAHLAQMILNPDAKLK
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 FLRNVTWVMVNLCRHKDPPPPMETIQEILPALCVLIHHTDVNILVDTVWALSYLTDAGNE
... .. .. .:. : . ::.:.. . .. : . .. . .. :
CCDS71 --HQILSALSQVSKHSVDLAEMVVEAEIFPVVLTCLKDKDEYVKKNASTLIREIAKHTPE
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 QIQMVIDSGIVPHLVPLLSHQEVKVQTAALRAVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALL
:.:...: : .. .. . ... .. .: ... ... ...:. .. .. . :
CCDS71 LSQLVVNAGGVAAVIDCIGSCKGNTRLPGIMMLGYVAAHSENLAMAVIISKGVPQLSVCL
290 300 310 320 330 340
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CCDS71 SEEPEDHIKAAAAWALGQIGRHTPEHARAVAVTNTLPVLLSLYMSTESSEDLQVKSKKAI
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.:.
CCDS71 KNILQKCTYLPALEPFLYDAPPNILKHVVGQFSKVLFPWIFRYTSAEGGQLSTT
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>>CCDS73072.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 (484 aa)
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CCDS73 LLDVVPTIQQTAALALGRLANYNDDLAEAVVKCDILPQLVYSLAEQNRFYKKAAAFVLRA
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CCDS73 V--GKHSPQLAQAIVDCGALDTLVICLE-DFDPGVKEAAAWALRYIARHNAELSQAVVDA
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CCDS73 GAVPLLVLCIQEPEIALKRIAASALSDIAKHSPELAQTVVDAGAVAHLAQMILNPDAKLK
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CCDS73 --HQILSALSQVSKHSVDLAEMVVEAEIFPVVLTCLKDKDEYVKKNASTLIREIAKHTPE
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CCDS73 LSQLVVNAGGVAAVIDCIGSCKGNTRLPGIMMLGYVAAHSENLAMAVIISKGVPQLSVCL
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CCDS73 SEEPEDHIKAAAAWALGQIGRHTPEHARAVAVTNTLPVLLSLY----MSTESSE-----D
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pF1KE4 ECGGLEKIEQ--------LQNHENEDIYKLAYEIIDQFFSSDDIDEDPSLVPEAIQGGTF
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CCDS73 TSGGLKKVQEIKAEPGSLLQEYINSINSCYPEEIVSKFFPELQVCALFRKFMRTP
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pF1KE4 GFNSSANVPTEGFQF
>>CCDS58071.1 SPAG6 gene_id:9576|Hs108|chr10 (484 aa)
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CCDS58 LLDVVPTIQQTAALALGRLANYNDDLAEAVVKCDILPQLVYSLAEQNRFYKKAAAFVLRA
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CCDS58 V--GKHSPQLAQAIVDCGALDTLVICLE-DFDPGVKEAAAWALRYIARHNAELSQAVVDA
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CCDS58 --HQILSALSQVSKHSVDLAEMVVEAEIFPVVLTCLKDKDEYVKKNASTLIREIAKHTPE
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CCDS58 LSQLVVNAGGVAAVIDCIGSCKGNTRLPGIMMLGYVAAHSENLAMAVIISKGVPQLSVCL
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CCDS58 SEEPEDHIKAAAAWALGQIGRHTPEHARAVAVTNTLPVLLSLY----MSTESSE-----D
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CCDS58 LQVKSKKAIKNILQKCTYLPALEPFLYDAPPNILKHVVGQFSKVLPH-DSKAR---RLFV
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CCDS58 TSGGLKKVQEIKAEPGSLLQEYINSINSCYPEEIVRYYSPGYSDTLLQRVDSYQPLNN
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521 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:44:34 2016 done: Sun Nov 6 00:44:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]