FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4484, 500 aa
1>>>pF1KE4484 500 - 500 aa - 500 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8104+/-0.000809; mu= 21.6658+/- 0.049
mean_var=73.2813+/-15.267, 0's: 0 Z-trim(107.8): 38 B-trim: 516 in 1/53
Lambda= 0.149823
statistics sampled from 9763 (9797) to 9763 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 3.280
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 ( 504) 809 184.2 2.9e-46
CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs108|chr17 ( 505) 578 134.3 3.1e-31
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CCDS11675.1 SLC16A6 gene_id:9120|Hs108|chr17 ( 523) 515 120.7 4e-27
CCDS11086.1 SLC16A11 gene_id:162515|Hs108|chr17 ( 471) 504 118.3 1.9e-26
CCDS2473.1 SLC16A14 gene_id:151473|Hs108|chr2 ( 510) 424 101.0 3.3e-21
CCDS7256.1 SLC16A9 gene_id:220963|Hs108|chr10 ( 509) 393 94.3 3.4e-19
CCDS823.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 487) 385 92.6 1.1e-18
CCDS5089.1 SLC16A10 gene_id:117247|Hs108|chr6 ( 515) 361 87.4 4.1e-17
CCDS14426.2 SLC16A2 gene_id:6567|Hs108|chrX ( 539) 327 80.1 6.9e-15
CCDS55624.1 SLC16A4 gene_id:9122|Hs108|chr1 ( 319) 322 78.8 1e-14
>>CCDS858.1 SLC16A1 gene_id:6566|Hs108|chr1 (500 aa)
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Smith-Waterman score: 3358; 100.0% identity (100.0% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-500)
10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVCIGVIG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 GLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWRGSFLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRHPKQ
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 EKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEKSAF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTYVGFCVYA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGDYK
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CCDS85 GFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGDYK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 YTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPNEVTKA
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CCDS85 YTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPNEVTKA
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE4 AESPDQKDTDGGPKEEESPV
::::::::::::::::::::
CCDS85 AESPDQKDTDGGPKEEESPV
490 500
>>CCDS8961.1 SLC16A7 gene_id:9194|Hs108|chr12 (478 aa)
initn: 1907 init1: 1002 opt: 1012 Z-score: 1181.6 bits: 228.1 E(32554): 1.7e-59
Smith-Waterman score: 1931; 61.3% identity (83.2% similar) in 465 aa overlap (1-465:1-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPPAVGGPVGYTPPDGGWGWAVVIGAFISIGFSYAFPKSITVFFKEIEGIFHATTSEVSW
::: ..: . :::::::: :: .:::::::::::::..:::::::. :::.: ::..:
CCDS89 MPPMPSAPPVHPPPDGGWGWIVVGAAFISIGFSYAFPKAVTVFFKEIQQIFHTTYSEIAW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVCIGVIG
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CCDS89 ISSIMLAVMYAGGPVSSVLVNKYGSRPVVIAGGLLCCLGMVLASFSSSVVQLYLTMGFIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWRGSFLI
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CCDS89 GLGLAFNLQPALTIIGKYFYRKRPMANGLAMAGSPVFLSSLAPFNQYLFNTFGWKGSFLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRHPKQ
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CCDS89 LGSLLLNACVAGSLMRPLGPNQTTS---KSK------NKTGKTED--DSSPKKI-----K
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEKSAF
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CCDS89 TKKSTWEKVNKYLDFSLFKHRGFLIYLSGNVIMFLGFFAPIIFLAPYAKDQGIDEYSAAF
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTYVGFCVYA
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CCDS89 LLSVMAFVDMFARPSVGLIANSKYIRPRIQYFFSFAIMFNGVCHLLCPLAQDYTSLVLYA
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 GFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGDYK
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CCDS89 VFFGLGFGSVSSVLFETLMDLVGAPRFSSAVGLVTIVECGPVLLGPPLAGKLVDLTGEYK
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 YTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPNEVTKA
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CCDS89 YMYMSCGAIVVAASVWLLIGNAINYRLLAKERKEENARQKTRESEPLSKSKHSEDVNVKV
410 420 430 440 450 460
490 500
pF1KE4 AESPDQKDTDGGPKEEESPV
CCDS89 SNAQSVTSERETNI
470
>>CCDS11804.1 SLC16A3 gene_id:9123|Hs108|chr17 (465 aa)
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Smith-Waterman score: 1280; 43.8% identity (67.8% similar) in 459 aa overlap (7-465:9-427)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPPAVGGPVGYTPPDGGWGWAVVIGAFISIGFSYAFPKSITVFFKEIEGIFHATTSEV
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CCDS11 MGGAVVDEGPTGVKAPDGGWGWAVLFGCFVITGFSYAFPKAVSVFFKELIQEFGIGYSDT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 SWISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVCIGV
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CCDS11 AWISSILLAMLYGTGPLCSVCVNRFGCRPVMLVGGLFASLGMVAASFCRSIIQVYLTTGV
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120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IGGLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWRGSF
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CCDS11 ITGLGLALNFQPSLIMLNRYFSKRRPMANGLAAAGSPVFLCALSPLGQLLQDRYGWRGGF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LILGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRHP
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CCDS11 LILGGLLLNCCVCAALMRPL------------------------------VVTAQPGSGP
190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 KQEKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEKS
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CCDS11 PRPSR-------RLLDLSVFRDRGFVLYAVAASVMVLGLFVPPVFVVSYAKDLGVPDTKA
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTYVGFCV
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CCDS11 AFLLTILGFIDIFARPAAGFVAGLGKVRPYSVYLFSFSMFFNGLADLAGSTAGDYGGLVV
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 YAGFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGD
. :::...: .... ::.:: .:: ..::::.::: ..: ::.::: :.: :
CCDS11 FCIFFGISYGMVGALQFEVLMAIVGTHKFSSAIGLVLLMEAVAVLVGPPSGGKLLDATHV
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 YKYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPNEVT
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CCDS11 YMYVFILAGAEVLTSSLILLLG---NFFCIRKKPKEPQPEVAAAEEEKLHKPPADSGVDL
390 400 410 420 430 440
480 490 500
pF1KE4 KAAESPDQKDTDGGPKEEESPV
CCDS11 REVEHFLKAEPEKNGEVVHTPETSV
450 460
>>CCDS13966.1 SLC16A8 gene_id:23539|Hs108|chr22 (504 aa)
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Smith-Waterman score: 1250; 41.4% identity (68.5% similar) in 485 aa overlap (6-484:4-473)
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pF1KE4 MPPAVGGPV-GYTPPDGGWGWAVVIGA-FISIGFSYAFPKSITVFFKEIEGIFHATTSEV
::: : :::::::: ::.:: :. ::.:.:::...:::. . : : :..
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pF1KE4 SWISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVCIGV
.:.::::::..:: ::.:::::...: : ::..:: :.. :.: ::: . . .::. ::
CCDS13 AWVSSIMLAMLYGTGPVSSILVTRFGCRPVMLAGGLLASAGMILASFATRLLELYLTAGV
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 IGGLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWRGSF
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CCDS13 LTGLGLALNFQPSLIMLGLYFERRRPLANGLAAAGSPVFLSALSPLGQQLLERFGWRGGF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LILGGLLLNCCVAGALMRPI-GPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRH
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CCDS13 LLLGGLLLHCCACGAVMRPPPGPGP----RPRRDSAGDRAGDAPGEAEADGAGLQLREAS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PKQEKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEK
:. . : ..:::.. : :.: .: . .: .:::.: ..: .:.:. .
CCDS13 PRVRPRR------RLLDLAVCTDRAFAVYAVTKFLMALGLFVPAILLVNYAKDAGVPDTD
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pF1KE4 SAFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTY---V
.::::::..:::.::::. : .:. .::.. :.:. ...:::. . . . .: :
CCDS13 AAFLLSIVGFVDIVARPACGALAGLARLRPHVPYLFSLALLANGLTDLSSARARSYGALV
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 GFCVYAGFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLND
.::: ::...: .... ::.:: :: :: ::.::: .:: ::.::: ::: :
CCDS13 AFCVA---FGLSYGMVGALQFEVLMAAVGAPRFPSALGLVLLVEAAAVLIGPPSAGRLVD
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 MYGDYKYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKP
. .:. .. : . ..:... .. . : :: .. . . . . .. :
CCDS13 VLKNYEIIFYLAGSEVALAGVFMAVATNCCLRC-AKAAPSGPGTEGGASDTEDAEAEGDS
410 420 430 440 450 460
480 490 500
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. . .:: :
CCDS13 EPLPVVAEEPGNLEALEVLSARGEPTEPEIEARPRLAAESV
470 480 490 500
>>CCDS11713.1 SLC16A5 gene_id:9121|Hs108|chr17 (505 aa)
initn: 840 init1: 575 opt: 578 Z-score: 674.3 bits: 134.3 E(32554): 3.1e-31
Smith-Waterman score: 836; 30.4% identity (64.1% similar) in 474 aa overlap (8-476:2-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPPAVGGPVGYTPPDGGWGWAVVIGAFISIGFSYAFPKSITVFFKEIEGIFHATTSEVSW
: . ::.:.:.:....... :.. .:: : .:: :.. :.:..::.::
CCDS11 MPQALERADGSWAWVVLLATMVTQGLTLGFPTCIGIFFTELQWEFQASNSETSW
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVCIGVIG
. ::. ::.. .::. ::::...: :.....:: :.. :..:.:: ....::: : :
CCDS11 FPSILTAVLHMAGPLCSILVGRFGCRVTVMLGGVLASLGMVASSFSHNLSQLYFTAGFIT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 GLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPL-NQVFFGIFGWRGSFL
:::. :... ..:..: :: .:: :::.:: : . . :: :: .. .. .::::.::
CCDS11 GLGMCFSFQSSITVLGFYFVRRRVLANALASMGVSLGI-TLWPLLSRYLLENLGWRGTFL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ILGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRHPK
..::..:.::. ::..::.. . . :. : . . . ::
CCDS11 VFGGIFLHCCICGAIIRPVATSVAPETKECPPPPPETPALGCLAA---------CGR---
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QEKRSVFQTINQFLDLTLFTHR-GFLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEKS
::.. : . .. : :. .:. : . .:. : ::: :. . . ...
CCDS11 --------TIQRHLAFDILRHNTGYCVYILGVMWSVLGFPLPQVFLVPYAMWHSVDEQQA
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTY---VG
:.:.::..: .. :: ::.:. . . .:.:. ... ::. ... : . ::
CCDS11 ALLISIIGFSNIFLRPLAGLMAGRPAFASHRKYLFSLALLLNGLTNLVCAASGDFWVLVG
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 FCVYAGFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDM
.:. .. ... .....:..:::.: ..: :.:: :... :..::: : : :
CCDS11 YCLA---YSVSMSGIGALIFQVLMDIVPMDQFPRALGLFTVLDGLAFLISPPLAGLLLDA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 YGDYKYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPN
....:... . :: .. ::.: : : : ::: . .. :.. ... :.
CCDS11 TNNFSYVFYMSSFFLISAA--LFMG-GSFYALQKKEQGKQAVAADALERDLFLEAKDGPG
400 410 420 430 440
480 490 500
pF1KE4 EVTKAAESPDQKDTDGGPKEEESPV
.
CCDS11 KQRSPEIMCQSSRQPRPAGVNKHLWGCPASSRTSHEWLLWPKAVLQAKQTALGWNSPT
450 460 470 480 490 500
>>CCDS7404.2 SLC16A12 gene_id:387700|Hs108|chr10 (516 aa)
initn: 809 init1: 575 opt: 578 Z-score: 674.2 bits: 134.3 E(32554): 3.1e-31
Smith-Waterman score: 829; 30.2% identity (62.9% similar) in 490 aa overlap (12-499:41-511)
10 20 30 40
pF1KE4 MPPAVGGPVGYTPPDGGWGWAVVIGAFISIGFSYAFPKSIT
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CCDS74 SSKIITWLLEQPGKEEKRKTMAKVNRARSTSPPDGGWGWMIVAGCFLVTICTRAVTRCIS
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 VFFKEIEGIFHATTSEVSWISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLI
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CCDS74 IFFVEFQTYFTQDYAQTAWIHSIVDCVTMLCAPLGSVVSNHLSCQVGIMLGGLLASTGLI
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 AASFCNTVQQLYVCIGVIGGLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTL
.:: .....::. .::. :::.:. .::..:.:::: .:. :: :.::.:: . :
CCDS74 LSSFATSLKHLYLTLGVLTGLGFALCYSPAIAMVGKYFSRRKALAYGIAMSGSGIGTFIL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 APLNQVFFGIFGWRGSFLILGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSG
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CCDS74 APVVQLLIEQFSWRGALLILGGFVLNLCVCGALMRPITLKEDHTTPEQNHVC--RTQKED
200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 VKKDLHDANTDLIGRHPKQEKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPL
.:. . ..: . . .: .:: .. :.. . ..: .: .
CCDS74 IKRV--SPYSSLTKEWAQTCLCCCLQQEYSFLLMS-----DFVVLAVSVLFMAYGCSPLF
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KE4 VFLSSYGKSQHYSSEKSAFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIR--PRIQYFFAASVVA
:.: :. : : ...:::.:::. .:... ..: ... . .. . :.::...
CCDS74 VYLVPYALSVGVSHQQAAFLMSILGVIDIIGNITFGWLTDRRCLKNYQYVCYLFAVGM--
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 NGVCHMLAPLSTTYVGFCVYAGFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVEC
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CCDS74 DGLCYLCLPMLQSLPLLVPFSCTFGYFDGAYVTLIPVVTTEIVGTTSLSSALGVVYFLHA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 CPVLLGPPLLGRLNDMYGDYKYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKK
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CCDS74 VPYLVSPPIAGRLVDTTGSYTAAFLLCGFSMIFSSVLL--GFA---RLIKRMRKTQLQFI
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE4 ESKEEETSIDVAGKPNEVTKAAESPDQKDTDGGPKEEESPV
.:: . .... . . . ..:. ::: : : :
CCDS74 -AKESDPKLQLWTNGSVAYSVARELDQK--HGEPVATAVPGYSLT
480 490 500 510
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10 20 30 40 50 60
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CCDS11 MARRTEPPDGGWGWVVVLSAFFQSALVFGVLRSFGVFFVEFVAAFEEQAARVSW
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CCDS11 IASIGIAVQQFGSPVGSALSTKFGPRPVVMTGGILAALGMLLASFATSLTHLYLSIGLLS
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 GLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWRGSFLI
: : :... :.:. .. :: .:: ::.:::..: . :.::. : ... ..::::.:.
CCDS11 GSGWALTFAPTLACLSCYFSRRRSLATGLALTGVGLSSFTFAPFFQWLLSHYAWRGSLLL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHDANTDLIGRHPKQ
...: :. . :::.:: :. : : . .: :.
CCDS11 VSALSLHLVACGALLRP----PSLA---------EDPAVGG----------------PRA
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250 260 270 280 290
pF1KE4 EKRSVFQTINQFLDLTLFTHRG-FLLYLSGNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEKSA
. :: . :.: :: : . ... : : : . : .. .. .. .:
CCDS11 Q-------------LTSLLHHGPFLRYTVALTLINTGYFIPYLHLVAHLQDLDWDPLPAA
210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 FLLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPRIQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTYVGFCVY
::::..:. :.:.: : .... : : . .. .. .:: : :.. . ... .
CCDS11 FLLSVVAISDLVGRVVSGWLGDAVP-GP-VTRLLMLWTTLTGVSLALFPVAQAPTALVAL
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 AGFFGFAFGWLSSVLFETLMDLVGPQRFSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGDY
: .::. : :. . : .: .:.: .:. ..::. ..: :::::: : : :. :.:
CCDS11 AVAYGFTSGALAPLAFSVLPELIGTRRIYCGLGLLQMIESIGGLLGPPLSGYLRDVTGNY
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 KYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPNEVTK
.. ...: .:. : ::
CCDS11 TASF-------VVAGAFLLSGSGILLTLPHFFCFSTTTSGPQDLVTEALDTKVPLPKEGL
380 390 400 410 420
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Smith-Waterman score: 753; 30.0% identity (64.0% similar) in 486 aa overlap (14-470:19-500)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPPAVGGPVGYTPPDGGWGWAVVIGAFISIGFSYAFPKSITVFFKEIEGIFHATT
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CCDS11 MTQNKLKLCSKANVYTEVPDGGWGWAVAVSFFFVEVFTYGIIKTFGVFFNDLMDSFNESN
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pF1KE4 SEVSWISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLIAASFCNTVQQLYVC
:..::: :: . :. ..:....: :..: :.:...:: : . :..:::: . :...::
CCDS11 SRISWIISICVFVLTFSAPLATVLSNRFGHRLVVMLGGLLVSTGMVAASFSQEVSHMYVA
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pF1KE4 IGVIGGLGLAFNLNPALTMIGKYFYKRRPLANGLAMAGSPVFLCTLAPLNQVFFGIFGWR
::.:.::: :.. :..:....:: ::: .....: .: . ..:: ... .:::
CCDS11 IGIISGLGYCFSFLPTVTILSQYFGKRRSIVTAVASTGECFAVFAFAPAIMALKERIGWR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE4 GSFLILGGLLLNCCVAGALMRPI---GPKPTKA----GKDKSKASLEKAGKSGVKKDLHD
:.:..: : :: . :::.::: :: : .. ... ::. :. .. : :
CCDS11 YSLLFVGLLQLNIVIFGALLRPIFIRGPASPKIVIQENRKEAQYMLENE-KTRTSIDSID
190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KE4 ANTDL------IGRH------PKQEKRSVF--------QTINQFLDLTLFTHRGFLLYLS
....: . : :: . ..:. . .::.... ...:. :
CCDS11 SGVELTTSPKNVPTHTNLELEPKADMQQVLVKTSPRPSEKKAPLLDFSILKEKSFICYAL
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 GNVIMFFGLFAPLVFLSSYGKSQHYSSEKSAFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTKPIRPR
... .:.::: ... : : .....::::: .:.... .: . :.: : .::: .
CCDS11 FGLFATLGFFAPSLYIIPLGISLGIDQDRAAFLLSTMAIAEVFGRIGAGFVLNREPIR-K
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 IQYFFAASVVANGVCHMLAPLSTTYVGFCVYAGFFGFAFGWLSSVLFETLM--DLVGPQR
: :. :. : . ..: . :. . :::: : .... . : :.:: ..
CCDS11 I-YIELICVILLTVSLFAFTFATEFWGLMSCSIFFGFMVGTIGGTHIPLLAEDDVVGIEK
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 FSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGDYKYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYR
.:::.:. ... : :::: : : :. :. ....:.. . .... : . ..
CCDS11 MSSAAGVYIFIQSIAGLAGPPLAGLLVDQSKIYSRAFYSCAAGMALAAVCLALVRPCKMG
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 LLAKEQKANEQKKESKEEETSIDVAGKPNEVTKAAESPDQKDTDGGPKEEESPV
: ......: : :.. .: :.
CCDS11 L-CQHHHSGETKVVSHRGKTLQDIPEDFLEMDLAKNEHRVHVQMEPV
480 490 500 510 520
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10 20 30 40
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CCDS11 MPAPQRKHRRGGFSHRCFPTPQTAMTPQPAGPPDGGWGWVVAAAAFAINGLSYGLLRSLG
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pF1KE4 VFFKEIEGIFHATTSEVSWISSIMLAVMYGGGPISSILVNKYGSRIVMIVGGCLSGCGLI
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CCDS11 LAFPDLAEHFDRSAQDTAWISALALAVQQAASPVGSALSTRWGARPVVMVGGVLASLGFV
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..: . . .::. .:...:.: :. . ::: ...:: .:: :: :::..:. . :
CCDS11 FSAFASDLLHLYLGLGLLAGFGWALVFAPALGTLSRYFSRRRVLAVGLALTGNGASSLLL
130 140 150 160 170 180
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pF1KE4 APLNQVFFGIFGWRGSFLILGGLLLNCCVAGALMRPIGPKPTKAGKDKSKASLEKAGKSG
:: :... :::::..:.::.. :. :::. :.
CCDS11 APALQLLLDTFGWRGALLLLGAITLHLTPCGALLLPL-----------------------
190 200 210
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pF1KE4 VKKDLHDANTDLIGRHPKQEKRSVFQTINQFLDLTLFTHRGFLLYLSGNVIMFFGLFAPL
.. : :: . . : :.:::.:.: .. :.... : :.:
CCDS11 -----------VLPGDPPAPPRSPLAA----LGLSLFTRRAFSIFALGTALVGGGYFVPY
220 230 240 250 260
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pF1KE4 VFLSSYGKSQHYSSEKSAFLLSILAFVDMVARPSMGLVANTK--PIRPRIQYFFAASVVA
: :. .. .. .. .:..... :. : :: : .:. :. ::. :.: .
CCDS11 VHLAPHALDRGLGGYGAALVVAVAAMGDAGARLVCGWLADQGWVPL-PRLLAVFGALTGL
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. :.:. .. : . :. .:.. : . ..: .: ::: .:.:::
CCDS11 GLWVVGLVPVVGGEESWGGPLLAAAVAYGLSAGSYAPLVFGVLPGLVGVGGVVQATGLVM
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pF1KE4 IVECCPVLLGPPLLGRLNDMYGDYKYTYWACGVVLIISGIYLFIGMGINYRLLAKEQKAN
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CCDS11 MLMSLGGLLGPPLSGFLRDETGDFTASFLLSGS-LILSGSFIYIGLPRALPSCGPASPPA
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CCDS11 TPPPETGELLPAPQAVLLSPGGPGSTLDTTC
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10 20 30 40
pF1KE4 MPPAVGGPVGYTPPDGGWGWAVVIGAFISIGFSYAFPKSITVFFKE
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CCDS24 MYTSHEDIGYDFEDGPKDKKTLKPHPNIDGGWAWMMVLSSFFVHILIMGSQMALGVLNVE
10 20 30 40 50 60
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CCDS24 WLEEFHQSRGLTAWVSSLSMGITLIVGPFIGLFINTCGCRQTAIIGGLVNSLGWVLSAYA
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CCDS24 ANVHYLFITFGVAAGLGSGMAYLPAVVMVGRYFQKRRALAQGLSTTGTGFGTFLMTVLLK
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pF1KE4 VFFGIFGWRGSFLILGGLLLNCCVAGALMRPIGP--KPTKAG-KD------KSKASLEKA
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CCDS24 YLCAEYGWRNAMLIQGAVSLNLCVCGALMRPLSPGKNPNDPGEKDVRGLPAHSTESVKST
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pF1KE4 GKSGV--KKD--LHDANT--DLIGRH-PKQ--EKRS-----VFQTINQ--------FLDL
:..: .:: : . .: :: ... : : .... ...:.. : :
CCDS24 GQQGRTEEKDGGLGNEETLCDLQAQECPDQAGHRKNMCALRILKTVSWLTMRVRKGFEDW
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260 270 280 290 300
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.:::.: :. .. .. . .. :.. : . . : ....: : ::.:
CCDS24 YSGYFGTASLFTNRMFVAFIFWALFAYSSFVIPFIHLPEIVNLYNLSEQNDVFPLTSIIA
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CCDS24 IVHIFGKVILGVIADLPCISVWNVFLLANFTLVLSI--FILPLMHTYAGLAVICALIGFS
370 380 390 400 410
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CCDS24 SGYFS-LMPVVTEDLVGIEHLANAYGIIICANGISALLGPPFAGWIYDITQKYDFSFYIC
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:.. .:. ..:.:
CCDS24 GLLYMIGILFLLIQPCIRIIEQSRRKYMDGAHV
480 490 500 510
500 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]