Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4480
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4480, 497 aa
1>>>pF1KE4480 497 - 497 aa - 497 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1681+/-0.000839; mu= 18.9314+/- 0.051
mean_var=65.5030+/-12.923, 0's: 0 Z-trim(106.4): 71 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.158469
statistics sampled from 8908 (8980) to 8908 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 3313 766.4 0
CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 2030 472.9 2.1e-133
CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 1221 288.1 1.4e-77
CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 1220 287.8 1.6e-77
CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 1218 287.4 2.3e-77
CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 1216 286.9 3.1e-77
CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 1170 276.4 4.5e-74
CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 1163 274.8 1.4e-73
CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 1147 271.1 1.6e-72
CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 1040 246.6 3.4e-65
CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 957 227.7 2.2e-59
CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 916 218.3 1.4e-56
CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 914 217.9 2e-56
CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 894 213.3 4.7e-55
CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 822 196.9 4.5e-50
CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 820 196.4 5.8e-50
CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 816 195.5 1.1e-49
CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 809 193.9 3.3e-49
CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 808 193.6 3.4e-49
CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 794 190.4 3.1e-48
CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 792 190.0 4.8e-48
CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 788 189.0 7.8e-48
CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 776 186.4 7.8e-47
CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 737 177.4 2.8e-44
CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 728 175.4 1.2e-43
CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 728 175.4 1.2e-43
CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 728 175.4 1.2e-43
CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 728 175.4 1.3e-43
CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 725 174.7 1.9e-43
CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 724 174.4 2.3e-43
CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 716 172.7 9.5e-43
CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 709 171.0 2.5e-42
CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 701 169.2 8.8e-42
CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 682 164.8 1.8e-40
CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 681 164.6 2.2e-40
CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 678 164.0 3.6e-40
CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 656 158.9 1.1e-38
CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 632 153.3 3.4e-37
CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 419 104.6 1.4e-22
CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 341 86.9 5.7e-17
CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 489) 334 85.3 1.7e-16
CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 505) 334 85.3 1.7e-16
CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8 ( 494) 333 85.1 2e-16
CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 319 81.9 1.8e-15
CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 316 81.2 2.8e-15
CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 310 79.8 7.3e-15
CCDS13517.1 CHRNA4 gene_id:1137|Hs108|chr20 ( 627) 310 79.9 9.2e-15
CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 516) 297 76.9 6.1e-14
CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs108|chr8 ( 529) 295 76.4 8.6e-14
CCDS3250.1 HTR3C gene_id:170572|Hs108|chr3 ( 447) 287 74.5 2.7e-13
>>CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 (497 aa)
initn: 3313 init1: 3313 opt: 3313 Z-score: 4090.5 bits: 766.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3313; 100.0% identity (100.0% similar) in 497 aa overlap (1-497:1-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MKFLLTTAFLILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MKFLLTTAFLILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 NRLLVSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NRLLVSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DFRGSDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DFRGSDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LSCPLDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQLEKIALPQFDIKKEDIEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LSCPLDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQLEKIALPQFDIKKEDIEY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GNCTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GNCTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LGIFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LGIFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EAEKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EAEKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SIVGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SIVGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARAL
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 FPFCFLFFNVIYWSIYL
:::::::::::::::::
CCDS37 FPFCFLFFNVIYWSIYL
490
>>CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 (303 aa)
initn: 2030 init1: 2030 opt: 2030 Z-score: 2508.4 bits: 472.9 E(32554): 2.1e-133
Smith-Waterman score: 2030; 100.0% identity (100.0% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MKFLLTTAFLILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MKFLLTTAFLILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 NRLLVSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NRLLVSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DFRGSDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFRGSDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LSCPLDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQLEKIALPQFDIKKEDIEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSCPLDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQLEKIALPQFDIKKEDIEY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 GNCTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GNCTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LGIFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRV
::
CCDS54 LGW
>>CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (452 aa)
initn: 1262 init1: 479 opt: 1221 Z-score: 1506.2 bits: 288.1 E(32554): 1.4e-77
Smith-Waterman score: 1267; 45.7% identity (66.1% similar) in 495 aa overlap (4-496:8-441)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MKFLLTTAF-LILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANS
.::. : ..: . . :. :...:..:: ::: . :..
CCDS48 MNRQLVNILTALFAFFLETNHFRTAFCKDHDSRSGKQ-------PSQTLS------PSDF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 TSNILNRLLVSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPR
.....: .:: :::::::: ::.:. :::::::::: ::::::::::::::.::: :
CCDS48 LDKLMGRT-SGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDSR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LKLPSDFRGSDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSM
: :.. .:.: .::.: .:::::::::::.::::::: .: :: : ..: :: :.
CCDS48 LAY-SEY-PDDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RLSITLSCPLDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIK
::..:::::.:: ::::.: : ::::::::: .:: : : : :::. : ..:::: :
CCDS48 RLTLTLSCPMDLKNFPMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQF-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 KEDIEYGNCTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDA
::. : : :::.:. :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::
CCDS48 KEEKELGYCTKHYN-TGKFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SAARVPLGIFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVML
. ::: ::: .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: ::.:.:::.:
CCDS48 APARVALGITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAV----
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NNPKRVEAEKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSD
: .: . : :. . .. ..: .:.... : .: : .: .:
CCDS48 NFVSRQHKEFLRLRRRQKRQNKEEDVTRESRFNFSG---------YGMGHCLQV------
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LRSNDFSIVGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRID
.: . : . : . :. . : : . :::::
CCDS48 ---KDGTAVKATPAN-----------PLP----------QPPKDGDAIKKKFVDRAKRID
390 400 410
480 490
pF1KE4 LYARALFPFCFLFFNVIYWSIYL
.:: ::. ::.::..:: :
CCDS48 TISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK
420 430 440 450
>>CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (452 aa)
initn: 1261 init1: 479 opt: 1220 Z-score: 1505.0 bits: 287.8 E(32554): 1.6e-77
Smith-Waterman score: 1266; 45.5% identity (66.1% similar) in 495 aa overlap (4-496:8-441)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MKFLLTTAF-LILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANS
.::. : ..: . . :. :...:..:: ::: . :..
CCDS14 MNRQLVNILTALFAFFLETNHFRTAFCKDHDSRSGKQ-------PSQTLS------PSDF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 TSNILNRLLVSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPR
.....: .:: :::::::: ::.:. :::::::::. ::::::::::::::.::: :
CCDS14 LDKLMGRT-SGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSVTETTMDYRVNIFLRQQWNDSR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LKLPSDFRGSDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSM
: :.. .:.: .::.: .:::::::::::.::::::: .: :: : ..: :: :.
CCDS14 LAY-SEY-PDDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RLSITLSCPLDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIK
::..:::::.:: ::::.: : ::::::::: .:: : : : :::. : ..:::: :
CCDS14 RLTLTLSCPMDLKNFPMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQF-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 KEDIEYGNCTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDA
::. : : :::.:. :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::
CCDS14 KEEKELGYCTKHYN-TGKFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SAARVPLGIFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVML
. ::: ::: .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: ::.:.:::.:
CCDS14 APARVALGITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAV----
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NNPKRVEAEKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSD
: .: . : :. . .. ..: .:.... : .: : .: .:
CCDS14 NFVSRQHKEFLRLRRRQKRQNKEEDVTRESRFNFSG---------YGMGHCLQV------
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LRSNDFSIVGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRID
.: . : . : . :. . : : . :::::
CCDS14 ---KDGTAVKATPAN-----------PLP----------QPPKDGDAIKKKFVDRAKRID
390 400 410
480 490
pF1KE4 LYARALFPFCFLFFNVIYWSIYL
.:: ::. ::.::..:: :
CCDS14 TISRAAFPLAFLIFNIFYWITYKIIRHEDVHKK
420 430 440 450
>>CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 (464 aa)
initn: 1264 init1: 468 opt: 1218 Z-score: 1502.4 bits: 287.4 E(32554): 2.3e-77
Smith-Waterman score: 1278; 47.0% identity (68.5% similar) in 464 aa overlap (38-496:25-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AFLILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNILNRLL---
: .... .: : :..:..:.
CCDS38 MAHVRHFRTLVSGFYFWEAALLLSLVATKETDSARSRSAPMSPSDFLDKLMGRT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRG
.:: :::::::: ::.:. :::::::::: ::::::::::::::::::::: :..
CCDS38 SGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLAY-SEY-P
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SDALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCP
.:.: .::.: .:::::::::::.::::.:: .: :: ::..:.:: :.::..:::::
CCDS38 DDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLTLSCP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGN
.:: ::::.: : ::::::::: .:: : ::. :::. : ..:::: .:.: :..:
CCDS38 MDLKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQDEAPVQVAEGLTLPQFLLKEEKDLRY--
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pF1KE4 CTKYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLG
:::.:. :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::
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pF1KE4 IFSVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEA
: .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . .: .
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290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSI
: :. . .. .. . : . :. : .. . : . .:
CCDS38 ELLRFRRKRKNKTEAFALEKFYRFSDMDDEVRESRFSF-TAYGMGPCLQAKD--------
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pF1KE4 VGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFP
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490
pF1KE4 FCFLFFNVIYWSIYL
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CCDS38 LAFLIFNIFYWVIYKILRHEDIHQQQD
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AFLILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNILNRLL---
: .... .: : :..:..:.
CCDS43 MAHVRHFRTLVSGFYFWEAALLLSLVATKETDSARSRSAPMSPSDFLDKLMGRT
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pF1KE4 VSYDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRG
.:: :::::::: ::.:. :::::::::: ::::::::::::::::::::: :..
CCDS43 SGYDARIRPNFKGPPVNVTCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLAY-SEY-P
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.:.: .::.: .:::::::::::.::::.:: .: :: ::..:.:: :.::..:::::
CCDS43 DDSLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLTLSCP
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pF1KE4 LDLTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGN
.:: ::::.: : ::::::::: .:: : ::. :::. : ..:::: .:.: :..:
CCDS43 MDLKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQDEAPVQVAEGLTLPQFLLKEEKDLRY--
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:::.:. :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::
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: .::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . .: .
CCDS43 ITTVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFV----SRQHK
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 EKARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSI
: :. . .. : . : . ..: : : :...:
CCDS43 ELLRFRRKRKN--------KDDEVRES----RFSFTAYGMGPC---------LQAKD---
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pF1KE4 VGSLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFP
: :. :. :..: . :: : . :. ::.:: .:: ::
CCDS43 -GMTPKG---PNH-----PVQV---MPKS-------PDEMRKVFIDRAKKIDTISRACFP
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490
pF1KE4 FCFLFFNVIYWSIYL
. ::.::..:: ::
CCDS43 LAFLIFNIFYWVIYKILRHEDIHQQQD
430 440
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20 30 40 50 60
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:: :::::::: ::.: :::::::::: ::::::::::::::.:::::: . .:
CCDS43 YDARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAY--NEYPDD
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pF1KE4 ALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLD
.: .::.: .:::::::::::.:.::..: .: :: : :.:.:: :.:...::.::.:
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: ::::.: : ::::::::: .:: : :: ::. . ..:::: .:.: :..: ::
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pF1KE4 KYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIF
:.:. :: .::.:. : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: :::
CCDS43 KHYN-TGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGIT
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.::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . .: . :
CCDS43 TVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFV----SRQHKEL
290 300 310 320 330 340
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pF1KE4 ARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVG
:. . .. .:. : : ..:. .: . : . .: .:. :
CCDS43 LRFRRKRRH--------HKEDEAGEGR-FNFSAYGMGPA-----CLQAKD----GISVKG
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pF1KE4 SLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFPFC
. .: . . : .:.: . .. ::.:: .: ::.
CCDS43 A-------NNSNTTNPP-----------PAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMA
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490
pF1KE4 FLFFNVIYWSIYL
::.::..:: ::
CCDS43 FLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
430 440
>>CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 (457 aa)
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20 30 40 50 60
pF1KE4 ILISLWVEEAYSKEKSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPAN-STSNILNRLL---VS
... :: .: : :..:..:. .
CCDS54 MYSFNTLRLYLWETIVFFSLAASKEAEAARSAPKPMSPSDFLDKLMGRTSG
10 20 30 40 50
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pF1KE4 YDPRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSD
:: :::::::: ::.: :::::::::: ::::::::::::::.:::::: . .:
CCDS54 YDARIRPNFKGPPVNVSCNIFINSFGSIAETTMDYRVNIFLRQQWNDPRLAY--NEYPDD
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pF1KE4 ALTVDPTMYKCLWKPDLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLD
.: .::.: .:::::::::::.:.::..: .: :: : :.:.:: :.:...::.::.:
CCDS54 SLDLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGAHFHEITTDNKLLRISRNGNVLYSIRITLTLACPMD
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pF1KE4 LTLFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKE-DIEYGNCT
: ::::.: : ::::::::: .:: : :: ::. . ..:::: .:.: :..: ::
CCDS54 LKNFPMDVQTCIMQLESFGYTMNDLIFEWQEQGAVQVADGLTLPQFILKEEKDLRY--CT
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pF1KE4 KYYKGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIF
:.:. :: .::.:. : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: :::
CCDS54 KHYN-TGKFTCIEARFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWISFWINMDAAPARVGLGIT
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pF1KE4 SVLSLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEK
.::..... . : :::::::::.:.:. .:::: :..:.:::.:. . . : : .
CCDS54 TVLTMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFSALLEYAAVNFVSRQHK--ELLR
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pF1KE4 ARIAKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVG
: : .. . :. ... . : : ..:. .: . : . .: .:. :
CCDS54 FR-RKRRHHKSPMLNLFQEDEA-GEGR-FNFSAYGMGPA-----CLQAKD----GISVKG
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pF1KE4 SLPRDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFPFC
. .: . . : .:.: . .. ::.:: .: ::.
CCDS54 A-------NNSNTTNPP-----------PAPSKSPEEMRKLFIQRAKKIDKISRIGFPMA
400 410 420 430
490
pF1KE4 FLFFNVIYWSIYL
::.::..:: ::
CCDS54 FLIFNMFYWIIYKIVRREDVHNQ
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pF1KE4 KSSKKGKGKKKQYLCPSQQSAEDLARVPANSTSNILNRLL---VSYDPRIRPNFKGIPVD
: :..:..:. .:: :::::::: ::.
CCDS43 LLWTLPGQVLLRVALAKEEVKSGTKGSQPMSPSDFLDKLMGRTSGYDARIRPNFKGPPVN
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pF1KE4 VVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSDALTVDPTMYKCLWKP
:. :::::::.:: .::::::::.::::.::::::. .:.: .::.: .:::
CCDS43 VTCNIFINSFSSITKTTMDYRVNVFLRQQWNDPRLSYRE--YPDDSLDLDPSMLDSIWKP
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pF1KE4 DLFFANEKSANFHDVTQENILLFIFRDGDVLVSMRLSITLSCPLDLTLFPMDTQRCKMQL
::::::::.::::.:: .: :: ::..:.:: :.::.. ::: .:: :::: : : :::
CCDS43 DLFFANEKGANFHEVTTDNKLLRIFKNGNVLYSIRLTLILSCLMDLKNFPMDIQTCTMQL
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250
pF1KE4 ESFGYTTDDLRFIWQSGDP-VQL-EKIALPQFDIKKEDIEYGNCTKYYKGTGYYTCVEVI
:::::: :: : : : ::. : ..:::: : ... . : :::.:. :: .::.::
CCDS43 ESFGYTMKDLVFEWLEDAPAVQVAEGLTLPQF-ILRDEKDLGCCTKHYN-TGKFTCIEVK
200 210 220 230 240
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pF1KE4 FTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIFSVLSLASECTTLAAE
: :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::: .::..... . :
CCDS43 FHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVGLGITTVLTMTTQSSGSRAS
250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 LPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEKARIAKAEQADGKGGN
:::::::::.:.:. .:::: ::.:.:::..
CCDS43 LPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAINFVSRQHKEFIRLRRRQRRQRLEEDIIQE
310 320 330 340 350 360
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pF1KE4 VAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVGSLPRDFELSNYDCYG
CCDS43 SRFYFRGYGLGHCLQARDGGPMEGSGIYSPQPPAPLLREGETTRKLYVD
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>>CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX (363 aa)
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Smith-Waterman score: 1082; 46.4% identity (66.4% similar) in 399 aa overlap (99-496:1-352)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PRIRPNFKGIPVDVVVNIFINSFGSIQETTMDYRVNIFLRQKWNDPRLKLPSDFRGSDAL
:::::::::::.::: :: :.. .:.:
CCDS55 MDYRVNIFLRQQWNDSRLAY-SEY-PDDSL
10 20
130 140 150 160 170 180
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.::.: .:::::::::::.::::::: .: :: : ..: :: :.::..:::::.::
CCDS55 DLDPSMLDSIWKPDLFFANEKGANFHDVTTDNKLLRISKNGKVLYSIRLTLTLSCPMDLK
30 40 50 60 70 80
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pF1KE4 LFPMDTQRCKMQLESFGYTTDDLRFIWQSGDPVQL-EKIALPQFDIKKEDIEYGNCTKYY
::::.: : ::::::::: .:: : : : :::. : ..:::: : ::. : : :::.:
CCDS55 NFPMDVQTCTMQLESFGYTMNDLIFEWLSDGPVQVAEGLTLPQF-ILKEEKELGYCTKHY
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pF1KE4 KGTGYYTCVEVIFTLRRQVGFYMMGVYAPTLLIVVLSWLSFWINPDASAARVPLGIFSVL
. :: .::.:: : :.::.:.:.. .: :.::::.:::.::::: ::. ::: ::: .::
CCDS55 N-TGKFTCIEVKFHLERQMGYYLIQMYIPSLLIVILSWVSFWINMDAAPARVALGITTVL
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SLASECTTLAAELPKVSYVKALDVWLIACLLFGFASLVEYAVVQVMLNNPKRVEAEKARI
..... . : :::::::::.:.:. .:::: ::.:.:::.:. . .: . : :.
CCDS55 TMTTQSSGSRASLPKVSYVKAIDIWMAVCLLFVFAALLEYAAVNFV----SRQHKEFLRL
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 AKAEQADGKGGNVAKKNTVNGTGTPVHISTLQVGETRCKKVCTSKSDLRSNDFSIVGSLP
. .. ..: .:.... : .: : .: .: .: . : . :
CCDS55 RRRQKRQNKEEDVTRESRFNFSG---------YGMGHCLQV---------KDGTAVKATP
270 280 290 300
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pF1KE4 RDFELSNYDCYGKPIEVNNGLGKSQAKNNKKPPPAKPVIPTAAKRIDLYARALFPFCFLF
. :. . : : . ::::: .:: ::. ::.
CCDS55 AN-----------PLP----------QPPKDGDAIKKKFVDRAKRIDTISRAAFPLAFLI
310 320 330 340
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pF1KE4 FNVIYWSIYL
::..:: :
CCDS55 FNIFYWITYKIIRHEDVHKK
350 360
497 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 00:52:15 2016 done: Sun Nov 6 00:52:16 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]