Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4476, 495 aa
1>>>pF1KE4476 495 - 495 aa - 495 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9481+/-0.000373; mu= 19.7003+/- 0.023
mean_var=63.7897+/-13.908, 0's: 0 Z-trim(111.4): 104 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.160583
statistics sampled from 19859 (19967) to 19859 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 9.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036566 (OMIM: 269920,604322,604369) sialin [Hom ( 495) 3342 783.4 0
XP_005248767 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 478) 3139 736.4 4.3e-212
XP_005248768 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 429) 2907 682.6 6e-196
XP_011534052 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 397) 2523 593.6 3.4e-169
XP_016866220 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 364) 1978 467.3 3.3e-131
XP_016866219 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTE ( 364) 1978 467.3 3.3e-131
XP_006715012 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 478) 1192 285.3 2.6e-76
XP_005248841 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 478) 1192 285.3 2.6e-76
NP_001273052 (OMIM: 611049) sodium-dependent phosp ( 478) 1192 285.3 2.6e-76
NP_065079 (OMIM: 607563) vesicular glutamate trans ( 582) 1168 279.8 1.5e-74
NP_647480 (OMIM: 605583,607557) vesicular glutamat ( 589) 1158 277.5 7.3e-74
NP_064705 (OMIM: 605208) vesicular glutamate trans ( 560) 1144 274.2 6.7e-73
NP_005486 (OMIM: 604216) probable small intestine ( 497) 1135 272.1 2.6e-72
XP_016865648 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 455) 1129 270.7 6.3e-72
XP_006715013 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 455) 1129 270.7 6.3e-72
NP_001273050 (OMIM: 604216) probable small intesti ( 443) 1090 261.6 3.2e-69
XP_011512513 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 443) 1090 261.6 3.2e-69
XP_016866691 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 489) 1073 257.7 5.4e-68
NP_005065 (OMIM: 182308) sodium-dependent phosphat ( 467) 1066 256.1 1.6e-67
NP_001091956 (OMIM: 611034,612671) sodium-dependen ( 498) 1066 256.1 1.7e-67
XP_016866688 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 517) 1066 256.1 1.7e-67
XP_016866690 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 517) 1066 256.1 1.7e-67
XP_016866689 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 517) 1066 256.1 1.7e-67
XP_011513123 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 396) 1012 243.5 8.1e-64
XP_011513120 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 499) 927 223.9 8.3e-58
XP_006715014 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 398) 904 218.5 2.8e-56
NP_001273054 (OMIM: 611049) sodium-dependent phosp ( 398) 904 218.5 2.8e-56
XP_016865649 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-depe ( 356) 898 217.1 6.7e-56
NP_005826 (OMIM: 611049) sodium-dependent phosphat ( 436) 896 216.7 1.1e-55
XP_011512515 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 419) 847 205.3 2.7e-52
XP_016865639 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 388) 828 200.9 5.4e-51
NP_006623 (OMIM: 611034,612671) sodium-dependent p ( 420) 768 187.0 8.9e-47
XP_011512520 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 289) 744 181.4 3.1e-45
XP_011512516 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 375) 725 177.0 8.1e-44
XP_011512517 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 333) 719 175.6 1.9e-43
XP_011513121 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 488) 635 156.3 1.9e-37
NP_001138760 (OMIM: 605583,607557) vesicular gluta ( 539) 598 147.7 7.8e-35
XP_011512519 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 321) 577 142.7 1.5e-33
XP_011513122 (OMIM: 182308) PREDICTED: sodium-depe ( 463) 545 135.4 3.4e-31
XP_016865640 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 250) 497 124.1 4.7e-28
XP_011512521 (OMIM: 604216) PREDICTED: probable sm ( 267) 423 107.0 7.1e-23
NP_001289572 (OMIM: 612107,616063) solute carrier ( 430) 401 102.0 3.5e-21
NP_071365 (OMIM: 612107,616063) solute carrier fam ( 436) 401 102.0 3.6e-21
XP_011527280 (OMIM: 612107,616063) PREDICTED: solu ( 316) 260 69.3 1.9e-11
>>NP_036566 (OMIM: 269920,604322,604369) sialin [Homo sa (495 aa)
initn: 3342 init1: 3342 opt: 3342 Z-score: 4182.6 bits: 783.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3342; 100.0% identity (100.0% similar) in 495 aa overlap (1-495:1-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MRSPVRDLARNDGEESTDRTPLLPGAPRAEAAPVCCSARYNLAILAFFGFFIVYALRVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MRSPVRDLARNDGEESTDRTPLLPGAPRAEAAPVCCSARYNLAILAFFGFFIVYALRVNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SVALVDMVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQTGKKYQWDAETQGWILGSFFYGYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 SVALVDMVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQTGKKYQWDAETQGWILGSFFYGYI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIAADLGVGPLIVLRALEGLGEGVTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 ITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIAADLGVGPLIVLRALEGLGEGVTFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 AMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWVPILKSLPLWAIVVAHFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 FLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWVPILKSLPLWAIVVAHFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 YNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNLRAKWNFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 YNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNLRAKWNFST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSINHLDIAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 LCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSINHLDIAPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 YAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEWQTVFYIAAAINVFGAIFFTLFAKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 YAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEWQTVFYIAAAINVFGAIFFTLFAKG
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 EVQNWALNDHHGHRH
:::::::::::::::
NP_036 EVQNWALNDHHGHRH
490
>>XP_005248767 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTED: s (478 aa)
initn: 3135 init1: 3135 opt: 3139 Z-score: 3928.6 bits: 736.4 E(85289): 4.3e-212
Smith-Waterman score: 3139; 97.3% identity (98.3% similar) in 480 aa overlap (16-495:2-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MRSPVRDLARNDGEESTDRTPLLPGAPRAEAAPVCCSARYNLAILAFFGFFIVYALRVNL
..: .: . . :: ::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASDSNPAFEDTLRA---PVCCSARYNLAILAFFGFFIVYALRVNL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SVALVDMVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQTGKKYQWDAETQGWILGSFFYGYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SVALVDMVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQTGKKYQWDAETQGWILGSFFYGYI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIAADLGVGPLIVLRALEGLGEGVTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIAADLGVGPLIVLRALEGLGEGVTFP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFW
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWVPILKSLPLWAIVVAHFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWVPILKSLPLWAIVVAHFS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 YNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNLRAKWNFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNLRAKWNFST
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSINHLDIAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSINHLDIAPS
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 YAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEWQTVFYIAAAINVFGAIFFTLFAKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEWQTVFYIAAAINVFGAIFFTLFAKG
410 420 430 440 450 460
490
pF1KE4 EVQNWALNDHHGHRH
:::::::::::::::
XP_005 EVQNWALNDHHGHRH
470
>>XP_005248768 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTED: s (429 aa)
initn: 2907 init1: 2907 opt: 2907 Z-score: 3638.8 bits: 682.6 E(85289): 6e-196
Smith-Waterman score: 2907; 100.0% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (67-495:1-429)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 SARYNLAILAFFGFFIVYALRVNLSVALVDMVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQ
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQ
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 TGKKYQWDAETQGWILGSFFYGYIITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGKKYQWDAETQGWILGSFFYGYIITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIA
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 ADLGVGPLIVLRALEGLGEGVTFPAMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ADLGVGPLIVLRALEGLGEGVTFPAMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPL
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 SGIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFWFLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SGIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFWFLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSS
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 QKSVPWVPILKSLPLWAIVVAHFSYNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QKSVPWVPILKSLPLWAIVVAHFSYNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYL
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 GSWLCMILSGQAADNLRAKWNFSTLCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSWLCMILSGQAADNLRAKWNFSTLCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFL
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 TISTTLGGFCSSGFSINHLDIAPSYAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TISTTLGGFCSSGFSINHLDIAPSYAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEW
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490
pF1KE4 QTVFYIAAAINVFGAIFFTLFAKGEVQNWALNDHHGHRH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QTVFYIAAAINVFGAIFFTLFAKGEVQNWALNDHHGHRH
400 410 420
>>XP_011534052 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTED: s (397 aa)
initn: 2559 init1: 2523 opt: 2523 Z-score: 3158.5 bits: 593.6 E(85289): 3.4e-169
Smith-Waterman score: 2523; 99.7% identity (100.0% similar) in 373 aa overlap (1-373:1-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MRSPVRDLARNDGEESTDRTPLLPGAPRAEAAPVCCSARYNLAILAFFGFFIVYALRVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRSPVRDLARNDGEESTDRTPLLPGAPRAEAAPVCCSARYNLAILAFFGFFIVYALRVNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SVALVDMVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQTGKKYQWDAETQGWILGSFFYGYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVALVDMVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQTGKKYQWDAETQGWILGSFFYGYI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIAADLGVGPLIVLRALEGLGEGVTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIAADLGVGPLIVLRALEGLGEGVTFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWVPILKSLPLWAIVVAHFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWVPILKSLPLWAIVVAHFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 YNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNLRAKWNFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNLRAKWNFST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSINHLDIAPS
::::::::::::.
XP_011 LCVRRIFSLIGMLVSSWASQIHLPLFQEWLGPSLLKV
370 380 390
>>XP_016866220 (OMIM: 269920,604322,604369) PREDICTED: s (364 aa)
initn: 1978 init1: 1978 opt: 1978 Z-score: 2476.7 bits: 467.3 E(85289): 3.3e-131
Smith-Waterman score: 1978; 100.0% identity (100.0% similar) in 291 aa overlap (205-495:74-364)
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 EGVTFPAMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFFG
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HCCPHPVHSHCCRFRSWTTHCTQSTRRTRRGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFFG
50 60 70 80 90 100
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TIGIFWFLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWVPILKSLPLWAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TIGIFWFLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQKSVPWVPILKSLPLWAI
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 VVAHFSYNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVAHFSYNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNLRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KWNFSTLCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSINH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDIAPSYAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEWQTVFYIAAAINVFGAIFF
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480 490
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:::::::::::::::::::::
XP_016 TLFAKGEVQNWALNDHHGHRH
350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KWNFSTLCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSINH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 TLFAKGEVQNWALNDHHGHRH
350 360
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..:... .. ..:..:::::::::: .:. .:. .:. : : ..:.: ..: ..::.:
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.. . . ::..:: .:.. :.. :: :.. .: ... .: . ...:.::: :
XP_006 LSRNLLRLITVRKLFSSLGLLLPSICAVALPFVASSYVITIILLILIPGTSNLCDSGFII
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: ::::: ::..:.::. :. : :... . . : .. . :..::...::.:.:: .
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pF1KE4 FFTLFAKGEVQNWALNDHHGHRH
:. :...:.:.::
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460 470
>>XP_005248841 (OMIM: 611049) PREDICTED: sodium-dependen (478 aa)
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. : : .. .: :: ::.::.. :. : . . ::.:
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pF1KE4 SFFYGYIITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIAADLGVGPLIVLRALEGL
:. :: :.: ::.::.:. .:.: .:: :.: ...::::::.:::.:: .:..:...:.
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pF1KE4 GEGVTFPAMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFF
..:... .. ..:..:::::::::: .:. .:. .:. : : ..:.: ..: ..::.:
XP_005 AQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGSFIILCVGGLISQALSWPFIFYIF
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pF1KE4 GTIGIFWFLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSLRNQLSSQ-KSVPWVPILKSLPLW
:. : :::. .. : :..: :: :::.::::: .: :: ..:: .. ::::
XP_005 GSTGCVCCLLWFTVIYDDPMHHPCISVREKEHILSSLAQQPSSPGRAVPIKAMVTCLPLW
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pF1KE4 AIVVAHFSYNWTFYTLLTLLPTYMKEILRFNVQENGFLSSLPYLGSWLCMILSGQAADNL
:: .. ::. : .:: ::::.. .:. :....: :::::.... : ::.:: :: :
XP_005 AIFLGFFSHFWLCTIILTYLPTYISTLLHVNIRDSGVLSSLPFIAAASCTILGGQLADFL
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pF1KE4 RAKWNFSTLCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSI
.. . . ::..:: .:.. :.. :: :.. .: ... .: . ...:.::: :
XP_005 LSRNLLRLITVRKLFSSLGLLLPSICAVALPFVASSYVITIILLILIPGTSNLCDSGFII
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pF1KE4 NHLDIAPSYAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEWQTVFYIAAAINVFGAI
: ::::: ::..:.::. :. : :... . . : .. . :..::...::.:.:: .
XP_005 NTLDIAPRYASFLMGISRGFGLIAGIISSTATGFLISQDFESGWRNVFFLSAAVNMFGLV
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pF1KE4 FFTLFAKGEVQNWALNDHHGHRH
:. :...:.:.::
XP_005 FYLTFGQAELQDWAKERTLTRL
460 470
>>NP_001273052 (OMIM: 611049) sodium-dependent phosphate (478 aa)
initn: 671 init1: 556 opt: 1192 Z-score: 1490.9 bits: 285.3 E(85289): 2.6e-76
Smith-Waterman score: 1192; 39.2% identity (71.6% similar) in 472 aa overlap (23-486:1-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MRSPVRDLARNDGEESTDRTPLLPGAPRAEAAPVCCSARYNLAILAFFGFFIVYALRVNL
. : : .. .: :: ::.::.. :. : . . ::.:
NP_001 MDGKPATRKGPDFCSLRYGLALIMHFSNFTMITQRVSL
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KE4 SVALVDMVD-------SNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQTGKKYQWDAETQGWILG
:.:.. ::. ::.. : . .. : . : :: . . .. :::. :::: :..
NP_001 SIAIIAMVNTTQQQGLSNASTE-GPVADAFNNSSISIK-EFDTKASVYQWSPETQGIIFS
40 50 60 70 80 90
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pF1KE4 SFFYGYIITQIPGGYVASKIGGKMLLGFGILGTAVLTLFTPIAADLGVGPLIVLRALEGL
:. :: :.: ::.::.:. .:.: .:: :.: ...::::::.:::.:: .:..:...:.
NP_001 SINYGIILTLIPSGYLAGIFGAKKMLGAGLLISSLLTLFTPLAADFGVILVIMVRTVQGM
100 110 120 130 140 150
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pF1KE4 GEGVTFPAMHAMWSSWAPPLERSKLLSISYAGAQLGTVISLPLSGIICYYMNWTYVFYFF
..:... .. ..:..:::::::::: .:. .:. .:. : : ..:.: ..: ..::.:
NP_001 AQGMAWTGQFTIWAKWAPPLERSKLTTIAGSGSAFGSFIILCVGGLISQALSWPFIFYIF
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NP_001 GSTGCVCCLLWFTVIYDDPMHHPCISVREKEHILSSLAQQPSSPGRAVPIKAMVTCLPLW
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:: .. ::. : .:: ::::.. .:. :....: :::::.... : ::.:: :: :
NP_001 AIFLGFFSHFWLCTIILTYLPTYISTLLHVNIRDSGVLSSLPFIAAASCTILGGQLADFL
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 RAKWNFSTLCVRRIFSLIGMIGPAVFLVAAGFIGCDYSLAVAFLTISTTLGGFCSSGFSI
.. . . ::..:: .:.. :.. :: :.. .: ... .: . ...:.::: :
NP_001 LSRNLLRLITVRKLFSSLGLLLPSICAVALPFVASSYVITIILLILIPGTSNLCDSGFII
340 350 360 370 380 390
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pF1KE4 NHLDIAPSYAGILLGITNTFATIPGMVGPVIAKSLTPDNTVGEWQTVFYIAAAINVFGAI
: ::::: ::..:.::. :. : :... . . : .. . :..::...::.:.:: .
NP_001 NTLDIAPRYASFLMGISRGFGLIAGIISSTATGFLISQDFESGWRNVFFLSAAVNMFGLV
400 410 420 430 440 450
480 490
pF1KE4 FFTLFAKGEVQNWALNDHHGHRH
:. :...:.:.::
NP_001 FYLTFGQAELQDWAKERTLTRL
460 470
>>NP_065079 (OMIM: 607563) vesicular glutamate transport (582 aa)
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10 20 30
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: . : :: .:. .: :.: :.
NP_065 GKEGLKNFAGKSLGQIYRVLEKKQDTGETIELTEDGKPLE--VPERKA-PLCDCTCFGLP
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pF1KE4 -RYNLAILAFFGFFIVYALRVNLSVALVDMVDSNTTLEDNRTSKACPEHSAPIKVHHNQT
:: .::.. .:: : ...: ::.::.::::. :.:. .: .:. :..
NP_065 RRYIIAIMSGLGFCISFGIRCNLGVAIVDMVN-NSTI--HRGGKVIKEKA----------
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:..:: :: : : ::::.:::::::::::.::..... ..: .:: :..:... : ::
NP_065 --KFNWDPETVGMIHGSFFWGYIITQIPGGYIASRLAANRVFGAAILLTSTLNMLIPSAA
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NP_065 RVHYGCVIFVRILQGLVEGVTYPACHGIWSKWAPPLERSRLATTSFCGSYAGAVIAMPLA
180 190 200 210 220 230
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pF1KE4 GIICYYMNWTYVFYFFGTIGIFWFLLWIWLVSDTPQKHKRISHYEKEYILSSL---RNQL
::. : .:. ::: .:..:. :...:. . ..: :: :. :..:: :. : :
NP_065 GILVQYTGWSSVFYVYGSFGMVWYMFWLLVSYESPAKHPTITDEERRYIEESIGESANLL
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..... .:: .. :.:..::.::.: .:::: :: :.:..:.. :.... :.::.
NP_065 GAMEKFKTPWRKFFTSMPVYAIIVANFCRSWTFYLLLISQPAYFEEVFGFEISKVGMLSA
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.:.: . . ..:: :: ::.: .:: ::.:.. :. :..:...:. . ..:
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..::.... ..:: :::..::::::: ::.::.::.: .:. ::: :.:. ..: ...
NP_065 ISFLVLAVGFSGFAISGFNVNHLDIAPRYASILMGISNGVGTLSGMVCPIIVGAMTKNKS
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pF1KE4 VGEWQTVFYIAAAINVFGAIFFTLFAKGEVQNWALNDHHGHRH
::: :: ::: .. :.::...::.:: : ::
NP_065 REEWQYVFLIAALVHYGGVIFYAIFASGEKQPWADPEETSEEKCGFIHEDELDEETGDIT
480 490 500 510 520 530
NP_065 QNYINYGTTKSYGATTQANGGWPSGWEKKEEFVQGEVQDSHSYKDRVDYS
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]