Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4475
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4475, 494 aa
1>>>pF1KE4475 494 - 494 aa - 494 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9524+/-0.000458; mu= 20.3466+/- 0.028
mean_var=78.9130+/-16.783, 0's: 0 Z-trim(110.3): 173 B-trim: 1034 in 1/50
Lambda= 0.144378
statistics sampled from 18456 (18630) to 18456 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 8.810
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine re ( 494) 3393 717.0 3e-206
NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine ( 479) 2775 588.3 1.6e-167
NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetyl ( 489) 1864 398.5 2.2e-110
NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcho ( 505) 1864 398.6 2.2e-110
XP_006720445 (OMIM: 118503,612052) PREDICTED: neur ( 438) 1708 366.0 1.2e-100
NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ac ( 627) 1578 339.1 2.2e-92
XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1522 327.3 6.4e-89
XP_011542690 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 529) 1522 327.3 6.4e-89
NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcho ( 529) 1522 327.3 6.4e-89
NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcho ( 502) 1491 320.9 5.5e-87
XP_011519489 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1460 314.4 4.7e-85
XP_011519488 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 495) 1460 314.4 4.7e-85
NP_000741 (OMIM: 118509) neuronal acetylcholine re ( 498) 1460 314.4 4.8e-85
XP_016877375 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1446 311.5 3.4e-84
XP_016877374 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 468) 1446 311.5 3.4e-84
XP_016883113 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 546) 1410 304.0 7e-82
NP_001269384 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetyl ( 514) 1394 300.7 6.7e-81
XP_011519492 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1356 292.7 1.4e-78
XP_011519493 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 424) 1356 292.7 1.4e-78
NP_000736 (OMIM: 118505,612052) neuronal acetylcho ( 468) 1324 286.0 1.5e-76
NP_000740 (OMIM: 118508) neuronal acetylcholine re ( 458) 1303 281.7 3.1e-75
NP_000070 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) acet ( 457) 1272 275.2 2.8e-73
XP_016858746 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 464) 1270 274.8 3.7e-73
XP_016877377 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 462) 1260 272.7 1.6e-72
XP_016877376 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 463) 1260 272.7 1.6e-72
XP_016877378 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 449) 1256 271.9 2.7e-72
XP_011526826 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 556) 1173 254.7 5.1e-67
NP_060051 (OMIM: 605116) neuronal acetylcholine re ( 479) 1137 247.1 8.3e-65
NP_001034612 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) a ( 482) 1117 242.9 1.5e-63
XP_016858745 (OMIM: 100690,253290,601462,608930) P ( 489) 1117 242.9 1.5e-63
XP_016868492 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 1113 242.0 2.2e-63
XP_005273454 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 370) 1113 242.0 2.2e-63
NP_000737 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetylcho ( 502) 1049 228.8 2.8e-59
NP_001177384 (OMIM: 118511,612001) neuronal acetyl ( 531) 1040 226.9 1.1e-58
NP_065135 (OMIM: 606372) neuronal acetylcholine re ( 450) 997 217.9 4.8e-56
XP_016855669 (OMIM: 118507,605375) PREDICTED: neur ( 332) 974 213.0 1.1e-54
XP_011542692 (OMIM: 118508) PREDICTED: neuronal ac ( 329) 955 209.0 1.6e-53
NP_001243502 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal ( 451) 950 208.1 4.2e-53
XP_016883114 (OMIM: 118504,188890,600513) PREDICTE ( 451) 950 208.1 4.2e-53
XP_011519478 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 486) 932 204.4 6e-52
XP_011542691 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 926 203.0 1.1e-51
XP_016868493 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neur ( 331) 926 203.0 1.1e-51
XP_011519480 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 380) 900 197.6 5.1e-50
XP_011519494 (OMIM: 118509) PREDICTED: neuronal ac ( 316) 881 193.6 6.9e-49
XP_005254199 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 243) 770 170.4 5.3e-42
XP_016877370 (OMIM: 118505,612052) PREDICTED: neur ( 245) 770 170.4 5.3e-42
NP_001155244 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine re ( 463) 724 161.1 6.4e-39
NP_000860 (OMIM: 182139) 5-hydroxytryptamine recep ( 484) 724 161.1 6.6e-39
XP_011519479 (OMIM: 118511,612001) PREDICTED: neur ( 401) 716 159.3 1.8e-38
NP_647536 (OMIM: 609756) CHRNA7-FAM7A fusion prote ( 412) 716 159.4 1.9e-38
>>NP_004189 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine recept (494 aa)
initn: 3393 init1: 3393 opt: 3393 Z-score: 3823.9 bits: 717.0 E(85289): 3e-206
Smith-Waterman score: 3393; 100.0% identity (100.0% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLTSKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MLTSKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VHFEVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VHFEVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VLYNNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VLYNNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 YDKAEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YDKAEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MFYTINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MFYTINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PLVGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PLVGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KTRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KTRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTA
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 GLFLQPLLGNTGKS
::::::::::::::
NP_004 GLFLQPLLGNTGKS
490
>>NP_001186208 (OMIM: 606888) neuronal acetylcholine rec (479 aa)
initn: 3274 init1: 2773 opt: 2775 Z-score: 3128.4 bits: 588.3 E(85289): 1.6e-167
Smith-Waterman score: 3248; 97.0% identity (97.0% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLTSKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLTSKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VHFEVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDI
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHFEVAITQLANV---------------IWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDI
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VLYNNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLYNNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 YDKAEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YDKAEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLP
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MFYTINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MFYTINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PLVGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLVGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLD
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KTRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVV
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 ENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTA
410 420 430 440 450 460
490
pF1KE4 GLFLQPLLGNTGKS
::::::::::::::
NP_001 GLFLQPLLGNTGKS
470
>>NP_001160166 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylchol (489 aa)
initn: 1964 init1: 1826 opt: 1864 Z-score: 2102.8 bits: 398.5 E(85289): 2.2e-110
Smith-Waterman score: 1961; 67.3% identity (84.3% similar) in 434 aa overlap (34-451:35-463)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 SKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVTVHF
:.:::..:: ::..:::: :::::: .::
NP_001 PLSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVARASEAEHRLFERLFEDYNEIIRPVANVSDPVIIHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDIVLY
::...::..::::::::::::::..:::::::.:.: .: : : .::::.::::::::::
NP_001 EVSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPSDYGGAEFMRVPAQKIWKPDIVLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 NNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYDK
:::::::::. ::::::::.: .:: ::::::::: .:.:.::::.:::..:::::.:::
NP_001 NNAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKIDVTYFPFDYQNCTMKFGSWSYDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLPMFY
:.:::..:::.....:.::..:: :: : ::::::::::::::: :::::.::::::.::
NP_001 AKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEEIYPDITYSLYIRRLPLFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPLV
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.
NP_001 TINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVIPLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 GEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLDKTR
::::::::::::::::.::::::.::::::::::: :::::::.:::.:..: : :
NP_001 GEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTTHTMPSWVKTVFLNLLPRVMFMTRP---TS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE4 GTGSDAVPRGL-----------ARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHK-----SNELATS
. :. :: : .: .:: ..: : . : .::. :: :.
NP_001 NEGNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKG--CKEGYPCQDGMCGYCHHRRIKISNFSANL
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 KRRLSHQPLQWVVENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVF
: : . .. :. : :::....:.::..::::::..::.::
NP_001 TRSSSSESVDAVLSLSALSPEIKEAIQSVKYIAENMKAQNEAKEEQKAQEIQQLKRKEKS
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KE4 LWVFIIVCVFGTAGLFLQPLLGNTGKS
NP_001 TETSDQEPGL
480
>>NP_000734 (OMIM: 118503,612052) neuronal acetylcholine (505 aa)
initn: 2175 init1: 1832 opt: 1864 Z-score: 2102.6 bits: 398.6 E(85289): 2.2e-110
Smith-Waterman score: 2191; 67.9% identity (85.4% similar) in 471 aa overlap (34-488:35-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 SKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVTVHF
:.:::..:: ::..:::: :::::: .::
NP_000 PLSLPLALSPPRLLLLLLLSLLPVARASEAEHRLFERLFEDYNEIIRPVANVSDPVIIHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDIVLY
::...::..::::::::::::::..:::::::.:.: .: : : .::::.::::::::::
NP_000 EVSMSQLVKVDEVNQIMETNLWLKQIWNDYKLKWNPSDYGGAEFMRVPAQKIWKPDIVLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 NNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYDK
:::::::::. ::::::::.: .:: ::::::::: .:.:.::::.:::..:::::.:::
NP_000 NNAVGDFQVDDKTKALLKYTGEVTWIPPAIFKSSCKIDVTYFPFDYQNCTMKFGSWSYDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 AEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLPMFY
:.:::..:::.....:.::..:: :: : ::::::::::::::: :::::.::::::.::
NP_000 AKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKHDIKYNCCEEIYPDITYSLYIRRLPLFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 TINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPLV
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.
NP_000 TINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVIPLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 GEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLDKTR
::::::::::::::::.::::::.::::::::::: :::::::.:::.:..: : :
NP_000 GEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHYRTPTTHTMPSWVKTVFLNLLPRVMFMTRP---TS
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370 380 390 400
pF1KE4 GTGSDAVPRGL-----------ARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHK-----SNELATS
. :. :: : .: .:: ..: : . : .::. :: :.
NP_000 NEGNAQKPRPLYGAELSNLNCFSRAESKG--CKEGYPCQDGMCGYCHHRRIKISNFSANL
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 KRRLSHQPLQWVVENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVF
: : . .. :. : :::....:.::..::::::..::.::..:::::::::.::.:
NP_000 TRSSSSESVDAVLSLSALSPEIKEAIQSVKYIAENMKAQNEAKEIQDDWKYVAMVIDRIF
420 430 440 450 460 470
470 480 490
pF1KE4 LWVFIIVCVFGTAGLFLQPLLGNTGKS
:::: .::..::::::::::.
NP_000 LWVFTLVCILGTAGLFLQPLMAREDA
480 490 500
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40 50 60 70 80 90
pF1KE4 LFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVTVHFEVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLR
..::..::::::::::::::..:::::::.
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:.: .: : : .::::.:::::::::::::::::::. ::::::::.: .:: :::::::
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pF1KE4 SCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYDKAEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKH
:: .:.:.::::.:::..:::::.::::.:::..:::.....:.::..:: :: : ::::
XP_006 SCKIDVTYFPFDYQNCTMKFGSWSYDKAKIDLVLIGSSMNLKDYWESGEWAIIKAPGYKH
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::::::::::: :::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::::
XP_006 DIKYNCCEEIYPDITYSLYIRRLPLFYTINLIIPCLLISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCI
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pF1KE4 SVLLSLTVFLLVITETIPSTSLVVPLVGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHT
:::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::.::::::.:::::::::
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:: :::::::.:::.:..: : : . :. :: : .: .:: .
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pF1KE4 HGEPRHLKECFHCHK-----SNELATSKRRLSHQPLQWVVENSEHSPEVEDVINSVQFIA
.: : . : .::. :: :. : : . .. :. : :::....:.::..::
XP_006 EGYPCQDGMCGYCHHRRIKISNFSANLTRSSSSESVDAVLSLSALSPEIKEAIQSVKYIA
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pF1KE4 ENMKSHNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAGLFLQPLLGNTGKS
::::..::.::..:::::::::.::.::::: .::..::::::::::.
XP_006 ENMKAQNEAKEIQDDWKYVAMVIDRIFLWVFTLVCILGTAGLFLQPLMAREDA
390 400 410 420 430
>>NP_000735 (OMIM: 118504,188890,600513) neuronal acetyl (627 aa)
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Smith-Waterman score: 1578; 67.7% identity (87.1% similar) in 325 aa overlap (34-358:37-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 SKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRPVENVSDPVTVHF
::::..:::: ::.. ::: :.:: : :.:
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pF1KE4 EVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKPDIVLY
..:.:: .::: ::.: ::.:... :.:::::::: .:... ..:.:.. ::.::::::
NP_000 GLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWVKQEWHDYKLRWDPADYENVTSIRIPSELIWRPDIVLY
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pF1KE4 NNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGSWTYDK
::: ::: : ::: : ..: . ::::::.:::: .:.::::::.:::..:::::::::
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pF1KE4 AEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDITYSFYIRRLPMFY
:.:::. . :.::. ::::..:: :.:: : . ::.:: ::: ::::.: :::::.::
NP_000 AKIDLVNMHSRVDQLDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIYPDITYAFVIRRLPLFY
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:::::::::.:: ::::::::::.::::.:::::::::::::::.::: :::::::.::.
NP_000 TINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSECGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPSTSLVIPLI
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pF1KE4 GEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLDKTR
::::::::::::::::.::::::.:.:.: ::::: ::. ::: ..:..:::. :
NP_000 GEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRTHTMPTWVRRVFLDIVPRLLLMKRPSVVKD
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pF1KE4 GTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGEPRHLKECFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVVENS
NP_000 NCRRLIESMHKMASAPRFWPEPEGEPPATSGTQSLHPPSPSFCVPLDVPAEPGPSCKSPS
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>--
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pF1KE4 PRWVKTVFLKLLPQVLLMRWPLDKTRGTGSDAVPRGLARRPAKGKLASHGE-------PR
::.:. : : : :::.. :
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. . : :.: . :: : : .. : . :: . ....::.::...:.
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pF1KE4 HNETKEVEDDWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAGLFLQPLLGNTGKS
.. :..::::::::.::.:::.:::::..::.:::: : :
NP_000 EDTDFSVKEDWKYVAMVIDRIFLWMFIIVCLLGTVGLFLPPWLAGMI
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>>XP_006716345 (OMIM: 118502,610353) PREDICTED: neuronal (529 aa)
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Smith-Waterman score: 1733; 53.9% identity (76.0% similar) in 484 aa overlap (22-488:47-525)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLTSKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRP
: . .: ::.:::..:: ::.. ::
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.. :: ::::::::: :.: : ::: : .: . :.::::.:::: .:.::::::.::
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:..::::::::::.::: . . ::..:.::..:: :..:.: .. ::.:: ::: :.:
XP_006 CKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVT
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:.: :::::.:::::::::::.:: :::::::::::::::.:::::::::::::::.:::
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:::::::.::.::::::::::::::::.::::::.:.:.:.:::::.::. ..: .:.
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360 370 380 390
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::: : :. . .. :: : .. .. . :.: :
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: : : . . : . : . .. ::... ....:..::....:.. . :..
XP_006 CSHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLL-----SPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKE
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460 470 480 490
pF1KE4 DWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAGLFLQPLLGNTGKS
::::::::.::.:::.::::: .:: :::: :.:
XP_006 DWKYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
500 510 520
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initn: 1766 init1: 1520 opt: 1522 Z-score: 1717.3 bits: 327.3 E(85289): 6.4e-89
Smith-Waterman score: 1733; 53.9% identity (76.0% similar) in 484 aa overlap (22-488:47-525)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLTSKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRP
: . .: ::.:::..:: ::.. ::
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: :.:: : :.: ..:.:: .::: ::.: ::.::.. :.::::::.: .. .: .::::
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pF1KE4 ADKIWKPDIVLYNNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQN
.. :: ::::::::: :.: : ::: : .: . :.::::.:::: .:.::::::.::
XP_011 SEMIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQN
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:..::::::::::.::: . . ::..:.::..:: :..:.: .. ::.:: ::: :.:
XP_011 CKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE4 YSFYIRRLPMFYTINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITE
:.: :::::.:::::::::::.:: :::::::::::::::.:::::::::::::::.:::
XP_011 YAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLITE
260 270 280 290 300 310
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pF1KE4 TIPSTSLVVPLVGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQ
:::::::.::.::::::::::::::::.::::::.:.:.:.:::::.::. ..: .:.
XP_011 IIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHTMPHWVRGALLGCVPR
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pF1KE4 VLLMRWP-------------LDKTRG---TGSDAVPRGLA-RRPAKGKLASHGEPRHLKE
::: : :. . .. :: : .. .. . :.: :
XP_011 WLLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSVGTL
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: : : . . : . : . .. ::... ....:..::....:.. . :..
XP_011 CSHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLL-----SPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKE
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460 470 480 490
pF1KE4 DWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAGLFLQPLLGNTGKS
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XP_011 DWKYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
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>>NP_000733 (OMIM: 118502,610353) neuronal acetylcholine (529 aa)
initn: 1766 init1: 1520 opt: 1522 Z-score: 1717.3 bits: 327.3 E(85289): 6.4e-89
Smith-Waterman score: 1733; 53.9% identity (76.0% similar) in 484 aa overlap (22-488:47-525)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLTSKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLFSHYNQFIRP
: . .: ::.:::..:: ::.. ::
NP_000 WWLLLTPAGGEEAKRPPPRAPGDPLSSPSPTALPQGGSHTETEDRLFKHLFRGYNRWARP
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pF1KE4 VENVSDPVTVHFEVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVP
: :.:: : :.: ..:.:: .::: ::.: ::.::.. :.::::::.: .. .: .::::
NP_000 VPNTSDVVIVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWLKQEWSDYKLRWNPTDFGNITSLRVP
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pF1KE4 ADKIWKPDIVLYNNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQN
.. :: ::::::::: :.: : ::: : .: . :.::::.:::: .:.::::::.::
NP_000 SEMIWIPDIVLYNNADGEFAVTHMTKAHLFSTGTVHWVPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQN
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pF1KE4 CSLKFGSWTYDKAEIDLLIIGSKVDMNDFWENSEWEIIDASGYKHDIKYNCCEEIYTDIT
:..::::::::::.::: . . ::..:.::..:: :..:.: .. ::.:: ::: :.:
NP_000 CKMKFGSWTYDKAKIDLEQMEQTVDLKDYWESGEWAIVNATGTYNSKKYDCCAEIYPDVT
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pF1KE4 YSFYIRRLPMFYTINLIIPCLFISFLTVLVFYLPSDCGEKVTLCISVLLSLTVFLLVITE
:.: :::::.:::::::::::.:: :::::::::::::::.:::::::::::::::.:::
NP_000 YAFVIRRLPLFYTINLIIPCLLISCLTVLVFYLPSDCGEKITLCISVLLSLTVFLLLITE
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300 310 320 330 340 350
pF1KE4 TIPSTSLVVPLVGEYLLFTMIFVTLSIVVTVFVLNIHYRTPTTHTMPRWVKTVFLKLLPQ
:::::::.::.::::::::::::::::.::::::.:.:.:.:::::.::. ..: .:.
NP_000 IIPSTSLVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPSTHTMPHWVRGALLGCVPR
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390
pF1KE4 VLLMRWP-------------LDKTRG---TGSDAVPRGLA-RRPAKGKLASHGEPRHLKE
::: : :. . .. :: : .. .. . :.: :
NP_000 WLLMNRPPPPVELCHPLRLKLSPSYHWLESNVDAEEREVVVEEEDRWACAGHVAPSVGTL
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 CFHCHKSNELATSKRRLSHQPLQWVVENSEHSPEVEDVINSVQFIAENMKSHNETKEVED
: : : . . : . : . .. ::... ....:..::....:.. . :..
NP_000 CSHGHLHSGASGPKAEALLQEGELLL-----SPHMQKALEGVHYIADHLRSEDADSSVKE
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490
pF1KE4 DWKYVAMVVDRVFLWVFIIVCVFGTAGLFLQPLLGNTGKS
::::::::.::.:::.::::: .:: :::: :.:
NP_000 DWKYVAMVIDRIFLWLFIIVCFLGTIGLFLPPFLAGMI
500 510 520
>>NP_000739 (OMIM: 118507,605375) neuronal acetylcholine (502 aa)
initn: 1484 init1: 624 opt: 1491 Z-score: 1682.7 bits: 320.9 E(85289): 5.5e-87
Smith-Waterman score: 1491; 48.1% identity (75.4% similar) in 468 aa overlap (27-490:22-485)
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pF1KE4 MLTSKGQGFLHGGLCLWLCVFTPFFKGCVGCATEERLFHKLF--SHYNQFIRPVENVSDP
: : ::::: ..:. :.::..:::. : :.
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10 20 30 40 50
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pF1KE4 VTVHFEVAITQLANVDEVNQIMETNLWLRHIWNDYKLRWDPMEYDGIETLRVPADKIWKP
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NP_000 VTVQLMVSLAQLISVHEREQIMTTNVWLTQEWEDYRLTWKPEEFDNMKKVRLPSKHIWLP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 DIVLYNNAVGDFQVEGKTKALLKYNGMITWTPPAIFKSSCPMDITFFPFDHQNCSLKFGS
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