Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4469
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4469, 490 aa
1>>>pF1KE4469 490 - 490 aa - 490 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0319+/-0.000832; mu= 19.4507+/- 0.050
mean_var=64.5559+/-13.042, 0's: 0 Z-trim(106.7): 80 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.159627
statistics sampled from 9071 (9153) to 9071 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 490) 3311 771.4 0
CCDS73166.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 420) 2820 658.3 4.7e-189
CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 ( 490) 2680 626.1 2.7e-179
CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 490) 2644 617.8 8.4e-177
CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 ( 490) 2635 615.7 3.5e-176
CCDS55721.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 388) 2563 599.1 2.9e-171
CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 ( 493) 1943 456.3 3.3e-128
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 1701 400.6 2e-111
CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 ( 494) 1698 399.9 3.2e-111
CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 ( 491) 1686 397.2 2.2e-110
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 1655 390.0 3.1e-108
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 1642 387.0 2.5e-107
CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 1401 331.5 1.3e-90
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 1278 303.2 4.3e-82
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 1244 295.4 9.7e-80
CCDS44460.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 431) 1200 285.2 9.7e-77
CCDS5319.2 CYP2W1 gene_id:54905|Hs108|chr7 ( 490) 1148 273.3 4.3e-73
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 1079 257.4 2.7e-68
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 1019 243.6 4.1e-64
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 876 210.6 2.9e-54
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 715 173.5 4.6e-43
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 676 164.6 2.3e-40
CCDS10268.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 ( 512) 647 157.9 2.4e-38
CCDS1793.1 CYP1B1 gene_id:1545|Hs108|chr2 ( 543) 640 156.3 7.7e-38
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 571 140.4 4.1e-33
CCDS32293.1 CYP1A2 gene_id:1544|Hs108|chr15 ( 516) 550 135.6 1.3e-31
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 498 123.6 5.1e-28
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 473 117.8 2.7e-26
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 455 113.7 4.9e-25
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 455 113.7 5.1e-25
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 451 112.7 9.2e-25
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 442 110.7 3.9e-24
CCDS81906.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 ( 483) 436 109.3 9.8e-24
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 387 98.0 2.6e-20
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 370 94.1 3.9e-19
CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 361 92.0 1.4e-18
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 ( 500) 344 88.1 2.4e-17
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 340 87.2 4.6e-17
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 334 85.8 1.2e-16
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 328 84.3 2.4e-16
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 325 83.7 4.1e-16
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 321 82.8 9.5e-16
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 309 80.1 6.7e-15
CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 297 77.3 4.5e-14
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 288 75.2 1.9e-13
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 287 75.0 2.2e-13
CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 ( 531) 287 75.0 2.2e-13
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 284 74.3 3.6e-13
CCDS10139.1 CYP19A1 gene_id:1588|Hs108|chr15 ( 503) 282 73.8 4.8e-13
CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 282 73.8 4.9e-13
>>CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 (490 aa)
initn: 3311 init1: 3311 opt: 3311 Z-score: 4117.8 bits: 771.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3311; 99.8% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRW
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YGPVFTVYFGMNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 RSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PSYQICFIPV
::::::::::
CCDS74 PSYQICFIPV
490
>>CCDS73166.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 (420 aa)
initn: 2820 init1: 2820 opt: 2820 Z-score: 3507.6 bits: 658.3 E(32554): 4.7e-189
Smith-Waterman score: 2820; 99.8% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (71-490:1-420)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 NMLQIDVKDICKSFTNFSKVYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNS
:::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS73 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 PISQRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PISQRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKS
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 DRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKE
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 FPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKS
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KE4 VDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 (490 aa)
initn: 2680 init1: 2680 opt: 2680 Z-score: 3332.4 bits: 626.1 E(32554): 2.7e-179
Smith-Waterman score: 2680; 78.2% identity (94.1% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSKV
:.:::::::::: .::.:.:::: : ::::::::::.:::.::::.::. ::.::.::.
CCDS74 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRW
::::::.:::.. .::.:::: ::::::: ::::::::. :...: ..:.::. ::::::
CCDS74 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALT
..::::::::::.::.::...:::.::...::::.::::: .:: :::::::.:::.:.
CCDS74 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 RSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTE
.: : ::::::: :.:.:::::::::::::::.::.::.:::.::::: :.:::. ::::
CCDS74 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSD
::::::::.::::::::::::::::::..::::.::::::::.:::::::::::.::: :
CCDS74 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFK
:.::..::::: :.:::::::::::::.. :::::::.::::::..::: ::::..::::
CCDS74 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLP
::.::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::. : :.:.:: :..:..:.:
CCDS74 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PSYQICFIPV
: ::.:::::
CCDS74 PFYQLCFIPV
490
>>CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 (490 aa)
initn: 2644 init1: 2644 opt: 2644 Z-score: 3287.6 bits: 617.8 E(32554): 8.4e-177
Smith-Waterman score: 2644; 76.9% identity (92.4% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSKV
:.: :.:::::: ..:.:::::: : .:: ::::::::::.::.::::. ::.::::::
CCDS74 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRW
::::::::::..::::.::::.:::::::.::::::::. :......:::::. ::::::
CCDS74 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::: : ::::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS74 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALT
:.:. ::::::: ::.::..::::.:::.::::::::::: ::: .::.:::. .: :
CCDS74 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 RSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTE
.::. :..:::: :::.:. ::::::::::::::: ::.:::..:.:..::.:.: ::::
CCDS74 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSD
:::::::::::::::.:::::::::::. :.::.:::::::::::::::::::::::: :
CCDS74 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFK
:.::..::::: :.::.::::::::::.. ::::::.:::::::..:::::::::.::::
CCDS74 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLP
:::::::::::::.: :::::::::::::::::::::::: : :... : ..... .:
CCDS74 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PSYQICFIPV
: ::.:::::
CCDS74 PLYQLCFIPV
490
>>CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 (490 aa)
initn: 2635 init1: 2635 opt: 2635 Z-score: 3276.4 bits: 615.7 E(32554): 3.5e-176
Smith-Waterman score: 2635; 77.8% identity (92.9% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSKV
:. .:::::::: .::.:::::: : ::::::::::.:::.::: .::: ::.::.:::
CCDS74 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRW
::::::.:::..::::.::::.::::::: :::::::: :...: ..:.::. ::::.:
CCDS74 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALT
..:.::::::::.::.::...:::..::.:::::.:::: .:: :::::::.:::::.
CCDS74 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 RSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTE
.::: ::::::: :.:.:::.:::::::.:::.:: :: :::.::.: .:..::: ::::
CCDS74 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSD
::::::::.::::::::::::::::::..::::.::::::::::::::::::::.::: :
CCDS74 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFK
:.::..::::: : :::::::::::::. :::::::.::::::..::: ::::..::::
CCDS74 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLP
:: ::::::::::::.::.:: ::::::::.:::::::::. : :::.:: :..:..:.:
CCDS74 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PSYQICFIPV
: ::.:::::
CCDS74 PFYQLCFIPV
490
>>CCDS55721.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 (388 aa)
initn: 2562 init1: 2562 opt: 2563 Z-score: 3188.3 bits: 599.1 E(32554): 2.9e-171
Smith-Waterman score: 2563; 99.0% identity (99.2% similar) in 387 aa overlap (104-490:4-388)
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 IVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRN
: :.:: ::::::::::::::::::::::
CCDS55 MFLQPIAKG--IISSNGKRWKEIRRFSLTTLRN
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 FGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQN
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 FLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQA
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 SLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 LKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTD
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 TKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKR
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 ICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
340 350 360 370 380
>>CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 (493 aa)
initn: 1943 init1: 1592 opt: 1943 Z-score: 2415.1 bits: 456.3 E(32554): 3.3e-128
Smith-Waterman score: 1943; 56.9% identity (82.5% similar) in 485 aa overlap (5-489:8-491)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNF
:.:.. .:.:: :.::: .::::: :::::::..:...:.: :::: .
CCDS76 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 SKVYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNG
.. .:::::.: : . .::.:::..:::::.: .::::::. : . . . ::: .::
CCDS76 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLP-AFHAHRDRGIIFNNG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNV
::.:::::::::::.::::.. :.:.:.::: :.: ::::...: ::::..:::::::
CCDS76 PTWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNV
: ...:.:.:::.:..:: :: :::::..:..::.:. :::: .. .::.: ::.:::
CCDS76 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVA
: .. :. :.::::. ::: : :::. ::.:..::.:: . . ....... :::::: :
CCDS76 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQR
::::::::::::::.:.:.::. :..::::.::: : : ..::..::: :::::::::
CCDS76 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 YSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNG
. :::...:: .: :: ::.:::::::... : :::.:..:::.:. : : :::..::
CCDS76 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 NFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIV
.:: :::: :::.:::.:::::::::::::.: .:::.:::: . : :... . . :.
CCDS76 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARMELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE4 SLPPSYQICFIPV
.:: :..: ::
CCDS76 CIPPRYKLCVIPRS
480 490
>>CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 (491 aa)
initn: 1710 init1: 1687 opt: 1701 Z-score: 2114.0 bits: 400.6 E(32554): 2e-111
Smith-Waterman score: 1701; 50.2% identity (78.2% similar) in 490 aa overlap (1-489:1-490)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEPFVVLVLCL-SFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSK
:: :.: : : . .::. . :. . .::::: :::..::.::.: . . ::: : .
CCDS12 MELSVLLFLALLTGLLLLLVQRHPNTHDRLPPGPRPLPLLGNLLQMDRRGLLKSFLRFRE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 VYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKR
:: ::::..: :.:.. : :...:::.:..: :::::. . . . .: :.: .::.:
CCDS12 KYGDVFTVHLGPRPVVMLCGVEAIREALVDKAEAFSGRGKIAMVDPFFRGYGVIFANGNR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 WKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVIC
:: .::::.::.:.:::::::.:.:.::::.::.:::::.:.. ::::.. :.::
CCDS12 WKVLRRFSVTTMRDFGMGKRSVEERIQEEAQCLIEELRKSKGALMDPTFLFQSITANIIC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVAL
:.:: ::: :.::.:: ... : ..: ...: . :. . : .. :::.: .: ::.
CCDS12 SIVFGKRFHYQDQEFLKMLNLFYQTFSLISSVFGQLFELFSGFLKYFPGAHRQVYKNLQE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGT
.:: ..:..:. .:: . :.:.:: .:..::.::.: .:::. .:: .. .:: :::
CCDS12 INAYIGHSVEKHRETLDPSAPKDLIDTYLLHMEKEKSNAHSEFSHQNLNLNTLSLFFAGT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 ETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYS
::::::::::.::.::.:.:. .: .::..::: :: : ..::..::::.::..::::.:
CCDS12 ETTSTTLRYGFLLMLKYPHVAERVYREIEQVIGPHRPPELHDRAKMPYTEAVIYEIQRFS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 DLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNF
::.: :::: :: :.::.:.::: : .. .:...::: . : .:. :.: :::: :: .
CCDS12 DLLPMGVPHIVTQHTSFRGYIIPKDTEVFLILSTALHDPHYFEKPDAFNPDHFLDANGAL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 KKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSL
::.. :.::: ::::: :::.:: :::::.:::::::.. : .... : :. ..
CCDS12 KKTEAFIPFSLGKRICLGEGIARAELFLFFTTILQNFSMASPVAPEDIDLTPQECGVGKI
430 440 450 460 470 480
480 490
pF1KE4 PPSYQICFIPV
::.::: :.:
CCDS12 PPTYQIRFLPR
490
>>CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 (494 aa)
initn: 1652 init1: 1652 opt: 1698 Z-score: 2110.2 bits: 399.9 E(32554): 3.2e-111
Smith-Waterman score: 1698; 51.0% identity (81.3% similar) in 486 aa overlap (4-489:8-493)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTN
.:.:. ::. :.:.:.::: : ::::::::::.:::.::...... .:. .
CCDS12 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 FSKVYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSN
.:. ::::::...: .::. :...:::::.:..:::::::.. . . :: :. ::
CCDS12 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 GKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCN
:.: :..::::..:::.::.:::.::.:.:::: :.. :: :... ::::.:. . :
CCDS12 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKN
:: :.:: ::::.:..::.:.. . .:.. . :. . : .. .:: .....:.
CCDS12 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFV
. ...: .::...: .:: :.:::::: :::.:..:. : ..:: ..::: :. .::
CCDS12 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQ
:::::.:::::::.:::.::::: :::.::::.:::..:.: ..::..::::.::.::::
CCDS12 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 RYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKN
:..:..: :. : :. :::::....:::: .. .: :::.: . : :: :.: :::::.
CCDS12 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGI
:.::::: :.::: ::: : ::::::::::::.:::.::: .:: .. :..... :.
CCDS12 GQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGF
430 440 450 460 470 480
480 490
pF1KE4 VSLPPSYQICFIPV
...: .: . :.:
CCDS12 ATIPRNYTMSFLPR
490
>>CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 (491 aa)
initn: 1672 init1: 1672 opt: 1686 Z-score: 2095.3 bits: 397.2 E(32554): 2.2e-110
Smith-Waterman score: 1686; 50.0% identity (78.4% similar) in 490 aa overlap (1-489:1-490)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRR-KLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSK
:. . . .: : . :. : : : . :::::: :: :.::.: . .:. :.:..::
CCDS12 MDSISTAILLLLLALVCLLLTLSSRDKGKLPPGPRPLSILGNLLLLCSQDMLTSLTKLSK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 VYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYESVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKR
:: ..::..: .::. ::..:::::.:.::::::::. : .::: :: :.: :
CCDS12 EYGSMYTVHLGPRRVVVLSGYQAVKEALVDQGEEFSGRGDYPAFFNFTKGNGIAFSSGDR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 WKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVIC
:: .:.::. ::::::::::::.:. ::. :. :::::.. : ::::.:. . :.::
CCDS12 WKVLRQFSIQILRNFGMGKRSIEERILEEGSFLLAELRKTEGEPFDPTFVLSRSVSNIIC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVAL
::.: .:::: :. .::... .:.::.:..::: .. . :: :.: :: :.....:
CCDS12 SVLFGSRFDYDDERLLTIIRLINDNFQIMSSPWGELYDIFPSLLDWVPGPHQRIFQNFKC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGT
:. : ..:..:::::: .:::::.::: :: .::.. :.:....:. :. .:. .::
CCDS12 LRDLIAHSVHDHQASLDPRSPRDFIQCFLTKMAEEKEDPLSHFHMDTLLMTTHNLLFGGT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 ETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYS
.:.::::....: :.:.:.: :.:::::: :.:: : : ..::. :::::::.::.::..
CCDS12 KTVSTTLHHAFLALMKYPKVQARVQEEIDLVVGRARLPALKDRAAMPYTDAVIHEVQRFA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 DLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNF
:..: ..:: :: :: ::..:::::: ...::..: .: ..: .:. :.: :::: : .:
CCDS12 DIIPMNLPHRVTRDTAFRGFLIPKGTDVITLLNTVHYDPSQFLTPQEFNPEHFLDANQSF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 KKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSL
::: :::::::.:.: ::.::::::::.::.:::.:.:. . .... : ...:. .:
CCDS12 KKSPAFMPFSAGRRLCLGESLARMELFLYLTAILQSFSLQPLGAPEDIDLTPLSSGLGNL
430 440 450 460 470 480
480 490
pF1KE4 PPSYQICFIPV
: .:.:. :
CCDS12 PRPFQLCLRPR
490
490 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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