Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4468
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4468, 490 aa
1>>>pF1KE4468 490 - 490 aa - 490 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8112+/-0.000381; mu= 20.4410+/- 0.024
mean_var=64.1205+/-12.863, 0's: 0 Z-trim(112.2): 184 B-trim: 1209 in 1/49
Lambda= 0.160168
statistics sampled from 20863 (21055) to 20863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 7.600
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 3318 775.8 0
XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 2841 665.6 8.9e-191
NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 2841 665.6 8.9e-191
NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 2841 665.6 8.9e-191
NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 2648 621.0 2.4e-177
NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 2282 536.4 6e-152
NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 2282 536.4 6e-152
NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 2078 489.2 8.8e-138
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 1997 470.6 4.6e-132
NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 1746 412.6 1.3e-114
XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 1746 412.6 1.5e-114
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 1709 404.0 4.9e-112
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 1691 399.9 8.8e-111
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 1677 396.6 8.3e-110
NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 1656 391.8 2.4e-108
XP_011524853 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1516 359.4 1.3e-98
XP_011524854 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1516 359.4 1.3e-98
XP_016881873 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 573) 1516 359.5 1.5e-98
NP_001122397 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 i ( 431) 1466 347.8 3.5e-95
XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 1431 339.8 1e-92
NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 1428 339.1 1.8e-92
XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 1354 321.9 2.2e-87
XP_005258626 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 422) 1292 307.6 4.4e-83
XP_011524849 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 386) 1276 303.9 5.4e-82
XP_011524848 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 416) 1276 303.9 5.7e-82
NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 1271 302.8 1.3e-81
NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 1230 293.3 1e-78
NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 1180 281.8 3.1e-75
XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 491) 1158 276.7 1e-73
XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 1158 276.7 1.1e-73
NP_060251 (OMIM: 615967) cytochrome P450 2W1 precu ( 490) 1144 273.5 9.8e-73
XP_011513743 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 475) 1089 260.7 6.4e-69
XP_011513742 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 564) 1088 260.6 8.6e-69
XP_011524855 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 456) 1060 254.0 6.5e-67
NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 1037 248.7 2.8e-65
NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 1009 242.3 2.6e-63
XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 997 239.3 1.1e-62
XP_011524857 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 415) 994 238.7 2.3e-62
XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 955 229.8 1.3e-59
XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 951 228.8 2.4e-59
XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 951 228.8 2.5e-59
XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 889 214.6 6e-55
XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 859 207.5 5.4e-53
XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 859 207.5 5.4e-53
XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 859 207.5 5.4e-53
XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 859 207.5 5.4e-53
XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 859 207.5 5.4e-53
XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 859 207.5 5.4e-53
XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 859 207.5 5.4e-53
XP_016881872 (OMIM: 608054) PREDICTED: cytochrome ( 293) 831 201.0 3.9e-51
>>NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isoform (490 aa)
initn: 3318 init1: 3318 opt: 3318 Z-score: 4141.8 bits: 775.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3318; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PLYQLCFIPV
::::::::::
NP_000 PLYQLCFIPV
490
>>XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cytochro (490 aa)
initn: 2841 init1: 2841 opt: 2841 Z-score: 3546.1 bits: 665.6 E(85289): 8.9e-191
Smith-Waterman score: 2841; 81.8% identity (95.1% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
:: :.::::::::.::::::::::::.:: ::::::.::::::. .::.::::::.:::
XP_016 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::: ::.::..:.:.::.:::::.:
XP_016 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
.::: :::::::.:::::::.:::..::::::::.:::: .:::.::.:::. .: :..
XP_016 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
:::.::..::::::.:::. .:::::::.:::.::::: ::::.::: :..:.::::::
XP_016 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
::::::::.::::::.:::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::.:::::
XP_016 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
::::.::::::::.::.::::::::::. :::::::..::::::::::: ::::..::::
XP_016 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
:: ::::::::::.:.::.:: ::::::::.::::::::: ::::..: ::..:.:. ::
XP_016 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PLYQLCFIPV
:.::::::::
XP_016 PFYQLCFIPV
490
>>NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C9 pr (490 aa)
initn: 2841 init1: 2841 opt: 2841 Z-score: 3546.1 bits: 665.6 E(85289): 8.9e-191
Smith-Waterman score: 2841; 81.8% identity (95.1% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
:: :.::::::::.::::::::::::.:: ::::::.::::::. .::.::::::.:::
NP_000 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::: ::.::..:.:.::.:::::.:
NP_000 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
.::: :::::::.:::::::.:::..::::::::.:::: .:::.::.:::. .: :..
NP_000 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
:::.::..::::::.:::. .:::::::.:::.::::: ::::.::: :..:.::::::
NP_000 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
::::::::.::::::.:::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::.:::::
NP_000 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
::::.::::::::.::.::::::::::. :::::::..::::::::::: ::::..::::
NP_000 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
:: ::::::::::.:.::.:: ::::::::.::::::::: ::::..: ::..:.:. ::
NP_000 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PLYQLCFIPV
:.::::::::
NP_000 PFYQLCFIPV
490
>>NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C19 p (490 aa)
initn: 2841 init1: 2841 opt: 2841 Z-score: 3546.1 bits: 665.6 E(85289): 8.9e-191
Smith-Waterman score: 2841; 80.8% identity (96.5% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
::: :.::::::::.:::.::::::::.:: ::::::.::::::.:.::.::::::.::.
NP_000 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
::::::.::::. .:::::::.::::::: :::::::: ::.::..:.:.::.:::::::
NP_000 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
.::. :::::::.:::::::.:::.::.:.::::.:::::..:::.::.:::. .:.:..
NP_000 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
.: .::..::::::.:.:. ::::::::::::.::.:::::::.:.:. :..:..:::::
NP_000 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
::::::::.::::::.:::::::::::: :.:::::::::::.:::::::::::.:::::
NP_000 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
:.::.:::::::::::.::::::::::.::::::::..::::::::::: ::::..::::
NP_000 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
::.::::::::::.:.:::::::::::::: ::::::::: .::::.: ::..:.:. ::
NP_000 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PLYQLCFIPV
:.::::::::
NP_000 PFYQLCFIPV
490
>>NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isoform a (490 aa)
initn: 2648 init1: 2648 opt: 2648 Z-score: 3305.0 bits: 621.0 E(85289): 2.4e-177
Smith-Waterman score: 2648; 77.1% identity (92.4% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
:.: :.:::::: ..:.:::::: : .:: ::::::::::.::.::::. ::.::::::
NP_000 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
::::::::::..::::.::::::::::::.::::::::. :......:::::. ::::::
NP_000 YGPVFTVYFGMNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::: : ::::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
:.:. ::::::: ::.::..::::.:::.::::::::::: ::: .::.:::. .: :
NP_000 VVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
.::. :..:::: :::.:. ::::::::::::::: ::.:::..:.:..::.:.: ::::
NP_000 RSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
:::::::::::::::.:::::::::::. :.::.:::::::::::::::::::::::: :
NP_000 TTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
:.::..::::: :.::.::::::::::.. ::::::.:::::::..:::::::::.::::
NP_000 LVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
:::::::::::::.: :::::::::::::::::::::::: : :... : ..... .:
NP_000 KSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE4 PLYQLCFIPV
: ::.:::::
NP_000 PSYQICFIPV
490
>>NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (420 aa)
initn: 2282 init1: 2282 opt: 2282 Z-score: 2848.9 bits: 536.4 E(85289): 6e-152
Smith-Waterman score: 2282; 77.4% identity (92.9% similar) in 420 aa overlap (71-490:1-420)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 NILQLDVKDMSKSLTNFSKVYGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSF
..::::.::::::::::::.::::::::.
NP_001 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 PVAEKVNKGLGILFSNGKRWKEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTN
:......:::::. :::::::::::: : ::::::::::::::::::::.:::::::::.
NP_001 PISQRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ASPCDPTFILGCAPCNVICSVIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFP
:::::::::::::::::::::.:. ::::::: ::.::..::::.:::.:::::::::::
NP_001 ASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 ALIDYLPGSHNKIAENFAYIKSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQS
::: .::.:::. .: : .::. :..:::: :::.:. ::::::::::::::: ::.:
NP_001 LLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKS
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EFTVESLIATVTDMFGAGTETTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQ
::..:.:..::.:.: :::::::::::::::::::.:::::::::::. :.::.::::::
NP_001 EFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 DRSHMPYTDAVVHEIQRYIDLLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKE
:::::::::::::::::: ::.::..::::: :.::.::::::::::.. ::::::.:::
NP_001 DRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKE
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 FPNPEMFDPGHFLDKSGNFKKSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKS
::::..:::::::::.:::::::::::::::::.: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKS
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KE4 QVDPKDIDITPIANAFGRVPPLYQLCFIPV
: :... : ..... .:: ::.:::::
NP_001 VDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (420 aa)
initn: 2282 init1: 2282 opt: 2282 Z-score: 2848.9 bits: 536.4 E(85289): 6e-152
Smith-Waterman score: 2282; 77.4% identity (92.9% similar) in 420 aa overlap (71-490:1-420)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 NILQLDVKDMSKSLTNFSKVYGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSF
..::::.::::::::::::.::::::::.
NP_001 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 PVAEKVNKGLGILFSNGKRWKEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTN
:......:::::. :::::::::::: : ::::::::::::::::::::.:::::::::.
NP_001 PISQRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ASPCDPTFILGCAPCNVICSVIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFP
:::::::::::::::::::::.:. ::::::: ::.::..::::.:::.:::::::::::
NP_001 ASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFP
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 ALIDYLPGSHNKIAENFAYIKSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQS
::: .::.:::. .: : .::. :..:::: :::.:. ::::::::::::::: ::.:
NP_001 LLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKS
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EFTVESLIATVTDMFGAGTETTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQ
::..:.:..::.:.: :::::::::::::::::::.:::::::::::. :.::.::::::
NP_001 EFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQ
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 DRSHMPYTDAVVHEIQRYIDLLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKE
:::::::::::::::::: ::.::..::::: :.::.::::::::::.. ::::::.:::
NP_001 DRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKE
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 FPNPEMFDPGHFLDKSGNFKKSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKS
::::..:::::::::.:::::::::::::::::.: ::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKS
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KE4 QVDPKDIDITPIANAFGRVPPLYQLCFIPV
: :... : ..... .:: ::.:::::
NP_001 VDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (388 aa)
initn: 2078 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 2594.6 bits: 489.2 E(85289): 8.8e-138
Smith-Waterman score: 2078; 78.2% identity (92.4% similar) in 380 aa overlap (111-490:9-388)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 EAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRWKEIRRFCLMTLRNFGMGKRS
::. :::::::::::: : :::::::::::
NP_001 MFLQPIAKGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRS
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 IEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICSVIFHDRFDYKDQRFLNLMEK
:::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::.:. ::::::: ::.::..
NP_001 IEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKR
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 FNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYIKSYVLERIKEHQESLDMNSA
::::.:::.::::::::::: ::: .::.:::. .: : .::. :..:::: :::.:.
NP_001 FNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNP
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 RDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTETTSTTLRYGLLLLLKYPEVT
::::::::::::::: ::.:::..:.:..::.:.: :::::::::::::::::::.::::
NP_001 RDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVT
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 AKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYIDLLPTNLPHAVTCDVKFKNYL
:::::::. :.::.:::::::::::::::::::::::: ::.::..::::: :.::.:::
NP_001 AKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYL
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 IPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFKKSDYFMPFSAGKRMCMGEGL
:::::::.. ::::::.:::::::..:::::::::.:::::::::::::::::.: ::::
NP_001 IPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGL
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490
pF1KE4 ARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVPPLYQLCFIPV
:::::::::::::::::::: : :... : ..... .:: ::.:::::
NP_001 ARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
340 350 360 370 380
>>NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precursor (493 aa)
initn: 1995 init1: 1644 opt: 1997 Z-score: 2492.0 bits: 470.6 E(85289): 4.6e-132
Smith-Waterman score: 1997; 57.5% identity (83.9% similar) in 485 aa overlap (5-489:8-491)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNF
:::.. . :.:.:.::: . :: :: :::::::..::..:.. ::.: .
NP_000 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 SKVYGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNG
.. .:::::.: : . .::.:::.::::::.:. .::::::..: : .... ::.:.::
NP_000 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLP-AFHAHRDRGIIFNNG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KRWKEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNV
::.:::: : ::::.::::.. :.:.:.::. :.: ::::...: ::::..:::::::
NP_000 PTWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ICSVIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENF
: ...:. .:::.:..:: :: ::::...::.::.:. ::::... :::::: :. .:
NP_000 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 AYIKSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGA
: .: :: ::.:::..::: : ::. ::.:..::.:::. . .:.... .::.:.: :
NP_000 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GTETTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQR
::::::::::::::.:.::::. :..:::. :.: .: : ..::..::: :::::::::
NP_000 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 YIDLLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSG
.: :.:.:::: .: :. :..:::::::... .: :::....:::.:: : : :::...:
NP_000 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 NFKKSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFG
.:: :::: :::.:::.: :::::::::::.: .:::.:::: :::::::..:: .::
NP_000 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARMELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KE4 RVPPLYQLCFIPV
.:: :.:: ::
NP_000 CIPPRYKLCVIPRS
480 490
>>NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precursor (491 aa)
initn: 1731 init1: 1707 opt: 1746 Z-score: 2178.6 bits: 412.6 E(85289): 1.3e-114
Smith-Waterman score: 1746; 52.2% identity (80.5% similar) in 483 aa overlap (7-489:11-490)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTN
:.: : :: ::.: .: .:.:: :: :: :.::.: : .:: :::.
NP_000 MDSISTAILLLLLALVCL-LLTL--SSRDKGKLPPGPRPLSILGNLLLLCSQDMLTSLTK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 FSKVYGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSN
.:: :: ..::..: . .::: ::.::::::.:.::::::::..:. . .:: :: ::.
NP_000 LSKEYGSMYTVHLGPRRVVVLSGYQAVKEALVDQGEEFSGRGDYPAFFNFTKGNGIAFSS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 GKRWKEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCN
: ::: .:.: .. ::::::::::::.:. ::. :. :::::.. : ::::.:. . :
NP_000 GDRWKVLRQFSIQILRNFGMGKRSIEERILEEGSFLLAELRKTEGEPFDPTFVLSRSVSN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VICSVIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAEN
.::::.: .:::: :.:.:.... .:.:..:.:::: .. . ::.:.:..:: :..: .:
NP_000 IICSVLFGSRFDYDDERLLTIIRLINDNFQIMSSPWGELYDIFPSLLDWVPGPHQRIFQN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FAYIKSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFG
: ... . . ...:: ::: : ::::.::: :: .::.. :.: ...:. :. ...
NP_000 FKCLRDLIAHSVHDHQASLDPRSPRDFIQCFLTKMAEEKEDPLSHFHMDTLLMTTHNLLF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AGTETTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQ
.::.:.::::....: :.:::.: :.:::::. :::: : : ..::. :::::::.::.:
NP_000 GGTKTVSTTLHHAFLALMKYPKVQARVQEEIDLVVGRARLPALKDRAAMPYTDAVIHEVQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 RYIDLLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKS
:. :..: :::: :: :. :...:::::: .:: :..: .. ..: .:. :.: :::: .
NP_000 RFADIIPMNLPHRVTRDTAFRGFLIPKGTDVITLLNTVHYDPSQFLTPQEFNPEHFLDAN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
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: .: .:::. :
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