Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4453
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4453, 473 aa
1>>>pF1KE4453 473 - 473 aa - 473 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1806+/-0.00139; mu= 2.0084+/- 0.084
mean_var=301.4740+/-60.165, 0's: 0 Z-trim(110.1): 126 B-trim: 99 in 1/50
Lambda= 0.073867
statistics sampled from 11240 (11362) to 11240 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 3032 337.0 2.6e-92
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 2569 287.7 1.9e-77
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1845 210.5 3.1e-54
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1843 210.2 3.4e-54
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1803 206.0 6.8e-53
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1770 202.5 7.4e-52
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1640 188.8 1.4e-47
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1565 180.6 2.7e-45
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1557 179.8 5.6e-45
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1465 170.1 5.8e-42
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1432 166.5 6e-41
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1383 161.3 2e-39
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1350 157.7 2.3e-38
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1343 157.0 3.8e-38
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1340 156.7 4.9e-38
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1311 153.6 4.2e-37
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1279 150.2 4.4e-36
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1222 144.0 2.8e-34
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1213 143.1 5.3e-34
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1206 142.3 8.9e-34
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1205 142.2 9.9e-34
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1190 140.7 3.1e-33
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1181 139.7 5.9e-33
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1110 132.1 1.1e-30
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 1086 129.6 6.6e-30
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 1046 125.3 1.2e-28
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 1036 124.3 2.7e-28
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 1027 123.3 5.6e-28
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 1016 122.1 1.2e-27
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 765 95.2 9.8e-20
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 681 86.6 8.4e-17
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 672 85.8 2.1e-16
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 657 83.9 3.8e-16
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 655 83.6 4.4e-16
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 653 83.4 5.1e-16
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 654 83.6 5.6e-16
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 653 83.5 5.6e-16
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 647 82.9 9.3e-16
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 638 81.9 1.7e-15
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 638 81.9 1.7e-15
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 633 81.3 2.4e-15
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 632 81.3 3e-15
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 630 81.1 3.3e-15
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 629 81.0 3.6e-15
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 627 80.7 3.7e-15
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 625 80.6 4.8e-15
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 615 79.6 1.1e-14
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 596 77.4 3.6e-14
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 593 77.1 4.8e-14
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 593 77.1 4.9e-14
>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa)
initn: 3032 init1: 3032 opt: 3032 Z-score: 1770.7 bits: 337.0 E(32554): 2.6e-92
Smith-Waterman score: 3032; 100.0% identity (100.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 MQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKIIA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 IEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE4 LEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
430 440 450 460 470
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 2065 init1: 2065 opt: 2569 Z-score: 1504.1 bits: 287.7 E(32554): 1.9e-77
Smith-Waterman score: 2569; 87.6% identity (95.4% similar) in 458 aa overlap (1-456:1-449)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSS-RFSSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GACGLGGGYGGGFSSSSS-FGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEK
:::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGG----FGGGFAGGDGLLVGSEK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 VTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLE
..::..::. .:::::::::::::::::: :: ::..::::.::::::::::::::.:::
CCDS11 LTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 MQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAE
::::.::::::::.::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 MQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLE
:::.::: ::..::::::.:::.:::::::..::..::::..:.::::::::::::::::
CCDS11 KNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYR
::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::
CCDS11 NSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 RLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
::::::::::::.: :. : :::.: .::::: :
CCDS11 RLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDV-----TSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTK
420 430 440 450 460 470
CCDS11 N
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 1786 init1: 1368 opt: 1845 Z-score: 1087.3 bits: 210.5 E(32554): 3.1e-54
Smith-Waterman score: 1845; 69.2% identity (86.9% similar) in 428 aa overlap (25-440:14-433)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGG-----LSVSS-
::::.: .:.::::. . .. .:: .:.::
CCDS11 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDG-LL
:: :.:. :::::::. ::::: :. .:.:::::.:.::::::.:::: ::
CCDS11 RFVSSGS---GGGYGGGMRVC-----GFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIK-DYSPYFKTIE
:.::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: :. . ::: ::::::
CCDS11 SGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTL
.::.::.:.::.:.. ::.:::::::::::: :::.:::::: ::::.::::::::::::
CCDS11 ELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQ
::::::::::::.::::::.::::::: . .: .:.:::::::::::::.:.: :::.:
CCDS11 ARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 YEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLS
:: ::::::::.:.::.:::::::::::::.:..:.:..:.:.:::..: ::::::::::
CCDS11 YEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 MKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQ
:::.::::: ::. :: ::.:::::::..: ::..:::::: :.:::..:::.::::::
CCDS11 MKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQ
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE4 EIATYRRLLEGEDAHLSS----QQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFS
:::::: ::::.::.... . .:: . ::
CCDS11 EIATYRSLLEGQDAKMAGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
410 420 430 440 450
470
pF1KE4 QGQSS
>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 2010 init1: 1803 opt: 1843 Z-score: 1086.4 bits: 210.2 E(32554): 3.4e-54
Smith-Waterman score: 1904; 70.2% identity (84.8% similar) in 446 aa overlap (1-445:1-410)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
::: ::::::::.::: :.::: . : :.:. :..:::: :.
CCDS11 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL----------------GS
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE4 ACGLGGGYGGG-FSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
: :::. ::. .:: ::::: ::::...: : ::::.:.::.
CCDS11 AGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--GGYGSSFG----------------GVDGLLAGGEKA
50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
:::::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.:::.
CCDS11 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKIL
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
.::..::. .::::::::::::::::.: : ::: .::::.::::::::::::::.::::
CCDS11 TATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEM
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
:::.::::::::.::::::: :::::.::..::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS11 QIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
::.::: ::.:::::::.:::.:::::::..::..::::..:.::::::::::::::::.
CCDS11 NRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEG
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
.: ::..:::.::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::
CCDS11 NLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRR
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
:::::::::. : . . ..:.: :
CCDS11 LLEGEDAHLT--QYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
390 400 410 420 430
>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (458 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
: . :::.:::: . :.:: :. :: :.:: :::
CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQ----LGGG--RGVST------CSTRFVSGG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE4 -ACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGG--------DG
: : ::: . ::.... :::::::::::::.:.:::::.::::::::: :
CCDS11 SAGGYGGGVSCGFGGGA--GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRP-SEIKDYSPYFKT
::.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::. .: : : .:::::.::
CCDS11 LLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKT
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDEL
::.::.::..::::: . ::.:::::::::::: :::.::::::.::::.::::::::::
CCDS11 IEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDEL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMR
::..::::::::.:.:::::..::::::: . .:. :.:::::::.::.::.:.: :::
CCDS11 TLSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMR
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQ
.::: :::.:::::: :: .:. ::::::..:. ..:.:..:.:::::.:::::::::::
CCDS11 EQYEAMAERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRL
:::::.:::.. ::. :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: :.:::..:::.::::
CCDS11 LSMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 EQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQG
:::::::: ::::.::.. . .:. : : : . ....::.: :
CCDS11 EQEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 QSS
>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (420 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
: . :::.:::: . :.:: :. :: :.:: :::
CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQ----LGGG--RGVST------CSTRFVSGG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE4 -ACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGG--------DG
: : ::: . ::.... :::::::::::::.:.:::::.::::::::: :
CCDS11 SAGGYGGGVSCGFGGGA--GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGG
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRP-SEIKDYSPYFKT
::.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::. .: : : .:::::.::
CCDS11 LLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKT
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 IEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDEL
::.::.::..::::: . ::.:::::::::::: :::.::::::.::::.::::::::::
CCDS11 IEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDEL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMR
::..::::::::.:.:::::..::::::: . .:. :.:::::::.::.::.:.: :::
CCDS11 TLSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMR
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 DQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQ
.::: :::.:::::: :: .:. ::::::..:. ..:.:..:.:::::.:::::::::::
CCDS11 EQYEAMAERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRL
:::::.:::.. ::. :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: :.:::..:::.::::
CCDS11 LSMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 EQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQG
:::::::: ::::.::
CCDS11 EQEIATYRSLLEGQDAKKRQPP
400 410 420
>>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 (584 aa)
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10 20 30
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIG---GGIGGGS-SRISSVLAG
:: ::: : : ::..::: :: :: :
CCDS11 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 GSCRAPST--YGG--GLSVSSRFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAG
:.: . :. ::: :.. .: .: :. ..::.::: :...: :..:::: :: : :
CCDS11 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGGSFGGGGFG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 FGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWY
:::.:.::::::.: ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::..::
CCDS11 -GGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWY
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 QRQRPS---EIKDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHEL
... : : .::: :.:::.::.:.:. : .::. .:::::::::::::: :::.:.
CCDS11 EKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 ALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDV
::::.::::.::::::::::::...:::::::.: ::::::.::::::: ::. . :::
CCDS11 ALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 NVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSR
::::.:::::::...::.::.::::.::.::.:::.:: :..::. :. .: : ..: .
CCDS11 NVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 SEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLR
::.::::: .:.:::::::::..: ::: :: ::.::::.::::::. :...:::: :.:
CCDS11 SEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIR
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 CEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSS
: : :. ::: :::.: :::.:: ::: ::::: . .. ...: :... ::...
CCDS11 AETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGG-SFGGGYGGGSSGGG
430 440 450 460 470 480
460 470
pF1KE4 SSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
::
CCDS11 SSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGGG
490 500 510 520 530 540
>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 (400 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE4 MTTCS-RQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSG
::. : :: ...::. ::.:::: :.. : . :::: .::.
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFG---PGVAFRAPSIHGGS----------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
:: : . ::. .:. .:.:::: .:: ....::::.:.::.
CCDS11 ------GGRGVSVSSARFVSSSSSGAYGGG------------YGGVLTASDGLLAGNEKL
50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.::.
CCDS11 TMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKIL
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
.:::::.. .::::::::::::::::.: : :::..::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 GATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEM
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
::::::::::::.::::::. .::::.::.:.::.:.:::.::..::..::.::: :::.
CCDS11 QIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQ
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
::.:::.:: :.:::::.:::...: .: ::::::.:::.::::::::::::::::.::.
CCDS11 NRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALED
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
.: ::..:. ::..::.::...: ::...: . :.:.:::: :.:.:.::::::::::
CCDS11 TLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRS
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
::::.. : .. .::
CCDS11 LLEGQEDHYNNLSASKVL
390 400
>>CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 (494 aa)
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10 20 30 40
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSM---KG--SCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRA
::...:.: . .: . ..:.: :: :. :.::
CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGG-----SAFGFGASC--
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 PSTYGGGLSVSSRFSSGGACGLGGGYGGGFSSS--SSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGA
:::.:..: : :.. :.::: :...... ...: ..::: :::: ::::. :.
CCDS11 ----GGGFSAASMF--GSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGG
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KE4 GFGGGFAGGDG-LLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPS
: : ..:.:: :: :::: :::::::::::::::::::::::..:: :::.::. . .
CCDS11 GSLGILSGNDGGLLSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTG
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 EI----KDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQT
.::: :. :::::::::.:.: ::: .::::::::::.::: :::.::::::
CCDS11 TADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQG
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 VEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMD
::::.::::::::::::.:::::::::.:.:::::..::::.:. ..: :.:.::::
CCDS11 VEADINGLRRVLDELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMD
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 AAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTE
:::::::.:.::.:: ::: .::.::.:::.::. :. :: ::...:.: .:::.::::.
CCDS11 AAPGVDLTRLLNDMRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTD
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 LRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQ
:::..:.:::::::::.:: :::.:: :..: :: ::::.: ::...: :: :.: . :.
CCDS11 LRRAFQNLEIELQSQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAER
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 QSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQT
:. ..: ::.::.::: :: ::::::.:: . ... . :. .. ...::.. .:
CCDS11 QNVDHQRLLNVKARLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKT
410 420 430 440 450 460
460 470
pF1KE4 RPILKEQSSSSFSQGQSS
: :
CCDS11 RKIKTVVQEMVNGEVVSSQVQEIEELM
470 480 490
>>CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 (623 aa)
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10 20 30
pF1KE4 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGG------GIGGGSSRI
:. : : .:. : :: : ::::::.
CCDS32 MSCRQFSSSYLSRSGGGGGGGLGSGGSIRSSYSRFSSSGGGGGGGRFSSSSGYGGGSSRV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KE4 SSVLAGGSC--RAPSTYGGGLSVSSRFSS--GGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYG
. .::: . :::.:.:: .. ::. :.::. :::.:::..::.::::: :
CCDS32 CGRGGGGSFGYSYGGGSGGGFSASSLGGGFGGGSRGFGGASGGGYSSSGGFGGGFGGGSG
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 GGLGAGFGGGLGA--GFGGGFAGGDG-LLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANAD
::.:.:.:.:.:. ::::: .:::: .:...:: :::.::.:::::::::.:::::: :
CCDS32 GGFGGGYGSGFGGFGGFGGGAGGGDGGILTANEKSTMQELNSRLASYLDKVQALEEANND
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 LEVKIRDWYQRQRPSEI-KDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFR
:: ::.:::... :. : :.::::..::.::...:. :. : . .:.:::.:.. ::::
CCDS32 LENKIQDWYDKKGPAAIQKNYSPYYNTIDDLKDQIVDLTVGNNKTLLDIDNTRMTLDDFR
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 TKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALR
:.: : ::: :.::.::::.:::.::. ..::::: : :.::: :.:::.::: :
CCDS32 IKFEMEQNLRQGVDADINGLRQVLDNLTMEKSDLEMQYETLQEELMALKKNHKEEMSQLT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 GQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNS
::..::::::...::: ::.. ::.::..:::. :::.: :. . .. ....::.:..
CCDS32 GQNSGDVNVEINVAPGKDLTKTLNDMRQEYEQLIAKNRKDIENQYETQITQIEHEVSSSG
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 ELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVE
. :::: .:::.::. .: :::::::::: ::.::.:::.::.::: ::..:: :...:
CCDS32 QEVQSSAKEVTQLRHGVQELEIELQSQLSKKAALEKSLEDTKNRYCGQLQMIQEQISNLE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 EQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREV
:....: :.: :.:::..::..: :::.:: ::. :::: . . :. :. . ..:
CCDS32 AQITDVRQEIECQNQEYSLLLSIKMRLEKEIETYHNLLEGGQEDFESSGAGKIGLGGR--
430 440 450 460 470
450 460 470
pF1KE4 FTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
.:..: .: .: :..:.. : :
CCDS32 -GGSGGSYGRGSRG----GSGGSYGGGGSGGGYGGGSGSRGGSGGSYGGGSGSGGGSGGG
480 490 500 510 520 530
473 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]