FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4423, 438 aa
1>>>pF1KE4423 438 - 438 aa - 438 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9787+/-0.000937; mu= 13.4177+/- 0.056
mean_var=68.1676+/-13.920, 0's: 0 Z-trim(104.5): 49 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.155341
statistics sampled from 7892 (7941) to 7892 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45435.1 ACSM3 gene_id:6296|Hs108|chr16 ( 438) 3006 682.9 1.6e-196
CCDS10589.1 ACSM3 gene_id:6296|Hs108|chr16 ( 586) 2797 636.1 2.7e-182
CCDS44825.1 ACSM4 gene_id:341392|Hs108|chr12 ( 580) 1639 376.6 3.5e-104
CCDS10585.1 ACSM5 gene_id:54988|Hs108|chr16 ( 579) 1629 374.4 1.7e-103
CCDS32401.1 ACSM2A gene_id:123876|Hs108|chr16 ( 577) 1355 313.0 5.1e-85
CCDS10587.1 ACSM1 gene_id:116285|Hs108|chr16 ( 577) 1351 312.1 9.5e-85
CCDS10586.1 ACSM2B gene_id:348158|Hs108|chr16 ( 577) 1337 308.9 8.3e-84
CCDS7440.2 ACSM6 gene_id:142827|Hs108|chr10 ( 480) 1222 283.1 4e-76
CCDS76838.1 ACSM2A gene_id:123876|Hs108|chr16 ( 498) 1168 271.0 1.8e-72
CCDS81954.1 ACSM5 gene_id:54988|Hs108|chr16 ( 208) 767 181.1 9.2e-46
CCDS13243.1 ACSS2 gene_id:55902|Hs108|chr20 ( 701) 260 67.6 4.5e-11
CCDS42868.2 ACSS2 gene_id:55902|Hs108|chr20 ( 714) 260 67.6 4.6e-11
>>CCDS45435.1 ACSM3 gene_id:6296|Hs108|chr16 (438 aa)
initn: 3006 init1: 3006 opt: 3006 Z-score: 3641.5 bits: 682.9 E(32554): 1.6e-196
Smith-Waterman score: 3006; 100.0% identity (100.0% similar) in 438 aa overlap (1-438:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLARVTRKMLRHAKCFQRLAIFGSVRALHKDNRTATPQNFSNYESMKQDFKLGIPEYFNF
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CCDS45 MLARVTRKMLRHAKCFQRLAIFGSVRALHKDNRTATPQNFSNYESMKQDFKLGIPEYFNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AKDVLDQWTDKEKAGKKPSNPAFWWINRNGEEMRWSFEELGSLSRKFANILSEACSLQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AKDVLDQWTDKEKAGKKPSNPAFWWINRNGEEMRWSFEELGSLSRKFANILSEACSLQRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DRVILILPRVPEWWLANVACLRTGTVLIPGTTQLTQKDILYRLQSSKANCIITNDVLAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DRVILILPRVPEWWLANVACLRTGTVLIPGTTQLTQKDILYRLQSSKANCIITNDVLAPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VDAVASKCENLHSKLIVSENSREGWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAIFFTSGTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VDAVASKCENLHSKLIVSENSREGWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAIFFTSGTSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YPKMTAHTHSSFGLGLSVNGRFWLDLTPSDVMWNTSDTGWAKSAWSSVFSPWIQGACVFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YPKMTAHTHSSFGLGLSVNGRFWLDLTPSDVMWNTSDTGWAKSAWSSVFSPWIQGACVFT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HHLPRFEPTSILQTLSKYPITVFCSAPTVYRMLVQNDITSYKFKSLKHCVSAGEPITPDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HHLPRFEPTSILQTLSKYPITVFCSAPTVYRMLVQNDITSYKFKSLKHCVSAGEPITPDV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TEKWRNKTGLDIYEGYGQTETVLICGNFKGMKIKPGSMGKPSPAFDVKVCTSPSRRMFNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TEKWRNKTGLDIYEGYGQTETVLICGNFKGMKIKPGSMGKPSPAFDVKVCTSPSRRMFNN
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE4 PICTLPTYRLPPYKLSLL
::::::::::::::::::
CCDS45 PICTLPTYRLPPYKLSLL
430
>>CCDS10589.1 ACSM3 gene_id:6296|Hs108|chr16 (586 aa)
initn: 2797 init1: 2797 opt: 2797 Z-score: 3386.3 bits: 636.1 E(32554): 2.7e-182
Smith-Waterman score: 2797; 99.8% identity (100.0% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-409)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLARVTRKMLRHAKCFQRLAIFGSVRALHKDNRTATPQNFSNYESMKQDFKLGIPEYFNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLARVTRKMLRHAKCFQRLAIFGSVRALHKDNRTATPQNFSNYESMKQDFKLGIPEYFNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AKDVLDQWTDKEKAGKKPSNPAFWWINRNGEEMRWSFEELGSLSRKFANILSEACSLQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AKDVLDQWTDKEKAGKKPSNPAFWWINRNGEEMRWSFEELGSLSRKFANILSEACSLQRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DRVILILPRVPEWWLANVACLRTGTVLIPGTTQLTQKDILYRLQSSKANCIITNDVLAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DRVILILPRVPEWWLANVACLRTGTVLIPGTTQLTQKDILYRLQSSKANCIITNDVLAPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VDAVASKCENLHSKLIVSENSREGWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAIFFTSGTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VDAVASKCENLHSKLIVSENSREGWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAIFFTSGTSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YPKMTAHTHSSFGLGLSVNGRFWLDLTPSDVMWNTSDTGWAKSAWSSVFSPWIQGACVFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YPKMTAHTHSSFGLGLSVNGRFWLDLTPSDVMWNTSDTGWAKSAWSSVFSPWIQGACVFT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HHLPRFEPTSILQTLSKYPITVFCSAPTVYRMLVQNDITSYKFKSLKHCVSAGEPITPDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HHLPRFEPTSILQTLSKYPITVFCSAPTVYRMLVQNDITSYKFKSLKHCVSAGEPITPDV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TEKWRNKTGLDIYEGYGQTETVLICGNFKGMKIKPGSMGKPSPAFDVKVCTSPSRRMFNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS10 TEKWRNKTGLDIYEGYGQTETVLICGNFKGMKIKPGSMGKPSPAFDVKIVDVNGNVLPPG
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE4 PICTLPTYRLPPYKLSLL
CCDS10 QEGDIGIQVLPNRPFGLFTHYVDNPSKTASTLRGNFYITGDRGYMDKDGYFWFVARADDV
430 440 450 460 470 480
>>CCDS44825.1 ACSM4 gene_id:341392|Hs108|chr12 (580 aa)
initn: 1628 init1: 1584 opt: 1639 Z-score: 1983.8 bits: 376.6 E(32554): 3.5e-104
Smith-Waterman score: 1639; 56.0% identity (86.7% similar) in 384 aa overlap (26-409:21-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLARVTRKMLRHAKCFQRLAIFGSVRALHKDNRTATPQNFSNYESMKQDFKLGIPEYFNF
: ::::.. :: .....:.... . .:. :::
CCDS44 MKIFFRYQTFRFIWLTKPPGRRLHKDHQLWTPLTLADFEAINR-CNRPLPKNFNF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AKDVLDQWTDKEKAGKKPSNPAFWWINRNGEEMRWSFEELGSLSRKFANILSEACSLQRG
: ::::::..:::.:..:.:::.::.: .:.:..:::.:::::::: ::.:.. :.::::
CCDS44 AADVLDQWSQKEKTGERPANPALWWVNGKGDEVKWSFRELGSLSRKAANVLTKPCGLQRG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DRVILILPRVPEWWLANVACLRTGTVLIPGTTQLTQKDILYRLQSSKANCIITNDVLAPA
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CCDS44 DRLAVILPRIPEWWLVNVACIRTGIIFMPGTIQLTAKDILYRLRASKAKCIVASEEVAPA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 VDAVASKCENLHSKLIVSENSREGWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAIFFTSGTSG
:.... .: .:..::.:: .: .:: ...::.. ::. :.::.: .: :.:.:::::.:
CCDS44 VESIVLECPDLKTKLLVSPQSWNGWLSFQELFQFASEEHSCVETGSQEPMTIYFTSGTTG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YPKMTAHTHSSFGLGLSVNGRFWLDLTPSDVMWNTSDTGWAKSAWSSVFSPWIQGACVFT
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CCDS44 FPKMAQHSQSSLGIGFTLCGRYWLDLKSSDIIWNMSDTGWVKAAIGSVFSSWLCGACVFV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HHLPRFEPTSILQTLSKYPITVFCSAPTVYRMLVQNDITSYKFKSLKHCVSAGEPITPDV
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CCDS44 HRMAQFDTDTFLDTLTTYPITTLCSPPTVYRMLVQKDLKRYKFKSLRHCLTGGEPLNPEV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TEKWRNKTGLDIYEGYGQTETVLICGNFKGMKIKPGSMGKPSPAFDVKVCTSPSRRMFNN
:.:: .:::..::::::::. .::.: ::..:::::::: .::..
CCDS44 LEQWRVQTGLELYEGYGQTEVGMICANQKGQEIKPGSMGKGMLPYDVQIIDENGNVLPPG
360 370 380 390 400 410
430
pF1KE4 PICTLPTYRLPPYKLSLL
CCDS44 KEGEIALRLKPTRPFCFFSKYVDNPQKTAATIRGDFYVTGDRGVMDSDGYFWFVGRADDV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS10585.1 ACSM5 gene_id:54988|Hs108|chr16 (579 aa)
initn: 1618 init1: 1074 opt: 1629 Z-score: 1971.7 bits: 374.4 E(32554): 1.7e-103
Smith-Waterman score: 1629; 55.1% identity (83.5% similar) in 405 aa overlap (7-409:2-403)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLARVTRKMLRHAKCFQRLAIFGSVRALH-KDNRTATPQNF-SNYESMKQDFKLGIPEYF
: ::: .: : . . : : .::.. ...:... .: .::::
CCDS10 MRPWLRHL-VLQALRNSRAFCGSHGKPAPLPVPQKIVATWEAISLGRQL-VPEYF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 NFAKDVLDQWTDKEKAGKKPSNPAFWWINRNGEEMRWSFEELGSLSRKFANILSEACSLQ
:::.:::: :. :.::..: ::::::.: .: :..:::::::. ::: ::.:. ::.::
CCDS10 NFAHDVLDVWSRLEEAGHRPPNPAFWWVNGTGAEIKWSFEELGKQSRKAANVLGGACGLQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 RGDRVILILPRVPEWWLANVACLRTGTVLIPGTTQLTQKDILYRLQSSKANCIITNDVLA
:::..:.:::.:::::..:::.:::::.:::.::::.::. ::::.:.:. :::.: ::
CCDS10 PGDRMMLVLPRLPEWWLVSVACMRTGTVMIPGVTQLTEKDLKYRLQASRAKSIITSDSLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 PAVDAVASKCENLHSKLIVSENSREGWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAIFFTSGT
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CCDS10 PRVDAISAECPSLQTKLLVSDSSRPGWLNFRELLREASTEHNCMRTKSRDPLAIYFTSGT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SGYPKMTAHTHSSFGLGLSVNGRFWLDLTPSDVMWNTSDTGWAKSAWSSVFSPWIQGACV
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CCDS10 TGAPKMVEHSQSSYGLGFVASGRRWVALTESDIFWNTTDTGWVKAAWT-LFSAWPNGSCI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 FTHHLPRFEPTSILQTLSKYPITVFCSAPTVYRMLVQNDITSYKFKSLKHCVSAGEPITP
:.:.::: . ::.::::.:::..: .::..:.:::.:.: :.:.::.::...:: ..:
CCDS10 FVHELPRVDAKVILNTLSKFPITTLCCVPTIFRLLVQEDLTRYQFQSLRHCLTGGEALNP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 DVTEKWRNKTGLDIYEGYGQTETVLICGNFKGMKIKPGSMGKPSPAFDVKVCTSPSRRMF
:: :::...::...::::::.:::.::.: :::::: ::::: :: .::..
CCDS10 DVREKWKHQTGVELYEGYGQSETVVICANPKGMKIKSGSMGKASPPYDVQIVDDEGNVLP
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KE4 NNPICTLPTYRLPPYKLSLL
CCDS10 PGEEGNVAVRIRPTRPFCFFNCYLDNPEKTAASEQGDFYITGDRARMDKDGYFWFMGRND
420 430 440 450 460 470
>>CCDS32401.1 ACSM2A gene_id:123876|Hs108|chr16 (577 aa)
initn: 1341 init1: 804 opt: 1355 Z-score: 1639.9 bits: 313.0 E(32554): 5.1e-85
Smith-Waterman score: 1355; 53.1% identity (78.4% similar) in 356 aa overlap (54-409:40-394)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 SVRALHKDNRTATPQNFSNYESMKQDFKLGIPEYFNFAKDVLDQWTDKEKAGKKPSNPAF
.: ::::.::::.:.: :::::. .::.
CCDS32 LCTLWGTQMSSRTLYINSRQLVSLQWGHQEVPAKFNFASDVLDHWADMEKAGKRLPSPAL
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 WWINRNGEEMRWSFEELGSLSRKFANILSEACSLQRGDRVILILPRVPEWWLANVACLRT
::.: .:.:. :.:.::. :.. ::.:: ::.::::::: ..:::::::::. ..:.:.
CCDS32 WWVNGKGKELMWNFRELSENSQQAANVLSGACGLQRGDRVAVVLPRVPEWWLVILGCIRA
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 GTVLIPGTTQLTQKDILYRLQSSKANCIITNDVLAPAVDAVASKCENLHSKLIVSENSRE
: ...::: :. . ::::::: :::. :...: . ::.:::.: .:. ::.:::.: .
CCDS32 GLIFMPGTIQMKSTDILYRLQMSKAKAIVAGDEVIQEVDTVASECPSLRIKLLVSEKSCD
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 GWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAIFFTSGTSGYPKMTAHTHSSFGLGLSVNGRFW
:: :.:.:...:: .: ::.: .: ::.::::::: :::. :..::.:: .... :
CCDS32 GWLNFKKLLNEASTTHHCVETGSQEASAIYFTSGTSGLPKMAEHSYSSLGLKAKMDAG-W
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 LDLTPSDVMWNTSDTGWAKSAWSSVFSPWIQGACVFTHHLPRFEPTSILQTLSKYPITVF
: ::.::. ::::: . :.. :: :::.:.: ::.:.: ::.:::.::: .
CCDS32 TGLQASDIMWTISDTGWILNILCSLMEPWALGACTFVHLLPKFDPLVILKTLSSYPIKSM
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 CSAPTVYRMLVQNDITSYKFKSLKHCVSAGEPITPDVTEKWRNKTGLDIYEGYGQTETVL
.:: :::::.:.:..:::: :..::..:: . :.. :.:: .::::: :.:::::: :
CCDS32 MGAPIVYRMLLQQDLSSYKFPHLQNCVTVGESLLPETLENWRAQTGLDIRESYGQTETGL
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430
pF1KE4 ICGNFKGMKIKPGSMGKPSPAFDVKVCTSPSRRMFNNPICTLPTYRLPPYKLSLL
: : :::::: :: . .::..
CCDS32 TCMVSKTMKIKPGYMGTAASCYDVQIIDDKGNVLPPGTEGDIGIRVKPIRPIGIFSGYVD
370 380 390 400 410 420
>>CCDS10587.1 ACSM1 gene_id:116285|Hs108|chr16 (577 aa)
initn: 1336 init1: 1336 opt: 1351 Z-score: 1635.0 bits: 312.1 E(32554): 9.5e-85
Smith-Waterman score: 1351; 49.1% identity (75.6% similar) in 405 aa overlap (17-409:2-400)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLARVTRKMLRHAKCFQRLAIFGSVRALHKDNRTATP-------QNFSNYESMK-QDFKL
: : : .. ..::. .. : ...:.. . . .:..
CCDS10 MQWLMRFRTLWGIHKSFHNIHPAPSQLRCRSLSEFGAPRWNDYE-
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GIPEYFNFAKDVLDQWTDKEKAGKKPSNPAFWWINRNGEEMRWSFEELGSLSRKFANILS
.:: ::::. ::: :..::: ::. ::::::.: .:.:..:::.:.:.:.:. ::...
CCDS10 -VPEEFNFASYVLDYWAQKEKEGKRGPNPAFWWVNGQGDEVKWSFREMGDLTRRVANVFT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 EACSLQRGDRVILILPRVPEWWLANVACLRTGTVLIPGTTQLTQKDILYRLQSSKANCII
..:.::.::.. :.:::::::::. :.:.::: ..::.: : :::::::: :::. :.
CCDS10 QTCGLQQGDHLALMLPRVPEWWLVAVGCMRTGIIFIPATILLKAKDILYRLQLSKAKGIV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 TNDVLAPAVDAVASKCENLHSKLIVSENSREGWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAI
: :.:: ::..::.: .:..::.::..::::: ... :.: :: :::::.: . :.:
CCDS10 TIDALASEVDSIASQCPSLKTKLLVSDHSREGWLDFRSLVKSASPEHTCVKSKTLDPMVI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE4 FFTSGTSGYPKMTAHTHSSFGLGL--SVNGRFWL-DLTPSDVMWNTSDTGW-AKSAWSSV
::::::.:.:::. :.: ::.: : : : .: ::: : ::.:: . . :. :
CCDS10 FFTSGTTGFPKMAKHSH---GLALQPSFPGSRKLRSLKTSDVSWCLSDSGWIVATIWTLV
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 FSPWIQGACVFTHHLPRFEPTSILQTLSKYPITVFCSAPTVYRMLVQNDITSYKFKSLKH
:: : :: ::::.:. :.::: ::::. : .. ..:::..:.:.:: .: .:.:
CCDS10 -EPWTAGCTVFIHHLPQFDTKVIIQTLLKYPINHFWGVSSIYRMILQQDFTSIRFPALEH
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 CVSAGEPITPDVTEKWRNKTGLDIYEGYGQTETVLICGNFKGMKIKPGSMGKPSPAFDVK
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CCDS10 CYTGGEVVLPKDQEEWKRRTGLLLYENYGQSETGLICATYWGMKIKPGFMGKATPPYDVQ
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:
CCDS10 VIDDKGSILPPNTEGNIGIRIKPVRPVSLFMCYEGDPEKTAKVECGDFYNTGDRGKMDEE
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: : :::::: :: . .::.:
CCDS10 TCMVSKTMKIKPGYMGTAASCYDVQVIDDKGNVLPPGTEGDIGIRVKPIRPIGIFSGYVE
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CCDS74 WKVSAKGEEDKWSFERMTQLSKKAASILSDTCALSHGDRLMIILPPTPEAYWIC-LACVR
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: ...::. ::: : : :.:. :::.::..:...::.:....: : .:..::.::..:
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pF1KE4 EGWGNLKELMKHASDSHTCVKTKHNEIMAIFFTSGTSGYPKMTAHTHSSFGLGLSVNGRF
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CCDS74 DGWLDFKKLIQVAPPKQTYMRTKSQDPMAIFFTKGTTGAPKMVEYSQYGLGMGFSQASRR
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CCDS74 GLLCATSKTIKLKPSSLGKPLPPYIVQIVDENSNLLPPGEEGNIAIRIKLNQPASLYCPH
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