Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4421
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4421, 437 aa
1>>>pF1KE4421 437 - 437 aa - 437 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7318+/-0.000527; mu= 11.1694+/- 0.033
mean_var=101.3413+/-19.986, 0's: 0 Z-trim(109.7): 30 B-trim: 30 in 1/49
Lambda= 0.127403
statistics sampled from 17857 (17880) to 17857 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 8.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001113 (OMIM: 103195) perilipin-2 [Homo sapiens ( 437) 2754 517.3 3.2e-146
XP_016869748 (OMIM: 103195) PREDICTED: perilipin-2 ( 445) 2520 474.2 2.9e-133
NP_005808 (OMIM: 602702) perilipin-3 isoform 1 [Ho ( 434) 1170 226.1 1.4e-58
NP_001157661 (OMIM: 602702) perilipin-3 isoform 2 ( 433) 1157 223.7 7.3e-58
NP_001157666 (OMIM: 602702) perilipin-3 isoform 3 ( 422) 629 126.7 1.2e-28
XP_005254991 (OMIM: 170290,613877) PREDICTED: peri ( 522) 429 89.9 1.6e-17
NP_001138783 (OMIM: 170290,613877) perilipin-1 [Ho ( 522) 429 89.9 1.6e-17
NP_002657 (OMIM: 170290,613877) perilipin-1 [Homo ( 522) 429 89.9 1.6e-17
NP_001013728 (OMIM: 613248) perilipin-5 [Homo sapi ( 463) 343 74.1 8.5e-13
>>NP_001113 (OMIM: 103195) perilipin-2 [Homo sapiens] (437 aa)
initn: 2754 init1: 2754 opt: 2754 Z-score: 2746.1 bits: 517.3 E(85289): 3.2e-146
Smith-Waterman score: 2754; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAENGVKTITSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAENGVKTITSV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAVTGAKDAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAVTGAKDAVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLVSSGVENAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLVSSGVENAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQKPSYYVRLGSLSTKLHSRAYQQALSRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQKPSYYVRLGSLSTKLHSRAYQQALSRVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWVEWKRSIGYDDTDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWVEWKRSIGYDDTDES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 ASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGA
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE4 EMDKSSQETQRSEHKTH
:::::::::::::::::
NP_001 EMDKSSQETQRSEHKTH
430
>>XP_016869748 (OMIM: 103195) PREDICTED: perilipin-2 iso (445 aa)
initn: 2517 init1: 2517 opt: 2520 Z-score: 2513.6 bits: 474.2 E(85289): 2.9e-133
Smith-Waterman score: 2520; 99.5% identity (99.5% similar) in 405 aa overlap (1-405:1-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAENGVKTITSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAENGVKTITSV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAVTGAKDAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAVTGAKDAVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 TTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLVSSGVENAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLVSSGVENAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQKPSYYVRLGSLSTKLHSRAYQQALSRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQKPSYYVRLGSLSTKLHSRAYQQALSRVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWVEWKRSIGYDDTDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWVEWKRSIGYDDTDES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 HCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 ASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_016 ASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVFDFTTIDLTSETDEIPDI
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE4 EMDKSSQETQRSEHKTH
XP_016 IALEEENGSNNSHANGPVLSGQDVE
430 440
>>NP_005808 (OMIM: 602702) perilipin-3 isoform 1 [Homo s (434 aa)
initn: 1111 init1: 671 opt: 1170 Z-score: 1172.7 bits: 226.1 E(85289): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 1170; 42.8% identity (80.7% similar) in 409 aa overlap (9-411:22-427)
10 20 30 40
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVC
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NP_005 MSADGAEADGSTQVTVEEPVQQPSVVDRVASMPLISSTCDMVSAAYASTKESYPHIKTVC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EMAENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVAN
. ::.::.:.:..:...: ::..::::::: :. :: .:::..:: ::::.::. ...:.
NP_005 DAAEKGVRTLTAAAVSGAQPILSKLEPQIASASEYAHRGLDKLEENLPILQQPTEKVLAD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 AKGAVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSR
.: :.. ... :..:::.::. .. ..: :.::: ..:.::::::.:....:.:::
NP_005 TKELVSSKVSGAQEMVSSAKDTVATQLSEAVDATRGAVQSGVDKTKSVVTGGVQSVMGSR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 MMQLVSSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLV------QKPSYYVRLG
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NP_005 LGQMVLSGVDTVLGKSEEWADNHLPLTDAELARIATSLDGFDVASVQQQRQEQSYFVRLG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SLSTKLHSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKL
::: .:...::...:.... .::..:... :: ... :.: ....: .::. ..:.::
NP_005 SLSERLRQHAYEHSLGKLRATKQRAQEALLQLSQVLSLMETVKQGV---DQKLVEGQEKL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YLSWVEWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQD
. :. :... : :..:::.:.. :...::::.:: .: :.:::.: :..:
NP_005 HQMWLSWNQKQLQGPEKEPPKPEQVESRALTMFRDIAQQLQATCTSLGSSIQGLPTNVKD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWL
:... .. :. ..: . ::...:.:.:..:. .. . .:.:: ...:...:::..::
NP_005 QVQQARRQVEDLQATFSSIHSFQDLSSSILAQSRERVASAREALDHMVEYVAQNTPVTWL
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KE4 VGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
:::: : .::
NP_005 VGPFAPGITEKAPEEKK
420 430
>>NP_001157661 (OMIM: 602702) perilipin-3 isoform 2 [Hom (433 aa)
initn: 1217 init1: 671 opt: 1157 Z-score: 1159.8 bits: 223.7 E(85289): 7.3e-58
Smith-Waterman score: 1157; 42.8% identity (80.4% similar) in 409 aa overlap (9-411:22-426)
10 20 30 40
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVC
::::: ::...::.::: :..:.:: :::..::..:.::
NP_001 MSADGAEADGSTQVTVEEPVQQPSVVDRVASMPLISSTCDMVSAAYASTKESYPHIKTVC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EMAENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVAN
. ::.::.:.:..:...: ::..::::::: :. :: .:::..:: ::::.::. ...:.
NP_001 DAAEKGVRTLTAAAVSGAQPILSKLEPQIASASEYAHRGLDKLEENLPILQQPTEKVLAD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 AKGAVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSR
.: :.. ... :..:::.::. .. ..: :.::: ..:.::::::.:....:.:::
NP_001 TKELVSSKVSGAQEMVSSAKDTVATQLSEAVDATRGAVQSGVDKTKSVVTGGVQSVMGSR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 MMQLVSSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLV------QKPSYYVRLG
. :.: :::...: ::: ....::::. :: . : ...:::.. :. ::.::::
NP_001 LGQMVLSGVDTVLGKSEEWADNHLPLTDAELARIATSLDGFDVASVQQQRQEQSYFVRLG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SLSTKLHSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKL
::: .:...::...:.... .::..:... :: ... :.: ....: .::. ..:.::
NP_001 SLSERLRQHAYEHSLGKLRATKQRAQEALLQLSQVLSLMETVKQGV---DQKLVEGQEKL
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YLSWVEWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQD
. :. :... : : .:::.:.. :...::::.:: .: :.:::.: :..:
NP_001 HQMWLSWNQKQLQGPEKEPPKPE-VESRALTMFRDIAQQLQATCTSLGSSIQGLPTNVKD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWL
:... .. :. ..: . ::...:.:.:..:. .. . .:.:: ...:...:::..::
NP_001 QVQQARRQVEDLQATFSSIHSFQDLSSSILAQSRERVASAREALDHMVEYVAQNTPVTWL
360 370 380 390 400 410
410 420 430
pF1KE4 VGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
:::: : .::
NP_001 VGPFAPGITEKAPEEKK
420 430
>>NP_001157666 (OMIM: 602702) perilipin-3 isoform 3 [Hom (422 aa)
initn: 1081 init1: 388 opt: 629 Z-score: 635.5 bits: 126.7 E(85289): 1.2e-28
Smith-Waterman score: 1138; 42.8% identity (79.2% similar) in 409 aa overlap (9-411:22-415)
10 20 30 40
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVC
::::: ::...::.::: :..:.:: :::..::..:.::
NP_001 MSADGAEADGSTQVTVEEPVQQPSVVDRVASMPLISSTCDMVSAAYASTKESYPHIKTVC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EMAENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVAN
. ::.::.:.:..:...: ::..::::::: :. :: .:::..:: ::::.::. .
NP_001 DAAEKGVRTLTAAAVSGAQPILSKLEPQIASASEYAHRGLDKLEENLPILQQPTEK----
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 AKGAVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSR
:.::.. :.. :::.::. .. ..: :.::: ..:.::::::.:....:.:::
NP_001 ----VSGAQEMVSS----AKDTVATQLSEAVDATRGAVQSGVDKTKSVVTGGVQSVMGSR
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 MMQLVSSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLV------QKPSYYVRLG
. :.: :::...: ::: ....::::. :: . : ...:::.. :. ::.::::
NP_001 LGQMVLSGVDTVLGKSEEWADNHLPLTDAELARIATSLDGFDVASVQQQRQEQSYFVRLG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SLSTKLHSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKL
::: .:...::...:.... .::..:... :: ... :.: ....: .::. ..:.::
NP_001 SLSERLRQHAYEHSLGKLRATKQRAQEALLQLSQVLSLMETVKQGV---DQKLVEGQEKL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 YLSWVEWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQD
. :. :... : :..:::.:.. :...::::.:: .: :.:::.: :..:
NP_001 HQMWLSWNQKQLQGPEKEPPKPEQVESRALTMFRDIAQQLQATCTSLGSSIQGLPTNVKD
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWL
:... .. :. ..: . ::...:.:.:..:. .. . .:.:: ...:...:::..::
NP_001 QVQQARRQVEDLQATFSSIHSFQDLSSSILAQSRERVASAREALDHMVEYVAQNTPVTWL
350 360 370 380 390 400
410 420 430
pF1KE4 VGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
:::: : .::
NP_001 VGPFAPGITEKAPEEKK
410 420
>>XP_005254991 (OMIM: 170290,613877) PREDICTED: perilipi (522 aa)
initn: 294 init1: 269 opt: 429 Z-score: 435.4 bits: 89.9 E(85289): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 461; 26.7% identity (58.9% similar) in 453 aa overlap (9-432:17-436)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAEN
: .:. ::..::.::.: . ....: :::. .: . :::. :.
XP_005 MAVNKGLTLLDGDLPEQENVLQRVLQLPVVSGTCECFQKTYTSTKEAHPLVASVCNAYEK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAV
::.. .:.: : :....: :...:: ::.:::..::..: :. : .:...
XP_005 GVQSASSLAAWSMEPVVRRLSTQFTAANELACRGLDHLEEKIPALQYPPEKIASE-----
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 TGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLV
::...: . .:..:.. :... ::. ::. .. : . .:. . . . ..: .:.
XP_005 --LKDTISTRLRSARNSISVPIASTSDKVLGAALAGCELAWGVARDTAEFAANTRAGRLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE4 SSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQK-----PSYYVRLGSLSTKL
:.:.. :: . : .:: :: .:: . . : . .:: :: :.:.:.. :
XP_005 SGGADLALGSIEKVVEYLLPPDKEE----SAPAPGHQQAQKSPKAKPSLLSRVGALTNTL
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 HSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWV-
:: :...: : .... . . ..: : .:. .. : : .. .... . :.
XP_005 -SRYTVQTMAR---ALEQGHTVAMWIPGVVPLSSLAQWGASVAMQAVSRRRSEVRVPWLH
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320
pF1KE4 ----------EWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIA-----RNL----TQQLQTTCHT
: . . .::.: . : :.. .: :.: .. :: : .:
XP_005 SLAAAQEEDHEDQTDTEGEDTEEEEELETEENKFSEVAALPGPRGLLGGVAHTLQKTLQT
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 LLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESL--
.: . .: . .: ::: . . : ..:.::. ......:
XP_005 TISAVTWAPAAV------LG-MAGRVLHLTPAPA---------VSSTKGRAMSLSDALKG
350 360 370 380
390 400 410 420 430
pF1KE4 --DDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH
:.:.: .:. .:: : . . :. .: .. .. ::... : . :
XP_005 VTDNVVDTVVHYVPLPRL-SLMEPE-SEFRDIDNPPAEVERREAERRASGAPSAGPEPAP
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>>NP_002657 (OMIM: 170290,613877) perilipin-1 [Homo sapi (522 aa)
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>>NP_001013728 (OMIM: 613248) perilipin-5 [Homo sapiens] (463 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]