FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4421, 437 aa 1>>>pF1KE4421 437 - 437 aa - 437 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5282+/-0.00129; mu= 11.7627+/- 0.077 mean_var=90.5343+/-17.790, 0's: 0 Z-trim(102.1): 29 B-trim: 6 in 1/48 Lambda= 0.134793 statistics sampled from 6795 (6810) to 6795 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16 Scan time: 2.890 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6490.1 PLIN2 gene_id:123|Hs108|chr9 ( 437) 2754 546.2 2.4e-155 CCDS12137.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 ( 434) 1170 238.2 1.3e-62 CCDS59338.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 ( 433) 1157 235.6 7.3e-62 CCDS59337.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 ( 422) 629 132.9 5.7e-31 CCDS10353.1 PLIN1 gene_id:5346|Hs108|chr15 ( 522) 429 94.1 3.5e-19 CCDS42473.1 PLIN5 gene_id:440503|Hs108|chr19 ( 463) 343 77.3 3.4e-14 >>CCDS6490.1 PLIN2 gene_id:123|Hs108|chr9 (437 aa) initn: 2754 init1: 2754 opt: 2754 Z-score: 2902.5 bits: 546.2 E(32554): 2.4e-155 Smith-Waterman score: 2754; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAENGVKTITSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMAENGVKTITSV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 AMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAVTGAKDAVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 AMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKGAVTGAKDAVT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 TTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLVSSGVENAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 TTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQLVSSGVENAL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 TKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQKPSYYVRLGSLSTKLHSRAYQQALSRVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 TKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEGFDLVQKPSYYVRLGSLSTKLHSRAYQQALSRVK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 EAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWVEWKRSIGYDDTDES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 EAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLSWVEWKRSIGYDDTDES 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 HCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 HCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 ASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS64 ASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGA 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 EMDKSSQETQRSEHKTH ::::::::::::::::: CCDS64 EMDKSSQETQRSEHKTH 430 >>CCDS12137.1 PLIN3 gene_id:10226|Hs108|chr19 (434 aa) initn: 1111 init1: 671 opt: 1170 Z-score: 1237.8 bits: 238.2 E(32554): 1.3e-62 Smith-Waterman score: 1170; 42.8% identity (80.7% similar) in 409 aa overlap (9-411:22-427) 10 20 30 40 pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVC ::::: ::...::.::: :..:.:: :::..::..:.:: CCDS12 MSADGAEADGSTQVTVEEPVQQPSVVDRVASMPLISSTCDMVSAAYASTKESYPHIKTVC 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 EMAENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVAN . ::.::.:.:..:...: ::..::::::: :. :: .:::..:: ::::.::. ...:. 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CCDS10 -SRYTVQTMAR---ALEQGHTVAMWIPGVVPLSSLAQWGASVAMQAVSRRRSEVRVPWLH 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 ----------EWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIA-----RNL----TQQLQTTCHT : . . .::.: . : :.. .: :.: .. :: : .: CCDS10 SLAAAQEEDHEDQTDTEGEDTEEEEELETEENKFSEVAALPGPRGLLGGVAHTLQKTLQT 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 LLSNIQGVPQNIQDQAKHMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESL-- .: . .: . .: ::: . . : ..:.::. ......: CCDS10 TISAVTWAPAAV------LG-MAGRVLHLTPAPA---------VSSTKGRAMSLSDALKG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 --DDVMDYLVNNTPLNWLVGPFYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH :.:.: .:. .:: : . . :. .: .. .. ::... : . : CCDS10 VTDNVVDTVVHYVPLPRL-SLMEPE-SEFRDIDNPPAEVERREAERRASGAPSAGPEPAP 390 400 410 420 430 440 CCDS10 RLAQPRRSLRSAQSPGAPPGPGLEDEVATPAAPRPGFPAVPREKPKRRVSDSFFRPSVME 450 460 470 480 490 500 >>CCDS42473.1 PLIN5 gene_id:440503|Hs108|chr19 (463 aa) initn: 816 init1: 328 opt: 343 Z-score: 368.2 bits: 77.3 E(32554): 3.4e-14 Smith-Waterman score: 747; 34.1% identity (64.7% similar) in 416 aa overlap (2-411:12-384) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MASVAVDPQPSVVTRVVNLPLVSSTYDLMSSAYLSTKDQYPYLKSVCEMA .:: . : .:: ::: :::: .: . ..: ..::..: : :.:..: CCDS42 MSEEEAAQIPRSSVWEQDQQNVVQRVVALPLVRATCTAVCDVYSAAKDRHPLLGSACRLA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 ENGVKTITSVAMTSALPIIQKLEPQIAVANTYACKGLDRIEERLPILNQPSTQIVANAKG :: : .:. :. : :....:.::.:. :. ::.:::..::.::.:.::: CCDS42 ENCVCGLTTRALDHAQPLLEHLQPQLATMNSLACRGLDKLEEKLPFLQQPSE-------- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 AVTGAKDAVTTTVTGAKDSVASTITGVMDKTKGAVTGSVEKTKSVVSGSINTVLGSRMMQ :.::.::: :::..:::.: .. . ::: .:: CCDS42 ----------TVVTSAKDVVASSVTGVVDLARRGRRWSVELKRSV--------------- 120 130 140 180 190 200 210 220 pF1KE4 LVSSGVENALTKSELLVEQYLPLTEEELEKEAKKVEG------FDLVQKPSYYVRLGSLS : .:. .: ::: ::...::.::::: : ..:: : .. .:.::::::: CCDS42 --SHAVDVVLEKSEELVDHFLPMTEEELAALAAEAEGPEVGSVEDQRRQQGYFVRLGSLS 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 TKLHSRAYQQALSRVKEAKQKSQQTISQLHSTVHLIEFARKNVYSANQKIQDAQDKLYLS .... ::..........:...:.:..::. :..::. . .: . :.. CCDS42 ARIRHLAYEHSVGKLRQSKHRAQDTLAQLQETLELIDHMQCGVTPTAPA---CPGKVHEL 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 WVEWKRSIGYDDTDESHCAEHIESRTLAIARNLTQQLQTTCHTLLSNIQGVPQNIQDQAK : :: . ::. . : .::...:.:::.:: : ..: :...:.: . :... CCDS42 WGEWGQR-----PPESRRRSQAELETLVLSRSLTQELQGTVEALESSVRGLPAGAQEKVA 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 HMGVMAGDIYSVFRNAASFKEVSDSLLTSSKGQLQKMKESLDDVMDYLVNNTPLNWLVGP .. . . ..: .: :..: . :. ..:.. . . .:.... .:. .:: ::::: CCDS42 EVRRSVDALQTAFADARCFRDVPAAALAEGRGRVAHAHACVDELLELVVQAVPLPWLVGP 320 330 340 350 360 370 410 420 430 pF1KE4 FYPQLTESQNAQDQGAEMDKSSQETQRSEHKTH : : :.: CCDS42 FAPILVERPEPLPDLADLVDEVIGGPDPRWAHLDWPAQQRAWEAEHRDGSGNGDGDRMGV 380 390 400 410 420 430 437 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 00:42:14 2016 done: Sun Nov 6 00:42:15 2016 Total Scan time: 2.890 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]