Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4391
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4391, 414 aa
1>>>pF1KE4391 414 - 414 aa - 414 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6511+/-0.00109; mu= 15.2189+/- 0.065
mean_var=68.2689+/-13.885, 0's: 0 Z-trim(102.6): 51 B-trim: 25 in 1/50
Lambda= 0.155225
statistics sampled from 6954 (7004) to 6954 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 2.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 2699 613.8 9.3e-176
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 1018 237.4 2e-62
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CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 897 210.3 2.7e-54
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 832 195.7 6.9e-50
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 765 180.7 2.4e-45
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 674 160.3 2.2e-39
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CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 632 150.9 2e-36
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 629 150.2 3e-36
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 624 149.1 6.5e-36
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 599 143.6 4e-34
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 583 139.9 3.4e-33
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CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 533 128.8 9.2e-30
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 532 128.5 1.1e-29
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 530 128.1 1.4e-29
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 509 123.4 4e-28
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 503 122.0 9.9e-28
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CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 479 116.7 4.9e-26
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CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 473 115.3 1e-25
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 473 115.3 1e-25
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 473 115.3 1.1e-25
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 463 113.1 4.9e-25
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 462 112.9 6.5e-25
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 456 111.5 1.4e-24
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 443 108.5 7e-24
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 415 102.3 8.9e-22
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 412 101.7 1.4e-21
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 372 92.7 6.8e-19
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 372 92.7 7.1e-19
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 364 90.9 2.3e-18
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 347 87.1 2.6e-17
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 345 86.7 4.5e-17
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 345 86.7 5.4e-17
CCDS1585.1 AGT gene_id:183|Hs108|chr1 ( 485) 309 78.6 1.4e-14
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 299 76.2 2.9e-14
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 296 75.7 9.4e-14
>>CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 (414 aa)
initn: 2699 init1: 2699 opt: 2699 Z-score: 3268.9 bits: 613.8 E(32554): 9.3e-176
Smith-Waterman score: 2699; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MNPTLGLAIFLAVLLTVKGLLKPSFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKELARQNMDLGFKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MNPTLGLAIFLAVLLTVKGLLKPSFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKELARQNMDLGFKLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQGFNFRKMPEKDLHEGFHYII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQGFNFRKMPEKDLHEGFHYII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HELTQKTQDLKLSIGNTLFIDQRLQPQRKFLEDAKNFYSAETILTNFQNLEMAQKQINDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 HELTQKTQDLKLSIGNTLFIDQRLQPQRKFLEDAKNFYSAETILTNFQNLEMAQKQINDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ISQKTHGKINNLIENIDPGTVMLLANYIFFRARWKHEFDPNVTKEEDFFLEKNSSVKVPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 ISQKTHGKINNLIENIDPGTVMLLANYIFFRARWKHEFDPNVTKEEDFFLEKNSSVKVPM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MFRSGIYQVGYDDKLSCTILEIPYQKNITAIFILPDEGKLKHLEKGLQVDTFSRWKTLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MFRSGIYQVGYDDKLSCTILEIPYQKNITAIFILPDEGKLKHLEKGLQVDTFSRWKTLLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RRVVDVSVPRLHMTGTFDLKKTLSYIGVSKIFEEHGDLTKIAPHRSLKVGEAVHKAELKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RRVVDVSVPRLHMTGTFDLKKTLSYIGVSKIFEEHGDLTKIAPHRSLKVGEAVHKAELKM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE4 DERGTEGAAGTGAQTLPMETPLVVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 DERGTEGAAGTGAQTLPMETPLVVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
370 380 390 400 410
>>CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 (418 aa)
initn: 1056 init1: 887 opt: 1018 Z-score: 1234.4 bits: 237.4 E(32554): 2e-62
Smith-Waterman score: 1018; 42.7% identity (76.6% similar) in 363 aa overlap (54-414:56-418)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 SFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKELARQNMDLGFKLLKKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAF
...:.: ..:: . . :::.::.::.:::
CCDS99 DPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNLAEFAFSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAF
30 40 50 60 70 80
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pF1KE4 SMLCLGAQDSTLDEIKQGFNFR--KMPEKDLHEGFHYIIHELTQKTQDLKLSIGNTLFID
.:: ::.. .: ::: .:.:: ..:: ..::::. ... :.: ..:.:. :: ::..
CCDS99 AMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLS
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 QRLQPQRKFLEDAKNFYSAETILTNFQNLEMAQKQINDFISQKTHGKINNLIENIDPGTV
. :. :::::.:..: .:.. .:: . : :.:::::.. . :.::: .:....: ::
CCDS99 EGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEEAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTV
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MLLANYIFFRARWKHEFDPNVTKEEDFFLEKNSSVKVPMMFRSGIYQVGYDDKLSCTILE
. :.:::::...:.. :. . :.:::: ... ..:::::: : :.... . ::: .:
CCDS99 FALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHVDQVTTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLL
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 IPYQKNITAIFILPDEGKLKHLEKGLQVDTFSRWKTLLSRRVVDVSVPRLHMTGTFDLKK
. : : ::::.:::::::.:::. : : .... .:: ... .:.: .:::.:::.
CCDS99 MKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIITKFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKS
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 TLSYIGVSKIFEEHGDLTKIAPHRSLKVGEAVHKAELKMDERGTEGAAGTGAQTLPMETP
.:. .:..:.: . .::. .. . ::...::::: : .::.:::.:.. ...:: :
CCDS99 VLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIP
330 340 350 360 370 380
390 400 410
pF1KE4 LVVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
::..::...:. .. : ::.::.::: :
CCDS99 PEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVVNPTQK
390 400 410
>>CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 (406 aa)
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Smith-Waterman score: 946; 37.5% identity (72.1% similar) in 405 aa overlap (13-411:10-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MNPTLGLAIFLAVLLTVKGLLKPSFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKELARQNMDLGFKLL
:::. .: ::..: : ...: . :. : :
CCDS99 MQLFLLLCLVLLSPQGASLHRHHPREMKKRVE----DLHVGATVAPSSRRDFTFDLY
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pF1KE4 KKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQGF--NFRKMPEKDLHEGFHY
. :: :...::.::.::: ...:: ::: .:: .: .:. :..: ::.::.::.
CCDS99 RALASAAPSQSIFFSPVSISMSLAMLSLGAGSSTKMQILEGLGLNLQKSSEKELHRGFQQ
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pF1KE4 IIHELTQKTQDLKLSIGNTLFIDQRLQPQRKFLEDAKNFYSAETILTNFQNLEMAQKQIN
...::.: . ..::.::.:: : .. : :. :..: :.:. :::.. :.::::
CCDS99 LLQELNQPRDGFQLSLGNALFTDLVVDLQDTFVSAMKTLYLADTFPTNFRDSAGAMKQIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DFISQKTHGKINNLIENIDPGTVMLLANYIFFRARWKHEFDPNVTKEEDFFLEKNSSVKV
:.....:.::: .:..:.: ..:....:::::.:.:. :. . :.:.::.. ... :.:
CCDS99 DYVAKQTKGKIVDLLKNLDSNAVVIMVNYIFFKAKWETSFNHKGTQEQDFYVTSETVVRV
180 190 200 210 220 230
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pF1KE4 PMMFRSGIYQVGYDDKLSCTILEIPYQKNITAIFILPDEGKLKHLEKGLQVDTFSRWKTL
::: : :. : .::: .. .::: : ::.::::.:::....:.::. :. .: .
CCDS99 PMMSREDQYHYLLDRNLSCRVVGVPYQGNATALFILPSEGKMQQVENGLSEKTLRKWLKM
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 LSRRVVDVSVPRLHMTGTFDLKKTLSYIGVSKIFEEHGDLTKIAPHRSLKVGEAVHKAEL
...: ... .:.. . :...:.:.: .:.:..: :.::. :. : ...:.: :::: .
CCDS99 FKKRQLELYLPKFSIEGSYQLEKVLPSLGISNVFTSHADLSGISNHSNIQVSEMVHKAVV
300 310 320 330 340 350
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pF1KE4 KMDERGTEGAAGTGA----QTLPMETPLVVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
..:: ::..::.::. .. ... .: ...:.:..: ...: :::::. :
CCDS99 EVDESGTRAAAATGTIFTFRSARLNSQRLV-FNRPFLMFIVDNNI---LFLGKVNRP
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>>CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 (435 aa)
initn: 782 init1: 377 opt: 943 Z-score: 1143.3 bits: 220.6 E(32554): 2.3e-57
Smith-Waterman score: 943; 34.5% identity (74.4% similar) in 414 aa overlap (7-411:19-432)
10 20 30 40
pF1KE4 MNPTLGLAIFLAVLLTVKGLLKPSF--SPRNYKALSEVQGWKQRMAAK
.: .: .: . :: : . :: : . . . :.
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50 60 70 80 90 100
pF1KE4 ELARQNMDLGFKLLKKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQG--FNF
.. : :..:.: ..:.. .:..:::.::.:.::...:: :::.. : .: :: ::.
CCDS41 QVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGFNL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 RKMPEKDLHEGFHYIIHELTQKTQDLKLSIGNTLFIDQRLQPQRKFLEDAKNFYSAETIL
. ::. .:.::....: :: ..:: :..:..::. ..:: : .:: ..: .: ::..
CCDS41 THTPESAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 TNFQNLEMAQKQINDFISQKTHGKINNLIENIDPGTVMLLANYIFFRARWKHEFDPNVTK
:.:.: .:: .::. ...::.::. ..:...: :.:.:.:.:::.:.:.. : :. :.
CCDS41 TDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EE-DFFLEKNSSVKVPMMFRSGIYQVGYDDKLSCTILEIPYQKNITAIFILPDEGKLKHL
.. :.. .. .:.:::: .. . : : .:.: .:.. :. . .:.:.::..::...:
CCDS41 KNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EKGLQVDTFSRWKTLLSRRVVDVSVPRLHMTGTFDLKKTLSYIGVSKIFEEHGDLTKIAP
:..:.. :. .:. :..: ..: .::. ......:. : .:....:....:.. ::
CCDS41 EQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIAK
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KE4 HRSLKVGEAVHKAELKMDERGTEGAAGTGAQTL--PMETP--LVVKIDKPYLLLIYSEKI
. ::.:..:.::: : ..:.:::..:.: .. . . : ..:.... .:..: ..
CCDS41 RDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKAT
370 380 390 400 410 420
400 410
pF1KE4 PSVLFLGKIVNPIGK
..:::::. ::
CCDS41 DGILFLGKVENPTKS
430
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 644 init1: 419 opt: 926 Z-score: 1122.9 bits: 216.8 E(32554): 3.2e-56
Smith-Waterman score: 926; 36.0% identity (72.4% similar) in 420 aa overlap (1-411:4-420)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MNPTLGLAIFLAVLLTVKGLLKPSFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKELARQNMDLGF
: : :.:.. ::. . : .:. :: . . :.. . . . :: :.:..:
CCDS32 MERMLPLLALGL-LAAGFCPAVLCHPN-SPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 KLLKKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQG--FNFRKMPEKDLHEG
.: :.:.. : .:...::::::::...: :::...:: :: .: ::. . : ..:..
CCDS32 SLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FHYIIHELTQKTQDLKLSIGNTLFIDQRLQPQRKFLEDAKNFYSAETILTNFQNLEMAQK
:..... :.:....:.::.::..:. ..:. .: :::: .:..:.. :.::. :.:
CCDS32 FQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKK
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CCDS32 RWRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQV
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CCDS32 VHKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKV
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410
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CCDS32 TNPKQA
420
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CCDS14 LHIGEKGTEAAAVPEVELSDQPENTFLHPIIQIDRSFMLLILERSTRSILFLGKVVNPTE
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CCDS14 A
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CCDS32 GDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNFALRLYKELAADAPG-NIFFSPVSISTTL
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CCDS32 ALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTETPEADIHQGFRSLLHTLALPSPKLELKVGNSLFLD
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CCDS32 KRLKPRQHYLDSIKELYGAFAFSANFTDSVTTGRQINDYLRRQTYGQVVDCLPEFSQDTF
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CCDS32 MVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERTSLQVPMMHQKEMHRFLYDQDLACTVL
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CCDS32 DILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSHKAMVDMSEKGTEAGAASGLLSQPPSL
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CCDS32 NTMSDPHA-HFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNPVAG
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CCDS99 GLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTISYLHDSE
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CCDS99 TLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
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CCDS99 ATSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGKVVDPTKP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]