Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4390, 412 aa
1>>>pF1KE4390 412 - 412 aa - 412 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3497+/-0.000909; mu= 16.4363+/- 0.054
mean_var=62.3710+/-12.633, 0's: 0 Z-trim(104.2): 29 B-trim: 426 in 1/51
Lambda= 0.162399
statistics sampled from 7772 (7796) to 7772 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 412) 2669 634.2 6.8e-182
CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 408) 2303 548.4 4.4e-156
CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 432) 947 230.8 2e-60
CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 421) 901 220.0 3.4e-57
CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 425) 901 220.0 3.4e-57
CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 385) 897 219.0 6.1e-57
CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 330) 894 218.3 8.6e-57
CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 426) 858 209.9 3.7e-54
CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 ( 415) 854 209.0 7e-54
CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 396) 814 199.6 4.4e-51
CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 454) 778 191.2 1.7e-48
CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 ( 621) 755 185.8 9.5e-47
CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 ( 430) 727 179.2 6.5e-45
CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 633) 715 176.5 6.4e-44
CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 655) 715 176.5 6.6e-44
CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 678) 715 176.5 6.8e-44
CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19 ( 438) 597 148.8 9.8e-36
CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1059) 507 127.8 4.7e-29
CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1090) 507 127.8 4.8e-29
CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3 ( 780) 461 117.0 6.3e-26
>>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (412 aa)
initn: 2669 init1: 2669 opt: 2669 Z-score: 3379.1 bits: 634.2 E(32554): 6.8e-182
Smith-Waterman score: 2669; 99.8% identity (100.0% similar) in 412 aa overlap (1-412:1-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 DKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTAN
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQNKGISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRMAF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 GAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE4 HQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 HQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
370 380 390 400 410
>>CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (408 aa)
initn: 2336 init1: 1296 opt: 2303 Z-score: 2915.7 bits: 548.4 E(32554): 4.4e-156
Smith-Waterman score: 2303; 89.2% identity (91.8% similar) in 417 aa overlap (1-412:1-408)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 DKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : : . : ..:
CCDS76 SLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGP-SLLGPT-------GPIFAL-
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE4 GTKAWITNAWEASAAVVFA-STDRA----LQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRG
: . . :. : .: : .:. : ..::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GQVGCPCPSSAATEACTFPRSRQRVSRPELLREGISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
360 370 380 390 400
>>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (432 aa)
initn: 878 init1: 756 opt: 947 Z-score: 1198.3 bits: 230.8 E(32554): 2e-60
Smith-Waterman score: 947; 40.8% identity (72.0% similar) in 375 aa overlap (36-410:59-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 LARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDKEHL
. ..:. .. . ::.... :... .:..
CCDS76 PPHVSKSSQSEALLNITNNGIHFAPLQTFTDEEMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSK
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 FPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNNSLYLG
. . .. . ::....: : ::.: ..:. ....::... ::..:. ..:.:
CCDS76 MEKSVIQGLFQQGLMGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVDASVAVFCEIQNTLINT
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLNGTKAW
: : :..::: ... .:. .:.: : ::: : :::. : .: : ::: .::::.: :
CCDS76 LIRKHGTEEQKATYLPQLTT-EKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTRADKEGDYYVLNGSKMW
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ITNAWEASAAVVFASTDRALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTANLIFED
:..: .:. .:.:..: .. :.:..::: :::: .:: :.:::.:.::: : ::.
CCDS76 ISSAEHAGLFLVMANVDPTIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFEN
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 CRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRMAFGAPLT
..:. .:::. : :.: :. .:. ::::::.: ::.:: .: .. : ..:. :: :
CCDS76 VKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLF
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 KLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAISHQAIQ
.: .: ..: .: ::.:::::. :: : . :::::::.::: ::: : . . :.
CCDS76 DFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEAGKPFIKEASMAKYYASEIAGQTTSKCIE
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410
pF1KE4 ILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
.::.::. ..:.:...:::.: ::::.:.:: .:: :. :
CCDS76 WMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHIDAEY
390 400 410 420 430
>>CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (421 aa)
initn: 726 init1: 549 opt: 901 Z-score: 1140.3 bits: 220.0 E(32554): 3.4e-57
Smith-Waterman score: 904; 37.5% identity (66.7% similar) in 411 aa overlap (15-412:13-421)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQ---------SVELPETHQMLLQTCRDFAEK
:.. ::. :: . : :. : .. . : : ::..
CCDS66 MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFARE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCAS
:..:.::. :: .:. ... :::. .::. :: :: . . ::.. ::
CCDS66 EIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC--
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 TGVIMSVN-NSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTA
::: ... ::: ::. :. .::. .. .: . . ..::: :::... .: :
CCDS66 TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE4 RAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTD---RALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKK
. .:: ...:: : ::::. .:. ..: .: .: ::....:.: :::. .:.:
CCDS66 EKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTAL
: ..: : :.: ...::: ..::...: : :::.:: ..: : .:. :.:.:: ::
CCDS66 ELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRAL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 DCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAM
: :..:: .: .:: :.. :.:.: ::.::. .: ::. ::: :. . :..
CCDS66 DEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 AKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLL
:: :.. :. .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: . .
CCDS66 AKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI
360 370 380 390 400 410
410
pF1KE4 RSYRS
.:..
CCDS66 DKYKN
420
>>CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (425 aa)
initn: 726 init1: 549 opt: 901 Z-score: 1140.2 bits: 220.0 E(32554): 3.4e-57
Smith-Waterman score: 908; 37.2% identity (66.0% similar) in 427 aa overlap (1-412:1-425)
10 20 30 40
pF1KE4 MAAAL--LARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQ---------SVELPETHQMLLQTCRDFA
:::.. : : . :.. ::. :: . : :. : .. . : : ::
CCDS44 MAAGFGRCCRCSLQVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGC
..:..:.::. :: .:. ... :::. .::. :: :: . . ::.. ::
CCDS44 REEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 ASTGVIMSVN-NSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAAST
::: ... ::: ::. :. .::. .. .: . . ..::: :::... .:
CCDS44 --TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKT
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 TARAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTD---RALQNKSISAFLVPMPTPGLTLG
:. .:: ...:: : ::::. .:. ..: .: .: ::....:.: :::. .:
CCDS44 KAEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 KKEDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQT
.:: ..: : :.: ...::: ..::...: : :::.:: ..: : .:. :.:.::
CCDS44 RKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 ALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEA
::: :..:: .: .:: :.. :.:.: ::.::. .: ::. ::: :. . :
CCDS44 ALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 AMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGH
..:: :.. :. .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: .
CCDS44 SIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVARE
360 370 380 390 400 410
410
pF1KE4 LLRSYRS
. .:..
CCDS44 HIDKYKN
420
>>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (385 aa)
initn: 722 init1: 549 opt: 897 Z-score: 1135.8 bits: 219.0 E(32554): 6.1e-57
Smith-Waterman score: 897; 38.5% identity (68.8% similar) in 384 aa overlap (33-412:4-385)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 AALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDK
:. : .. . : : ::..:..:.::. ::
CCDS65 MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVN-NS
.:. ... :::. .::. :: :: . . ::.. :: ::: ... ::
CCDS65 TGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC--TGVQTAIEGNS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLNG
: ::. :. .::. .. .: . . ..::: :::... .: :. .:: ...::
CCDS65 LGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIING
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KE4 TKAWITNAWEASAAVVFASTD---RALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSST
: ::::. .:. ..: .: .: ::....:.: :::. .:.:: ..: : :.:
CCDS65 QKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDT
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRM
...::: ..::...: : :::.:: ..: : .:. :.:.:: ::: :..:: .:
CCDS65 RGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATA
.:: :.. :.:.: ::.::. .: ::. ::: :. . :..:: :.. :.
CCDS65 TFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQ
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 ISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
.. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: . . .:..
CCDS65 LATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
340 350 360 370 380
>>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (330 aa)
initn: 850 init1: 756 opt: 894 Z-score: 1133.0 bits: 218.3 E(32554): 8.6e-57
Smith-Waterman score: 894; 44.1% identity (72.8% similar) in 331 aa overlap (80-410:1-330)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 EKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGC
....: : ::.: ..:. ....::...
CCDS81 MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVD
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 ASTGVIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTT
::..:. ..:.: : : :..::: ... .:. .:.: : ::: : :::. : .:
CCDS81 ASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTT-EKVGSFCLSEAGAGSDSFALKTR
40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ARAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKED
: ::: .::::.: ::..: .:. .:.:..: .. :.:..::: :::: .:: :.
CCDS81 ADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVDPTIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGKPEN
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 KLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDC
:::.:.::: : ::. ..:. .:::. : :.: :. .:. ::::::.: ::.:: .:
CCDS81 KLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGCFDY
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 AVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAK
.. : ..:. :: : .: .: ..: .: ::.:::::. :: : . :::::::.:::
CCDS81 TIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEAGKPFIKEASMAK
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 LAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRS
::: : . . :. .::.::. ..:.:...:::.: ::::.:.:: .:: :.
CCDS81 YYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAKHIDAE
270 280 290 300 310 320
410
pF1KE4 YRS
:
CCDS81 Y
330
>>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (426 aa)
initn: 798 init1: 487 opt: 858 Z-score: 1085.7 bits: 209.9 E(32554): 3.7e-54
Smith-Waterman score: 858; 37.8% identity (70.5% similar) in 373 aa overlap (34-402:45-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 ALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKELFPIAAQVDKE
: : ...: :: : ...: : : ..:.
CCDS10 VASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HLFPAAQV--KKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTGVIMSVNNS
. : . :..:.::.:.. .: . ::.:: :: ....::::::. ...:. ......
CCDS10 NEFKNLREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAHSN
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAEGDSWVLNG
: .. ... :.. ::. .. . ::. :: .:.:::. :::. . . :. .:. ..:::
CCDS10 LCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYILNG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KE4 TKAWITNAWEASAAVVFASTDRAL--QNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGIRGSSTA
.: ::::. .:.. .:.:.:: : ...:.::.: ::.. .:: ::::.:::.:
CCDS10 NKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRGSNTC
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 NLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNYAENRMA
.::::::.:: .:::. . : . :. ::. :. .:. ::. :..:: .. : . : :
CCDS10 ELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVREA
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 FGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAMAKLAASEAATAI
:: . ..:..: :.::: : . : .. .: :. . :. : . : ..: :: .
CCDS10 FGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDCAGVILYSAECATQV
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 SHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
. ..:: .:: ::....: : :::.. :: ::::..::::
CCDS10 ALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH
380 390 400 410 420
>>CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 (415 aa)
initn: 737 init1: 318 opt: 854 Z-score: 1080.8 bits: 209.0 E(32554): 7e-54
Smith-Waterman score: 854; 36.9% identity (69.7% similar) in 396 aa overlap (15-408:21-414)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHT-IYQSVELPETHQMLLQTCRDFAEKEL
:.: . :.: . : :. : : .. . .. ::: .:.
CCDS84 MLWSGCRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLNEEQKEFQKVAFDFAAREM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 FPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCASTG
: :. :...:::. ..: . ::. .. . ..::.::. : .. .: .. ::.::
CCDS84 APNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTARAE
. .:..: . : .::..::.. . :. . .:.. . :.:::.::::.. :.:. .
CCDS84 AYISIHN-MCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQ
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRALQNKSISAFLVPMPTPGLTLGKKEDKLGI
:: ..:::.::.:..: :.. ::. : :.:: ..: ::::..:::: :.:
CCDS84 GDHYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTGGP-GPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVGW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTALDCAVNY
.. : .::::: .: . .: :.:: ::.. :. :::.::: .:: :.... . ..
CCDS84 NSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRDH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAM-LKDNKKPFIKEAAMAKLAA
. : :: ::.. : .:: ::::: : .:::.. ::. :....: . .:::: :
CCDS84 LNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLFA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 SEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLLRSYRS
.. :: .::.:. ::.::. .. .... ::.:. .: ::..:..:..:. ::.
CCDS84 TDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE
360 370 380 390 400 410
>>CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (396 aa)
initn: 798 init1: 487 opt: 814 Z-score: 1030.5 bits: 199.6 E(32554): 4.4e-51
Smith-Waterman score: 814; 39.0% identity (72.4% similar) in 333 aa overlap (72-402:55-387)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LQTCRDFAEKELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIA
:..:.::.:.. .: . ::.:: :: ....
CCDS53 AGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQEFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLV
30 40 50 60 70 80
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 MEEISRGCASTGVIMSVNNSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGS
::::::. ...:. ......: .. ... :.. ::. .. . ::. :: .:.:::. ::
CCDS53 MEEISRASGAVGLSYGAHSNLCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGS
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210
pF1KE4 DAGAASTTARAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTDRAL--QNKSISAFLVPMPT
:. . . :. .:. ..:::.: ::::. .:.. .:.:.:: : ...:.::.:
CCDS53 DVVSMKLKAEKKGNHYILNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDLAAVPASRGITAFIVEKGM
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 PGLTLGKKEDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQA
::.. .:: ::::.:::.: .::::::.:: .:::. . : . :. ::. :. .:.
CCDS53 PGFSTSKKLDKLGMRGSNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGP
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 LGIAQTALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKK
::. :..:: .. : . : ::: . ..:..: :.::: : . : .. .: :. .
CCDS53 LGLMQAVLDHTIPYLHVREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGH
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 PFIKEAAMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQR
:. : . : ..: :: .. ..:: .:: ::....: : :::.. :: ::::..:
CCDS53 CTAKDCAGVILYSAECATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRR
330 340 350 360 370 380
400 410
pF1KE4 LVIAGHLLRSYRS
:::
CCDS53 LVIGRAFNADFH
390
412 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 22:56:23 2016 done: Sat Nov 5 22:56:24 2016
Total Scan time: 2.530 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]