Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4386
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4386, 406 aa
1>>>pF1KE4386 406 - 406 aa - 406 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5322+/-0.00081; mu= 11.6395+/- 0.048
mean_var=105.1830+/-21.504, 0's: 0 Z-trim(110.6): 43 B-trim: 217 in 2/50
Lambda= 0.125055
statistics sampled from 11727 (11769) to 11727 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.362), width: 16
Scan time: 3.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12200.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 406) 2806 516.7 1.5e-146
CCDS42493.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 ( 368) 1322 248.9 5.6e-66
CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 ( 460) 699 136.6 4.6e-32
CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 495) 608 120.2 4.3e-27
CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 444) 606 119.8 5e-27
CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 ( 496) 606 119.8 5.5e-27
CCDS1327.1 ANGPTL1 gene_id:9068|Hs108|chr1 ( 491) 591 117.1 3.6e-26
CCDS13009.1 ANGPT4 gene_id:51378|Hs108|chr20 ( 503) 581 115.3 1.3e-25
CCDS83313.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 298) 577 114.5 1.4e-25
CCDS56551.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 497) 577 114.6 2.1e-25
CCDS6306.1 ANGPT1 gene_id:284|Hs108|chr8 ( 498) 577 114.6 2.1e-25
CCDS128.1 ANGPTL7 gene_id:10218|Hs108|chr1 ( 346) 565 112.3 6.9e-25
CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9 ( 493) 561 111.7 1.5e-24
CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 548 109.4 7.3e-24
CCDS12224.1 ANGPTL6 gene_id:83854|Hs108|chr19 ( 470) 548 109.4 7.5e-24
CCDS300.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 299) 545 108.7 7.5e-24
CCDS6985.1 FCN1 gene_id:2219|Hs108|chr9 ( 326) 539 107.6 1.7e-23
CCDS6983.1 FCN2 gene_id:2220|Hs108|chr9 ( 313) 533 106.5 3.5e-23
CCDS301.1 FCN3 gene_id:8547|Hs108|chr1 ( 288) 522 104.5 1.3e-22
CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 494 99.5 3.9e-21
CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 494 99.5 4.2e-21
CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 469 95.1 1.4e-19
CCDS30943.1 TNN gene_id:63923|Hs108|chr1 (1299) 441 90.3 1.1e-17
CCDS1318.1 TNR gene_id:7143|Hs108|chr1 (1358) 423 87.1 1.1e-16
CCDS4736.1 TNXB gene_id:7148|Hs108|chr6 ( 673) 402 83.1 8.5e-16
CCDS6811.1 TNC gene_id:3371|Hs108|chr9 (2201) 397 82.5 4.2e-15
CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8 ( 312) 372 77.5 1.9e-14
CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 437) 352 74.0 3.1e-13
CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 453) 352 74.0 3.2e-13
CCDS3787.1 FGA gene_id:2243|Hs108|chr4 ( 866) 353 74.3 4.8e-13
CCDS8312.1 ANGPTL5 gene_id:253935|Hs108|chr11 ( 388) 311 66.6 4.7e-11
>>CCDS12200.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 (406 aa)
initn: 2806 init1: 2806 opt: 2806 Z-score: 2744.3 bits: 516.7 E(32554): 1.5e-146
Smith-Waterman score: 2806; 100.0% identity (100.0% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSGAPTAGAALMLCAATAVLLSAQGGPVQSKSPRFASWDEMNVLAHGLLQLGQGLREHAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSGAPTAGAALMLCAATAVLLSAQGGPVQSKSPRFASWDEMNVLAHGLLQLGQGLREHAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RTRSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDLPLAPESRVDPEVLHSLQTQLKAQNSRIQQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RTRSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDLPLAPESRVDPEVLHSLQTQLKAQNSRIQQLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HKVAQQQRHLEKQHLRIQHLQSQFGLLDHKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHNVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HKVAQQQRHLEKQHLRIQHLQSQFGLLDHKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHNVSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LHRLPRDCQELFQVGERQSGLFEIQPQGSPPFLVNCKMTSDGGWTVIQRRHDGSVDFNRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LHRLPRDCQELFQVGERQSGLFEIQPQGSPPFLVNCKMTSDGGWTVIQRRHDGSVDFNRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 WEAYKAGFGDPHGEFWLGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGNAELLQFSVHLGGEDTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WEAYKAGFGDPHGEFWLGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGNAELLQFSVHLGGEDTAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SLQLTAPVAGQLGATTVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWFGTCSHSNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLQLTAPVAGQLGATTVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWFGTCSHSNLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KE4 GQYFRSIPQQRQKLKKGIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GQYFRSIPQQRQKLKKGIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS
370 380 390 400
>>CCDS42493.1 ANGPTL4 gene_id:51129|Hs108|chr19 (368 aa)
initn: 2513 init1: 1316 opt: 1322 Z-score: 1298.0 bits: 248.9 E(32554): 5.6e-66
Smith-Waterman score: 2441; 90.4% identity (90.6% similar) in 406 aa overlap (1-406:1-368)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSGAPTAGAALMLCAATAVLLSAQGGPVQSKSPRFASWDEMNVLAHGLLQLGQGLREHAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSGAPTAGAALMLCAATAVLLSAQGGPVQSKSPRFASWDEMNVLAHGLLQLGQGLREHAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RTRSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDLPLAPESRVDPEVLHSLQTQLKAQNSRIQQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RTRSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDLPLAPESRVDPEVLHSLQTQLKAQNSRIQQLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HKVAQQQRHLEKQHLRIQHLQSQFGLLDHKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHNVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HKVAQQQRHLEKQHLRIQHLQSQFGLLDHKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHNVSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LHRLPRDCQELFQVGERQSGLFEIQPQGSPPFLVNCKMTSDGGWTVIQRRHDGSVDFNRP
::. :::::::::::::::::::
CCDS42 LHH--------------------------------------GGWTVIQRRHDGSVDFNRP
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 WEAYKAGFGDPHGEFWLGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGNAELLQFSVHLGGEDTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WEAYKAGFGDPHGEFWLGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGNAELLQFSVHLGGEDTAY
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SLQLTAPVAGQLGATTVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWFGTCSHSNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SLQLTAPVAGQLGATTVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWFGTCSHSNLN
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400
pF1KE4 GQYFRSIPQQRQKLKKGIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GQYFRSIPQQRQKLKKGIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS
330 340 350 360
>>CCDS622.1 ANGPTL3 gene_id:27329|Hs108|chr1 (460 aa)
initn: 738 init1: 371 opt: 699 Z-score: 689.1 bits: 136.6 E(32554): 4.6e-32
Smith-Waterman score: 699; 35.4% identity (67.2% similar) in 314 aa overlap (93-404:153-458)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDLPLAPESRVDPEVLHSLQTQLKAQNSRIQQLFHK
::. ::: ::.: .. :.. :..:..
CCDS62 KLESLLEEKILLQQKVKYLEEQLTNLIQNQPETPEHPEVT-SLKTFVEKQDNSIKDLLQT
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VAQQQRHLEKQHLRIQHLQSQFGLLD-HKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHNVSRL
: .: ..:..:: .:.....:. . .. . ... : : . : .. .:: .
CCDS62 VEDQYKQLNQQHSQIKEIENQLRRTSIQEPTEISLSSKPRAPRTTPFLQ-LNEIRNV-KH
190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 HRLPRDCQELFQVGERQSGLFEIQPQGSPPFLVNCKMTSDGGWTVIQRRHDGSVDFNRPW
.: .: ... ::. ::.. :.:..: : : : . : . ::.::.: ::: .::. :
CCDS62 DGIPAECTTIYNRGEHTSGMYAIRPSNSQVFHVYCDVISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETW
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EAYKAGFGDPHGEFWLGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGNAELLQFSVHLGGEDTAYS
: :: ::: :::::::::..::. . : : ..:.:: : . ...: .::...: :.
CCDS62 ENYKYGFGRLDGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKDNKHYIEYSFYLGNHETNYT
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LQLTAPVAGQLGATTVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWF-GTCSHSNLN
:.:.: ..:.. . : . .. ::::: : . :: .. :::::. :...:::
CCDS62 LHLVA-ITGNVPNAI--PENKDLVFSTWD--HKAKGHFNCPEGYSGGWWWHDECGENNLN
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400
pF1KE4 GQYFRSIPQQRQKLKKGIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS
:.: . ... . ..:. ::. :: : ...: :::.: .:.
CCDS62 GKYNKPRAKSKPERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE
420 430 440 450 460
>>CCDS47762.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 (495 aa)
initn: 462 init1: 285 opt: 608 Z-score: 599.9 bits: 120.2 E(32554): 4.3e-27
Smith-Waterman score: 608; 33.4% identity (63.5% similar) in 356 aa overlap (60-399:152-492)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 SKSPRFASWDEMNVLAHGLLQLGQGLREHAERTRSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDL
. :: .:. ::. ::. : . ....
CCDS47 AVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSEI
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PLAPE--SRVDPEVL-----HSLQTQ-LKAQNSRIQQLFHKVAQQQRHLEKQHLRIQHLQ
. : .. .:: : .: : .: .....: : :..:. .:. . .:
CCDS47 NKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVL---VSKQNSIIEELEKKIVTAT
190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 SQFGLLDHKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHNVSRLHRLP-RDCQELFQVGERQSG
. ..:.... :.. . . . : :. . .:.. ... ::: :.:. :. .:
CCDS47 VNNSVLQKQQ--HDLMETVN-NLLTMMSTSNSKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTTNG
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250
pF1KE4 LFEIQ-PQGSPPFLVNCKMTSDGG-WTVIQRRHDGSVDFNRPWEAYKAGFGDPHGEFWLG
.. . :... . . : : . :: ::.::::.::::::.: :. ::.:::.: ::.:::
CCDS47 IYTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYWLG
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 LEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGN-AELLQFSVHLGGEDTAYSLQLTA--PVAGQLGAT
: : ..:... : ..:.::.:: : : .:..:. : ..: . .::....
CCDS47 NEFVSQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKISSI
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 TVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWFGTCSHSNLNGQYFRSIPQQRQKLK
. : . ::: : :.: . .:.. :.::::: .:. :::::.:. :: ::. .
CCDS47 SQPGN----DFSTKDGDND-KCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYY---PQ-RQNTN
420 430 440 450 460
380 390 400
pF1KE4 K--GIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS
: :: : :.: : :.::::.:.:
CCDS47 KFNGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPADF
470 480 490
>>CCDS47761.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 (444 aa)
initn: 462 init1: 285 opt: 606 Z-score: 598.6 bits: 119.8 E(32554): 5e-27
Smith-Waterman score: 606; 33.5% identity (63.7% similar) in 358 aa overlap (60-399:100-441)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 SKSPRFASWDEMNVLAHGLLQLGQGLREHAERTRSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDL
. :: .:. ::. ::. : . ....
CCDS47 PLEYDDSVQRLQVLENIMENNTQWLMKVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSEI
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PLAPE--SRVDPEVL-----HSLQTQ-LKAQNSRIQQLFHKVAQQQRHLEKQHLRIQHLQ
. : .. .:: : .: : .: .....: : :..:. .:. . .:
CCDS47 NKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVL---VSKQNSIIEELEKKIVTAT
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190
pF1KE4 SQFGLLDHKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHN--VSRLHRLP-RDCQELFQVGERQ
. ..:.... :.. . . . : : . . :.. :.. ... ::: :.:. :.
CCDS47 VNNSVLQKQQ--HDLMETV--NNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTT
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 SGLFEIQ-PQGSPPFLVNCKMTSDGG-WTVIQRRHDGSVDFNRPWEAYKAGFGDPHGEFW
.:.. . :... . . : : . :: ::.::::.::::::.: :. ::.:::.: ::.:
CCDS47 NGIYTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYW
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 LGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGN-AELLQFSVHLGGEDTAYSLQLTA--PVAGQLG
:: : : ..:... : ..:.::.:: : : .:..:. : ..: . .::...
CCDS47 LGNEFVSQLTNQQRYVLKIHLKDWEGNEAYSLYEHFYLSSEELNYRIHLKGLTGTAGKIS
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 ATTVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWFGTCSHSNLNGQYFRSIPQQRQK
. . : . ::: : :.: . .:.. :.::::: .:. :::::.:. :: ::.
CCDS47 SISQPGN----DFSTKDGDND-KCICKCSQMLTGGWWFDACGPSNLNGMYY---PQ-RQN
370 380 390 400 410
380 390 400
pF1KE4 LKK--GIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS
.: :: : :.: : :.::::.:.:
CCDS47 TNKFNGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPADF
420 430 440
>>CCDS5958.1 ANGPT2 gene_id:285|Hs108|chr8 (496 aa)
initn: 462 init1: 285 opt: 606 Z-score: 597.9 bits: 119.8 E(32554): 5.5e-27
Smith-Waterman score: 606; 33.5% identity (63.7% similar) in 358 aa overlap (60-399:152-493)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 SKSPRFASWDEMNVLAHGLLQLGQGLREHAERTRSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDL
. :: .:. ::. ::. : . ....
CCDS59 AVMIEIGTNLLNQTAEQTRKLTDVEAQVLNQTTRLELQLLEHSLSTNKLEKQILDQTSEI
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PLAPE--SRVDPEVL-----HSLQTQ-LKAQNSRIQQLFHKVAQQQRHLEKQHLRIQHLQ
. : .. .:: : .: : .: .....: : :..:. .:. . .:
CCDS59 NKLQDKNSFLEKKVLAMEDKHIIQLQSIKEEKDQLQVL---VSKQNSIIEELEKKIVTAT
190 200 210 220 230
150 160 170 180 190
pF1KE4 SQFGLLDHKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHN--VSRLHRLP-RDCQELFQVGERQ
. ..:.... :.. . . . : : . . :.. :.. ... ::: :.:. :.
CCDS59 VNNSVLQKQQ--HDLMETV--NNLLTMMSTSNSAKDPTVAKEEQISFRDCAEVFKSGHTT
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 SGLFEIQ-PQGSPPFLVNCKMTSDGG-WTVIQRRHDGSVDFNRPWEAYKAGFGDPHGEFW
.:.. . :... . . : : . :: ::.::::.::::::.: :. ::.:::.: ::.:
CCDS59 NGIYTLTFPNSTEEIKAYCDMEAGGGGWTIIQRREDGSVDFQRTWKEYKVGFGNPSGEYW
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 LGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGN-AELLQFSVHLGGEDTAYSLQLTA--PVAGQLG
:: : : ..:... : ..:.::.:: : : .:..:. : ..: . .::...
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320 330 340 350 360 370
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380 390 400
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CCDS59 TNKFNGIKWYYWKGSGYSLKATTMMIRPADF
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CCDS13 RSKHQDGIFWAEYRGGSYSLRAVQMMIKPID
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CCDS83 RSTTMMIRPLDF
290
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]