Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4366
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4366, 383 aa
1>>>pF1KE4366 383 - 383 aa - 383 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3809+/-0.000392; mu= 16.2927+/- 0.024
mean_var=70.0959+/-14.829, 0's: 0 Z-trim(112.3): 36 B-trim: 1839 in 2/50
Lambda= 0.153189
statistics sampled from 21077 (21112) to 21077 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16
Scan time: 8.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001267 (OMIM: 181500,601525,611960) chitinase-3 ( 383) 2605 585.1 9.5e-167
NP_003456 (OMIM: 600031,614122) chitotriosidase-1 ( 466) 1389 316.4 8.9e-86
NP_003991 (OMIM: 601526) chitinase-3-like protein ( 390) 1376 313.4 5.6e-85
NP_001020368 (OMIM: 601526) chitinase-3-like prote ( 380) 1336 304.6 2.5e-82
NP_970615 (OMIM: 606080) acidic mammalian chitinas ( 476) 1309 298.7 1.9e-80
NP_001020370 (OMIM: 601526) chitinase-3-like prote ( 311) 1133 259.7 6.8e-69
NP_002548 (OMIM: 603578) oviduct-specific glycopro ( 678) 1130 259.2 2.1e-68
NP_001243054 (OMIM: 600031,614122) chitotriosidase ( 447) 999 230.2 7.6e-60
NP_001244932 (OMIM: 606080) acidic mammalian chiti ( 368) 905 209.3 1.2e-53
XP_016856537 (OMIM: 606080) PREDICTED: acidic mamm ( 368) 905 209.3 1.2e-53
NP_001244930 (OMIM: 606080) acidic mammalian chiti ( 368) 905 209.3 1.2e-53
NP_068569 (OMIM: 606080) acidic mammalian chitinas ( 368) 905 209.3 1.2e-53
XP_016856536 (OMIM: 606080) PREDICTED: acidic mamm ( 315) 745 173.9 4.5e-43
NP_001035713 (OMIM: 606080) acidic mammalian chiti ( 315) 745 173.9 4.5e-43
XP_006710640 (OMIM: 606080) PREDICTED: acidic mamm ( 315) 745 173.9 4.5e-43
NP_001244933 (OMIM: 606080) acidic mammalian chiti ( 315) 745 173.9 4.5e-43
NP_001244931 (OMIM: 606080) acidic mammalian chiti ( 315) 745 173.9 4.5e-43
NP_001244934 (OMIM: 606080) acidic mammalian chiti ( 315) 745 173.9 4.5e-43
NP_001257438 (OMIM: 600031,614122) chitotriosidase ( 421) 534 127.4 6.2e-29
>>NP_001267 (OMIM: 181500,601525,611960) chitinase-3-lik (383 aa)
initn: 2605 init1: 2605 opt: 2605 Z-score: 3114.6 bits: 585.1 E(85289): 9.5e-167
Smith-Waterman score: 2605; 100.0% identity (100.0% similar) in 383 aa overlap (1-383:1-383)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFAN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKQHFTTLIKEMKAEFIKEAQPGKKQLLLSAALSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKQHFTTLIKEMKAEFIKEAQPGKKQLLLSAALSA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRFSNTDYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRFSNTDYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 VGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASSETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGTLAYYEIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASSETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGTLAYYEIC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWALDLDDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWALDLDDFQ
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE4 GSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
:::::::::::::::::::::::
NP_001 GSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
370 380
>>NP_003456 (OMIM: 600031,614122) chitotriosidase-1 isof (466 aa)
initn: 1379 init1: 626 opt: 1389 Z-score: 1661.0 bits: 316.4 E(85289): 8.9e-86
Smith-Waterman score: 1389; 53.2% identity (80.5% similar) in 380 aa overlap (9-381:9-386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFAN
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NP_003 MVRSVAWAGFMVLLMIPWGSAAKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFI
..: ...: :::: ::: .: ::. ::.:::::..::::::.:.:. .......:.::.
NP_003 MTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 KSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRR-----DKQHFTTLIKEMKAEFIKEAQP-GKKQLLL
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NP_003 NSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRF
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NP_003 SAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAAS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASS-ETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGT
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NP_003 LNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LAYYEICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWA
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NP_003 LAYYEVCSW-KGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWA
310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE4 LDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
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NP_003 LDLDDFAGFSCNQG-RYPLIQTLRQELSLPYLPSGTPELEVPKPGQPSEPEHGPSPGQDT
360 370 380 390 400 410
>>NP_003991 (OMIM: 601526) chitinase-3-like protein 2 is (390 aa)
initn: 1358 init1: 656 opt: 1376 Z-score: 1646.6 bits: 313.4 E(85289): 5.6e-85
Smith-Waterman score: 1376; 51.2% identity (80.0% similar) in 385 aa overlap (1-382:6-389)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHII
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NP_003 MGATTMDQKSLWAGVVVLLLLQGGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 YSFANISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQS
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NP_003 YSFASIENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 RRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKQHFTTLIKEMKAEFIKE-AQPGKKQLLL
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NP_003 RLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKDFTKSTKERLLL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGT--TGHHSPLFRGQEDASPD
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NP_003 TAGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQDRGPS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RFSNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASSETGVGAPISGPGIPGRFTKEAG
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NP_003 SYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGPGAAGPITESSG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 TLAYYEICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVW
:::::::.::.:: . :. ::::::.:::::::::: .:...:::.::. .:.:::.:
NP_003 FLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLNLGGAMIW
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KE4 ALDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
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NP_003 SIDMDDFTGKSCNQG-PYPLVQAVKRSLGSL
370 380 390
>>NP_001020368 (OMIM: 601526) chitinase-3-like protein 2 (380 aa)
initn: 1318 init1: 656 opt: 1336 Z-score: 1599.0 bits: 304.6 E(85289): 2.5e-82
Smith-Waterman score: 1336; 51.4% identity (80.9% similar) in 366 aa overlap (20-382:15-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFAN
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NP_001 MGATTMDQKSLWAGSAYKLVCYFTNWSQDRQEPGKFTPENIDPFLCSHLIYSFAS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFI
: :... . ..: :: .:.::..::.:: :::.::. :::. : ..... :: ::
NP_001 IENNKVIIKDKSEVMLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKGFHPMVDSSTSRLEFI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 KSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKQHFTTLIKEMKAEFIKE-AQPGKKQLLLSAALS
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NP_001 NSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKDFTKSTKERLLLTAGVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 AGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGT--TGHHSPLFRGQEDASPDRFSNT
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NP_001 AGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPLSKGWQDRGPSSYYNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASSETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGTLAYY
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NP_001 EYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGPGAAGPITESSGFLAYY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 EICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWALDLD
:::.::.:: . :. ::::::.:::::::::: .:...:::.::. .:.:::.:..:.:
NP_001 EICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLKNLNLGGAMIWSIDMD
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE4 DFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
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NP_001 DFTGKSCNQG-PYPLVQAVKRSLGSL
360 370 380
>>NP_970615 (OMIM: 606080) acidic mammalian chitinase is (476 aa)
initn: 1262 init1: 542 opt: 1309 Z-score: 1565.3 bits: 298.7 E(85289): 1.9e-80
Smith-Waterman score: 1309; 51.2% identity (77.2% similar) in 381 aa overlap (8-380:8-387)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFAN
::.:... :: :::.:.::.:.:.::: : : .:: .: ::::.::.::.
NP_970 MTKLILLTGLVLILNLQLGSAYQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDNIDPCLCTHLIYAFAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFI
.:..: : :::::::: .: :::.: .:::::..::::::. :. ..:. ..:.:::
NP_970 RQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 KSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRR-----DKQHFTTLIKEMKAEFIKEA-QPGKKQLLL
:: ::: . :::::. : ::: : ::. ::.:..::. : .:: : .: .:..
NP_970 TSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRF
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NP_970 TAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAY
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLAS-SETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGT
:.::...: :::: ::..:.::.:..: :.. :.::.::: :: : : ..::.:
NP_970 LNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LAYYEICDFLR-GATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVW
:::::: ::. ::: :.:::: .:: :::::. .: :.:.:: ...:::::
NP_970 WAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNIKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVW
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KE4 ALDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
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NP_970 AIDLDDFTGTFCNQG-KFPLISTLKKALGLQSASCTAPAQPIEPITAAPSGSGNGSGSSS
370 380 390 400 410
>>NP_001020370 (OMIM: 601526) chitinase-3-like protein 2 (311 aa)
initn: 1135 init1: 656 opt: 1133 Z-score: 1357.8 bits: 259.7 E(85289): 6.8e-69
Smith-Waterman score: 1133; 51.6% identity (81.6% similar) in 310 aa overlap (76-382:2-310)
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LDRFLCTHIIYSFANISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQR
:: .:.::..::.:: :::.::. :::.
NP_001 MLYQTINSLKTKNPKLKILLSIGGYLFGSKG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 FSKIASNTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKQHFTTLIKEMKAEFIKE-
: ..... :: ::.:. :::.:.:::::..:.:: .... :::.::.:. : :.
NP_001 FHPMVDSSTSRLEFINSIILFLRNHNFDGLDVSWIYPDQKENTHFTVLIHELAEAFQKDF
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 AQPGKKQLLLSAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGT--TGHHSPL
.. :..:::.:..:::. ::.::.. :... ::::.....::::.:. :::.:::
NP_001 TKSTKERLLLTAGVSAGRQMIDNSYQVEKLAKDLDFINLLSFDFHGSWEKPLITGHNSPL
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 FRGQEDASPDRFSNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASSETGVGAPISGPG
.: .: .:. . :..::::: .. : :. :.::::::.:.::::::.:: :::: ::::
NP_001 SKGWQDRGPSSYYNVEYAVGYWIHKGMPSEKVVMGIPTYGHSFTLASAETTVGAPASGPG
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 IPGRFTKEAGTLAYYEICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLK
: .:. .: :::::::.::.:: . :. ::::::.:::::::::: .:...:::.::
NP_001 AAGPITESSGFLAYYEICQFLKGAKITRLQDQQVPYAVKGNQWVGYDDVKSMETKVQFLK
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380
pF1KE4 DRQLAGAMVWALDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
. .:.:::.:..:.::: :. :.: .::..:.: .:..
NP_001 NLNLGGAMIWSIDMDDFTGKSCNQG-PYPLVQAVKRSLGSL
280 290 300 310
>>NP_002548 (OMIM: 603578) oviduct-specific glycoprotein (678 aa)
initn: 991 init1: 342 opt: 1130 Z-score: 1349.2 bits: 259.2 E(85289): 2.1e-68
Smith-Waterman score: 1130; 46.8% identity (73.4% similar) in 380 aa overlap (9-380:9-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFAN
:.:... . .:.:::::.:.:.. : : .: .: :: :::::.:..::.
NP_002 MWKLLLWVGLVLVLKHHDGAAHKLVCYFTNWAHSRPGPASILPHDLDPFLCTHLIFAFAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 ISNDHIDTWEWNDVT-LYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTF
..:..: . . .: :: .: ::.:: .::::::.::::::..::. . :. .:. :
NP_002 MNNNQIVAKDLQDEKILYPEFNKLKERNRELKTLLSIGGWNFGTSRFTTMLSTFANREKF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRR-----DKQHFTTLIKEMKAEFIKEAQ-PGKKQLL
: :: .:::: :::::: .:::: : :. : ::.:. : ::: . .::
NP_002 IASVISLLRTHDFDGLDLFFLYPGLRGSPMHDRWTFLFLIEELLFAFRKEALLTMRPRLL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 LSAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDR
::::.:. ...:::. ... ::::....::.::.:. :::.:::: :: :
NP_002 LSAAVSGVPHIVQTSYDVRFLGRLLDFINVLSYDLHGSWERFTGHNSPLFSLPED--P--
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 FSNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTL-ASSETGVGAPISGPGIPGRFTKEAG
... ::..: .::::. ::.:::::.::.: : .:..:. : ::. ::..::. :
NP_002 -KSSAYAMNYWRKLGAPSEKLIMGIPTYGRTFRLLKASKNGLQARAIGPASPGKYTKQEG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 TLAYYEICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVW
:::.:::.:. :: : : : ::::.::..:::::. : . :. ... ....:::::
NP_002 FLAYFEICSFVWGAKKHWIDYQYVPYANKGKEWVGYDNAISFSYKAWFIRREHFGGAMVW
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE4 ALDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
.::.:: .:.::: :::. ...: :
NP_002 TLDMDDVRGTFCGTG-PFPLVYVLNDILVRAEFSSTSLPQFWLSSAVNSSSTDPERLAVT
360 370 380 390 400 410
>>NP_001243054 (OMIM: 600031,614122) chitotriosidase-1 i (447 aa)
initn: 1253 init1: 626 opt: 999 Z-score: 1195.4 bits: 230.2 E(85289): 7.6e-60
Smith-Waterman score: 1229; 49.5% identity (75.5% similar) in 380 aa overlap (9-381:9-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MGVKASQTGFVVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYREGDGSCFPDALDRFLCTHIIYSFAN
::.::... :: :::::.:.:.:::.:.. .: :: ::::.::.::.
NP_001 MVRSVAWAGFMVLLMIPWGSAAKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ISNDHIDTWEWNDVTLYGMLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFI
..: ...: :::: ::: .: :: . :. .......:.::.
NP_001 MTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLK-------------------KMFTDMVATANNRQTFV
70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE4 KSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRR-----DKQHFTTLIKEMKAEFIKEAQP-GKKQLLL
.:. ::: ..:::::: : ::: . ::..::::.... : .::: ::..:::
NP_001 NSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SAALSAGKVTIDSSYDIAKISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRF
:::. ::.. .:..:.. ::.:.:::...:.:::::.:. .:::.:::.. ::...
NP_001 SAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAAS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 SNTDYAVGYMLRLGAPASKLVMGIPTFGRSFTLASS-ETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGT
:.: :: :. :.:::::..:.::.::::::::: .: :::: .: : :: ::::.:
NP_001 LNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGM
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LAYYEICDFLRGATVHRILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWA
:::::.:.. .::: .:: :.::: . :::::.:: :: :.::.:::.. :.::::::
NP_001 LAYYEVCSW-KGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWA
290 300 310 320 330 340
360 370 380
pF1KE4 LDLDDFQGSFCGQDLRFPLTNAIKDALAAT
:::::: : :.: :.:: ..... :.
NP_001 LDLDDFAGFSCNQG-RYPLIQTLRQELSLPYLPSGTPELEVPKPGQPSEPEHGPSPGQDT
350 360 370 380 390
>>NP_001244932 (OMIM: 606080) acidic mammalian chitinase (368 aa)
initn: 858 init1: 315 opt: 905 Z-score: 1084.4 bits: 209.3 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 905; 49.3% identity (76.1% similar) in 280 aa overlap (109-380:1-279)
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 MLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLA
..:. ..:.::: :: ::: . :::::.
NP_001 MVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFD
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 WLYPGRR-----DKQHFTTLIKEMKAEFIKEA-QPGKKQLLLSAALSAGKVTIDSSYDIA
: ::: : ::. ::.:..::. : .:: : .: .:...::..:: .:.:.:.:
NP_001 WEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIP
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRFSNTDYAVGYMLRLGAPAS
..::.::.: .::::.::.:.: ::..:::.. :.. . . :.::...: ::::
NP_001 QLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAE
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 KLVMGIPTFGRSFTLAS-SETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGTLAYYEICDFLR-GATVHR
::..:.::.:..: :.. :.::.::: :: : : ..::.: :::::: ::. :::
NP_001 KLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGW
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 ILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWALDLDDFQGSFCGQDLRF
:.:::: .:: :::::. .: :.:.:: ...::::::.::::: :.::.: .:
NP_001 DAPQEVPYAYQGNVWVGYDNIKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQG-KF
220 230 240 250 260
380
pF1KE4 PLTNAIKDALAAT
:: ...: ::
NP_001 PLISTLKKALGLQSASCTAPAQPIEPITAAPSGSGNGSGSSSSGGSSGGSGFCAVRANGL
270 280 290 300 310 320
>>XP_016856537 (OMIM: 606080) PREDICTED: acidic mammalia (368 aa)
initn: 858 init1: 315 opt: 905 Z-score: 1084.4 bits: 209.3 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 905; 49.3% identity (76.1% similar) in 280 aa overlap (109-380:1-279)
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 MLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGSQRFSKIASNTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLA
..:. ..:.::: :: ::: . :::::.
XP_016 MVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFD
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 WLYPGRR-----DKQHFTTLIKEMKAEFIKEA-QPGKKQLLLSAALSAGKVTIDSSYDIA
: ::: : ::. ::.:..::. : .:: : .: .:...::..:: .:.:.:.:
XP_016 WEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIP
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 KISQHLDFISIMTYDFHGAWRGTTGHHSPLFRGQEDASPDRFSNTDYAVGYMLRLGAPAS
..::.::.: .::::.::.:.: ::..:::.. :.. . . :.::...: ::::
XP_016 QLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAE
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 KLVMGIPTFGRSFTLAS-SETGVGAPISGPGIPGRFTKEAGTLAYYEICDFLR-GATVHR
::..:.::.:..: :.. :.::.::: :: : : ..::.: :::::: ::. :::
XP_016 KLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGW
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 ILGQQVPYATKGNQWVGYDDQESVKSKVQYLKDRQLAGAMVWALDLDDFQGSFCGQDLRF
:.:::: .:: :::::. .: :.:.:: ...::::::.::::: :.::.: .:
XP_016 DAPQEVPYAYQGNVWVGYDNIKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQG-KF
220 230 240 250 260
380
pF1KE4 PLTNAIKDALAAT
:: ...: ::
XP_016 PLISTLKKALGLQSASCTAPAQPIEPITAAPSGSGNGSGSSSSGGSSGGSGFCAVRANGL
270 280 290 300 310 320
383 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 02:02:07 2016 done: Sun Nov 6 02:02:08 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]