Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4357
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4357, 374 aa
1>>>pF1KE4357 374 - 374 aa - 374 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0124+/-0.000805; mu= 13.9446+/- 0.048
mean_var=93.1487+/-19.070, 0's: 0 Z-trim(110.1): 75 B-trim: 441 in 1/52
Lambda= 0.132888
statistics sampled from 11307 (11389) to 11307 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 1644 325.1 5.8e-89
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 1510 299.4 3.1e-81
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 1207 241.4 1.2e-63
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 1199 239.9 3.4e-63
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1091 219.1 5.7e-57
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1012 204.0 2e-52
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 919 186.0 3.3e-47
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 916 185.5 5.9e-47
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 668 138.2 2e-32
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 667 138.0 2.3e-32
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 667 138.0 2.3e-32
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 646 133.9 3.8e-31
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 614 127.7 2.1e-29
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 614 127.8 2.5e-29
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 610 127.0 4.2e-29
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 605 126.0 7.2e-29
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 576 120.4 3.3e-27
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 576 120.5 3.8e-27
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 576 120.5 3.8e-27
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 569 119.2 1e-26
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 556 116.7 5.7e-26
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 556 116.7 5.8e-26
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 544 114.3 2.3e-25
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 542 113.9 3e-25
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 524 110.5 3.3e-24
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 520 109.7 5.6e-24
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 503 106.4 5.1e-23
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 503 106.4 5.2e-23
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 452 96.5 3.2e-20
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 445 95.2 7.8e-20
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 440 94.2 1.5e-19
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 426 91.5 9.8e-19
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 424 91.2 1.3e-18
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 424 91.2 1.3e-18
CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 354 77.8 1.6e-14
CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 354 78.0 2.6e-14
CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 349 76.8 3e-14
CCDS12907.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 287) 348 76.6 3.1e-14
CCDS12909.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 275) 329 72.9 3.7e-13
CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 265) 303 67.9 1.1e-11
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 298 67.0 2.3e-11
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 288 65.1 8.9e-11
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 288 65.1 9e-11
>>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 (348 aa)
initn: 1642 init1: 1642 opt: 1644 Z-score: 1710.7 bits: 325.1 E(32554): 5.8e-89
Smith-Waterman score: 2311; 92.8% identity (93.0% similar) in 374 aa overlap (1-374:1-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT--
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILLFFLLHRWCSNKKNA
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ------------------------GNPRHLHILIGTSVVIILFILLFFLLHRWCSNKKNA
240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTE
280 290 300 310 320 330
370
pF1KE4 LPNAESRSKVVSCP
::::::::::::::
CCDS12 LPNAESRSKVVSCP
340
>>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 (341 aa)
initn: 2264 init1: 1507 opt: 1510 Z-score: 1572.0 bits: 299.4 E(32554): 3.1e-81
Smith-Waterman score: 2069; 85.0% identity (89.6% similar) in 366 aa overlap (1-365:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:::.::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::: :.::::
CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLDI
:::: :.:::.::::::::::::::::. : :::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS33 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNGT
:: ::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS33 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTER
::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::.:
CCDS33 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSET--
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE4 MFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHRWCSNKKN
.::::::.:::::::::::::: :::::::: ::::
CCDS33 ------------------------GNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKN
240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 AAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYT
:.::::: :::::.: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYT
280 290 300 310 320 330
360 370
pF1KE4 ELPNAESRSKVVSCP
::::::
CCDS33 ELPNAEP
340
>>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 (444 aa)
initn: 2230 init1: 1200 opt: 1207 Z-score: 1256.4 bits: 241.4 E(32554): 1.2e-63
Smith-Waterman score: 1810; 78.4% identity (84.4% similar) in 352 aa overlap (24-374:119-444)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV
: ::::::::::: :::: : ::::::::.
CCDS42 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA
:::::.::.::. .: ::.:. :::::::::::. : :::::::::::::.:::.::
CCDS42 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
::::::::. : ::::::::: :: : :::.:::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS42 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
::: :::::::::::::::::::::::. :::::: :::::::::::::.:::::::
CCDS42 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PSSKTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHR
::::. .::::::::::::::::::::: :::::
CCDS42 PSSKS--------------------------GNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHL
330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 WCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP
:::::::::::::: ::::::::::::::::.::::.::.::::::::::::::::::::
CCDS42 WCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDSDEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPP
370 380 390 400 410 420
360 370
pF1KE4 TDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
:: :.:::::::. ::::::::
CCDS42 TDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
430 440
>>CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (455 aa)
initn: 2260 init1: 1193 opt: 1199 Z-score: 1247.9 bits: 239.9 E(32554): 3.4e-63
Smith-Waterman score: 1747; 76.7% identity (83.5% similar) in 352 aa overlap (24-374:119-444)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV
: ::::::::::: :.:: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA
:::::.:::::. .: ::.:. :::::::::::. . ::::::::::: :::::.::
CCDS12 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
::::::::: ::::::::::: :::: ::::::::::: ::::.:::::::::::::: :
CCDS12 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
:::: :::::::::::::::::::::::. : ::.::::::::::::::.:::::::
CCDS12 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PSSKTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHR
::::. . : ::::.::::::::.::::: ::::.:
CCDS12 PSSKS----------------------GIC----RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYR
330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 WCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP
:::::::::::::: ::.::.: .::::::::::::.::.:::: ::::.:::::::::
CCDS12 WCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDSDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPL
370 380 390 400 410 420
360 370
pF1KE4 TDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
:: ::::::::: ::::::::
CCDS12 TDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQSGLEGVF
430 440 450
>>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 1615 init1: 1091 opt: 1091 Z-score: 1136.3 bits: 219.1 E(32554): 5.7e-57
Smith-Waterman score: 1606; 72.7% identity (78.7% similar) in 352 aa overlap (24-374:119-427)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV
: ::::::::::: :.:: :::::::::::
CCDS58 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA
:::::.:::::. .: ::.:. :::::::::::. . ::::::::::: :::::.::
CCDS58 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
::::::::: ::::::::::: :::: ::::::::::: ::::.:::::::::::::: :
CCDS58 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
:::: :::::::::::::::::::::::. : ::.:::::::::::
CCDS58 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTG-----------
270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PSSKTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHR
: ::::.::::::::.::::: ::::.:
CCDS58 --------------IC------------------RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYR
320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 WCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP
:::::::::::::: ::.::.: .::::::::::::.::.:::: ::::.:::::::::
CCDS58 WCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDSDEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPL
350 360 370 380 390 400
360 370
pF1KE4 TDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
:: ::::::::: ::::::::
CCDS58 TDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQSGLEGVF
410 420 430
>>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa)
initn: 2117 init1: 1012 opt: 1012 Z-score: 1054.8 bits: 204.0 E(32554): 2e-52
Smith-Waterman score: 1435; 68.1% identity (77.3% similar) in 335 aa overlap (24-357:119-410)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV
::::::::::::: :::: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSA
::.:::::::. .: :::.:. ::. :..:.:.. :: :::::::.::::: ::..::
CCDS12 RFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PSDPLDIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
::::::::..::: ::::::: :::: ::::::::::::: .:.::::::.:: : :: :
CCDS12 PSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
.:::::::.:::::.::::.:::::::. :. :: :::: ::::::
CCDS12 VLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRALPHAWSDPSDPLPVSVTGNS---------
270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PSSKTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILF-ILLFFLLHR
:.::.::::::::: : :::::::::
CCDS12 ----------------------------------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHR
320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 WCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP
::.:::::.::::: :::::.: :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS12 WCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPP
350 360 370 380 390 400
360 370
pF1KE4 TDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
:: :
CCDS12 TDTSV
410
>--
initn: 433 init1: 232 opt: 328 Z-score: 346.1 bits: 72.8 E(32554): 5.9e-13
Smith-Waterman score: 328; 46.3% identity (65.9% similar) in 123 aa overlap (1-122:1-117)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:::.::::::::::::.: ::: : . :: : : :: .:. . : ::: : . :..: :
CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 HRE-GMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLD
.: :: . : .. . . .: .. .: :::::: .: ::: ::::.:.
CCDS12 SKEDGMP------VPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNG
:..
CCDS12 IMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDA
120 130 140 150 160 170
>>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa)
initn: 982 init1: 799 opt: 919 Z-score: 961.0 bits: 186.0 E(32554): 3.3e-47
Smith-Waterman score: 999; 56.5% identity (68.9% similar) in 299 aa overlap (1-298:3-270)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHF
:: :. .::.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPL
:... : . . : .. . .: :: .: :::::: : ::: . ::::.::
CCDS42 TLYKK----DGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVN
:.. ::::::::.:. :::: :::::::::::.::.:.::::::::::: :::: :..:
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
::::::::::::::: ::::::::: :::::: :::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHRWCSNK
: : :::: .: ::.:::: .: :::::::::.:
CCDS42 -------GIA-------------------RHLHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKK
240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIV
:
CCDS42 KMLL
270
>>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa)
initn: 1379 init1: 795 opt: 916 Z-score: 956.5 bits: 185.5 E(32554): 5.9e-47
Smith-Waterman score: 1122; 53.0% identity (64.1% similar) in 368 aa overlap (1-368:3-305)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHF
:: :. .::.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LLHREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPL
:... : . . : .. . .: :: .: :::::: : ::: . ::::.::
CCDS42 TLYKK----DGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DIVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVN
:.. ::::::::.:. :::: :::::::::::.::.:.::::::::::: :::: :..:
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
::::::::::::::: ::::::::: :::::: :::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILLFFLLHRWCSNKK
.
CCDS42 D-----------------------------------------------------------
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQEVTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVY
::::.:: ::.::.: :::::::::::::.::.::.::::::: :::: : : :: :
CCDS42 -AAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDPQEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVC
240 250 260 270 280 290
360 370
pF1KE4 TELPNAESRSKVVSCP
:::::: :.
CCDS42 IELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGSSRETTALSQTQLASSNVPAAGI
300 310 320 330 340
>>CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (650 aa)
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Smith-Waterman score: 671; 37.7% identity (64.7% similar) in 377 aa overlap (24-374:221-578)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV
:: .:::: ..:: .: :::. ::: ::.
CCDS42 RRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEETLTLQCGSDA
200 210 220 230 240 250
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEH-HDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVS
...:.:...: : :.: : . . :.:.:::... .... .: :::::. . : . :
CCDS42 GYNRFVLYKDGE-RDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 APSDPLDIVIIG-LYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHER-R
::::::::.: : .:.. :::.: :::: .:::::: :.:.. .. . :..:: : . :
CCDS42 APSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWR
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220
pF1KE4 LPAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSW
: . . . .::.::.::.: :.:::::.:: ..:: .. :::: . :.: ::..
CCDS42 LRSTYQ-SQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSG-PSGGP
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 PSPTE-PSSKTERMFHHVGQACLKL-PTSSDPTVSACQSN-PRHLHILIGTSVVIILFIL
::: :.: . : : ::.::: ::. ::: ..:: :..::..:
CCDS42 SSPTTGPTSTS-------GPEDQPLTPTGSDP-----QSGLGRHLGVVIGILVAVILLLL
430 440 450 460 470
290 300 310 320
pF1KE4 LFFLL-----HR-----WCSNKKNAAVMDQESAG-------NRTANSEDSDEQDPQEVT-
:..:: :: : :....: :. :: .: . ..: : :: .
CCDS42 LLLLLFLILRHRRQGKHWTSTQRKADF--QHPAGAVGPEPTDRGLQWRSSPAADAQEENL
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370
pF1KE4 YTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
:. ..: . . .. :. . ..:.:. ... : ...: :
CCDS42 YAAVKHTQ-PEDGVEMDTRSPHDEDPQAVTYAEVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDR
540 550 560 570 580 590
CCDS42 QAEEDRQMDTEAAASEAPQDVTYAQLHSLTLRREATEPPPSQEGPSPAVPSIYATLAIH
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 373 init1: 182 opt: 410 Z-score: 428.2 bits: 88.7 E(32554): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 410; 35.9% identity (61.8% similar) in 220 aa overlap (1-216:1-215)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:. ... . :.:. : . . : ::.: :.:: .. . : :.: . ... :
CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCY-GSVTHSPYQVSAPSDPLD
.:: . : . . :.:..: : .: . .: :::: :: : . : ::::.
CCDS42 YREKKTAPWITRIPQ--ELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGR---SESSDPLE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGE-AHERRLPAGPKVN
.:. : : ::.:::: .:.: .: ::::.:.:. ..: . : .::: : . : . :..
CCDS42 LVVTGAYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHAR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGT--YRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSS
:. .: : .::.. . :::.. .:::::: :: :
CCDS42 GSSRAIFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 KTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILLFFLLHRWCSN
CCDS42 VAPEETLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY
240 250 260 270 280 290
>>CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 (651 aa)
initn: 659 init1: 361 opt: 667 Z-score: 694.5 bits: 138.0 E(32554): 2.3e-32
Smith-Waterman score: 673; 37.7% identity (65.0% similar) in 377 aa overlap (24-374:221-579)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDV
:: .:::: ..:: .: :::. ::: ::.
CCDS42 RRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPIVAPEETLTLQCGSDA
200 210 220 230 240 250
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 MFEHFLLHREGMFNDTLRLIGEH-HDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVS
...:.:...: : :.: : . . :.:.:::... .... .: :::::. . : . :
CCDS42 GYNRFVLYKDGE-RDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 APSDPLDIVIIG-LYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHER-R
::::::::.: : .:.. :::.: :::: .:::::: :.:.. .. . :..:: : . :
CCDS42 APSDPLDILIAGQFYDRVSLSVQPGPTVASGENVTLLCQSQGWMQTFLLTKEGAADDPWR
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220
pF1KE4 LPAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSW
: . . . .::.::.::.: :.:::::.:: ..:: .. :::: . :.: ::..
CCDS42 LRSTYQ-SQKYQAEFPMGPVTSAHAGTYRCYGSQSSKPYLLTHPSDPLELVVSG-PSGGP
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 PSPTE-PSSKTERMFHHVGQACLKL-PTSSDPTVSACQSN-PRHLHILIGTSVVIILFIL
::: :.: . .: : ::.::: ::. ::: ..:: :..::..:
CCDS42 SSPTTGPTSTS------AGPEDQPLTPTGSDP-----QSGLGRHLGVVIGILVAVILLLL
430 440 450 460 470
290 300 310 320
pF1KE4 LFFLL-----HR-----WCSNKKNAAVMDQESAG-------NRTANSEDSDEQDPQEVT-
:..:: :: : :....: :. :: .: . ..: : :: .
CCDS42 LLLLLFLILRHRRQGKHWTSTQRKADF--QHPAGAVGPEPTDRGLQWRSSPAADAQEENL
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370
pF1KE4 YTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
:. ..: . . .. :. . ..:.:. ... : ...: :
CCDS42 YAAVKHTQ-PEDGVEMDTRSPHDEDPQAVTYAEVKHSRPRREMASPPSPLSGEFLDTKDR
540 550 560 570 580 590
CCDS42 QAEEDRQMDTEAAASEAPQDVTYAQLHSLTLRREATEPPPSQEGPSPAVPSIYATLAIH
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 373 init1: 182 opt: 410 Z-score: 428.2 bits: 88.7 E(32554): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 410; 35.9% identity (61.8% similar) in 220 aa overlap (1-216:1-215)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:. ... . :.:. : . . : ::.: :.:: .. . : :.: . ... :
CCDS42 MTPILTVLICLGLSLGPRTHVQAGHLPKPTLWAEPGSVITQGSPVTLRCQGGQETQEYRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCY-GSVTHSPYQVSAPSDPLD
.:: . : . . :.:..: : .: . .: :::: :: : . : ::::.
CCDS42 YREKKTAPWITRIPQ--ELVKKGQFPIPSITWEHTGRYRCYYGSDTAGR---SESSDPLE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IVIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGE-AHERRLPAGPKVN
.:. : : ::.:::: .:.: .: ::::.:.:. ..: . : .::: : . : . :..
CCDS42 LVVTGAYIKPTLSAQPSPVVNSGGNVTLQCDSQVAFDGFILCKEGEDEHPQCLNSQPHAR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGT--YRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSS
:. .: : .::.. . :::.. .:::::: :: :
CCDS42 GSSRAIFSVGPVSPSRRWWYRCYAYDSNSPYEWSLPSDLLELLVLGVSKKPSLSVQPGPI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 KTERMFHHVGQACLKLPTSSDPTVSACQSNPRHLHILIGTSVVIILFILLFFLLHRWCSN
CCDS42 VAPEETLTLQCGSDAGYNRFVLYKDGERDFLQLAGAQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY
240 250 260 270 280 290
374 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]