Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4332
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4332, 341 aa
1>>>pF1KE4332 341 - 341 aa - 341 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8140+/-0.000716; mu= 14.4218+/- 0.043
mean_var=84.9115+/-16.685, 0's: 0 Z-trim(111.0): 72 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.139185
statistics sampled from 11969 (12043) to 11969 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 2343 479.9 1.3e-135
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 2118 434.7 5.4e-122
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 1865 384.0 1.3e-106
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 1821 375.1 6e-104
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1139 238.2 9.8e-63
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1051 220.5 1.9e-57
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 1046 219.4 2.8e-57
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 892 188.5 6.8e-48
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 703 150.7 3e-36
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 703 150.7 3e-36
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 702 150.5 3.4e-36
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 629 135.9 9.1e-32
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 629 135.9 9.1e-32
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 627 135.5 1.2e-31
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 627 135.5 1.2e-31
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 606 131.2 1.7e-30
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 584 126.8 3.7e-29
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 584 126.8 3.9e-29
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 584 126.8 4.4e-29
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 582 126.4 5.9e-29
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 572 124.4 2e-28
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 571 124.1 2.3e-28
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 563 122.5 7e-28
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 556 121.1 1.8e-27
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 556 121.1 1.8e-27
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 552 120.3 3.3e-27
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 552 120.4 3.8e-27
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 552 120.4 3.8e-27
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 524 114.6 1.1e-25
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 505 110.7 1.5e-24
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 470 103.7 1.9e-22
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 449 99.5 3.7e-21
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 449 99.5 3.7e-21
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 431 95.9 4.4e-20
CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 368 83.3 3.2e-16
CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 368 83.4 5.2e-16
CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 339 77.4 1.7e-14
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 303 70.2 2.3e-12
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 298 69.2 4.7e-12
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 298 69.2 4.7e-12
CCDS12874.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 252) 291 67.7 1.1e-11
CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 265) 287 67.0 2.1e-11
CCDS12875.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 263) 286 66.7 2.4e-11
CCDS12873.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 267) 286 66.8 2.4e-11
CCDS46173.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 271) 285 66.6 2.8e-11
CCDS82395.1 TARM1 gene_id:441864|Hs108|chr19 ( 279) 278 65.2 7.5e-11
>>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 (341 aa)
initn: 2343 init1: 2343 opt: 2343 Z-score: 2548.0 bits: 479.9 E(32554): 1.3e-135
Smith-Waterman score: 2343; 99.4% identity (99.7% similar) in 341 aa overlap (1-341:1-341)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTEPSSETGN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS33 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSETGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 PRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE4 VTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS33 VTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
310 320 330 340
>>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 (348 aa)
initn: 1882 init1: 1647 opt: 2118 Z-score: 2303.7 bits: 434.7 E(32554): 5.4e-122
Smith-Waterman score: 2118; 91.2% identity (96.2% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
:::.::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::: :.::::
CCDS12 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
:::: :.:::.::::::::::::::::. : :::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS12 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
:: ::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS12 VIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTEPSSETGN
::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::: :::::::.:::
CCDS12 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 PRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQE
:::::.:::::::::::::: :::::::: :::::.::::: :::::.: ::::::::::
CCDS12 PRHLHILIGTSVVIILFILL-FFLLHRWCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQE
250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KE4 VTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
:::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS12 VTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
300 310 320 330 340
>>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 (444 aa)
initn: 2396 init1: 1860 opt: 1865 Z-score: 2027.6 bits: 384.0 E(32554): 1.3e-106
Smith-Waterman score: 1865; 84.9% identity (91.8% similar) in 318 aa overlap (24-341:119-436)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
: :::::::::::::::: : ::::::::.
CCDS42 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
:.::.::.:: :: .:.:. ::::::::::::::: :::::::::::::.::::::
CCDS42 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
::::::::.:: :::::::::::: : :::::::::::::::::::::::: :::::. :
CCDS42 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTE
::: :::::::::::::::::::::::: ::::::. :::::::::::::.:: ::::
CCDS42 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
:::..:::::::.:::::::::::::::::::: :: :::::.:::::::::::.: :::
CCDS42 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340
pF1KE4 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
:::::.:::::::.::::::::::.::::::::::: :.:::::::.:
CCDS42 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
390 400 410 420 430 440
>--
initn: 303 init1: 193 opt: 310 Z-score: 340.1 bits: 71.7 E(32554): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 310; 43.9% identity (64.2% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
::::::::.:::.::.: : :: : . :: : : :. .: : :.: ::..:.:
CCDS42 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
..: : .: : : . . .:...:. ::.: : :: ::: ::::.:. :
CCDS42 YKE----DRIH-IPIFHGRIFQESFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
..:
CCDS42 MVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGV
120 130 140 150 160 170
>>CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (455 aa)
initn: 1821 init1: 1821 opt: 1821 Z-score: 1979.7 bits: 375.1 E(32554): 6e-104
Smith-Waterman score: 1821; 84.3% identity (91.2% similar) in 318 aa overlap (24-341:119-436)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
: :::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
:.::.::::: .: .:.:. :::::::::::::.: ::::::::::: ::::::::
CCDS12 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
:::::::::::::::::::::::::: :::.::::::: ::::.:::::::::::::. :
CCDS12 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTE
:::: :::::::::::::::::::::::: : :::::::::::::::::.:: ::::
CCDS12 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
:::..: :::::::::::::.::::::::::.::: :::::.::::::::.:::::.::
CCDS12 PSSKSGICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340
pF1KE4 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
:::::::::::::.:::: ::::..:::::::: :: ::::::::::
CCDS12 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ
390 400 410 420 430 440
CCDS12 SGLEGVF
450
>--
initn: 307 init1: 187 opt: 331 Z-score: 362.7 bits: 75.9 E(32554): 7e-14
Smith-Waterman score: 331; 47.2% identity (62.6% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
::: ::::.:::::::::::: : . :: : :.:. .: : ::: :..:.:
CCDS12 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
..: : : . : . . .: .::. :::::: :: :: ::::.:: :
CCDS12 YKE----DRSH-VPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
..:
CCDS12 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV
120 130 140 150 160 170
>>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 1192 init1: 1139 opt: 1139 Z-score: 1239.8 bits: 238.2 E(32554): 9.8e-63
Smith-Waterman score: 1681; 80.2% identity (86.2% similar) in 318 aa overlap (24-341:119-419)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
: :::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS58 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
:.::.::::: .: .:.:. :::::::::::::.: ::::::::::: ::::::::
CCDS58 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
:::::::::::::::::::::::::: :::.::::::: ::::.:::::::::::::. :
CCDS58 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTE
:::: :::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::::
CCDS58 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGIC---------
270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
:::::::::::::.::::::::::.::: :::::.::::::::.:::::.::
CCDS58 --------RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340
pF1KE4 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
:::::::::::::.:::: ::::..:::::::: :: ::::::::::
CCDS58 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ
380 390 400 410 420 430
CCDS58 SGLEGVF
>--
initn: 307 init1: 187 opt: 331 Z-score: 362.9 bits: 75.9 E(32554): 6.8e-14
Smith-Waterman score: 331; 47.2% identity (62.6% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
::: ::::.:::::::::::: : . :: : :.:. .: : ::: :..:.:
CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
..: : : . : . . .: .::. :::::: :: :: ::::.:: :
CCDS58 YKE----DRSH-VPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
..:
CCDS58 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV
120 130 140 150 160 170
>>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa)
initn: 2201 init1: 1051 opt: 1051 Z-score: 1144.7 bits: 220.5 E(32554): 1.9e-57
Smith-Waterman score: 1560; 75.7% identity (85.4% similar) in 309 aa overlap (24-332:119-410)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
:::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
::..::::::: .: :.:.:. ::. :..:.:.::: :::::::.::::: ::.:::
CCDS12 RFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
::::::::..::: :::::::::::: :::.::::::::: .:.::::::.:: : :..:
CCDS12 PSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTE
.:::::::.:::::.::::.:::::::: :. ::. :::: ::::::
CCDS12 VLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRALPHAWSDPSDPLPVSVTGNS---------
270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 PSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
:.:::::::::::: : .:::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS12 --------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHRWCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340
pF1KE4 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
::::::::::::::::::::::::.::::::::::: :
CCDS12 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTSV
380 390 400 410
>--
initn: 356 init1: 231 opt: 348 Z-score: 381.8 bits: 79.3 E(32554): 6e-15
Smith-Waterman score: 348; 47.2% identity (66.7% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
::::::::.:::::::.: ::: : . :: : : :: .:. . : ::: : . :..: :
CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
.: : . . : .. . . .: .::. :::::: .: ::: ::::.:. :
CCDS12 SKE----DGMP-VPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
..:
CCDS12 MVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAG
120 130 140 150 160 170
>>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa)
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Smith-Waterman score: 1046; 59.3% identity (75.5% similar) in 273 aa overlap (1-273:3-270)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHF
:: :. ..:.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL
:.. :: . . : .. . .: :.:. :::::: : ::: . ::::.::
CCDS42 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN
:..:::::::::.:.::::: :::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..:
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTEPSSET
::::::::::::::: ::::::::. ::::::. :::: ::::::::.:: :::::: .:
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDP
: ::::..: ::.:::: .: :::::::: .::
CCDS42 GIARHLHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKKKMLL
240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE4 QEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
>>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa)
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Smith-Waterman score: 1178; 56.6% identity (69.8% similar) in 341 aa overlap (1-341:3-303)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHF
:: :. ..:.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 LLHREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL
:.. :: . . : .. . .: :.:. :::::: : ::: . ::::.::
CCDS42 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN
:..:::::::::.:.::::: :::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..:
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTEPSSET
::::::::::::::: ::::::::. ::::::. :::: ::::::::.:: :::::: .:
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDP
.:.::.:::::.:::::::::::::
CCDS42 -----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDP
240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KE4 QEVTYAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
::::::::.::.::::::: :::: : : :: : :::::::
CCDS42 QEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGS
270 280 290 300 310 320
CCDS42 SRETTALSQTQLASSNVPAAGI
330 340
>>CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (631 aa)
initn: 409 init1: 398 opt: 703 Z-score: 764.3 bits: 150.7 E(32554): 3e-36
Smith-Waterman score: 735; 39.9% identity (67.2% similar) in 338 aa overlap (24-341:220-551)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
:: ::::::. ::.. ... ::: :::
CCDS33 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLS
...:.:..::. .: :. :.. . :.:.:::..::. .. .: :::::. . : . :
CCDS33 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
250 260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 APSDPLDIVITG-LYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRF
::::::::.::: .:. :::::::::: .::..:: :.::. .: . :..:: ::
CCDS33 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLR
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220
pF1KE4 SAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWL
. .::.::..:.: :.:::::.:: ..:. : :.:: . :.:. ..: :
CCDS33 LRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSL
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SPTEPSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLL--------HRWCCNKKNAVVMDQE
:: : : : :.:.::::.::...:...::.::: :: ..:. :.
CCDS33 PPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDF---QR
430 440 450 460 470 480
290 300 310 320 330
pF1KE4 PAG-------NRTVNREDSDEQDPQEVT-YAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVY
::: .: . :..: : :: . :: .. . .. .. :: :. . ..:
CCDS33 PAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKD-TQSEDRVELDSQSPHDEDPQAVTY
490 500 510 520 530 540
340
pF1KE4 TELPNAEP
. . .. :
CCDS33 APVKHSSPRREMASPPSSLSGEFLDTKDRQVEEDRQMDTEAAASEASQDVTYAQLHSLTL
550 560 570 580 590 600
>--
initn: 312 init1: 197 opt: 447 Z-score: 486.5 bits: 99.3 E(32554): 8.9e-21
Smith-Waterman score: 447; 35.1% identity (64.0% similar) in 222 aa overlap (1-218:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
:. .....:.:. : . . : ::.: :.:: ... : . : .... :.. :
CCDS33 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
.::. . . .. . .:: ::: : : :: :::. .: : :::::..
CCDS33 DKEGSPEPWDR--NNPLEPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCH---YYSSAGWSEPSDPLEL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRFSAGPKVN
:.::.:.::.::: :.:.: .: ..:: :.:...: . : .::: :. : ... .
CCDS33 VMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDSQQLHS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWLSPTEPSS
: ::: ::.::.: : . :. . ..:. ::. :::: .
CCDS33 GGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQ
CCDS33 LAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY
240 250 260 270 280 290
>>CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (632 aa)
initn: 409 init1: 398 opt: 703 Z-score: 764.3 bits: 150.7 E(32554): 3e-36
Smith-Waterman score: 731; 39.9% identity (66.3% similar) in 338 aa overlap (24-341:220-552)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
:: ::::::. ::.. ... ::: :::
CCDS46 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RFQHFLLHREGKFKDTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLS
...:.:..::. .: :. :.. . :.:.:::..::. .. .: :::::. . : . :
CCDS46 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
250 260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 APSDPLDIVITG-LYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRF
::::::::.::: .:. :::::::::: .::..:: :.::. .: . :..:: ::
CCDS46 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLR
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220
pF1KE4 SAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWL
. .::.::..:.: :.:::::.:: ..:. : :.:: . :.:. ..: :
CCDS46 LRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSL
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SPTEPSSETGNPRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLL--------HRWCCNKKNAVVMDQE
:: : : : :.:.::::.::...:...::.::: :: ..:. :.
CCDS46 PPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDF---QR
430 440 450 460 470 480
290 300 310 320 330
pF1KE4 PAG-------NRTVNREDSDEQDPQEVT-YAQLNHCVFTQRKITHPSQRPKTPPTDIIVY
::: .: . :..: : :: . :: .. .: .: :. . ..:
CCDS46 PAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQQSPHDEDPQAVTY
490 500 510 520 530 540
340
pF1KE4 TELPNAEP
. . .. :
CCDS46 APVKHSSPRREMASPPSSLSGEFLDTKDRQVEEDRQMDTEAAASEASQDVTYAQLHSLTL
550 560 570 580 590 600
>--
initn: 312 init1: 197 opt: 447 Z-score: 486.5 bits: 99.3 E(32554): 8.9e-21
Smith-Waterman score: 447; 35.1% identity (64.0% similar) in 222 aa overlap (1-218:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
:. .....:.:. : . . : ::.: :.:: ... : . : .... :.. :
CCDS46 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
.::. . . .. . .:: ::: : : :: :::. .: : :::::..
CCDS46 DKEGSPEPWDR--NNPLEPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCH---YYSSAGWSEPSDPLEL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE4 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRFSAGPKVN
:.::.:.::.::: :.:.: .: ..:: :.:...: . : .::: :. : ... .
CCDS46 VMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDSQQLHS
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