Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4316
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4316, 323 aa
1>>>pF1KE4316 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3846+/-0.00087; mu= 15.1758+/- 0.052
mean_var=65.6089+/-13.472, 0's: 0 Z-trim(105.8): 28 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.158341
statistics sampled from 8570 (8597) to 8570 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 2173 505.2 2.7e-143
CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 2123 493.8 7.5e-140
CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1927 449.0 2.3e-126
CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1923 448.1 4.3e-126
CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 1839 428.9 2.5e-120
CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 1321 310.6 1.1e-84
CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 1171 276.3 2e-74
CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 1165 275.0 5.3e-74
CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1069 253.0 2.2e-67
CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1008 239.1 3.5e-63
CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 946 225.0 6.9e-59
CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 922 219.5 2.9e-57
CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 788 188.7 2.3e-48
CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 585 142.5 3.9e-34
CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 366 92.4 3.6e-19
CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 366 92.4 4.2e-19
CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 366 92.5 5e-19
>>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 2173 init1: 2173 opt: 2173 Z-score: 2686.0 bits: 505.2 E(32554): 2.7e-143
Smith-Waterman score: 2173; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
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CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
:::::::::::::::::::::::
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123 Z-score: 2624.2 bits: 493.8 E(32554): 7.5e-140
Smith-Waterman score: 2123; 97.8% identity (99.4% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::.::::::
CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.: ::::::::
CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
:::::::::::::::::::::::
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1927 init1: 1927 opt: 1927 Z-score: 2382.3 bits: 449.0 E(32554): 2.3e-126
Smith-Waterman score: 1927; 87.9% identity (95.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
::::.::::::::::::::::::::: :::.:::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS70 MDSKHQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
:::::::::::::::::::::::::: . ::::::::::: :::. ::::::::::: :.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
:.:::::. : :::::..:: ::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.:.. ::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
::..:.. : ::. ::::.::::
CCDS70 RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
310 320
>>CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1923 init1: 1923 opt: 1923 Z-score: 2377.3 bits: 448.1 E(32554): 4.3e-126
Smith-Waterman score: 1923; 87.6% identity (95.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
::::.::.:::::::::::::::::: :::.:::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDSKHQCLKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
:::::::::::::::::::::::::: . ::::::::::: :::. ::::::::::: :.
CCDS73 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
:.:::::. : :::::..:: ::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.:.. ::::::::::::::
CCDS73 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.
CCDS73 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
::..:.. : ::. ::::.::::
CCDS73 RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
310 320
>>CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1839 init1: 1839 opt: 1839 Z-score: 2273.6 bits: 428.9 E(32554): 2.5e-120
Smith-Waterman score: 1839; 82.7% identity (95.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
:: ::: :.::::::::::::::::: :::...:.:.:::::::::::::::.:::::::
CCDS70 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
:::::::::::::::::::::::::::. .:..:.:::: :::.::::::::::.:::.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
..:::: .:::::::..:::::: ::::..:::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS70 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNCRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
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CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::.::..::::
CCDS70 LCALAKKHKQTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
:: ::...:.. :.:::::::
CCDS70 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
310 320
>>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 1310 init1: 1261 opt: 1321 Z-score: 1634.1 bits: 310.6 E(32554): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 1321; 58.7% identity (85.2% similar) in 317 aa overlap (8-323:10-326)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYA-PAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNN
. :.::. .:..:.:::. : .::. ..:.::..:.::::.:..:.:
CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIH
:..:: ::: :::.:.:.:::::: .::: ..: ::.:::.:::.:. :::::::::.:.
CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL
:.. :::.:. :.::::: :. .:::::::.: ::::::.::.:::::::::::.::
CCDS58 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLE
::::::.::: :::::::::.: ::: ::...:::..::: ::. :. ::. .:: ::.
CCDS58 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAID
: .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::..: :.:.:.:: :::: :.
CCDS58 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE4 GLNRNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
.::.:::.. : .. :.::: :::
CCDS58 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
310 320
>>CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (290 aa)
initn: 1160 init1: 1111 opt: 1171 Z-score: 1449.6 bits: 276.3 E(32554): 2e-74
Smith-Waterman score: 1171; 59.6% identity (85.9% similar) in 277 aa overlap (8-283:10-286)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYA-PAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNN
. :.::. .:..:.:::. : .::. ..:.::..:.::::.:..:.:
CCDS55 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIH
:..:: ::: :::.:.:.:::::: .::: ..: ::.:::.:::.:. :::::::::.:.
CCDS55 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FPVSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMIL
:.. :::.:. :.::::: :. .:::::::.: ::::::.::.:::::::::::.::
CCDS55 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 NKPGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLE
::::::.::: :::::::::.: ::: ::...:::..::: ::. :. ::. .:: ::.
CCDS55 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAID
: .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::..: ::
CCDS55 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQVARSS
250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE4 GLNRNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
>>CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (297 aa)
initn: 1152 init1: 1152 opt: 1165 Z-score: 1442.1 bits: 275.0 E(32554): 5.3e-74
Smith-Waterman score: 1877; 89.8% identity (91.3% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.::::::.::::::
CCDS81 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
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CCDS81 SVK--------------------------AMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]