Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4315
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4315, 323 aa
1>>>pF1KE4315 323 - 323 aa - 323 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6825+/-0.000906; mu= 13.9086+/- 0.054
mean_var=72.2342+/-14.768, 0's: 0 Z-trim(106.3): 29 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.150905
statistics sampled from 8893 (8918) to 8893 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 2164 480.3 8.7e-136
CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 1848 411.5 4.5e-115
CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1847 411.3 5.2e-115
CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 1843 410.4 9.5e-115
CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 1818 405.0 4.1e-113
CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 1285 289.0 3.6e-78
CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 1132 255.6 3.4e-68
CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1066 241.3 7.8e-64
CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 1032 233.9 1.3e-61
CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1011 229.3 3.1e-60
CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 936 213.0 2.8e-55
CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 905 206.2 2.8e-53
CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 653 151.2 4.5e-37
CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 606 141.1 1.1e-33
CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 513 120.9 1.2e-27
CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 363 88.1 6.8e-18
CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 363 88.2 7.9e-18
>>CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 2164 init1: 2164 opt: 2164 Z-score: 2551.3 bits: 480.3 E(32554): 8.7e-136
Smith-Waterman score: 2164; 99.4% identity (99.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
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CCDS70 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMILNKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS70 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNCRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LCALAKKHKQTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
:::::::::::::::::::::::
CCDS70 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
310 320
>>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1848 init1: 1848 opt: 1848 Z-score: 2179.5 bits: 411.5 E(32554): 4.5e-115
Smith-Waterman score: 1848; 83.0% identity (95.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
:: ::: :.::::::::::::::::: :::...:.:.:::::::::::::::.:::::::
CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
:::::::::::::::::::::::::::. .:..:.:::: :::.::::::::::.:::.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMILNKP
..:::: .:::::::..:::::: ::::..:::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAVEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
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CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::.::..::::
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
:: ::...:.. :.:::::::
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1847 init1: 1847 opt: 1847 Z-score: 2178.3 bits: 411.3 E(32554): 5.2e-115
Smith-Waterman score: 1847; 84.2% identity (93.5% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
:: :.: :.::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::.:::::::
CCDS70 MDSKHQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
:::::::::::::::::::::::::: :: .:..:.::::.:::: :::::::::.: ::
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMILNKP
.::::: : ::::::::: ::: .:::.::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS70 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
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CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::::..:::.
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
:: .: : . .::.::.::::
CCDS70 RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
310 320
>>CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1843 init1: 1843 opt: 1843 Z-score: 2173.6 bits: 410.4 E(32554): 9.5e-115
Smith-Waterman score: 1843; 83.9% identity (93.5% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
:: :.: ..::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::.:::::::
CCDS73 MDSKHQCLKLNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRSKALEVTKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
:::::::::::::::::::::::::: :: .:..:.::::.:::: :::::::::.: ::
CCDS73 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSTFHRPELVRPALENSLKKAQLDYVDLYLIHSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMILNKP
.::::: : ::::::::: ::: .:::.::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS73 SLKPGEELSPTDENGKVIFDIVDLCTTWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNRRQLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::.:.::::::::::::::::.::::.:: : ::::::::::::::
CCDS73 GLKYKPVCNQVECHPYFNRSKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSQRDKRWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::.::::..:::.
CCDS73 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTAEDMKAIDGLD
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
:: .: : . .::.::.::::
CCDS73 RNLHYFNSDSFASHPNYPYSDEY
310 320
>>CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 (323 aa)
initn: 1818 init1: 1818 opt: 1818 Z-score: 2144.2 bits: 405.0 E(32554): 4.1e-113
Smith-Waterman score: 1818; 81.7% identity (94.7% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
:: ::: :.::::::::::::::::: :::...:.:..::::::::.:::::..::::::
CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
:::::::::::::::::::::::::: . .:..:.:::: :::.::::::::::.:::.
CCDS70 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMILNKP
..:::: .:::::::..:::::: ::::.:::::::::::::::::::.: ::::::::
CCDS70 SVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNKP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLEDPV
::::::::::::::::.:: :::::::::::::::.::::..:.. ::::::::::::::
CCDS70 GLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDPV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLDGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::.::..::::
CCDS70 LCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGLN
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE4 RNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
:: ::...:.. :.:::::::
CCDS70 RNVRYLTLDIFAGPPNYPFSDEY
310 320
>>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 1259 init1: 1200 opt: 1285 Z-score: 1517.0 bits: 289.0 E(32554): 3.6e-78
Smith-Waterman score: 1285; 56.7% identity (84.6% similar) in 319 aa overlap (6-323:8-326)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNN
.:. :.::. .:..:.:::. :. .:.. . .:.::..:.::::.::.:.:
CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLH
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CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FPMALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMIL
:::.:::. :.::::: .. .: ::::.:: ::::::.::.:::::: ::::.::
CCDS58 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 NKPGLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLE
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CCDS58 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLD
: .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::.::.:.:.:.:: :.:: ..
CCDS58 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQIFDFSLTEEEMKDIE
250 260 270 280 290 300
300 310 320
pF1KE4 GLNRNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
.::.: :.: . . :::.::: :::
CCDS58 ALNKNVRFVELLMWRDHPEYPFHDEY
310 320
>>CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (290 aa)
initn: 1106 init1: 1047 opt: 1132 Z-score: 1337.7 bits: 255.6 E(32554): 3.4e-68
Smith-Waterman score: 1132; 57.7% identity (85.3% similar) in 279 aa overlap (6-283:8-286)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPE-VPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNN
.:. :.::. .:..:.:::. :. .:.. . .:.::..:.::::.::.:.:
CCDS55 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EEQVGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLH
:..:: ::: :::.:.:.:::::: .::: : :.::.:.:: .:. :::::::::...
CCDS55 EHEVGEAIREKIAEGKVRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYIIE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FPMALKPGETPLPKDENGKVIFDTVDLSATWEVMEKCKDAGLAKSIGVSNFNYRQLEMIL
:::.:::. :.::::: .. .: ::::.:: ::::::.::.:::::: ::::.::
CCDS55 VPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 NKPGLKYKPVCNQVECHPYLNQSKLLDFCKSKDIVLVAHSALGTQRHKLWVDPNSPVLLE
::::::.::: ::::::::..: ::: ::...:::..:.: :::.:. .::. .:: ::.
CCDS55 NKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLLK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 DPVLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRENIQVFEFQLTSEDMKVLD
: .: .:.:....: : :.::...::::::. ::.: .::.::.::
CCDS55 DALLNSLGKRYNKTAAQIVLRFNIQRGVVVIPKSFNLERIKENFQVARSS
250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE4 GLNRNYRYVVMDFLMDHPDYPFSDEY
>>CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 986 init1: 726 opt: 1066 Z-score: 1259.5 bits: 241.3 E(32554): 7.8e-64
Smith-Waterman score: 1066; 48.3% identity (79.5% similar) in 317 aa overlap (7-323:4-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPKYQRVELNDGHFMPVLGFGTYAPPEVPRNRAVEVTKLAIEAGFRHIDSAYLYNNEEQ
:. ::.: ::.::.::. : : ....:..:.::..:.:::: :..:.::..
CCDS58 MASRLLLNNGAKMPILGLGTWKSP--P-GQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 VGLAIRSKIADGSVKREDIFYTSKLWCTFFQPQMVQPALESSLKKLQLDYVDLYLLHFPM
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]