FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4259, 1038 aa
1>>>pF1KE4259 1038 - 1038 aa - 1038 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0883+/-0.000583; mu= 7.7220+/- 0.036
mean_var=152.8841+/-31.268, 0's: 0 Z-trim(111.3): 58 B-trim: 246 in 2/48
Lambda= 0.103727
statistics sampled from 19850 (19889) to 19850 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 10.530
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006382 (OMIM: 605586) importin-7 [Homo sapiens] (1038) 6944 1052.6 0
NP_006381 (OMIM: 605600) importin-8 isoform 1 [Hom (1037) 4591 700.4 1.3e-200
XP_016874180 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8 (1020) 4479 683.7 1.4e-195
XP_016874181 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8 ( 975) 4361 666.0 2.8e-190
NP_001177924 (OMIM: 605600) importin-8 isoform 2 [ ( 832) 3684 564.7 7.7e-160
XP_016874182 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8 ( 532) 2539 393.2 2e-108
XP_011526901 (OMIM: 601342) PREDICTED: exportin-2 ( 945) 362 67.6 3.8e-10
NP_001307 (OMIM: 601342) exportin-2 isoform 1 [Hom ( 971) 362 67.6 3.9e-10
NP_001243064 (OMIM: 601342) exportin-2 isoform 2 [ ( 915) 250 50.8 4.2e-05
NP_057422 (OMIM: 610889) importin-11 isoform 2 [Ho ( 975) 201 43.5 0.0071
NP_001128251 (OMIM: 610889) importin-11 isoform 1 (1015) 201 43.5 0.0073
>>NP_006382 (OMIM: 605586) importin-7 [Homo sapiens] (1038 aa)
initn: 6944 init1: 6944 opt: 6944 Z-score: 5625.7 bits: 1052.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6944; 100.0% identity (100.0% similar) in 1038 aa overlap (1-1038:1-1038)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPNTIIEALRGTMDPALREAAERQLNEAHKSLNFVSTLLQITMSEQLDLPVRQAGVIYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MDPNTIIEALRGTMDPALREAAERQLNEAHKSLNFVSTLLQITMSEQLDLPVRQAGVIYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KNMITQYWPDRETAPGDISPYTIPEEDRHCIRENIVEAIIHSPELIRVQLTTCIHHIIKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KNMITQYWPDRETAPGDISPYTIPEEDRHCIRENIVEAIIHSPELIRVQLTTCIHHIIKH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DYPSRWTAIVDKIGFYLQSDNSACWLGILLCLYQLVKNYEYKKPEERSPLVAAMQHFLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DYPSRWTAIVDKIGFYLQSDNSACWLGILLCLYQLVKNYEYKKPEERSPLVAAMQHFLPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LKDRFIQLLSDQSDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LKDRFIQLLSDQSDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 PNETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PNETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVGV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QQVLLKVLYQYKEKQYMAPRVLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QQVLLKVLYQYKEKQYMAPRVLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMCY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TDADEELWQEDPYEYIRMKFDVFEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TDADEELWQEDPYEYIRMKFDVFEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQILT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EPNADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARACWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EPNADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARACWVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 HYFCEVKFKSDQNLQTALELTRRCLIDDREMPVKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HYFCEVKFKSDQNLQTALELTRRCLIDDREMPVKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFIR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 PVMQALLHIIRETENDDLTNVIQKMICEYSEEVTPIAVEMTQHLAMTFNQVIQTGPDEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PVMQALLHIIRETENDDLTNVIQKMICEYSEEVTPIAVEMTQHLAMTFNQVIQTGPDEEG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 SDDKAVTAMGILNTIDTLLSVVEDHKEITQQLEGICLQVIGTVLQQHVLEFYEEIFSLAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SDDKAVTAMGILNTIDTLLSVVEDHKEITQQLEGICLQVIGTVLQQHVLEFYEEIFSLAH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 SLTCQQVSPQMWQLLPLVFEVFQQDGFDYFTDMMPLLHNYVTVDTDTLLSDTKYLEMIYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SLTCQQVSPQMWQLLPLVFEVFQQDGFDYFTDMMPLLHNYVTVDTDTLLSDTKYLEMIYS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 MCKKVLTGVAGEDAECHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVEAALERLTREVKTSELRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MCKKVLTGVAGEDAECHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVEAALERLTREVKTSELRT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 MCLQVAIAALYYNPHLLLNTLENLRFPNNVEPVTNHFITQWLNDVDCFLGLHDRKMCVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MCLQVAIAALYYNPHLLLNTLENLRFPNNVEPVTNHFITQWLNDVDCFLGLHDRKMCVLG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 LCALIDMEQIPQVLNQVSGQILPAFILLFNGLKRAYACHAEHENDSDDDDEAEDDDETEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LCALIDMEQIPQVLNQVSGQILPAFILLFNGLKRAYACHAEHENDSDDDDEAEDDDETEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 LGSDEDDIDEDGQEYLEILAKQAGEDGDDEDWEEDDAEETALEGYSTIIDDEDNPVDEYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LGSDEDDIDEDGQEYLEILAKQAGEDGDDEDWEEDDAEETALEGYSTIIDDEDNPVDEYQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 IFKAIFQTIQNRNPVWYQALTHGLNEEQRKQLQDIATLADQRRAAHESKMIEKHGGYKFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IFKAIFQTIQNRNPVWYQALTHGLNEEQRKQLQDIATLADQRRAAHESKMIEKHGGYKFS
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KE4 APVVPSSFNFGGPAPGMN
::::::::::::::::::
NP_006 APVVPSSFNFGGPAPGMN
1030
>>NP_006381 (OMIM: 605600) importin-8 isoform 1 [Homo sa (1037 aa)
initn: 2777 init1: 2554 opt: 4591 Z-score: 3722.7 bits: 700.4 E(85289): 1.3e-200
Smith-Waterman score: 4591; 64.5% identity (86.7% similar) in 1042 aa overlap (1-1038:1-1037)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPNTIIEALRGTMDPALREAAERQLNEAHKSLNFVSTLLQITMSEQLDLPVRQAGVIYL
:: : ::.::.::.:: :: ::: .::...: .::. .::.: .:.....:::::..:::
NP_006 MDLNRIIQALKGTIDPKLRIAAENELNQSYKIINFAPSLLRIIVSDHVEFPVRQAAAIYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 KNMITQYWPDRETAPGD-ISPYTIPEEDRHCIRENIVEAIIHSPELIRVQLTTCIHHIIK
:::.:::::::: ::. : :..: :.::. ::.::::.::.::.:.::::: :.. :::
NP_006 KNMVTQYWPDREPPPGEAIFPFNIHENDRQQIRDNIVEGIIRSPDLVRVQLTMCLRAIIK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 HDYPSRWTAIVDKIGFYLQSDNSACWLGILLCLYQLVKNYEYKKPEERSPLVAAMQHFLP
::.:..: ..:::: .::::..:: ::: :::::::::.::::: ::: ::. ::: :::
NP_006 HDFPGHWPGVVDKIDYYLQSQSSASWLGSLLCLYQLVKTYEYKKAEEREPLIIAMQIFLP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VLKDRFIQLLSDQSDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRD
......::: :.: :::.::::.:::::::::.:::.:.:.:..: :.::..:...:
NP_006 RIQQQIVQLLPDSSYYSVLLQKQILKIFYALVQYALPLQLVNNQTMTTWMEIFRTIIDRT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VPNETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVG
:: :::...::::::: :::::::::::.:::::::::::::.::: ::.: :::..:::
NP_006 VPPETLHIDEDDRPELVWWKCKKWALHIVARLFERYGSPGNVTKEYFEFSEFFLKTYAVG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 VQQVLLKVLYQYKEKQYMAPRVLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMC
.::::::.: ::..:.:.:::::::..::.:::: :..:::..:::::.: .:::: .::
NP_006 IQQVLLKILDQYRQKEYVAPRVLQQAFNYLNQGVVHSITWKQMKPHIQNISEDVIFSVMC
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 YTDADEELWQEDPYEYIRMKFDVFEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQIL
: : ::::::::::::::::::.:::. ::::::::::.:: .:::::: : :.::::::
NP_006 YKDEDEELWQEDPYEYIRMKFDIFEDYASPTTAAQTLLYTAAKKRKEVLPKMMAFCYQIL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 TEPNADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARACWV
:.:: ::::::::::.:::::::::::...::::: .::::::::. :.:::.:::.:::
NP_006 TDPNFDPRKKDGALHVIGSLAEILLKKSLFKDQMELFLQNHVFPLLLSNLGYLRARSCWV
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 LHYFCEVKFKSDQNLQTALELTRRCLIDDREMPVKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFI
:: : .::... ::..:.::... ::.:.:::::::::.::: ::::: .::::. : .
NP_006 LHAFSSLKFHNELNLRNAVELAKKSLIEDKEMPVKVEAALALQSLISNQIQAKEYMKPHV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 RPVMQALLHIIRETENDDLTNVIQKMICEYSEEVTPIAVEMTQHLAMTFNQVIQTGPDEE
::.:: ::::.:::::::.::::::::::::.::. :::.:::::: :..:.:. ::
NP_006 RPIMQELLHIVRETENDDVTNVIQKMICEYSQEVASIAVDMTQHLAEIFGKVLQSDEYEE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 GSDDKAVTAMGILNTIDTLLSVVEDHKEITQQLEGICLQVIGTVLQQHVLEFYEEIFSLA
.::.: :::::.::::.:.:::::::::::::.:::..: :::.::.::::::.:::
NP_006 -VEDKTVMAMGILHTIDTILTVVEDHKEITQQLENICLRIIDLVLQKHVIEFYEEILSLA
610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 HSLTCQQVSPQMWQLLPLVFEVFQQDGFDYFTDMMPLLHNYVTVDTDTLLSDTKYLEMIY
.::::...:::::::: ...:::::: :.::::::::::::::.:::::::..:.::...
NP_006 YSLTCHSISPQMWQLLGILYEVFQQDCFEYFTDMMPLLHNYVTIDTDTLLSNAKHLEILF
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 SMCKKVLTGVAGEDAECHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVEAALERLTREVKTSELR
.::.::: : :::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::::: :::::::
NP_006 TMCRKVLCGDAGEDAECHAAKLLEVIILQCKGRGIDQCIPLFVQLVLERLTRGVKTSELR
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 TMCLQVAIAALYYNPHLLLNTLENLRFPNNVEPVTNHFITQWLNDVDCFLGLHDRKMCVL
::::::::::::::: :::.::: ...:.: :.: .::.::.::.::::: ::::::..
NP_006 TMCLQVAIAALYYNPDLLLHTLERIQLPHNPGPITVQFINQWMNDTDCFLGHHDRKMCII
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE4 GLCALIDMEQIPQVLNQVSGQILPAFILLFNGLKRAYACHAEHENDSDDDDEAE--DDDE
:: :..... : ... : :::.:....:: :::.. : ... . .: ..:: : .:
NP_006 GLSILLELQNRPPAVDAVVGQIVPSILFLFLGLKQV--CATRQLVNREDRSKAEKADMEE
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KE4 TEELGSDEDDIDEDGQEYLEILAKQAGEDGDDEDWEEDDAEETALEGYSTIIDDEDNPVD
.::..:::.. . .: . .. :. .:.::.:. :::::::.:: .: :: ::
NP_006 NEEISSDEEETNVTAQAMQSNNGRGEDEEEEDDDWDEEVLEETALEGFSTPLD-LDNSVD
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE4 EYQIFKAIFQTIQNRNPVWYQALTHGLNEEQRKQLQDIATLADQRRAAHESKM-IEKHGG
:::.: . :.:.:. .::: : :.:.:: ::.. :::..::.. :.: ::..::
NP_006 EYQFFTQALITVQSRDAAWYQLLMAPLSEDQRTALQEVYTLAEHRRTVAEAKKKIEQQGG
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030
pF1KE4 YKFSAPVVPSSFNFGGPAPGMN
. : : :.:::: .:. :
NP_006 FTFENKGVLSAFNFG-TVPSNN
1020 1030
>>XP_016874180 (OMIM: 605600) PREDICTED: importin-8 isof (1020 aa)
initn: 2967 init1: 2554 opt: 4479 Z-score: 3632.2 bits: 683.7 E(85289): 1.4e-195
Smith-Waterman score: 4479; 64.4% identity (86.8% similar) in 1015 aa overlap (28-1038:11-1020)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDPNTIIEALRGTMDPALREAAERQLNEAHKSLNFVSTLLQITMSEQLDLPVRQAGVIYL
...: .::. .::.: .:.....:::::..:::
XP_016 MVILLYLRHIKSYKIINFAPSLLRIIVSDHVEFPVRQAAAIYL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE4 KNMITQYWPDRETAPGD-ISPYTIPEEDRHCIRENIVEAIIHSPELIRVQLTTCIHHIIK
:::.:::::::: ::. : :..: :.::. ::.::::.::.::.:.::::: :.. :::
XP_016 KNMVTQYWPDREPPPGEAIFPFNIHENDRQQIRDNIVEGIIRSPDLVRVQLTMCLRAIIK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 HDYPSRWTAIVDKIGFYLQSDNSACWLGILLCLYQLVKNYEYKKPEERSPLVAAMQHFLP
::.:..: ..:::: .::::..:: ::: :::::::::.::::: ::: ::. ::: :::
XP_016 HDFPGHWPGVVDKIDYYLQSQSSASWLGSLLCLYQLVKTYEYKKAEEREPLIIAMQIFLP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 VLKDRFIQLLSDQSDQSVLIQKQIFKIFYALVQYTLPLELINQQNLTEWIEILKTVVNRD
......::: :.: :::.::::.:::::::::.:::.:.:.:..: :.::..:...:
XP_016 RIQQQIVQLLPDSSYYSVLLQKQILKIFYALVQYALPLQLVNNQTMTTWMEIFRTIIDRT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VPNETLQVEEDDRPELPWWKCKKWALHILARLFERYGSPGNVSKEYNEFAEVFLKAFAVG
:: :::...::::::: :::::::::::.:::::::::::::.::: ::.: :::..:::
XP_016 VPPETLHIDEDDRPELVWWKCKKWALHIVARLFERYGSPGNVTKEYFEFSEFFLKTYAVG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 VQQVLLKVLYQYKEKQYMAPRVLQQTLNYINQGVSHALTWKNLKPHIQGIIQDVIFPLMC
.::::::.: ::..:.:.:::::::..::.:::: :..:::..:::::.: .:::: .::
XP_016 IQQVLLKILDQYRQKEYVAPRVLQQAFNYLNQGVVHSITWKQMKPHIQNISEDVIFSVMC
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 YTDADEELWQEDPYEYIRMKFDVFEDFISPTTAAQTLLFTACSKRKEVLQKTMGFCYQIL
: : ::::::::::::::::::.:::. ::::::::::.:: .:::::: : :.::::::
XP_016 YKDEDEELWQEDPYEYIRMKFDIFEDYASPTTAAQTLLYTAAKKRKEVLPKMMAFCYQIL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 TEPNADPRKKDGALHMIGSLAEILLKKKIYKDQMEYMLQNHVFPLFSSELGYMRARACWV
:.:: ::::::::::.:::::::::::...::::: .::::::::. :.:::.:::.:::
XP_016 TDPNFDPRKKDGALHVIGSLAEILLKKSLFKDQMELFLQNHVFPLLLSNLGYLRARSCWV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 LHYFCEVKFKSDQNLQTALELTRRCLIDDREMPVKVEAAIALQVLISNQEKAKEYITPFI
:: : .::... ::..:.::... ::.:.:::::::::.::: ::::: .::::. : .
XP_016 LHAFSSLKFHNELNLRNAVELAKKSLIEDKEMPVKVEAALALQSLISNQIQAKEYMKPHV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 RPVMQALLHIIRETENDDLTNVIQKMICEYSEEVTPIAVEMTQHLAMTFNQVIQTGPDEE
::.:: ::::.:::::::.::::::::::::.::. :::.:::::: :..:.:. ::
XP_016 RPIMQELLHIVRETENDDVTNVIQKMICEYSQEVASIAVDMTQHLAEIFGKVLQSDEYEE
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 GSDDKAVTAMGILNTIDTLLSVVEDHKEITQQLEGICLQVIGTVLQQHVLEFYEEIFSLA
.::.: :::::.::::.:.:::::::::::::.:::..: :::.::.::::::.:::
XP_016 -VEDKTVMAMGILHTIDTILTVVEDHKEITQQLENICLRIIDLVLQKHVIEFYEEILSLA
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
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:: :..... : ... : :::.:....:: :::.. : ... . .: ..:: : .:
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.::..:::.. . .: . .. :. .:.::.:. :::::::.:: .: :: ::
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. . .::.: . : : :. : : :: :. :::. .. ::: :. ::.
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