Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4255
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4255, 1022 aa
1>>>pF1KE4255 1022 - 1022 aa - 1022 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1920+/-0.000464; mu= 16.6409+/- 0.029
mean_var=79.6124+/-16.310, 0's: 0 Z-trim(110.9): 345 B-trim: 284 in 2/49
Lambda= 0.143742
statistics sampled from 19045 (19411) to 19045 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 13.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060382 (OMIM: 609249) probable E3 ubiquitin-pro (1022) 6881 1437.6 0
XP_005263140 (OMIM: 609249) PREDICTED: probable E3 (1034) 6428 1343.6 0
XP_016863822 (OMIM: 609249) PREDICTED: probable E3 ( 614) 4152 871.6 0
NP_001158608 (OMIM: 609249) probable E3 ubiquitin- ( 986) 4076 855.9 0
XP_011530355 (OMIM: 609249) PREDICTED: probable E3 ( 998) 3623 761.9 0
NP_057407 (OMIM: 608242) E3 ISG15--protein ligase (1024) 3158 665.5 4.1e-190
XP_011530324 (OMIM: 608242) PREDICTED: E3 ISG15--p (1100) 1637 350.1 3.9e-95
XP_016864296 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 ( 924) 1347 289.9 4.2e-77
NP_001265115 (OMIM: 609248) probable E3 ubiquitin- ( 794) 1324 285.1 1e-75
XP_011537895 (OMIM: 609248) PREDICTED: probable E3 (1073) 1324 285.2 1.3e-75
NP_001258531 (OMIM: 605200) probable E3 ubiquitin- ( 932) 1282 276.5 4.9e-73
XP_016864297 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 ( 580) 1259 271.6 8.7e-72
XP_011530699 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 ( 494) 1123 243.4 2.3e-63
XP_011537896 (OMIM: 609248) PREDICTED: probable E3 (1011) 1111 241.0 2.5e-62
XP_011537897 (OMIM: 609248) PREDICTED: probable E3 (1011) 1111 241.0 2.5e-62
XP_011537894 (OMIM: 609248) PREDICTED: probable E3 (1081) 1111 241.0 2.6e-62
XP_011537899 (OMIM: 609248) PREDICTED: probable E3 ( 960) 1094 237.5 2.7e-61
XP_005263389 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 ( 896) 1024 222.9 6e-57
XP_005263388 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 ( 903) 1024 222.9 6.1e-57
XP_005263387 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 ( 993) 1024 223.0 6.6e-57
XP_016864295 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 (1042) 1024 223.0 6.9e-57
XP_005263386 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 (1042) 1024 223.0 6.9e-57
XP_005263384 (OMIM: 605200) PREDICTED: probable E3 (1050) 1024 223.0 6.9e-57
NP_055421 (OMIM: 605200) probable E3 ubiquitin-pro (1050) 1024 223.0 6.9e-57
NP_001305434 (OMIM: 605200) probable E3 ubiquitin- ( 368) 1009 219.7 2.4e-56
XP_016871530 (OMIM: 609248) PREDICTED: probable E3 ( 936) 912 199.7 6.1e-50
NP_001265114 (OMIM: 609248) probable E3 ubiquitin- ( 979) 912 199.7 6.4e-50
NP_056416 (OMIM: 609248) probable E3 ubiquitin-pro (1049) 912 199.7 6.8e-50
NP_071362 (OMIM: 609248) probable E3 ubiquitin-pro (1057) 912 199.7 6.8e-50
XP_011537898 (OMIM: 609248) PREDICTED: probable E3 ( 987) 830 182.7 8.5e-45
XP_005268327 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_006720738 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878042 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878043 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_005268324 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_005268326 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878041 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
NP_570853 (OMIM: 105830,601623) ubiquitin-protein ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878044 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878040 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_005268328 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_005268325 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_006720739 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 852) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878039 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 872) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878038 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 872) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878036 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 872) 802 176.9 4.2e-43
NP_570854 (OMIM: 105830,601623) ubiquitin-protein ( 872) 802 176.9 4.2e-43
XP_016878037 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 872) 802 176.9 4.2e-43
XP_011520297 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 875) 802 176.9 4.3e-43
XP_016878033 (OMIM: 105830,601623) PREDICTED: ubiq ( 875) 802 176.9 4.3e-43
>>NP_060382 (OMIM: 609249) probable E3 ubiquitin-protein (1022 aa)
initn: 6881 init1: 6881 opt: 6881 Z-score: 7706.7 bits: 1437.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6881; 100.0% identity (100.0% similar) in 1022 aa overlap (1-1022:1-1022)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNLGVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNLGVVY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGLVSQIDCGSYHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 ISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGLVSQIDCGSYHTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 FLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 VFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 VFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 AIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 RQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 RQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 FHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 LALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 QS
::
NP_060 QS
>>XP_005263140 (OMIM: 609249) PREDICTED: probable E3 ubi (1034 aa)
initn: 6867 init1: 6428 opt: 6428 Z-score: 7198.9 bits: 1343.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6847; 98.8% identity (98.8% similar) in 1034 aa overlap (1-1022:1-1034)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE4 QRGELP------------EPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLG
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QRGELPVVVGGCFVLFPKEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 IGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 KHIFAGTYANFVTTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KHIFAGTYANFVTTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIR
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 MIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRA
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 LPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQE
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 SSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINE
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 LSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSE
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 KKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINE
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 ICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLS
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 LFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFS
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KE4 IHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEIL
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 RHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLF
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 FLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAI
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020
pF1KE4 NNNRGFVSPMLTQS
::::::::::::::
XP_005 NNNRGFVSPMLTQS
1030
>>XP_016863822 (OMIM: 609249) PREDICTED: probable E3 ubi (614 aa)
initn: 4152 init1: 4152 opt: 4152 Z-score: 4651.7 bits: 871.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4152; 100.0% identity (100.0% similar) in 614 aa overlap (409-1022:1-614)
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 ISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLE
10 20 30
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 MARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWK
40 50 60 70 80 90
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 NLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQDHCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQDHCN
100 110 120 130 140 150
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 VKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAETPSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAETPSPV
160 170 180 190 200 210
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 IFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRR
220 230 240 250 260 270
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 SRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMY
280 290 300 310 320 330
740 750 760 770 780 790
pF1KE4 PEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLK
340 350 360 370 380 390
800 810 820 830 840 850
pF1KE4 ELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSK
400 410 420 430 440 450
860 870 880 890 900 910
pF1KE4 YIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYE
460 470 480 490 500 510
920 930 940 950 960 970
pF1KE4 QGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERD
520 530 540 550 560 570
980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 HPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
580 590 600 610
>>NP_001158608 (OMIM: 609249) probable E3 ubiquitin-prot (986 aa)
initn: 4076 init1: 4076 opt: 4076 Z-score: 4563.2 bits: 855.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6564; 96.5% identity (96.5% similar) in 1022 aa overlap (1-1022:1-986)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 QRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNLGVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNLGVVY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGLVSQIDCGSYHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGLVSQIDCGSYHTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 FLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 VFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 AIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 RQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETIL
::::::::: :::::::::::::::
NP_001 RQLFRDNHL------------------------------------MSEKKAYMLMHETIL
610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEF
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 FHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFP
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 LALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIP
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
870 880 890 900 910 920
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
930 940 950 960 970 980
pF1KE4 QS
::
NP_001 QS
>>XP_011530355 (OMIM: 609249) PREDICTED: probable E3 ubi (998 aa)
initn: 4062 init1: 3623 opt: 3623 Z-score: 4055.5 bits: 761.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6530; 95.4% identity (95.4% similar) in 1034 aa overlap (1-1022:1-998)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE4 QRGELP------------EPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLG
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRGELPVVVGGCFVLFPKEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 IGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQV
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 KHIFAGTYANFVTTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KHIFAGTYANFVTTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIR
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 MIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRA
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 LPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQE
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 SSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINE
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 LSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSE
::::::::::::::::::::: :::
XP_011 LSNLLNFYIDRGRQLFRDNHL------------------------------------MSE
610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 KKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINE
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KE4 ICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLS
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 LFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFS
750 760 770 780 790 800
830 840 850 860 870 880
pF1KE4 IHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEIL
810 820 830 840 850 860
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 RHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLF
870 880 890 900 910 920
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 FLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAI
930 940 950 960 970 980
1010 1020
pF1KE4 NNNRGFVSPMLTQS
::::::::::::::
XP_011 NNNRGFVSPMLTQS
990
>>NP_057407 (OMIM: 608242) E3 ISG15--protein ligase HERC (1024 aa)
initn: 3054 init1: 1754 opt: 3158 Z-score: 3534.1 bits: 665.5 E(85289): 4.1e-190
Smith-Waterman score: 3181; 49.8% identity (74.3% similar) in 1017 aa overlap (18-1014:26-1023)
10 20 30 40
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAEL--LQAASGERHSLLLLTN-HRVLSCGD
: ::::.: . .:.: ...:: .. : : :.
NP_057 MERRSRRKSRRNGRSTAGKAAATQPAKSPGAQLWLFPSAAGLHRALLRRVEVTRQLCCSP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE4 NSRGQLGRRGA--QRGEL---------PEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFA
. . : : :: : .: :. :. ... . :. : :: : . :. :
NP_057 GRLAVLERGGAGVQVHQLLAGSGGARTPKCIKLGKNMKIHSVDQGAEHMLILSSDGKPFE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 WGAGSEGQLGIGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHG
. : .: .:. : :.. ::::..:: :::::::: ...:.::.: ::
NP_057 YDNYSMKHL---RFESI---------LQEKKIIQITCGDYHSLALSKGGELFAWGQNLHG
130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 QLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGR
:::.:..::: ..:: :. : :.::::..:: :::.:::. :. ..::.: :::.:.
NP_057 QLGVGRKFPSTTTPQIVEHLAGVPLAQISAGEAHSMALSMSGNIYSWGKNECGQLGLGHT
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 NVPVQSNKPLSVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRG
. ... : . .: : : ...:: .:.:.::::: .:::: .. ::::.. : ..
NP_057 E---SKDDPSLIEGLDNQKVEFVACGGSHSALLTQDGLLFTFGAGKHGQLGHNSTQNELR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 PQLVERIDGL-VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPSDT--SKPTHPEALTENFDIS
: :: .. : :.:: :: .:::::: :.: ::: : . . :. . . .:
NP_057 PCLVAELVGYRVTQIACGRWHTLAYVSDLGKVFSFGSGKDGQLGNGGTRDQLMPLPVKVS
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 CL--ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFVTTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAV
.. :. .. . ..:: ... . .: .:.: . ... ...:::
NP_057 SSEELKLESHTSEKELIMIAGGNQSILLWIKKENSYVNLKRTIPTL---NEGTVKRWIA-
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 KRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWI
.. . . .: ::. :::::::::.:::.:: : : . .::. ::. ::.::.:.::
NP_057 DVETKRWQSTKREIQEIFSSPACLTGSFLRKRRTTEMMPVYLDLNKARNIFKELTQKDWI
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 SSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSK
..::::::.:.::. :: ::: :::: .:.::::::.:: :.::..:::::::.::.::
NP_057 TNMITTCLKDNLLKRLPFHSPPQEALEIFFLLPECPMMHISNNWESLVVPFAKVVCKMSD
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 QSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVN
:: ::.. :: ::::... :.::.:.:.: :: . .. ... ::.::: :.:.::.::
NP_057 QSSLVLEEYWATLQESTFSKLVQMFKTAVICQLDYWDESAEENGNVQALLEMLKKLHRVN
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 KANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAET-PSPVIFSDFPFIFNSLSK
...:.:::. :...:: . :::... :. . . .:. :::: ::::::.:::
NP_057 QVKCQLPESIFQVDELLHRLNFFVEVCRRYLWKMTVDASENVQCCVIFSHFPFIFNNLSK
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640 650 660 670 680 690
pF1KE4 IKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQA
::::..:. .:.. ...:::. ....:: : : : :::..:..:.: ::::
NP_057 IKLLHTDTLLKIESKKHKAYLRSAAIEEERESEFALRPTFDLTVRRNHLIEDVLNQLSQF
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 EATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPK
: :. : : : : .:: . :::..:::.:.: :: .:::::::::: .::::::.:::
NP_057 ENEDLRKELWVSFSGEIGYDLGGVKKEFFYCLFAEMIQPEYGMFMYPEGASCMWFPVKPK
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 PEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVL
::::::.::.:::::::: :::::::::::.:::::: ::::::::::: :::.:: .:
NP_057 FEKKRYFFFGVLCGLSLFNCNVANLPFPLALFKKLLDQMPSLEDLKELSPDLGKNLQTLL
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pF1KE4 DDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVY
:: .:.. ... :.:..:::.::..::::: :: :.::::::::::::.:::: ::::::
NP_057 DDEGDNFEEVFYIHFNVHWDRNDTNLIPNGSSITVNQTNKRDYVSKYINYIFNDSVKAVY
830 840 850 860 870 880
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pF1KE4 EEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFW
:::.::::..:...:.. :.:::: .:.:::::::: ::.:..:: ::..::::: .::
NP_057 EEFRRGFYKMCDEDIIKLFHPEELKDVIVGNTDYDWKTFEKNARYEPGYNSSHPTIVMFW
890 900 910 920 930 940
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 KAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLP
::::::::.:::::: :::: :::. . ...:.:.: :::...::: ..:: ..: ::
NP_057 KAFHKLTLEEKKKFLVFLTGTDRLQMKDLNNMKITFCCPESWNERDPIRALTCFSVLFLP
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020
pF1KE4 KYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
:::::: .::::: ::::::::
NP_057 KYSTMETVEEALQEAINNNRGFG
1010 1020
>>XP_011530324 (OMIM: 608242) PREDICTED: E3 ISG15--prote (1100 aa)
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pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAEL--LQAASGERHSLLLLTN-HRV
: ::::.: . .:.: ...:: .. :
XP_011 PRKAAMERRSRRKSRRNGRSTAGKAAATQPAKSPGAQLWLFPSAAGLHRALLRRVEVTRQ
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pF1KE4 LSCGDNSRGQLGRRGA--QRGEL---------PEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHK
: :. . . : : :: : .: :. :. ... . :. : :: : .
XP_011 LCCSPGRLAVLERGGAGVQVHQLLAGSGGARTPKCIKLGKNMKIHSVDQGAEHMLILSSD
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pF1KE4 GRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWG
:. : . : .: .:. : :.. ::::..:: :::::::: ...:.::
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.: :::::.:..::: ..:: :. : :.::::..:: :::.:::. :. ..::.: :::
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.:. . ... : . .: : : ...:: .:.:.::::: .:::: .. ::::.. :
XP_011 GLGHTE---SKDDPSLIEGLDNQKVEFVACGGSHSALLTQDGLLFTFGAGKHGQLGHNST
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.. : :: .. : :.:: :: .:::::: :.: ::: : . . :. . .
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.: .. :. .. . ..:: ... . .: .:.: . ... ..
XP_011 PVKVSSSEELKLESHTSEKELIMIAGGNQSILLWIKKENSYVNLKRTIPTL---NEGTVK
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pF1KE4 KWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLT
.::: .. . . .: ::. :::::::::.:::.:: : : . .::. ::. ::.::
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pF1KE4 KKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAV
.:.::..::::::.:.::. :: ::: :::: .:.::::::.:: :.::..:::::::.:
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:.:: :: ::.. :: ::::... :.::.:.:.: :: . .. ... ::.::: :.:.
XP_011 CKMSDQSSLVLEEYWATLQESTFSKLVQMFKTAVICQLDYWDESAEENGNVQALLEMLKK
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pF1KE4 LHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFN
::. .: :
XP_011 LHRSKK---------------------------------H--------------------
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pF1KE4 SLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQ
:::. ....:: : : : :::..:..:.: :
XP_011 ---------------------KAYLRSAAIEEERESEFALRPTFDLTVRRNHLIEDVLNQ
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::: : :. : : : : .:: . :::..:::.:.: :: .:::::::::: .::::::
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.::: ::::::.::.:::::::: :::::::::::.:::::: ::::::::::: :::.:
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pF1KE4 QEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSV
: .::: .:.. ... :.:..:::.::..::::: :: :.::::::::::::.:::: ::
XP_011 QTLLDDEGDNFEEVFYIHFNVHWDRNDTNLIPNGSSITVNQTNKRDYVSKYINYIFNDSV
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pF1KE4 KAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTI
:::::::.::::..:...:.. :.:::: .:.:::::::: ::.:..:: ::..:::::
XP_011 KAVYEEFRRGFYKMCDEDIIKLFHPEELKDVIVGNTDYDWKTFEKNARYEPGYNSSHPTI
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pF1KE4 QLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNI
.::::::::::.:::::: :::: :::. . ...:.:.: :::...::: ..:: ..
XP_011 VMFWKAFHKLTLEEKKKFLVFLTGTDRLQMKDLNNMKITFCCPESWNERDPIRALTCFSV
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pF1KE4 LSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
: :::::::: .::::: ::::::::
XP_011 LFLPKYSTMETVEEALQEAINNNRGFG
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pF1KE4 AVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQ
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.::::.:: .. . ..: : :.. :::::::. ::::::..: ::::: . :::
XP_016 NAGQLGLSDEK---DRESPCHVKLLRTQKVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQL
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:.. .. .:. : : . . :.:: :: ::::.: ..: . .:: : .
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.. :. .. . . :. : ::.::.: .:: .. .. : . .:.
XP_016 VKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFKYHIVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMN
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. : . .. ::: :.. .::. :.. . .:.:: :: ..:::.:. ::
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. ::. .: :.:: ... : .: . .:. :. : : ::. ..:.:::
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:...::: . .:..:.: :. ... . .:: . :. . . . :... :.:.. ::.
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pF1KE4 QTKTEQD----HCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLF
:: . . : : ....:.::: .. .:: : :.:::... : ..
XP_016 GRKTFLIPVLFNNYITAALKLLEKLYKVNLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFL
460 470 480 490 500 510
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pF1KE4 RDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKD
: .: : . ..::::.. .: :.::.:....::.. . : . .: .
XP_016 ---HQAGMDT---VTLCSYPFIFDAQAKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEP
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pF1KE4 EFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCM
. :: ..:.:::. :: ::::.:: :. : : : : .: ..:::..::: .
XP_016 LLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELSIHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLL
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pF1KE4 FEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALY
..:. .: :::: : . .. .:: :.. . :.:. :::...: .:..: ::::::
XP_016 LKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDTCFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALY
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pF1KE4 KKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDV----DLIP
::::. ::.::::::::: :.::::.:: ..:. ...:. :.: .. : :::
XP_016 KKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQELLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIP
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pF1KE4 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
.: .. : . :....:. :..:.:..::. : :. :: .:: ..:. : : :: . .
XP_016 GGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQISVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMM
750 760 770 780 790 800
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pF1KE4 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
.::..:.:...:... :. :. .:::..:::..::.. :..:::::.:::: ::. :
XP_016 VGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHPTVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYG
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pF1KE4 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
. ...::.. . .:. :.. ::.:.:.:::::. : . : :..: .::
XP_016 MASLQIVIQSTAS-GEEYLPVAHTCYNLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA
870 880 890 900 910 920
pF1KE4 QS
>>NP_001265115 (OMIM: 609248) probable E3 ubiquitin-prot (794 aa)
initn: 1414 init1: 467 opt: 1324 Z-score: 1480.4 bits: 285.1 E(85289): 1e-75
Smith-Waterman score: 1559; 34.8% identity (65.9% similar) in 801 aa overlap (250-1014:1-791)
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pF1KE4 VPVQSNKPLSVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGP
.. ..: ::::: . ::::.. : .. .:
NP_001 MMKMEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINP
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pF1KE4 QLV-ERIDGLVSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS------DTSKPTHPEALTEN-
. : : . ..:..: :: :: :.: ..:.. ::: : . .::. : .. :
NP_001 RKVFELMGSIVTEIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNW
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pF1KE4 --FDISCL--ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANF--VTTHQDTSST---RAPGKTLPEISRI
.. .:: :..:.. ::.::.: .: .. :. . : :. : .: .
NP_001 YPYNGQCLPDIDSEEYF--CVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPNPT-KQIWTV
100 110 120 130 140
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pF1KE4 SQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTASFLKKRG-----TGETTSIDVDL
.... .::.. :.: .:: ::: .::..::: . :: : ::.
NP_001 NEALIQKWLSYPSGRFPVEIA-NEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFS-GVDM
150 160 170 180 190 200
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pF1KE4 EMARDTFKKLTKKE--WISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSK
. :: :.:: . . ::..... :: .:. : : ::: .: :::::.: ::.
NP_001 NAARLLFHKLIQPDHPQISQQVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSN
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 NWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTK----
:. ....::. :. .. : :.::.. :. :. . .....: ... .::. :
NP_001 NFTTIAIPFGTALVNLEKAPLKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVV-HLLKLYKIGIP
270 280 290 300 310 320
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pF1KE4 -TEQDHCN--VKALLGMMKELHKVNKANCRLPE-NTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDN
.:. : ... : ... ::.::. .. . . : :.:...:... : . ..
NP_001 PSERRIFNSFLHTALKVLEILHRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQA
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. . :. :: . .::.:.. .: :::.:. ..:::. .:. ... :
NP_001 YGMLADI--PVTICTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLFLPVIE-S
390 400 410 420 430 440
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pF1KE4 PSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEE
.: .:: ::: .: ::.. : ... :. : : : :..: ..::: .::: ...:
NP_001 VNPCLILVVRRENIVGDAMEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRE
450 460 470 480 490 500
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pF1KE4 MTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKL
. :.:::: : : . .:: : .. . :.:..:::...: ....: :::::::::
NP_001 LLDPKYGMFRYYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKKL
510 520 530 540 550 560
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pF1KE4 LDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSI---HWDQNDV-DLIPNGI
: .::::.::::: : .:.:.:..:: ::: ...:. :.: .. ..: .:. ::
NP_001 LKKKPSLDDLKELMPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTITVENFGATEVKELVLNGA
570 580 590 600 610 620
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pF1KE4 SIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGN
. :.. :....:. :.::::: :: .... :. ::..:: ..: : :.::.. .:::
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