Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4255
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4255, 1022 aa
1>>>pF1KE4255 1022 - 1022 aa - 1022 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8189+/-0.00102; mu= 18.7228+/- 0.061
mean_var=72.8849+/-14.506, 0's: 0 Z-trim(104.4): 77 B-trim: 7 in 1/48
Lambda= 0.150230
statistics sampled from 7815 (7893) to 7815 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 4.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (1022) 6881 1501.4 0
CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 ( 986) 4076 893.5 0
CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024) 3158 694.5 2.9e-199
CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050) 1024 232.0 5e-60
CCDS82939.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 ( 368) 1009 228.6 1.9e-59
CCDS60541.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 ( 979) 912 207.7 9.6e-53
CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049) 912 207.7 1e-52
CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057) 912 207.7 1e-52
CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 852) 802 183.9 1.3e-45
CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 872) 802 183.9 1.3e-45
CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 875) 802 183.9 1.3e-45
CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 834) 528 124.5 9.4e-28
CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 854) 528 124.5 9.6e-28
CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 757) 527 124.2 1e-27
CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 911) 528 124.5 1e-27
CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 947) 528 124.5 1e-27
CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 955) 528 124.5 1.1e-27
CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 967) 528 124.5 1.1e-27
CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 975) 528 124.5 1.1e-27
CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 731) 524 123.6 1.5e-27
CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17 ( 748) 522 123.2 2.1e-27
CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 ( 900) 499 118.2 7.8e-26
CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247) 499 118.3 1e-25
CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1303) 499 118.3 1.1e-25
CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1319) 499 118.3 1.1e-25
CCDS14246.1 RPGR gene_id:6103|Hs108|chrX ( 815) 493 116.9 1.8e-25
CCDS35229.1 RPGR gene_id:6103|Hs108|chrX (1152) 493 116.9 2.4e-25
CCDS73571.1 RCBTB2 gene_id:1102|Hs108|chr13 ( 527) 473 112.5 2.4e-24
CCDS9411.1 RCBTB2 gene_id:1102|Hs108|chr13 ( 551) 473 112.5 2.5e-24
CCDS73572.1 RCBTB2 gene_id:1102|Hs108|chr13 ( 556) 473 112.5 2.6e-24
CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 431) 462 110.0 1.1e-23
CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 754) 462 110.2 1.7e-23
CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 870) 462 110.2 2e-23
CCDS9418.1 RCBTB1 gene_id:55213|Hs108|chr13 ( 531) 451 107.7 6.7e-23
CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 ( 909) 454 108.5 6.8e-23
CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1216) 455 108.7 7.6e-23
CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1572) 455 108.8 9.5e-23
CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 752) 447 106.9 1.7e-22
CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 862) 447 106.9 1.9e-22
CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 903) 447 106.9 1.9e-22
CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1572) 421 101.4 1.6e-20
CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1606) 421 101.4 1.6e-20
CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374) 413 99.8 1.3e-19
CCDS5577.1 RCC1L gene_id:81554|Hs108|chr7 ( 464) 397 96.0 2e-19
CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 776) 390 94.6 8.9e-19
CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 780) 390 94.6 8.9e-19
CCDS64683.1 RCC1L gene_id:81554|Hs108|chr7 ( 454) 379 92.1 2.9e-18
CCDS45277.1 HERC1 gene_id:8925|Hs108|chr15 (4861) 376 91.8 3.6e-17
CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083) 353 86.6 3.1e-16
CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 ( 922) 351 86.1 3.6e-16
>>CCDS47098.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (1022 aa)
initn: 6881 init1: 6881 opt: 6881 Z-score: 8051.8 bits: 1501.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6881; 100.0% identity (100.0% similar) in 1022 aa overlap (1-1022:1-1022)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNLGVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNLGVVY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGLVSQIDCGSYHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGLVSQIDCGSYHTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 FLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 VFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 AIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 RQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETIL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 FHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 LALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 QS
::
CCDS47 QS
>>CCDS54777.1 HERC6 gene_id:55008|Hs108|chr4 (986 aa)
initn: 4076 init1: 4076 opt: 4076 Z-score: 4766.5 bits: 893.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6564; 96.5% identity (96.5% similar) in 1022 aa overlap (1-1022:1-986)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLGRRGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEISFTPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVRSLEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNLGVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNLGVVY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGLVSQIDCGSYHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLVERIDGLVSQIDCGSYHTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 FLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 VFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 AIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 RQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETIL
::::::::: :::::::::::::::
CCDS54 RQLFRDNHL------------------------------------MSEKKAYMLMHETIL
610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEF
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 FHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFP
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 LALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIP
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAI
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARG
870 880 890 900 910 920
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLT
930 940 950 960 970 980
pF1KE4 QS
::
CCDS54 QS
>>CCDS3630.1 HERC5 gene_id:51191|Hs108|chr4 (1024 aa)
initn: 3054 init1: 1754 opt: 3158 Z-score: 3690.9 bits: 694.5 E(32554): 2.9e-199
Smith-Waterman score: 3181; 49.8% identity (74.3% similar) in 1017 aa overlap (18-1014:26-1023)
10 20 30 40
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAEL--LQAASGERHSLLLLTN-HRVLSCGD
: ::::.: . .:.: ...:: .. : : :.
CCDS36 MERRSRRKSRRNGRSTAGKAAATQPAKSPGAQLWLFPSAAGLHRALLRRVEVTRQLCCSP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE4 NSRGQLGRRGA--QRGEL---------PEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFA
. . : : :: : .: :. :. ... . :. : :: : . :. :
CCDS36 GRLAVLERGGAGVQVHQLLAGSGGARTPKCIKLGKNMKIHSVDQGAEHMLILSSDGKPFE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 WGAGSEGQLGIGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHG
. : .: .:. : :.. ::::..:: :::::::: ...:.::.: ::
CCDS36 YDNYSMKHL---RFESI---------LQEKKIIQITCGDYHSLALSKGGELFAWGQNLHG
130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 QLGLGKEFPSQASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGR
:::.:..::: ..:: :. : :.::::..:: :::.:::. :. ..::.: :::.:.
CCDS36 QLGVGRKFPSTTTPQIVEHLAGVPLAQISAGEAHSMALSMSGNIYSWGKNECGQLGLGHT
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 NVPVQSNKPLSVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRG
. ... : . .: : : ...:: .:.:.::::: .:::: .. ::::.. : ..
CCDS36 E---SKDDPSLIEGLDNQKVEFVACGGSHSALLTQDGLLFTFGAGKHGQLGHNSTQNELR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 PQLVERIDGL-VSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPSDT--SKPTHPEALTENFDIS
: :: .. : :.:: :: .:::::: :.: ::: : . . :. . . .:
CCDS36 PCLVAELVGYRVTQIACGRWHTLAYVSDLGKVFSFGSGKDGQLGNGGTRDQLMPLPVKVS
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 CL--ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANFVTTHQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAV
.. :. .. . ..:: ... . .: .:.: . ... ...:::
CCDS36 SSEELKLESHTSEKELIMIAGGNQSILLWIKKENSYVNLKRTIPTL---NEGTVKRWIA-
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 KRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTASFLKKRGTGETTSIDVDLEMARDTFKKLTKKEWI
.. . . .: ::. :::::::::.:::.:: : : . .::. ::. ::.::.:.::
CCDS36 DVETKRWQSTKREIQEIFSSPACLTGSFLRKRRTTEMMPVYLDLNKARNIFKELTQKDWI
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 SSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSK
..::::::.:.::. :: ::: :::: .:.::::::.:: :.::..:::::::.::.::
CCDS36 TNMITTCLKDNLLKRLPFHSPPQEALEIFFLLPECPMMHISNNWESLVVPFAKVVCKMSD
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 QSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVN
:: ::.. :: ::::... :.::.:.:.: :: . .. ... ::.::: :.:.::.::
CCDS36 QSSLVLEEYWATLQESTFSKLVQMFKTAVICQLDYWDESAEENGNVQALLEMLKKLHRVN
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 KANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAET-PSPVIFSDFPFIFNSLSK
...:.:::. :...:: . :::... :. . . .:. :::: ::::::.:::
CCDS36 QVKCQLPESIFQVDELLHRLNFFVEVCRRYLWKMTVDASENVQCCVIFSHFPFIFNNLSK
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 IKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLSQA
::::..:. .:.. ...:::. ....:: : : : :::..:..:.: ::::
CCDS36 IKLLHTDTLLKIESKKHKAYLRSAAIEEERESEFALRPTFDLTVRRNHLIEDVLNQLSQF
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 EATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPK
: :. : : : : .:: . :::..:::.:.: :: .:::::::::: .::::::.:::
CCDS36 ENEDLRKELWVSFSGEIGYDLGGVKKEFFYCLFAEMIQPEYGMFMYPEGASCMWFPVKPK
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 PEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVL
::::::.::.:::::::: :::::::::::.:::::: ::::::::::: :::.:: .:
CCDS36 FEKKRYFFFGVLCGLSLFNCNVANLPFPLALFKKLLDQMPSLEDLKELSPDLGKNLQTLL
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860 870
pF1KE4 DDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVY
:: .:.. ... :.:..:::.::..::::: :: :.::::::::::::.:::: ::::::
CCDS36 DDEGDNFEEVFYIHFNVHWDRNDTNLIPNGSSITVNQTNKRDYVSKYINYIFNDSVKAVY
830 840 850 860 870 880
880 890 900 910 920 930
pF1KE4 EEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFW
:::.::::..:...:.. :.:::: .:.:::::::: ::.:..:: ::..::::: .::
CCDS36 EEFRRGFYKMCDEDIIKLFHPEELKDVIVGNTDYDWKTFEKNARYEPGYNSSHPTIVMFW
890 900 910 920 930 940
940 950 960 970 980 990
pF1KE4 KAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLP
::::::::.:::::: :::: :::. . ...:.:.: :::...::: ..:: ..: ::
CCDS36 KAFHKLTLEEKKKFLVFLTGTDRLQMKDLNNMKITFCCPESWNERDPIRALTCFSVLFLP
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020
pF1KE4 KYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
:::::: .::::: ::::::::
CCDS36 KYSTMETVEEALQEAINNNRGFG
1010 1020
>>CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050 aa)
initn: 1777 init1: 676 opt: 1024 Z-score: 1191.1 bits: 232.0 E(32554): 5e-60
Smith-Waterman score: 2319; 39.2% identity (68.2% similar) in 1018 aa overlap (27-1014:38-1047)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLG
..: : ::..:: . .: .:: :..::::
CCDS34 SLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGLNTKGQLG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RRGAQRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEIS
.. ..:. :: : :: . :.::. ::::. .:..:.:::::.::::. ..
CCDS34 HE--REGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVR
.:. :. ::. :.:::::..: :::. :.: :.:::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNL
:::::::::::::::::::::: :. :::: :.::::.:: .. . ..: : :..
CCDS34 SLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEK---DRESPCHVKLLRTQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLV-ERIDGLVSQIDCG
:::::::. ::::::..: ::::: . ::::.. .. .:. : : . . :.:: ::
CCDS34 KVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE4 SYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS---------DTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDV
::::.: ..: . .:: : ... :. .. . . :. :
CCDS34 RQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARADRFKYH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 QVKHIFAGTYANFVT-THQDTSSTRAPGKTLPEISRISQSMAEKWIAVKRRS-TEHEMAK
::.::.: .:: .. .. : . .:. . .. .. . .. ::: :.. .::. :.
CCDS34 IVKQIFSGGDQTFVLCSKYENYSPAVDFRTMNQ-AHYTSLINDETIAVWRQKLSEHNNAN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450
pF1KE4 S--EIRMIFSSPACLTASFLKKR-GTGETTSIDV---DLEMARDTFKKL--TKKEWISSM
. . .:.:: :: ..:::.:. :: . ::. .: :.:: ... : .
CCDS34 TINGVVQILSSAACWNGSFLEKKIDEHFKTSPKIPGIDLNSTRVLFEKLMNSQHSMILEQ
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 ITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPFAKAVCEMSKQSL
: . .:. :. : : ::. ..:.::: :...::: . .:..:.: :. ... .
CCDS34 ILNSFESCLIPQLSSSPPDVEAMRIYLILPEFPLLQDSKYYITLTIPLAMAILRLDTNPS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 QVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTKTEQD----HCNVKALLGMMKELHKV
.:: . :. . . . :... :.:.. ::. :: . . : : ....:.::
CCDS34 KVLDNWWSQVCPKYFMKLVNLYKGAVL-YLLRGRKTFLIPVLFNNYITAALKLLEKLYKV
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 NKANCRLPENTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLI--PAETPSPVIFSDFPFIFNSL
: .. .:: : :.:::... : .... . :. . : . ..::::..
CCDS34 NLKVKHVEYDTFYIPEISNLVDIQEDYLMWFLHQAGMKARPSIIQDTVTLCSYPFIFDAQ
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 SKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQLS
.: :.::.:....::.. . : . .: . . :: ..:.:::. :: ::::.::
CCDS34 AKTKMLQTDAELQMQVAVNGANLQNVFMLLTLEPLLARSPFLVLHVRRNNLVGDALRELS
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 QAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAK
:. : : : : .: ..:::..::: ...:. .: :::: : . .. .::
CCDS34 IHSDIDLKKPLKVIFDGEEAVDAGGVTKEFFLLLLKELLNPIYGMFTYYQDSNLLWFSDT
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 PKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQE
:.. . :.:. :::...: .:..: ::::::::::. ::.::::::::: :.::::
CCDS34 CFVEHNWFHLIGITCGLAIYNSTVVDLHFPLALYKKLLNVKPGLEDLKELSPTEGRSLQE
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860
pF1KE4 VLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDV----DLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNV
.:: ..:. ...:. :.: .. : :::.: .. : . :....:. :..:.:..
CCDS34 LLDYPGEDVEETFCLNFTICRESYGVIEQKKLIPGGDNVTVCKDNRQEFVDAYVNYVFQI
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KE4 SVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHP
::. : :. :: .:: ..:. : : :: . ..::..:.:...:... :. :. .::
CCDS34 SVHEWYTAFSSGFLKVCGGKVLELFQPSELRAMMVGNSNYNWEELEETAIYKGDYSATHP
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KE4 TIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCH
:..:::..::.. :..:::::.:::: ::. :. ...::.. . .:. :.. ::.
CCDS34 TVKLFWETFHEFPLEKKKKFLLFLTGSDRIPIYGMASLQIVIQSTAS-GEEYLPVAHTCY
970 980 990 1000 1010
990 1000 1010 1020
pF1KE4 NILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
:.:.:::::. : . : :..: .::
CCDS34 NLLDLPKYSSKEILSARLTQALDNYEGFSLA
1020 1030 1040 1050
>>CCDS82939.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (368 aa)
initn: 906 init1: 676 opt: 1009 Z-score: 1180.7 bits: 228.6 E(32554): 1.9e-59
Smith-Waterman score: 1009; 54.1% identity (76.2% similar) in 290 aa overlap (27-315:38-322)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MYFCWGADSRELQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCGDNSRGQLG
..: : ::..:: . .: .:: :..::::
CCDS82 SLGQPGISTNLQGIVAEPQVCGFISDRSVKEVACGGNHSVFLLEDGEVYTCGLNTKGQLG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RRGAQRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLGIGEFKEIS
.. ..:. :: : :: . :.::. ::::. .:..:.:::::.::::. ..
CCDS82 HE--REGNKPEQIGALADQHIIHVACGESHSLALSDRGQLFSWGAGSDGQLGLMTTEDSV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVR
.:. :. ::. :.:::::..: :::. :.: :.:::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVPRLIQKLNQQTILQVSCGNWHCLALAADGQFFTWGKNSHGQLGLGKEFPSQASPQRVR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPLSVGALKNL
:::::::::::::::::::::: :. :::: :.::::.:: .. . ..: : :..
CCDS82 SLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLSGAVFGWGMNNAGQLGLSDEK---DRESPCHVKLLRTQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 GVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLV-ERIDGLVSQIDCG
:::::::. ::::::..: ::::: . ::::.. .. .:. : : . . :.:: ::
CCDS82 KVVYISCGEEHTAVLTKSGGVFTFGAGSCGQLGHDSMNDEVNPRRVLELMGSEVTQIACG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 SYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPSDTSKPTHPEALTENFDISCLISAEDFVDVQVKHIFAGT
::::.: ..: . .:: :
CCDS82 RQHTLAFVPSSGLIYAFGCGARGQLGTGHTCNVKCPSPVKGYWAAHSGQLSARAGKNDCL
310 320 330 340 350 360
>>CCDS60541.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (979 aa)
initn: 1481 init1: 586 opt: 912 Z-score: 1060.4 bits: 207.7 E(32554): 9.6e-53
Smith-Waterman score: 1871; 34.5% identity (61.4% similar) in 1062 aa overlap (3-1014:2-976)
10 20 30 40
pF1KE4 MYFCWGADS----------RE--LQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCG
.::: : .: :. :.. . .. ... : ::....: . : .::
CCDS60 MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKRVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 DNSRGQLGRRGAQRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLG
:. ::::.. ... :: . ::.. . ::::. :.::. ::.:.::: :.::::
CCDS60 CNDLGQLGHEKSRKK--PEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 IGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPS
. .: .:..: .:.::.:.::.::.:::::::: :.:: ::.:..:::::: . .
CCDS60 LVGSEECIRVPRNIKSLSDIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGTDCKK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPL
:.::: ..:: :::. ::::::::::.:.: :. :::: :. :::.:. .: . :
CCDS60 QTSPQLLKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDEN---DRYVPN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLV-ERIDG
. .:.. .::: ::. :::.::..: ::::: . ::::.. : .. .:. : : . .
CCDS60 LLKSLRSQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE4 LVSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS------DTSKPTHPEALTEN---FDISCL-
.:..: :: :: :.: ..:.. ::: : . .::. : .. : .. .::
CCDS60 IVTEIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWYPYNGQCLP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 -ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANF--VTTHQDTSST---RAPGKTLPEISRISQSMAEKWI
:..:.. ::.::.: .: .. :. . : :. : .: ..... .::.
CCDS60 DIDSEEY--FCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPNPT-KQIWTVNEALIQKWL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE4 AVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTASFLKKRG-----TGETTSIDVDLEMARDTFKK
. :.: .:: ::: .::..::: . :: : ::.. :: :.:
CCDS60 SYPSGRFPVEIA-NEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFS-GVDMNAARLLFHK
420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 LTKKE--WISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPF
: . . ::..... :: .:. : : ::: .: :::::.: ::.:. ....::
CCDS60 LIQPDHPQISQQVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSNNFTTIAIPF
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KE4 AKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTK-----TEQDHCN-
. :. .. : :.::.. :. :. . .....: ... .::. : .:. :
CCDS60 GTALVNLEKAPLKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVV-HLLKLYKIGIPPSERRIFNS
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 -VKALLGMMKELHKVNKANCRLPE-NTFNINELSNLLNF---YIDRGRQLFRD---NHLI
... : ... ::.::. .. . . : :.:...:... ::. .: :: .
CCDS60 FLHTALKVLEILHRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQAYGMDVNHGL
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 PAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSP
. :: . .::.:.. .: :::.:. ..:::. .:. ... : .:
CCDS60 TELADIPVTICTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLFLPVIE-SVNP
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 RFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTK
.:: ::: .: ::.. : ... :. : : : :..: ..::: .::: ...:.
CCDS60 CLILVVRRENIVGDAMEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLD
710 720 730 740 750 760
740 750 760 770 780 790
pF1KE4 PEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQ
:.:::: : : . .:: : :. ::
CCDS60 PKYGMFRYYEDSRLIWFSDKITVEN-----FGAT--------------------------
770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KE4 KPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQNDVDLIPNGISIPVDQT
..::: :: :: . :..
CCDS60 -----EVKEL----------VL----------------------------NGADTAVNKQ
800 810
860 870 880 890 900 910
pF1KE4 NKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQ
:....:. :.::::: :: .... :. ::..:: ..: : :.::.. .::::.::::.
CCDS60 NRQEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVLLLFQPNELQAMVIGNTNYDWKE
820 830 840 850 860 870
920 930 940 950 960 970
pF1KE4 FEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRC
.:.:..:. : ::::..::..::.: :..::.::.:::: ::. :......:..
CCDS60 LEKNTEYKGEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKLVIQS
880 890 900 910 920 930
980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 PETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
.:. :.: :: :.:.::::. : .. : ::..:.::
CCDS60 TGG-GEEYLPVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI
940 950 960 970
>>CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049 aa)
initn: 1762 init1: 586 opt: 912 Z-score: 1060.0 bits: 207.7 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 2275; 37.3% identity (67.1% similar) in 1060 aa overlap (3-1014:2-1046)
10 20 30 40
pF1KE4 MYFCWGADS----------RE--LQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCG
.::: : .: :. :.. . .. ... : ::....: . : .::
CCDS72 MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKRVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 DNSRGQLGRRGAQRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLG
:. ::::.. ... :: . ::.. . ::::. :.::. ::.:.::: :.::::
CCDS72 CNDLGQLGHEKSRKK--PEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 IGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPS
. .: .:..: .:.::.:.::.::.:::::::: :.:: ::.:..:::::: . .
CCDS72 LVGSEECIRVPRNIKSLSDIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGTDCKK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPL
:.::: ..:: :::. ::::::::::.:.: :. :::: :. :::.:. .: . :
CCDS72 QTSPQLLKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDEN---DRYVPN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLV-ERIDG
. .:.. .::: ::. :::.::..: ::::: . ::::.. : .. .:. : : . .
CCDS72 LLKSLRSQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE4 LVSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS------DTSKPTHPEALTEN---FDISCL-
.:..: :: :: :.: ..:.. ::: : . .::. : .. : .. .::
CCDS72 IVTEIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWYPYNGQCLP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 -ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANF--VTTHQDTSST---RAPGKTLPEISRISQSMAEKWI
:..:.. ::.::.: .: .. :. . : :. : .: ..... .::.
CCDS72 DIDSEEY--FCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPNPT-KQIWTVNEALIQKWL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE4 AVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTASFLKKRG-----TGETTSIDVDLEMARDTFKK
. :.: .:: ::: .::..::: . :: : ::.. :: :.:
CCDS72 SYPSGRFPVEIA-NEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFS-GVDMNAARLLFHK
420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 LTKKE--WISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPF
: . . ::..... :: .:. : : ::: .: :::::.: ::.:. ....::
CCDS72 LIQPDHPQISQQVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSNNFTTIAIPF
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KE4 AKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTK-----TEQDHCN-
. :. .. : :.::.. :. :. . .....: ... .::. : .:. :
CCDS72 GTALVNLEKAPLKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVV-HLLKLYKIGIPPSERRIFNS
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 -VKALLGMMKELHKVNKANCRLPE-NTFNINELSNLLNFYIDRGRQLFRDNHLIPAETPS
... : ... ::.::. .. . . : :.:...:... : . .. . . :.
CCDS72 FLHTALKVLEILHRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQAYGMLADI--
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 PVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSPRFILRV
:: . .::.:.. .: :::.:. ..:::. .:. ... : .: .:: :
CCDS72 PVTICTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLFLPVIE-SVNPCLILVV
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 RRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTKPEYGMF
:: .: ::.. : ... :. : : : :..: ..::: .::: ...:. :.::::
CCDS72 RRENIVGDAMEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLDPKYGMF
710 720 730 740 750 760
740 750 760 770 780 790
pF1KE4 MYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQKPSLED
: : . .:: : .. . :.:..:::...: ....: :::::::::: .::::.:
CCDS72 RYYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKKLLKKKPSLDD
770 780 790 800 810 820
800 810 820 830 840 850
pF1KE4 LKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSI---HWDQNDV-DLIPNGISIPVDQTNK
:::: : .:.:.:..:: ::: ...:. :.: .. ..: .:. :: . :.. :.
CCDS72 LKELMPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTITVENFGATEVKELVLNGADTAVNKQNR
830 840 850 860 870 880
860 870 880 890 900 910
pF1KE4 RDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDYDWKQFE
...:. :.::::: :: .... :. ::..:: ..: : :.::.. .::::.::::..:
CCDS72 QEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVLLLFQPNELQAMVIGNTNYDWKELE
890 900 910 920 930 940
920 930 940 950 960 970
pF1KE4 QNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPE
.:..:. : ::::..::..::.: :..::.::.:::: ::. :......:..
CCDS72 KNTEYKGEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKLVIQSTG
950 960 970 980 990 1000
980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 TFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
.:. :.: :: :.:.::::. : .. : ::..:.::
CCDS72 G-GEEYLPVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI
1010 1020 1030 1040
>>CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057 aa)
initn: 1762 init1: 586 opt: 912 Z-score: 1059.9 bits: 207.7 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 2276; 37.3% identity (66.8% similar) in 1066 aa overlap (3-1014:2-1054)
10 20 30 40
pF1KE4 MYFCWGADS----------RE--LQRRRTAGSPGAELLQAASGERHSLLLLTNHRVLSCG
.::: : .: :. :.. . .. ... : ::....: . : .::
CCDS41 MLCWGNASFGQLGLGGIDEEIVLEPRKSDFFINKRVRDVGCGLRHTVFVLDDGTVYTCG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 DNSRGQLGRRGAQRGELPEPIQALETLIVDLVSCGKEHSLAVCHKGRVFAWGAGSEGQLG
:. ::::.. ... :: . ::.. . ::::. :.::. ::.:.::: :.::::
CCDS41 CNDLGQLGHEKSRKK--PEQVVALDAQNIVAVSCGEAHTLALNDKGQVYAWGLDSDGQLG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 IGEFKEISFTPKKIMTLNDIKIIQVSCGHYHSLALSKDSQVFSWGKNSHGQLGLGKEFPS
. .: .:..: .:.::.:.::.::.:::::::: :.:: ::.:..:::::: . .
CCDS41 LVGSEECIRVPRNIKSLSDIQIVQVACGYYHSLALSKASEVFCWGQNKYGQLGLGTDCKK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QASPQRVRSLEGIPLAQVAAGGAHSFALSLCGTSFGWGSNSAGQLALSGRNVPVQSNKPL
:.::: ..:: :::. ::::::::::.:.: :. :::: :. :::.:. .: . :
CCDS41 QTSPQLLKSLLGIPFMQVAAGGAHSFVLTLSGAIFGWGRNKFGQLGLNDEN---DRYVPN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SVGALKNLGVVYISCGDAHTAVLTQDGKVFTFGDNRSGQLGYSPTPEKRGPQLV-ERIDG
. .:.. .::: ::. :::.::..: ::::: . ::::.. : .. .:. : : . .
CCDS41 LLKSLRSQKIVYICCGEDHTAALTKEGGVFTFGAGGYGQLGHNSTSHEINPRKVFELMGS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE4 LVSQIDCGSYHTLAYVHTTGQVVSFGHGPS------DTSKPTHPEALTEN---FDISCL-
.:..: :: :: :.: ..:.. ::: : . .::. : .. : .. .::
CCDS41 IVTEIACGRQHTSAFVPSSGRIYSFGLGGNGQLGTGSTSNRKSPFTVKGNWYPYNGQCLP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 -ISAEDFVDVQVKHIFAGTYANF--VTTHQDTSST---RAPGKTLPEISRISQSMAEKWI
:..:.. ::.::.: .: .. :. . : :. : .: ..... .::.
CCDS41 DIDSEEY--FCVKRIFSGGDQSFSHYSSPQNCGPPDDFRCPNPT-KQIWTVNEALIQKWL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE4 AVKRRSTEHEMAKSEIRMIFSSPACLTASFLKKRG-----TGETTSIDVDLEMARDTFKK
. :.: .:: ::: .::..::: . :: : ::.. :: :.:
CCDS41 SYPSGRFPVEIA-NEIDGTFSSSGCLNGSFLAVSNDDHYRTGTRFS-GVDMNAARLLFHK
420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 LTKKE--WISSMITTCLEDDLLRALPCHSPHQEALSVFLLLPECPVMHDSKNWKNLVVPF
: . . ::..... :: .:. : : ::: .: :::::.: ::.:. ....::
CCDS41 LIQPDHPQISQQVAASLEKNLIPKLTSSLPDVEALRFYLTLPECPLMSDSNNFTTIAIPF
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KE4 AKAVCEMSKQSLQVLKKCWAFLQESSLNPLIQMLKAAIISQLLHQTK-----TEQDHCN-
. :. .. : :.::.. :. :. . .....: ... .::. : .:. :
CCDS41 GTALVNLEKAPLKVLENWWSVLEPPLFLKIVELFKEVVV-HLLKLYKIGIPPSERRIFNS
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 -VKALLGMMKELHKVNKANCRLPE-NTFNINELSNLLNF---YIDRGRQLFRD---NHLI
... : ... ::.::. .. . . : :.:...:... ::. .: :: .
CCDS41 FLHTALKVLEILHRVNEKMGQIIQYDKFYIHEVQELIDIRNDYINWVQQQAYGMDVNHGL
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 PAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHETILQKKDEFPPSP
. :: . .::.:.. .: :::.:. ..:::. .:. ... : .:
CCDS41 TELADIPVTICTYPFVFDAQAKTTLLQTDAVLQMQMAIDQAHRQNVSSLFLPVIE-SVNP
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 RFILRVRRSRLVKDALRQLSQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGGVSSEFFHCMFEEMTK
.:: ::: .: ::.. : ... :. : : : :..: ..::: .::: ...:.
CCDS41 CLILVVRRENIVGDAMEVLRKTKNIDYKKPLKVIFVGEDAVDAGGVRKEFFLLIMRELLD
710 720 730 740 750 760
740 750 760 770 780 790
pF1KE4 PEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVANLPFPLALYKKLLDQ
:.:::: : : . .:: : .. . :.:..:::...: ....: :::::::::: .
CCDS41 PKYGMFRYYEDSRLIWFSDKTFEDSDLFHLIGVICGLAIYNCTIVDLHFPLALYKKLLKK
770 780 790 800 810 820
800 810 820 830 840
pF1KE4 KPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSI---HWDQNDV-DLIPNGISIP
::::.::::: : .:.:.:..:: ::: ...:. :.: .. ..: .:. :: .
CCDS41 KPSLDDLKELMPDVGRSMQQLLDYPEDDIEETFCLNFTITVENFGATEVKELVLNGADTA
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 VDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEILRHFYPEELMTAIIGNTDY
:.. :....:. :.::::: :: .... :. ::..:: ..: : :.::.. .::::.:
CCDS41 VNKQNRQEFVDAYVDYIFNKSVASLFDAFHAGFHKVCGGKVLLLFQPNELQAMVIGNTNY
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 DWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFLFFLTGRDRLHARGIQKMEI
:::..:.:..:. : ::::..::..::.: :..::.::.:::: ::. :......
CCDS41 DWKELEKNTEYKGEYWAEHPTIKIFWEVFHELPLEKKKQFLLFLTGSDRIPILGMKSLKL
950 960 970 980 990 1000
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 VFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVAINNNRGFVSPMLTQS
:.. .:. :.: :: :.:.::::. : .. : ::..:.::
CCDS41 VIQSTGG-GEEYLPVSHTCFNLLDLPKYTEKETLRSKLIQAIDHNEGFSLI
1010 1020 1030 1040 1050
>>CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 (852 aa)
initn: 501 init1: 262 opt: 802 Z-score: 932.5 bits: 183.9 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 804; 33.3% identity (64.3% similar) in 457 aa overlap (572-1014:411-849)
550 560 570 580 590
pF1KE4 IISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFN--INE-LSNLLNFYID
:. .:: : :. ::: :...:. .:
CCDS32 SSELTLQELLGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLE--MD
390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RGRQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHET
. .:. .:: . : :::.:...: : :..:.: .::.. .:. .
CCDS32 KDYTFFK------VETENKFSFMTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRM-YSERRITVLY--S
440 450 460 470 480
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 ILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQL---SQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGG
..: .. .: . :.:::.... ::: .: .. . .:. : : ::: .: . ::
CCDS32 LVQGQQL---NPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGG
490 500 510 520 530 540
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 VSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVA
::.:::. . ::. .:. ::: : : . .:: . . .. :.:.. ::...: .
CCDS32 VSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCIL
550 560 570 580 590 600
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 NLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQND
.. ::...:.::. .: ...:: . : : .::...:. .. : . : :.: .:.:
CCDS32 DVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLE-YEGNVEDDMMITFQI--SQTD
610 620 630 640 650 660
840 850 860 870 880
pF1KE4 V-------DLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEIL
. :: :: .::. . :....:. : :::.: ::. .. :.:::. : .. :
CCDS32 LFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPL
670 680 690 700 710 720
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 RH-FYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFL
.. : :::. : :. . :.. .:....:. :: .. :. ::. :..: ..:. ::
CCDS32 KYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFL
730 740 750 760 770 780
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 FFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVA
: :: :: . :. :..... .:: ::: :: :.: ::.::. :...: : :
CCDS32 QFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTER-LPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKA
790 800 810 820 830 840
1010 1020
pF1KE4 INNNRGFVSPMLTQS
:. .::
CCDS32 ITYAKGFGML
850
>>CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 (872 aa)
initn: 501 init1: 262 opt: 802 Z-score: 932.4 bits: 183.9 E(32554): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 804; 33.3% identity (64.3% similar) in 457 aa overlap (572-1014:431-869)
550 560 570 580 590
pF1KE4 IISQLLHQTKTEQDHCNVKALLGMMKELHKVNKANCRLPENTFN--INE-LSNLLNFYID
:. .:: : :. ::: :...:. .:
CCDS45 SSELTLQELLGEERRNKKGPRVDPLETELGVKTLDCRKPLIPFEEFINEPLNEVLE--MD
410 420 430 440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RGRQLFRDNHLIPAETPSPVIFSDFPFIFNSLSKIKLLQADSHIKMQMSEKKAYMLMHET
. .:. .:: . : :::.:...: : :..:.: .::.. .:. .
CCDS45 KDYTFFK------VETENKFSFMTCPFILNAVTKNLGLYYDNRIRM-YSERRITVLY--S
460 470 480 490 500
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 ILQKKDEFPPSPRFILRVRRSRLVKDALRQL---SQAEATDFCKVLVVEFINEICPESGG
..: .. .: . :.:::.... ::: .: .. . .:. : : ::: .: . ::
CCDS45 LVQGQQL---NPYLRLKVRRDHIIDDALVRLEMIAMENPADLKKQLYVEFEGEQGVDEGG
510 520 530 540 550 560
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 VSSEFFHCMFEEMTKPEYGMFMYPEMGSCMWFPAKPKPEKKRYFLFGMLCGLSLFNLNVA
::.:::. . ::. .:. ::: : : . .:: . . .. :.:.. ::...: .
CCDS45 VSKEFFQLVVEEIFNPDIGMFTYDESTKLFWFNPSSFETEGQFTLIGIVLGLAIYNNCIL
570 580 590 600 610 620
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 NLPFPLALYKKLLDQKPSLEDLKELSPRLGKSLQEVLDDAADDIGDALCIRFSIHWDQND
.. ::...:.::. .: ...:: . : : .::...:. .. : . : :.: .:.:
CCDS45 DVHFPMVVYRKLMGKKGTFRDLGDSHPVLYQSLKDLLE-YEGNVEDDMMITFQI--SQTD
630 640 650 660 670 680
840 850 860 870 880
pF1KE4 V-------DLIPNGISIPVDQTNKRDYVSKYIDYIFNVSVKAVYEEFQRGFYRVCEKEIL
. :: :: .::. . :....:. : :::.: ::. .. :.:::. : .. :
CCDS45 LFGNPMMYDLKENGDKIPITNENRKEFVNLYSDYILNKSVEKQFKAFRRGFHMVTNESPL
690 700 710 720 730 740
890 900 910 920 930 940
pF1KE4 RH-FYPEELMTAIIGNTDYDWKQFEQNSKYEQGYQKSHPTIQLFWKAFHKLTLDEKKKFL
.. : :::. : :. . :.. .:....:. :: .. :. ::. :..: ..:. ::
CCDS45 KYLFRPEEIELLICGSRNLDFQALEETTEYDGGYTRDSVLIREFWEIVHSFTDEQKRLFL
750 760 770 780 790 800
950 960 970 980 990 1000
pF1KE4 FFLTGRDRLHARGIQKMEIVFRCPETFSERDHPTSITCHNILSLPKYSTMERMEEALQVA
: :: :: . :. :..... .:: ::: :: :.: ::.::. :...: : :
CCDS45 QFTTGTDRAPVGGLGKLKMIIAKNGPDTER-LPTSHTCFNVLLLPEYSSKEKLKERLLKA
810 820 830 840 850 860
1010 1020
pF1KE4 INNNRGFVSPMLTQS
:. .::
CCDS45 ITYAKGFGML
870
1022 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 16:26:22 2016 done: Mon Nov 7 16:26:23 2016
Total Scan time: 4.600 Total Display time: 0.400
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]