FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4253, 1013 aa
1>>>pF1KE4253 1013 - 1013 aa - 1013 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8463+/-0.000977; mu= 15.0691+/- 0.059
mean_var=113.6976+/-22.672, 0's: 0 Z-trim(108.1): 44 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.120281
statistics sampled from 9923 (9964) to 9923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 4.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013) 6732 1179.9 0
CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 ( 991) 6560 1150.0 0
CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 711) 755 142.6 2.8e-33
CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 715) 755 142.6 2.8e-33
CCDS45573.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 ( 730) 755 142.6 2.8e-33
CCDS218.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 663) 733 138.8 3.7e-32
CCDS53276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 681) 733 138.8 3.8e-32
CCDS53277.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 727) 733 138.8 4e-32
CCDS81276.1 RAP1GAP gene_id:5909|Hs108|chr1 ( 748) 733 138.8 4.1e-32
CCDS61491.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1782) 700 133.3 4.4e-30
CCDS61490.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1783) 700 133.3 4.4e-30
CCDS9807.1 SIPA1L1 gene_id:26037|Hs108|chr14 (1804) 700 133.3 4.5e-30
CCDS8108.1 SIPA1 gene_id:6494|Hs108|chr11 (1042) 688 131.1 1.2e-29
CCDS41474.1 SIPA1L2 gene_id:57568|Hs108|chr1 (1722) 681 130.0 4.2e-29
CCDS33007.1 SIPA1L3 gene_id:23094|Hs108|chr19 (1781) 679 129.6 5.5e-29
>>CCDS6869.2 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (1013 aa)
initn: 6732 init1: 6732 opt: 6732 Z-score: 6314.1 bits: 1179.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6732; 100.0% identity (100.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1013:1-1013)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MVVDFCRRFVARSLCIILMKHFCSSSVSEDLGCRRGDFSRKHYGSVELLISSDADGAIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MVVDFCRRFVARSLCIILMKHFCSSSVSEDLGCRRGDFSRKHYGSVELLISSDADGAIQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AGRFRVENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 AGRFRVENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FFLSVTLSDQNNQRVPQYRAILWRKTGTQKICLPYSPTKTLSVKSILSAMNLDKFEKGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 FFLSVTLSDQNNQRVPQYRAILWRKTGTQKICLPYSPTKTLSVKSILSAMNLDKFEKGPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EIFHPEIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EIFHPEIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ITLKGWTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ITLKGWTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DIVTIVFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYNQQNDNYRLKIFSEESVPLFGPPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DIVTIVFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYNQQNDNYRLKIFSEESVPLFGPPLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TPPVFTDHQEFRDFLLVKLINGEKATLETPTFAQKRRRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 TPPVFTDHQEFRDFLLVKLINGEKATLETPTFAQKRRRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 NRRSFSDVLPESPKSARKKEEARQAEFVRIGQALKLKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 NRRSFSDVLPESPKSARKKEEARQAEFVRIGQALKLKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 PQCFCSNFPHEAVCADPWGQALLVSTDAGVLLVDDDLPSVPVFDRTLPVKQMHVLETLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PQCFCSNFPHEAVCADPWGQALLVSTDAGVLLVDDDLPSVPVFDRTLPVKQMHVLETLDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LVLRADKGKDARLFVFRLSALQKGLEGKQAGKSRSDCRENKLEKTKGCHLYAINTHHSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LVLRADKGKDARLFVFRLSALQKGLEGKQAGKSRSDCRENKLEKTKGCHLYAINTHHSRE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LRIVVAIRNKLLLITRKHNKPSGVTSTSLLSPLSESPVEEFQYIREICLSDSPMVMTLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LRIVVAIRNKLLLITRKHNKPSGVTSTSLLSPLSESPVEEFQYIREICLSDSPMVMTLVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 GPAEESDNLICVAYRHQFDVVNESTGEAFRLHHVEANRVNFVAAIDVYEDGEAGLLLCYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GPAEESDNLICVAYRHQFDVVNESTGEAFRLHHVEANRVNFVAAIDVYEDGEAGLLLCYN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 YSCIYKKVCPFNGGSFLVQPSASDFQFCWNQAPYAIVCAFPYLLAFTTDSMEIRLVVNGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 YSCIYKKVCPFNGGSFLVQPSASDFQFCWNQAPYAIVCAFPYLLAFTTDSMEIRLVVNGN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 LVHTAVVPQLQLVASRSDIYFTATAAVNEVSSGGSSKGASARNSPQTPPGRDTPVFPSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LVHTAVVPQLQLVASRSDIYFTATAAVNEVSSGGSSKGASARNSPQTPPGRDTPVFPSSL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GEGEIQSKNLYKIPLRNLVGRSIERPLKSPLVSKVITPPTPISVGLAAIPVTHSLSLSRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GEGEIQSKNLYKIPLRNLVGRSIERPLKSPLVSKVITPPTPISVGLAAIPVTHSLSLSRM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 EIKEIASRTRRELLGLSDEGGPKSEGAPKAKSKPRKRLEESQGGPKPGAVRSSSSDRIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EIKEIASRTRRELLGLSDEGGPKSEGAPKAKSKPRKRLEESQGGPKPGAVRSSSSDRIPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KE4 GSLESASTSEANPEGHSASSDQDPVADREGSPVSGSSPFQLTAFSDEDIIDLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GSLESASTSEANPEGHSASSDQDPVADREGSPVSGSSPFQLTAFSDEDIIDLK
970 980 990 1000 1010
>>CCDS69663.1 GARNL3 gene_id:84253|Hs108|chr9 (991 aa)
initn: 6560 init1: 6560 opt: 6560 Z-score: 6153.0 bits: 1150.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6560; 100.0% identity (100.0% similar) in 989 aa overlap (25-1013:3-991)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MVVDFCRRFVARSLCIILMKHFCSSSVSEDLGCRRGDFSRKHYGSVELLISSDADGAIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MKSSVSEDLGCRRGDFSRKHYGSVELLISSDADGAIQR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AGRFRVENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AGRFRVENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSP
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FFLSVTLSDQNNQRVPQYRAILWRKTGTQKICLPYSPTKTLSVKSILSAMNLDKFEKGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FFLSVTLSDQNNQRVPQYRAILWRKTGTQKICLPYSPTKTLSVKSILSAMNLDKFEKGPR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EIFHPEIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EIFHPEIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ITLKGWTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ITLKGWTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGN
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DIVTIVFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYNQQNDNYRLKIFSEESVPLFGPPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DIVTIVFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYNQQNDNYRLKIFSEESVPLFGPPLP
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TPPVFTDHQEFRDFLLVKLINGEKATLETPTFAQKRRRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TPPVFTDHQEFRDFLLVKLINGEKATLETPTFAQKRRRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNML
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 NRRSFSDVLPESPKSARKKEEARQAEFVRIGQALKLKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NRRSFSDVLPESPKSARKKEEARQAEFVRIGQALKLKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWE
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 PQCFCSNFPHEAVCADPWGQALLVSTDAGVLLVDDDLPSVPVFDRTLPVKQMHVLETLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PQCFCSNFPHEAVCADPWGQALLVSTDAGVLLVDDDLPSVPVFDRTLPVKQMHVLETLDL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LVLRADKGKDARLFVFRLSALQKGLEGKQAGKSRSDCRENKLEKTKGCHLYAINTHHSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LVLRADKGKDARLFVFRLSALQKGLEGKQAGKSRSDCRENKLEKTKGCHLYAINTHHSRE
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LRIVVAIRNKLLLITRKHNKPSGVTSTSLLSPLSESPVEEFQYIREICLSDSPMVMTLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LRIVVAIRNKLLLITRKHNKPSGVTSTSLLSPLSESPVEEFQYIREICLSDSPMVMTLVD
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 GPAEESDNLICVAYRHQFDVVNESTGEAFRLHHVEANRVNFVAAIDVYEDGEAGLLLCYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GPAEESDNLICVAYRHQFDVVNESTGEAFRLHHVEANRVNFVAAIDVYEDGEAGLLLCYN
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 YSCIYKKVCPFNGGSFLVQPSASDFQFCWNQAPYAIVCAFPYLLAFTTDSMEIRLVVNGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YSCIYKKVCPFNGGSFLVQPSASDFQFCWNQAPYAIVCAFPYLLAFTTDSMEIRLVVNGN
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 LVHTAVVPQLQLVASRSDIYFTATAAVNEVSSGGSSKGASARNSPQTPPGRDTPVFPSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LVHTAVVPQLQLVASRSDIYFTATAAVNEVSSGGSSKGASARNSPQTPPGRDTPVFPSSL
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 GEGEIQSKNLYKIPLRNLVGRSIERPLKSPLVSKVITPPTPISVGLAAIPVTHSLSLSRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GEGEIQSKNLYKIPLRNLVGRSIERPLKSPLVSKVITPPTPISVGLAAIPVTHSLSLSRM
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 EIKEIASRTRRELLGLSDEGGPKSEGAPKAKSKPRKRLEESQGGPKPGAVRSSSSDRIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EIKEIASRTRRELLGLSDEGGPKSEGAPKAKSKPRKRLEESQGGPKPGAVRSSSSDRIPS
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010
pF1KE4 GSLESASTSEANPEGHSASSDQDPVADREGSPVSGSSPFQLTAFSDEDIIDLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GSLESASTSEANPEGHSASSDQDPVADREGSPVSGSSPFQLTAFSDEDIIDLK
940 950 960 970 980 990
>>CCDS82035.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 (711 aa)
initn: 608 init1: 608 opt: 755 Z-score: 711.0 bits: 142.6 E(32554): 2.8e-33
Smith-Waterman score: 755; 40.1% identity (69.0% similar) in 319 aa overlap (97-411:136-449)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSPFFLSVT
: : ..:::. : :. . . . ..:::
CCDS82 SLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVK
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LSDQNNQRVPQYRAILWRKTGTQKICLPYSPTKTL-SVKSILSAMNLDKFEKGPREIFHP
.. . . :.:: : : . .: . . : :: .: .:. : ...:
CCDS82 C--EEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYP
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDTITLKG
. .. .. .:.: . .:::::.. : : ..:.:.:. : :..::.::::::::.
CCDS82 KASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQD
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 WTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGNDIVTI
. :.:::::. . ::..::::... .:::::::: ::.. . ::..::::::::::.:
CCDS82 FKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAI
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYNQ---QNDNYRLKIFSEESVPLFGPPLPTP
.::: :..: : :.:: :.: : . .:. . .. .:.... ..:.:: ::::::.:
CCDS82 IFQE--ENTP-FVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSP
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PVFTDHQEFRDFLLVKLINGEKATLETPTFAQKRRRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNMLNR
::: :::.:::.:: :.:.: .. ::. . :: :. .::..:
CCDS82 PVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLG
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 RSFSDVLPESPKSARKKEEARQAEFVRIGQALKLKSIVRGDAPSSLAASGICKKEPWEPQ
CCDS82 PEEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVT
470 480 490 500 510 520
>>CCDS45574.1 RAP1GAP2 gene_id:23108|Hs108|chr17 (715 aa)
initn: 608 init1: 608 opt: 755 Z-score: 711.0 bits: 142.6 E(32554): 2.8e-33
Smith-Waterman score: 755; 40.1% identity (69.0% similar) in 319 aa overlap (97-411:140-453)
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ENGSSDENATALPGTWRRTDVHLENPEYHTRWYFKYFLGQVHQNYIGNDAEKSPFFLSVT
: : ..:::. : :. . . . ..:::
CCDS45 SLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVK
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LSDQNNQRVPQYRAILWRKTGTQKICLPYSPTKTL-SVKSILSAMNLDKFEKGPREIFHP
.. . . :.:: : : . .: . . : :: .: .:. : ...:
CCDS45 C--EEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYP
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EIQKDLLVLEEQEGSVNFKFGVLFAKDGQLTDDEMFSNEIGSEPFQKFLNLLGDTITLKG
. .. .. .:.: . .:::::.. : : ..:.:.:. : :..::.::::::::.
CCDS45 KASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQD
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 WTGYRGGLDTKNDTTGIHSVYTVYQGHEIMFHVSTMLPYSKENKQQVERKRHIGNDIVTI
. :.:::::. . ::..::::... .:::::::: ::.. . ::..::::::::::.:
CCDS45 FKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAI
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VFQEGEESSPAFKPSMIRSHFTHIFALVRYNQ---QNDNYRLKIFSEESVPLFGPPLPTP
.::: :..: : :.:: :.: : . .:. . .. .:.... ..:.:: ::::::.:
CCDS45 IFQE--ENTP-FVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSP
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PVFTDHQEFRDFLLVKLINGEKATLETPTFAQKRRRTLDMLIRSLHQDLMPDLHKNMLNR
::: :::.:::.:: :.:.: .. ::. . :: :. .::..:
CCDS45 PVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLG
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
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130 140 150 160 170 180
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.. . . :.:: : : . .: . . : :: .: .:. : ...:
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190 200 210 220 230 240
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250 260 270 280 290 300
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310 320 330 340 350 360
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CCDS45 PEEDKFENGGHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVT
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380 390 400 410 420 430
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CCDS81 RTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFY--P--VLYPKASRLIVTFDEHVISN
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CCDS61 ESAGPAFEEFLQLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGTHSLYTTYKDYEIMFHVSTMLP
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CCDS61 YTPNNKQQLLRKRHIGNDIVTIVFQE--PGAQPFSPKNIRSHFQHVFVIVRVHNPCSDSV
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CCDS61 CYSVAVTRSRDVPSFGPPIPKGVTFPKSNVFRDFLLAKVINAENA-------AHKSEKFR
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CCDS61 AMATRT-RQEYLKDLAEKNVTNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPGAELSSMGAIVW
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CCDS61 AVRAEDYNKAMELDCLLGISNEFIVLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTSTDTSLKIFYERG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]